RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000487547.1

USP34-216, Transcript of ubiquitin specific peptidase 34, humanhuman

TSL 3

Gene USP34, Length 612 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP34-216ENST00000487547 PHKA2P46019 1235 aa11.74□□□□□ -0.53
USP34-216ENST00000487547 TEAD4Q15561 434 aa11.74□□□□□ -0.53
USP34-216ENST00000487547 SLC9A9Q8IVB4 645 aa11.74□□□□□ -0.53
USP34-216ENST00000487547 ITGA6P23229 1130 aa11.73□□□□□ -0.53
USP34-216ENST00000487547 SWI5Q1ZZU3 235 aa11.73□□□□□ -0.53
USP34-216ENST00000487547 NBPF1Q3BBV0 1214 aa11.73□□□□□ -0.53
USP34-216ENST00000487547 PSMA6P60900 246 aaKnown RBP11.72□□□□□ -0.53
USP34-216ENST00000487547 ARID3AQ99856 593 aa11.72□□□□□ -0.53
USP34-216ENST00000487547 SERTM1A2A2V5 107 aa11.71□□□□□ -0.53
USP34-216ENST00000487547 PLA2G4AP47712 749 aa11.71□□□□□ -0.53
USP34-216ENST00000487547 STAG2Q8N3U4 1231 aa11.71□□□□□ -0.53
USP34-216ENST00000487547 NANOS1Q8WY41 292 aaKnown RBP11.71□□□□□ -0.53
USP34-216ENST00000487547 GAS2L1Q99501 681 aaPredicted RBP11.71□□□□□ -0.53
USP34-216ENST00000487547 ATAD2Q6PL18 1390 aa11.7□□□□□ -0.54
USP34-216ENST00000487547 CSB-PGBD3P0DP91 1061 aa11.7□□□□□ -0.54
USP34-216ENST00000487547 TATP17735 454 aaPredicted RBP11.7□□□□□ -0.54
USP34-216ENST00000487547 NOS2P35228 1153 aa11.7□□□□□ -0.54
USP34-216ENST00000487547 ZNF295-AS1Q8N0V1 137 aa11.7□□□□□ -0.54
USP34-216ENST00000487547 PGBD3Q8N328 593 aa11.7□□□□□ -0.54
USP34-216ENST00000487547 AIDAQ96BJ3 306 aa11.7□□□□□ -0.54
USP34-216ENST00000487547 TSPAN10Q9H1Z9 355 aaPredicted RBP11.7□□□□□ -0.54
USP34-216ENST00000487547 ZDHHC3Q9NYG2 299 aa11.7□□□□□ -0.54
USP34-216ENST00000487547 IGFBP4P22692 258 aa11.69□□□□□ -0.54
USP34-216ENST00000487547 LBRQ14739 615 aaKnown RBP11.69□□□□□ -0.54
USP34-216ENST00000487547 RIPOR1Q6ZS17 1223 aa11.69□□□□□ -0.54
USP34-216ENST00000487547 TRIM22Q8IYM9 498 aa11.69□□□□□ -0.54
USP34-216ENST00000487547 L3MBTL2Q969R5 705 aa11.69□□□□□ -0.54
USP34-216ENST00000487547 ZMIZ1Q9ULJ6 1067 aa11.69□□□□□ -0.54
USP34-216ENST00000487547 ZNF232Q9UNY5 417 aa11.69□□□□□ -0.54
USP34-216ENST00000487547 PPP1R12BO60237 982 aaPredicted RBP11.68□□□□□ -0.54
USP34-216ENST00000487547 MSX1P28360 303 aa11.68□□□□□ -0.54
USP34-216ENST00000487547 FOXR1Q6PIV2 292 aa11.68□□□□□ -0.54
USP34-216ENST00000487547 SCG3Q8WXD2 468 aaKnown RBP11.68□□□□□ -0.54
USP34-216ENST00000487547 STK17AQ9UEE5 414 aa11.68□□□□□ -0.54
USP34-216ENST00000487547 USP3Q9Y6I4 520 aa11.68□□□□□ -0.54
USP34-216ENST00000487547 HIRAP54198 1017 aaPredicted RBP11.67□□□□□ -0.54
USP34-216ENST00000487547 SV2AQ7L0J3 742 aa11.67□□□□□ -0.54
USP34-216ENST00000487547 LORP23490 312 aaPredicted RBP11.66□□□□□ -0.54
USP34-216ENST00000487547 TBCELQ5QJ74 424 aa11.66□□□□□ -0.54
USP34-216ENST00000487547 UTP3Q9NQZ2 479 aaKnown RBP eCLIP11.66□□□□□ -0.54
USP34-216ENST00000487547 GPC6Q9Y625 555 aaPredicted RBP11.66□□□□□ -0.54
USP34-216ENST00000487547 WEE1P30291 646 aa11.65□□□□□ -0.54
USP34-216ENST00000487547 PDE4CQ08493 712 aa11.65□□□□□ -0.54
USP34-216ENST00000487547 EFHC2Q5JST6 749 aa11.65□□□□□ -0.54
USP34-216ENST00000487547 C1orf53Q5VUE5 145 aa11.65□□□□□ -0.54
USP34-216ENST00000487547 POTEAQ6S8J7 498 aa11.65□□□□□ -0.54
USP34-216ENST00000487547 ZDHHC1Q8WTX9 485 aa11.65□□□□□ -0.54
USP34-216ENST00000487547 STK32AQ8WU08 396 aa11.65□□□□□ -0.54
USP34-216ENST00000487547 C21orf2O43822 256 aa11.64□□□□□ -0.55
