RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000494971.2

USP20-208, Transcript of ubiquitin specific peptidase 20, humanhuman

TSL 3

Gene USP20, Length 503 nt, Biotype processed transcript.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP20-208ENST00000494971 GOLGB1Q14789 3259 aaKnown RBP22.58■■□□□ 1.21
USP20-208ENST00000494971 MMP10P09238 476 aa22.58■■□□□ 1.21
USP20-208ENST00000494971 TAF7Q15545 349 aaPredicted RBP22.58■■□□□ 1.21
USP20-208ENST00000494971 COL15A1P39059 1388 aa22.56■■□□□ 1.2
USP20-208ENST00000494971 SRP68Q9UHB9 627 aaKnown RBP22.56■■□□□ 1.2
USP20-208ENST00000494971 WDR43Q15061 677 aaKnown RBP eCLIP22.55■■□□□ 1.2
USP20-208ENST00000494971 EIF5P55010 431 aaKnown RBP22.54■■□□□ 1.2
USP20-208ENST00000494971 NARFQ9UHQ1 456 aa22.54■■□□□ 1.2
USP20-208ENST00000494971 KDM3BQ7LBC6 1761 aa22.53■■□□□ 1.2
USP20-208ENST00000494971 TMPOP42166 694 aaKnown RBP22.53■■□□□ 1.2
USP20-208ENST00000494971 FKBP8Q14318 412 aa22.53■■□□□ 1.2
USP20-208ENST00000494971 PNISRQ8TF01 805 aaKnown RBP22.53■■□□□ 1.2
USP20-208ENST00000494971 ADAMTS8Q9UP79 889 aa22.53■■□□□ 1.2
USP20-208ENST00000494971 KIF13BQ9NQT8 1826 aa22.52■■□□□ 1.2
USP20-208ENST00000494971 ZPR1O75312 459 aa22.52■■□□□ 1.2
USP20-208ENST00000494971 SNRPA1P09661 255 aaKnown RBP22.52■■□□□ 1.2
USP20-208ENST00000494971 CANXP27824 592 aaKnown RBP22.52■■□□□ 1.2
USP20-208ENST00000494971 RIPK4P57078 832 aa22.52■■□□□ 1.2
USP20-208ENST00000494971 RUNDC1Q96C34 613 aa22.52■■□□□ 1.2
USP20-208ENST00000494971 IL6STP40189 918 aaPredicted RBP22.51■■□□□ 1.19
USP20-208ENST00000494971 USPL1Q5W0Q7 1092 aa22.51■■□□□ 1.19
USP20-208ENST00000494971 THUMPD2Q9BTF0 503 aaKnown RBP22.51■■□□□ 1.19
USP20-208ENST00000494971 USP16Q9Y5T5 823 aa22.51■■□□□ 1.19
USP20-208ENST00000494971 A0A087WZG4 1122 aa22.5■■□□□ 1.19
USP20-208ENST00000494971 CCDC146Q8IYE0 955 aa22.5■■□□□ 1.19
USP20-208ENST00000494971 MIS18AQ9NYP9 233 aa22.5■■□□□ 1.19
USP20-208ENST00000494971 C10orf71Q711Q0 1435 aa22.49■■□□□ 1.19
USP20-208ENST00000494971 PRAMEF22A3QJZ6 481 aa22.49■■□□□ 1.19
USP20-208ENST00000494971 A1BGP04217 495 aa22.49■■□□□ 1.19
USP20-208ENST00000494971 TM4SF1P30408 202 aa22.49■■□□□ 1.19
USP20-208ENST00000494971 LMOD3Q0VAK6 560 aa22.49■■□□□ 1.19
USP20-208ENST00000494971 GPR162Q16538 588 aa22.49■■□□□ 1.19
USP20-208ENST00000494971 PARP3Q9Y6F1 533 aa22.49■■□□□ 1.19
USP20-208ENST00000494971 DDR1Q08345 913 aa22.48■■□□□ 1.19
USP20-208ENST00000494971 BCL2L12Q9HB09 334 aa22.48■■□□□ 1.19
USP20-208ENST00000494971 KIAA1551Q9HCM1 1747 aa22.46■■□□□ 1.19
USP20-208ENST00000494971 EIF4A1P60842 406 aaKnown RBP22.46■■□□□ 1.19
USP20-208ENST00000494971 BABAM1Q9NWV8 329 aa22.46■■□□□ 1.19
USP20-208ENST00000494971 SCN7AQ01118 1682 aa22.46■■□□□ 1.19
USP20-208ENST00000494971 LAMB4A4D0S4 1761 aa22.45■■□□□ 1.19
USP20-208ENST00000494971 POLRMTO00411 1230 aaKnown RBP22.45■■□□□ 1.18
USP20-208ENST00000494971 YBX3P16989 372 aaKnown RBP eCLIP22.45■■□□□ 1.18
USP20-208ENST00000494971 TGFB2P61812 414 aa22.45■■□□□ 1.18
USP20-208ENST00000494971 RRP7AQ9Y3A4 280 aaKnown RBP22.45■■□□□ 1.18
USP20-208ENST00000494971 CHD4Q14839 1912 aa22.45■■□□□ 1.18
USP20-208ENST00000494971 PXDNLA1KZ92 1463 aa22.44■■□□□ 1.18
USP20-208ENST00000494971 YY1P25490 414 aa22.44■■□□□ 1.18
USP20-208ENST00000494971 TRIM35Q9UPQ4 493 aa22.44■■□□□ 1.18
