RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000496055.5

RABGGTB-213, Transcript of Rab geranylgeranyltransferase subunit beta, humanhuman

TSL 2

Gene RABGGTB, Length 3,863 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGGTB-213ENST00000496055 FOXD4L1Q9NU39 408 aa5.71□□□□□ -1.5
RABGGTB-213ENST00000496055 RAI14Q9P0K7 980 aa5.71□□□□□ -1.5
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RABGGTB-213ENST00000496055 CAMTA1Q9Y6Y1 1673 aa5.71□□□□□ -1.5
RABGGTB-213ENST00000496055 THSD7AQ9UPZ6 1657 aa5.7□□□□□ -1.5
RABGGTB-213ENST00000496055 BCL9O00512 1426 aa5.7□□□□□ -1.5
RABGGTB-213ENST00000496055 SATB1Q01826 763 aa5.7□□□□□ -1.5
RABGGTB-213ENST00000496055 SPG7Q9UQ90 795 aa5.7□□□□□ -1.5
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RABGGTB-213ENST00000496055 UTP3Q9NQZ2 479 aaKnown RBP eCLIP5.7□□□□□ -1.52e-6■■■■□ 25.7
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RABGGTB-213ENST00000496055 USP31Q70CQ4 1352 aa5.7□□□□□ -1.5
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RABGGTB-213ENST00000496055 SYT17Q9BSW7 474 aa5.7□□□□□ -1.5
RABGGTB-213ENST00000496055 GOLGA6AQ9NYA3 693 aa5.7□□□□□ -1.5
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RABGGTB-213ENST00000496055 RGPD8O14715 1765 aaPredicted RBP5.69□□□□□ -1.5
RABGGTB-213ENST00000496055 TRPM1Q7Z4N2 1603 aa5.69□□□□□ -1.5
RABGGTB-213ENST00000496055 TESPA1A2RU30 521 aaPredicted RBP5.69□□□□□ -1.5
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RABGGTB-213ENST00000496055 NRKQ7Z2Y5 1582 aa5.69□□□□□ -1.5
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RABGGTB-213ENST00000496055 SSR1P43307 286 aaKnown RBP5.69□□□□□ -1.5
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RABGGTB-213ENST00000496055 STK24Q9Y6E0 443 aa5.69□□□□□ -1.5
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RABGGTB-213ENST00000496055 ARHGEF28Q8N1W1 1705 aaKnown RBP5.68□□□□□ -1.5
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RABGGTB-213ENST00000496055 IPO9Q96P70 1041 aaKnown RBP5.68□□□□□ -1.5
RABGGTB-213ENST00000496055 SLC12A5Q9H2X9 1139 aa5.68□□□□□ -1.5
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RABGGTB-213ENST00000496055 RTL1A6NKG5 1358 aa5.67□□□□□ -1.5
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RABGGTB-213ENST00000496055 ZSCAN20P17040 1043 aaPredicted RBP5.67□□□□□ -1.5
RABGGTB-213ENST00000496055 FRAT1Q92837 279 aaPredicted RBP5.67□□□□□ -1.5
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RABGGTB-213ENST00000496055 MRVI1Q9Y6F6 885 aa5.66□□□□□ -1.5
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RABGGTB-213ENST00000496055 CEP83Q9Y592 693 aa5.65□□□□□ -1.5
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RABGGTB-213ENST00000496055 ZNF280DQ6N043 979 aa5.65□□□□□ -1.51
RABGGTB-213ENST00000496055 PROCA1Q8NCQ7 364 aaPredicted RBP5.65□□□□□ -1.51
RABGGTB-213ENST00000496055 ST20-MTHFSA0A0A6YYL1 179 aa5.65□□□□□ -1.51
RABGGTB-213ENST00000496055 CT47A1Q5JQC4 288 aaPredicted RBP5.65□□□□□ -1.51
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