RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000487548.2

SENP6-210, Transcript of SUMO specific peptidase 6, humanhuman

TSL 2

Gene SENP6, Length 427 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Exosome, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SENP6-210ENST00000487548 DNAAF2Q9NVR5 837 aaKnown RBP7.5□□□□□ -1.21
SENP6-210ENST00000487548 NOP53Q9NZM5 478 aaKnown RBP7.5□□□□□ -1.21
SENP6-210ENST00000487548 PCBP4P57723 403 aaKnown RBP7.49□□□□□ -1.21
SENP6-210ENST00000487548 EIF4G2P78344 907 aaKnown RBP eCLIP7.49□□□□□ -1.21
SENP6-210ENST00000487548 A0A1W2PNR3 127 aa7.48□□□□□ -1.21
SENP6-210ENST00000487548 MAPTP10636 758 aaKnown RBP7.48□□□□□ -1.21
SENP6-210ENST00000487548 ADH6P28332 368 aa7.48□□□□□ -1.21
SENP6-210ENST00000487548 BCANQ96GW7 911 aa7.48□□□□□ -1.21
SENP6-210ENST00000487548 NIFKQ9BYG3 293 aaKnown RBP7.48□□□□□ -1.21
SENP6-210ENST00000487548 KLF15Q9UIH9 416 aa7.48□□□□□ -1.21
SENP6-210ENST00000487548 PRR12Q9ULL5 1215 aa7.48□□□□□ -1.21
SENP6-210ENST00000487548 GJA3Q9Y6H8 435 aa7.48□□□□□ -1.21
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SENP6-210ENST00000487548 NLRP8Q86W28 1048 aa7.46□□□□□ -1.22
SENP6-210ENST00000487548 PHTF2Q8N3S3 785 aa7.46□□□□□ -1.22
SENP6-210ENST00000487548 PARP3Q9Y6F1 533 aa7.46□□□□□ -1.22
SENP6-210ENST00000487548 ITGB7P26010 798 aa7.45□□□□□ -1.22
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SENP6-210ENST00000487548 TNP2Q05952 138 aa7.45□□□□□ -1.22
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SENP6-210ENST00000487548 TRIM11Q96F44 468 aa7.45□□□□□ -1.22
SENP6-210ENST00000487548 PLVAPQ9BX97 442 aa7.45□□□□□ -1.22
SENP6-210ENST00000487548 CABP1Q9NZU7 370 aa7.45□□□□□ -1.22
SENP6-210ENST00000487548 TATP17735 454 aaPredicted RBP7.44□□□□□ -1.22
SENP6-210ENST00000487548 GATA4P43694 442 aa7.44□□□□□ -1.22
SENP6-210ENST00000487548 ZMYM1Q5SVZ6 1142 aa7.44□□□□□ -1.22
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SENP6-210ENST00000487548 KRTAP4-8Q9BYQ9 185 aa7.44□□□□□ -1.22
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SENP6-210ENST00000487548 BRPF1P55201 1214 aaPredicted RBP7.43□□□□□ -1.22
SENP6-210ENST00000487548 IRF5Q13568 498 aa7.43□□□□□ -1.22
SENP6-210ENST00000487548 PSMG3-AS1Q96PY0 264 aa7.43□□□□□ -1.22
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SENP6-210ENST00000487548 ABL2P42684 1182 aa7.42□□□□□ -1.22
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SENP6-210ENST00000487548 FAM229AH3BQW9 127 aa7.41□□□□□ -1.22
SENP6-210ENST00000487548 ZNF468Q5VIY5 522 aaPredicted RBP7.41□□□□□ -1.22
SENP6-210ENST00000487548 ZIC5Q96T25 663 aa7.41□□□□□ -1.22
SENP6-210ENST00000487548 A6NJY4 79 aa7.4□□□□□ -1.22
SENP6-210ENST00000487548 SPATA31C1P0DKV0 1188 aa7.4□□□□□ -1.22