USP34-216ENST00000487547 TMEM164Q5U3C3 297 aa11.64□□□□□ -0.55
USP34-216ENST00000487547 C2orf49Q9BVC5 232 aaPredicted RBP11.64□□□□□ -0.55
USP34-216ENST00000487547 CRISPLD1Q9H336 500 aa11.64□□□□□ -0.55
USP34-216ENST00000487547 PARP3Q9Y6F1 533 aa11.64□□□□□ -0.55
USP34-216ENST00000487547 EML1O00423 815 aa11.63□□□□□ -0.55
USP34-216ENST00000487547 FOXO3O43524 673 aa11.63□□□□□ -0.55
USP34-216ENST00000487547 FAM69CQ0P6D2 419 aa11.63□□□□□ -0.55
USP34-216ENST00000487547 VWA5B2Q8N398 1253 aa11.63□□□□□ -0.55
USP34-216ENST00000487547 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP11.63□□□□□ -0.55
USP34-216ENST00000487547 NUCKS1Q9H1E3 243 aaKnown RBP11.63□□□□□ -0.55
USP34-216ENST00000487547 GPAMQ9HCL2 828 aa11.63□□□□□ -0.55
USP34-216ENST00000487547 CDC14CA4D256 554 aa11.62□□□□□ -0.55
USP34-216ENST00000487547 DBN1Q16643 649 aa11.62□□□□□ -0.55
USP34-216ENST00000487547 ARSJQ5FYB0 599 aaPredicted RBP11.62□□□□□ -0.55
USP34-216ENST00000487547 NLRP8Q86W28 1048 aa11.62□□□□□ -0.55
USP34-216ENST00000487547 CLP1Q92989 425 aaKnown RBP11.62□□□□□ -0.55
USP34-216ENST00000487547 VTI1AQ96AJ9 217 aa11.62□□□□□ -0.55
USP34-216ENST00000487547 FIGNL1Q6PIW4 674 aa11.61□□□□□ -0.55
USP34-216ENST00000487547 TRERF1Q96PN7 1200 aa11.61□□□□□ -0.55
USP34-216ENST00000487547 NEUROD4Q9HD90 331 aa11.61□□□□□ -0.55
USP34-216ENST00000487547 ATP4AP20648 1035 aa11.6□□□□□ -0.55
USP34-216ENST00000487547 BICDL1Q6ZP65 573 aa11.6□□□□□ -0.55
USP34-216ENST00000487547 CUEDC1Q9NWM3 386 aaPredicted RBP11.6□□□□□ -0.55
USP34-216ENST00000487547 HIF1AQ16665 826 aa11.59□□□□□ -0.55
USP34-216ENST00000487547 ZSCAN1Q8NBB4 408 aa11.59□□□□□ -0.55
USP34-216ENST00000487547 ZNF837Q96EG3 531 aaPredicted RBP11.59□□□□□ -0.55
USP34-216ENST00000487547 RUBCNLQ9H714 662 aa11.59□□□□□ -0.55
USP34-216ENST00000487547 ANKIB1Q9P2G1 1089 aa11.59□□□□□ -0.55
USP34-216ENST00000487547 PHF24Q9UPV7 400 aa11.59□□□□□ -0.55
USP34-216ENST00000487547 USTQ9Y2C2 406 aa11.59□□□□□ -0.55
USP34-216ENST00000487547 HCN4Q9Y3Q4 1203 aa11.59□□□□□ -0.55
USP34-216ENST00000487547 GJA3Q9Y6H8 435 aa11.59□□□□□ -0.55
USP34-216ENST00000487547 TXLNAP40222 546 aa11.58□□□□□ -0.56
USP34-216ENST00000487547 A0A1W2PNR3 127 aa11.57□□□□□ -0.56
USP34-216ENST00000487547 LGR5O75473 907 aa11.57□□□□□ -0.56
USP34-216ENST00000487547 GPR161Q8N6U8 529 aaKnown RBP11.57□□□□□ -0.56
USP34-216ENST00000487547 RHPN1Q8TCX5 695 aa11.57□□□□□ -0.56
USP34-216ENST00000487547 PRIMPOLQ96LW4 560 aa11.57□□□□□ -0.56
USP34-216ENST00000487547 ZIC5Q96T25 663 aa11.57□□□□□ -0.56
USP34-216ENST00000487547 PHACTR1Q9C0D0 580 aa11.57□□□□□ -0.56
USP34-216ENST00000487547 PRMT3O60678 531 aa11.56□□□□□ -0.56
USP34-216ENST00000487547 ALDH16A1Q8IZ83 802 aa11.56□□□□□ -0.56
USP34-216ENST00000487547 COL26A1Q96A83 441 aa11.56□□□□□ -0.56
USP34-216ENST00000487547 CFHR5Q9BXR6 569 aa11.56□□□□□ -0.56
USP34-216ENST00000487547 OCLNQ16625 522 aa11.55□□□□□ -0.56
USP34-216ENST00000487547 GTPBP3Q969Y2 492 aaKnown RBP11.55□□□□□ -0.56
USP34-216ENST00000487547 CXXC1Q9P0U4 656 aaPredicted RBP11.55□□□□□ -0.56
USP34-216ENST00000487547 TMEM88BA6NKF7 163 aa11.54□□□□□ -0.56
USP34-216ENST00000487547 PTCD1O75127 700 aaKnown RBP11.54□□□□□ -0.56
USP34-216ENST00000487547 KRT76Q01546 638 aa11.54□□□□□ -0.56
USP34-216ENST00000487547 RTN1Q16799 776 aa11.54□□□□□ -0.56
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 74.6 ms