RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000504294.5

SH3BP2-208, Transcript of SH3 domain binding protein 2, humanhuman

TSL 5

Gene SH3BP2, Length 557 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP2-208ENST00000504294 MIS18AQ9NYP9 233 aa18.9■□□□□ 0.62
SH3BP2-208ENST00000504294 SOS1Q07889 1333 aaPredicted RBP18.9■□□□□ 0.62
SH3BP2-208ENST00000504294 UBR2Q8IWV8 1755 aa18.9■□□□□ 0.62
SH3BP2-208ENST00000504294 TAF1LQ8IZX4 1826 aa18.9■□□□□ 0.62
SH3BP2-208ENST00000504294 QSER1Q2KHR3 1735 aa18.89■□□□□ 0.61
SH3BP2-208ENST00000504294 KCNQ3O43525 872 aa18.89■□□□□ 0.61
SH3BP2-208ENST00000504294 GIGYF1O75420 1035 aaPredicted RBP18.89■□□□□ 0.61
SH3BP2-208ENST00000504294 POLD1P28340 1107 aa18.89■□□□□ 0.61
SH3BP2-208ENST00000504294 COL23A1Q86Y22 540 aaPredicted RBP18.89■□□□□ 0.61
SH3BP2-208ENST00000504294 SRCAPQ6ZRS2 3230 aa18.88■□□□□ 0.61
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SH3BP2-208ENST00000504294 ZNF853P0CG23 659 aa18.88■□□□□ 0.61
SH3BP2-208ENST00000504294 IL6STP40189 918 aaPredicted RBP18.88■□□□□ 0.61
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SH3BP2-208ENST00000504294 ERBB4Q15303 1308 aa18.88■□□□□ 0.61
SH3BP2-208ENST00000504294 NLGN1Q8N2Q7 840 aa18.87■□□□□ 0.61
SH3BP2-208ENST00000504294 ZPR1O75312 459 aa18.86■□□□□ 0.61
SH3BP2-208ENST00000504294 MYH16Q9H6N6 1097 aa18.86■□□□□ 0.61
SH3BP2-208ENST00000504294 USP16Q9Y5T5 823 aa18.86■□□□□ 0.61
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SH3BP2-208ENST00000504294 ARHGEF1Q92888 912 aaKnown RBP18.85■□□□□ 0.61
SH3BP2-208ENST00000504294 COL5A3P25940 1745 aaPredicted RBP18.85■□□□□ 0.61
SH3BP2-208ENST00000504294 RGL2O15211 777 aa18.84■□□□□ 0.61
SH3BP2-208ENST00000504294 ZBTB7AO95365 584 aa18.84■□□□□ 0.61
SH3BP2-208ENST00000504294 MBIPQ9NS73 344 aa18.84■□□□□ 0.61
SH3BP2-208ENST00000504294 PPP1R1BQ9UD71 204 aaPredicted RBP18.84■□□□□ 0.61
SH3BP2-208ENST00000504294 KDM3BQ7LBC6 1761 aa18.83■□□□□ 0.61
SH3BP2-208ENST00000504294 TJP1Q07157 1748 aa18.83■□□□□ 0.61
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SH3BP2-208ENST00000504294 ZBTB1Q9Y2K1 713 aa18.83■□□□□ 0.6
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SH3BP2-208ENST00000504294 COL15A1P39059 1388 aa18.81■□□□□ 0.6
SH3BP2-208ENST00000504294 ATF5Q9Y2D1 282 aaPredicted RBP18.81■□□□□ 0.6
SH3BP2-208ENST00000504294 CASZ1Q86V15 1759 aa18.81■□□□□ 0.6
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SH3BP2-208ENST00000504294 ZNF652Q9Y2D9 606 aa18.8■□□□□ 0.6
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SH3BP2-208ENST00000504294 ZNF330Q9Y3S2 320 aaPredicted RBP18.79■□□□□ 0.6
SH3BP2-208ENST00000504294 LRP5O75197 1615 aa18.78■□□□□ 0.6
SH3BP2-208ENST00000504294 E9PSI1 815 aa18.78■□□□□ 0.6
SH3BP2-208ENST00000504294 EIF2S2P20042 333 aaKnown RBP18.78■□□□□ 0.6
