RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000481211.1

NISCH-208, Transcript of nischarin, humanhuman

TSL 2

Gene NISCH, Length 557 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NISCH-208ENST00000481211 CNTNAP4Q9C0A0 1308 aa16.7■□□□□ 0.26
NISCH-208ENST00000481211 CYP19A1P11511 503 aaPredicted RBP16.7■□□□□ 0.26
NISCH-208ENST00000481211 EIF2S2P20042 333 aaKnown RBP16.7■□□□□ 0.26
NISCH-208ENST00000481211 RC3H1Q5TC82 1133 aaKnown RBP16.7■□□□□ 0.26
NISCH-208ENST00000481211 DDX21Q9NR30 783 aaKnown RBP eCLIP16.7■□□□□ 0.26
NISCH-208ENST00000481211 SMC4Q9NTJ3 1288 aa16.7■□□□□ 0.26
NISCH-208ENST00000481211 HYPKQ9NX55 129 aa16.7■□□□□ 0.26
NISCH-208ENST00000481211 USP16Q9Y5T5 823 aa16.7■□□□□ 0.26
NISCH-208ENST00000481211 RREB1Q92766 1687 aa16.69■□□□□ 0.26
NISCH-208ENST00000481211 GOLGA6L2Q8N9W4 650 aaPredicted RBP16.69■□□□□ 0.26
NISCH-208ENST00000481211 SSH1Q8WYL5 1049 aa16.69■□□□□ 0.26
NISCH-208ENST00000481211 PRAMEF22A3QJZ6 481 aa16.68■□□□□ 0.26
NISCH-208ENST00000481211 ITPK1Q13572 414 aa16.68■□□□□ 0.26
NISCH-208ENST00000481211 TXNRD1Q16881 649 aa16.68■□□□□ 0.26
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NISCH-208ENST00000481211 PIAS4Q8N2W9 510 aaPredicted RBP16.67■□□□□ 0.26
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NISCH-208ENST00000481211 ARHGAP45Q92619 1136 aa16.67■□□□□ 0.26
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NISCH-208ENST00000481211 CHPF2Q9P2E5 772 aa16.67■□□□□ 0.26
NISCH-208ENST00000481211 TAF1LQ8IZX4 1826 aa16.67■□□□□ 0.26
NISCH-208ENST00000481211 PTPRCP08575 1304 aa16.67■□□□□ 0.26
NISCH-208ENST00000481211 SLC4A2P04920 1241 aa16.66■□□□□ 0.26
NISCH-208ENST00000481211 IL6STP40189 918 aaPredicted RBP16.66■□□□□ 0.26
NISCH-208ENST00000481211 CAMKK2Q96RR4 588 aa16.66■□□□□ 0.26
NISCH-208ENST00000481211 EP400Q96L91 3159 aa16.65■□□□□ 0.26
NISCH-208ENST00000481211 C4BP0C0L5 1744 aa16.65■□□□□ 0.26
NISCH-208ENST00000481211 MS4A1P11836 297 aa16.65■□□□□ 0.26
NISCH-208ENST00000481211 CRKLP46109 303 aaKnown RBP16.65■□□□□ 0.26
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NISCH-208ENST00000481211 LINC00116Q8NCU8 138 aa16.65■□□□□ 0.26
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NISCH-208ENST00000481211 RNF123Q5XPI4 1314 aa16.64■□□□□ 0.25
NISCH-208ENST00000481211 A0A087WZG4 1122 aa16.63■□□□□ 0.25
NISCH-208ENST00000481211 NBPF26B4DH59 902 aa16.63■□□□□ 0.25
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NISCH-208ENST00000481211 BCAR3O75815 825 aa16.63■□□□□ 0.25
NISCH-208ENST00000481211 A1BGP04217 495 aa16.63■□□□□ 0.25
NISCH-208ENST00000481211 NBPF14Q5TI25 921 aa16.63■□□□□ 0.25
NISCH-208ENST00000481211 NBPF10Q6P3W6 841 aaKnown RBP16.63■□□□□ 0.25
NISCH-208ENST00000481211 INTS5Q6P9B9 1019 aaKnown RBP16.63■□□□□ 0.25
NISCH-208ENST00000481211 PROM2Q8N271 834 aa16.63■□□□□ 0.25
NISCH-208ENST00000481211 NBPF15Q8N660 670 aa16.63■□□□□ 0.25
NISCH-208ENST00000481211 NECTIN2Q92692 538 aa16.63■□□□□ 0.25
NISCH-208ENST00000481211 MSH5O43196 834 aa16.62■□□□□ 0.25
NISCH-208ENST00000481211 FLIIQ13045 1269 aa16.62■□□□□ 0.25