USP20-208ENST00000494971 GIGYF1O75420 1035 aaPredicted RBP22.43■■□□□ 1.18
USP20-208ENST00000494971 NFIXQ14938 502 aa22.43■■□□□ 1.18
USP20-208ENST00000494971 PELP1Q8IZL8 1130 aaKnown RBP22.43■■□□□ 1.18
USP20-208ENST00000494971 NRXN2Q9P2S2 1712 aa22.43■■□□□ 1.18
USP20-208ENST00000494971 GRIN3BO60391 1043 aa22.42■■□□□ 1.18
USP20-208ENST00000494971 NEUROD2Q15784 382 aa22.42■■□□□ 1.18
USP20-208ENST00000494971 TSPYL4Q9UJ04 414 aa22.42■■□□□ 1.18
USP20-208ENST00000494971 NBPF26B4DH59 902 aa22.41■■□□□ 1.18
USP20-208ENST00000494971 CAMTA2O94983 1202 aa22.41■■□□□ 1.18
USP20-208ENST00000494971 CCDC184Q52MB2 194 aa22.41■■□□□ 1.18
USP20-208ENST00000494971 NBPF10Q6P3W6 841 aaKnown RBP22.41■■□□□ 1.18
USP20-208ENST00000494971 NPM2Q86SE8 214 aaKnown RBP22.41■■□□□ 1.18
USP20-208ENST00000494971 NBPF15Q8N660 670 aa22.41■■□□□ 1.18
USP20-208ENST00000494971 TBC1D2BQ9UPU7 963 aa22.41■■□□□ 1.18
USP20-208ENST00000494971 ZNF330Q9Y3S2 320 aaPredicted RBP22.41■■□□□ 1.18
USP20-208ENST00000494971 AFDNP55196 1824 aaKnown RBP22.41■■□□□ 1.18
USP20-208ENST00000494971 BCORQ6W2J9 1755 aa22.4■■□□□ 1.18
USP20-208ENST00000494971 ANP32CO43423 234 aa22.4■■□□□ 1.18
USP20-208ENST00000494971 PIP4K2AP48426 406 aaPredicted RBP22.4■■□□□ 1.18
USP20-208ENST00000494971 N4BP2Q86UW6 1770 aaPredicted RBP22.4■■□□□ 1.18
USP20-208ENST00000494971 DZIP3Q86Y13 1208 aaKnown RBP22.38■■□□□ 1.17
USP20-208ENST00000494971 BRCA1P38398 1863 aaKnown RBP22.37■■□□□ 1.17
USP20-208ENST00000494971 CHL1O00533 1208 aa22.37■■□□□ 1.17
USP20-208ENST00000494971 RGL2O15211 777 aa22.37■■□□□ 1.17
USP20-208ENST00000494971 SERPINB2P05120 415 aa22.37■■□□□ 1.17
USP20-208ENST00000494971 TBC1D9BQ66K14 1250 aa22.37■■□□□ 1.17
USP20-208ENST00000494971 A0A0G2JLW4 131 aa22.36■■□□□ 1.17
USP20-208ENST00000494971 APAF1O14727 1248 aa22.36■■□□□ 1.17
USP20-208ENST00000494971 DPEP1P16444 411 aa22.36■■□□□ 1.17
USP20-208ENST00000494971 KCNA3P22001 575 aa22.35■■□□□ 1.17
USP20-208ENST00000494971 CLEC4GQ6UXB4 293 aa22.35■■□□□ 1.17
USP20-208ENST00000494971 ERBB4Q15303 1308 aa22.34■■□□□ 1.17
USP20-208ENST00000494971 CARMIL3Q8ND23 1372 aa22.34■■□□□ 1.17
USP20-208ENST00000494971 BICDL1Q6ZP65 573 aa22.33■■□□□ 1.17
USP20-208ENST00000494971 WWC3Q9ULE0 1092 aa22.33■■□□□ 1.17
USP20-208ENST00000494971 CFAP44Q96MT7 982 aa22.32■■□□□ 1.16
USP20-208ENST00000494971 MRS2Q9HD23 443 aa22.32■■□□□ 1.16
USP20-208ENST00000494971 ZNF652Q9Y2D9 606 aa22.32■■□□□ 1.16
USP20-208ENST00000494971 SETDB2Q96T68 719 aa22.31■■□□□ 1.16
USP20-208ENST00000494971 ZNF853P0CG23 659 aa22.29■■□□□ 1.16
USP20-208ENST00000494971 CHRNA5P30532 468 aa22.29■■□□□ 1.16
USP20-208ENST00000494971 PRR5LQ6MZQ0 368 aa22.29■■□□□ 1.16
USP20-208ENST00000494971 PIM2Q9P1W9 311 aa22.29■■□□□ 1.16
USP20-208ENST00000494971 LAS1LQ9Y4W2 734 aaKnown RBP22.29■■□□□ 1.16
USP20-208ENST00000494971 ARFGEF1Q9Y6D6 1849 aa22.29■■□□□ 1.16
USP20-208ENST00000494971 ERVV-1B6SEH8 477 aa22.28■■□□□ 1.16
USP20-208ENST00000494971 PDIA6Q15084 440 aa22.28■■□□□ 1.16
USP20-208ENST00000494971 LRP10Q7Z4F1 713 aa22.28■■□□□ 1.16
USP20-208ENST00000494971 BCS1LQ9Y276 419 aa22.28■■□□□ 1.16
USP20-208ENST00000494971 DLEC1Q9Y238 1755 aa22.27■■□□□ 1.16
USP20-208ENST00000494971 MYL6BP14649 208 aa22.27■■□□□ 1.16
USP20-208ENST00000494971 CALD1Q05682 793 aaKnown RBP22.27■■□□□ 1.16
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