SH3BP2-208ENST00000504294 HDGFL1Q5TGJ6 251 aa18.78■□□□□ 0.6
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SH3BP2-208ENST00000504294 GYS1P13807 737 aa18.77■□□□□ 0.6
SH3BP2-208ENST00000504294 CCDC30Q5VVM6 783 aa18.77■□□□□ 0.6
SH3BP2-208ENST00000504294 KIF6Q6ZMV9 814 aa18.77■□□□□ 0.6
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SH3BP2-208ENST00000504294 PARP3Q9Y6F1 533 aa18.76■□□□□ 0.59
SH3BP2-208ENST00000504294 ZNF521Q96K83 1311 aa18.75■□□□□ 0.59
SH3BP2-208ENST00000504294 MYH14Q7Z406 1995 aaKnown RBP18.75■□□□□ 0.59
SH3BP2-208ENST00000504294 PTGER2P43116 358 aa18.75■□□□□ 0.59
SH3BP2-208ENST00000504294 USPL1Q5W0Q7 1092 aa18.75■□□□□ 0.59
SH3BP2-208ENST00000504294 TUBGCP6Q96RT7 1819 aa18.74■□□□□ 0.59
SH3BP2-208ENST00000504294 LAMB4A4D0S4 1761 aa18.74■□□□□ 0.59
SH3BP2-208ENST00000504294 ERVV-1B6SEH8 477 aa18.74■□□□□ 0.59
SH3BP2-208ENST00000504294 TWISTNBQ3B726 338 aaPredicted RBP18.74■□□□□ 0.59
SH3BP2-208ENST00000504294 SGIP1Q9BQI5 828 aa18.74■□□□□ 0.59
SH3BP2-208ENST00000504294 STK31Q9BXU1 1019 aa18.74■□□□□ 0.59
SH3BP2-208ENST00000504294 FANCIQ9NVI1 1328 aa18.74■□□□□ 0.59
SH3BP2-208ENST00000504294 NBPF26B4DH59 902 aa18.73■□□□□ 0.59
SH3BP2-208ENST00000504294 MYL6BP14649 208 aa18.73■□□□□ 0.59
SH3BP2-208ENST00000504294 MSL1Q68DK7 614 aa18.73■□□□□ 0.59
SH3BP2-208ENST00000504294 NBPF10Q6P3W6 841 aaKnown RBP18.73■□□□□ 0.59
SH3BP2-208ENST00000504294 NBPF15Q8N660 670 aa18.73■□□□□ 0.59
SH3BP2-208ENST00000504294 TBC1D2BQ9UPU7 963 aa18.73■□□□□ 0.59
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SH3BP2-208ENST00000504294 TSR2Q969E8 191 aaKnown RBP18.72■□□□□ 0.59
SH3BP2-208ENST00000504294 SENP3-EIF4A1A0A087X0R7 540 aa18.71■□□□□ 0.59
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SH3BP2-208ENST00000504294 HSP90AB3PQ58FF7 597 aa18.71■□□□□ 0.59
SH3BP2-208ENST00000504294 SMIM5Q71RC9 77 aa18.71■□□□□ 0.59
SH3BP2-208ENST00000504294 C8orf58Q8NAV2 365 aa18.71■□□□□ 0.59
SH3BP2-208ENST00000504294 ZNF428Q96B54 188 aa18.71■□□□□ 0.59
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SH3BP2-208ENST00000504294 TM4SF1P30408 202 aa18.7■□□□□ 0.58
SH3BP2-208ENST00000504294 HNRNPUQ00839 825 aaKnown RBP eCLIP18.7■□□□□ 0.58
SH3BP2-208ENST00000504294 FKBP8Q14318 412 aa18.7■□□□□ 0.58
SH3BP2-208ENST00000504294 CD2APQ9Y5K6 639 aa18.7■□□□□ 0.58
SH3BP2-208ENST00000504294 MAP3K15Q6ZN16 1313 aa18.7■□□□□ 0.58
SH3BP2-208ENST00000504294 CT47B1P0C2W7 299 aaPredicted RBP18.69■□□□□ 0.58
SH3BP2-208ENST00000504294 PDIA6Q15084 440 aa18.69■□□□□ 0.58
SH3BP2-208ENST00000504294 KRT24Q2M2I5 525 aa18.69■□□□□ 0.58
SH3BP2-208ENST00000504294 PIP4K2AP48426 406 aaPredicted RBP18.68■□□□□ 0.58
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SH3BP2-208ENST00000504294 NECTIN2Q92692 538 aa18.68■□□□□ 0.58
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