NISCH-208ENST00000481211 ZKSCAN2Q63HK3 967 aa16.62■□□□□ 0.25
NISCH-208ENST00000481211 LRP10Q7Z4F1 713 aa16.62■□□□□ 0.25
NISCH-208ENST00000481211 UPF1Q92900 1129 aaKnown RBP eCLIP16.62■□□□□ 0.25
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NISCH-208ENST00000481211 BCL2L13Q9BXK5 485 aa16.62■□□□□ 0.25
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NISCH-208ENST00000481211 ZBTB1Q9Y2K1 713 aa16.62■□□□□ 0.25
NISCH-208ENST00000481211 RPS6KA4O75676 772 aa16.61■□□□□ 0.25
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NISCH-208ENST00000481211 MYL6BP14649 208 aa16.6■□□□□ 0.25
NISCH-208ENST00000481211 RRP1P56182 461 aaKnown RBP16.6■□□□□ 0.25
NISCH-208ENST00000481211 EZH2Q15910 746 aaKnown RBP16.6■□□□□ 0.25
NISCH-208ENST00000481211 ATF7IPQ6VMQ6 1270 aa16.6■□□□□ 0.25
NISCH-208ENST00000481211 FLAD1Q8NFF5 587 aa16.6■□□□□ 0.25
NISCH-208ENST00000481211 MYH14Q7Z406 1995 aaKnown RBP16.6■□□□□ 0.25
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NISCH-208ENST00000481211 SSFA2P28290 1259 aa16.59■□□□□ 0.25
NISCH-208ENST00000481211 FKBP5Q13451 457 aaPredicted RBP16.59■□□□□ 0.25
NISCH-208ENST00000481211 PDE3AQ14432 1141 aa16.59■□□□□ 0.25
NISCH-208ENST00000481211 PROSER3Q2NL68 480 aa16.59■□□□□ 0.25
NISCH-208ENST00000481211 KIF6Q6ZMV9 814 aa16.59■□□□□ 0.25
NISCH-208ENST00000481211 NOB1Q9ULX3 412 aaKnown RBP16.59■□□□□ 0.25
NISCH-208ENST00000481211 COL15A1P39059 1388 aa16.59■□□□□ 0.25
NISCH-208ENST00000481211 PXDNLA1KZ92 1463 aa16.59■□□□□ 0.25
NISCH-208ENST00000481211 GNPATO15228 680 aa16.58■□□□□ 0.24
NISCH-208ENST00000481211 KCNQ4P56696 695 aa16.58■□□□□ 0.24
NISCH-208ENST00000481211 COPS6Q7L5N1 327 aa16.58■□□□□ 0.24
NISCH-208ENST00000481211 PLBD2Q8NHP8 589 aa16.58■□□□□ 0.24
NISCH-208ENST00000481211 XAGE3Q8WTP9 111 aa16.58■□□□□ 0.24
NISCH-208ENST00000481211 FRAT1Q92837 279 aaPredicted RBP16.58■□□□□ 0.24
NISCH-208ENST00000481211 AKT1S1Q96B36 256 aa16.58■□□□□ 0.24
NISCH-208ENST00000481211 PHAXQ9H814 394 aaKnown RBP16.58■□□□□ 0.24
NISCH-208ENST00000481211 NUP188Q5SRE5 1749 aa16.58■□□□□ 0.24
NISCH-208ENST00000481211 IBTKQ9P2D0 1353 aaPredicted RBP16.57■□□□□ 0.24
NISCH-208ENST00000481211 ERVV-1B6SEH8 477 aa16.57■□□□□ 0.24
NISCH-208ENST00000481211 ANXA1P04083 346 aa16.57■□□□□ 0.24
NISCH-208ENST00000481211 KSR2Q6VAB6 950 aa16.57■□□□□ 0.24
NISCH-208ENST00000481211 ANKRD13DQ6ZTN6 518 aa16.57■□□□□ 0.24
NISCH-208ENST00000481211 G2E3Q7L622 706 aa16.57■□□□□ 0.24
NISCH-208ENST00000481211 DEFB132Q7Z7B7 95 aa16.57■□□□□ 0.24
NISCH-208ENST00000481211 SUPT16HQ9Y5B9 1047 aaKnown RBP16.57■□□□□ 0.24
NISCH-208ENST00000481211 UBR3Q6ZT12 1888 aa16.56■□□□□ 0.24
NISCH-208ENST00000481211 QSER1Q2KHR3 1735 aa16.56■□□□□ 0.24
NISCH-208ENST00000481211 TRIM27P14373 513 aa16.56■□□□□ 0.24
NISCH-208ENST00000481211 ILDR2Q71H61 639 aa16.56■□□□□ 0.24
NISCH-208ENST00000481211 FTSJ3Q8IY81 847 aaKnown RBP16.56■□□□□ 0.24
NISCH-208ENST00000481211 STK32BQ9NY57 414 aa16.56■□□□□ 0.24
NISCH-208ENST00000481211 ABCC4O15439 1325 aa16.55■□□□□ 0.24
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