SENP6-210ENST00000487548 FAM182BQ5T319 152 aa7.4□□□□□ -1.22
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SENP6-210ENST00000487548 MARK1Q9P0L2 795 aa7.4□□□□□ -1.22
SENP6-210ENST00000487548 TMEM229AB2RXF0 380 aa7.39□□□□□ -1.23
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SENP6-210ENST00000487548 ELOA3DA6NLF2 546 aaPredicted RBP7.37□□□□□ -1.23
SENP6-210ENST00000487548 CDK2AP1O14519 115 aa7.37□□□□□ -1.23
SENP6-210ENST00000487548 APBA3O96018 575 aa7.37□□□□□ -1.23
SENP6-210ENST00000487548 SEMA3FQ13275 785 aa7.37□□□□□ -1.23
SENP6-210ENST00000487548 ELOA3BQ3SY89 546 aa7.37□□□□□ -1.23
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SENP6-210ENST00000487548 ZNF295-AS1Q8N0V1 137 aa7.37□□□□□ -1.23
SENP6-210ENST00000487548 ELOA3Q8NG57 546 aa7.37□□□□□ -1.23
SENP6-210ENST00000487548 ZDHHC3Q9NYG2 299 aa7.37□□□□□ -1.23
SENP6-210ENST00000487548 CHIC2Q9UKJ5 165 aa7.37□□□□□ -1.23
SENP6-210ENST00000487548 IQSEC3Q9UPP2 1182 aaPredicted RBP7.37□□□□□ -1.23
SENP6-210ENST00000487548 PIK3CDO00329 1044 aa7.36□□□□□ -1.23
SENP6-210ENST00000487548 RSPO4Q2I0M5 234 aaPredicted RBP7.36□□□□□ -1.23
SENP6-210ENST00000487548 MAP7D1Q3KQU3 841 aa7.36□□□□□ -1.23
SENP6-210ENST00000487548 C8orf86Q6ZUL3 223 aa7.36□□□□□ -1.23
SENP6-210ENST00000487548 NEUROD4Q9HD90 331 aa7.36□□□□□ -1.23
SENP6-210ENST00000487548 TPSG1Q9NRR2 321 aa7.36□□□□□ -1.23
SENP6-210ENST00000487548 ZNF232Q9UNY5 417 aa7.36□□□□□ -1.23
SENP6-210ENST00000487548 SPDYE3A6NKU9 549 aa7.35□□□□□ -1.23
SENP6-210ENST00000487548 M0R082 166 aa7.35□□□□□ -1.23
SENP6-210ENST00000487548 RAB44Q7Z6P3 723 aaPredicted RBP7.35□□□□□ -1.23
SENP6-210ENST00000487548 ZNF417Q8TAU3 575 aa7.35□□□□□ -1.23
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SENP6-210ENST00000487548 ZNF587Q96SQ5 575 aaPredicted RBP7.35□□□□□ -1.23
SENP6-210ENST00000487548 EFSO43281 561 aa7.34□□□□□ -1.23
SENP6-210ENST00000487548 MTFR1Q15390 333 aa7.34□□□□□ -1.23
SENP6-210ENST00000487548 FOXD4L6Q3SYB3 417 aaPredicted RBP7.34□□□□□ -1.23
SENP6-210ENST00000487548 FOXD4L3Q6VB84 417 aaPredicted RBP7.34□□□□□ -1.23
SENP6-210ENST00000487548 SERBP1Q8NC51 408 aaKnown RBP eCLIP7.34□□□□□ -1.23
SENP6-210ENST00000487548 ZDHHC1Q8WTX9 485 aa7.34□□□□□ -1.23
SENP6-210ENST00000487548 SFSWAPQ12872 951 aaKnown RBP7.33□□□□□ -1.24
SENP6-210ENST00000487548 GRIK4Q16099 956 aa7.33□□□□□ -1.24
SENP6-210ENST00000487548 SAMD5Q5TGI4 173 aa7.33□□□□□ -1.24
SENP6-210ENST00000487548 L3MBTL2Q969R5 705 aa7.33□□□□□ -1.24
SENP6-210ENST00000487548 SLC30A3Q99726 388 aa7.33□□□□□ -1.24
SENP6-210ENST00000487548 PCDHGA11Q9Y5H2 935 aa7.33□□□□□ -1.24
SENP6-210ENST00000487548 KRTAP9-1A8MXZ3 250 aaPredicted RBP7.32□□□□□ -1.24
SENP6-210ENST00000487548 BACH1O14867 736 aa7.32□□□□□ -1.24
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