RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000476204.5

HOXB-AS3-208, HOXB cluster antisense RNA 3, humanhuman

TSL 4

Gene HOXB-AS3, Length 539 nt, Biotype antisense RNA, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXB-AS3-208ENST00000476204 UBR2Q8IWV8 1755 aa25.13■■□□□ 1.61
HOXB-AS3-208ENST00000476204 ZNF521Q96K83 1311 aa25.12■■□□□ 1.61
HOXB-AS3-208ENST00000476204 GNPATO15228 680 aa25.12■■□□□ 1.61
HOXB-AS3-208ENST00000476204 TAF1LQ8IZX4 1826 aa25.11■■□□□ 1.61
HOXB-AS3-208ENST00000476204 PSDA5PKW4 1024 aaPredicted RBP25.1■■□□□ 1.61
HOXB-AS3-208ENST00000476204 A0A087WZG4 1122 aa25.09■■□□□ 1.61
HOXB-AS3-208ENST00000476204 RPL17-C18orf32A0A0A6YYL6 228 aaKnown RBP25.09■■□□□ 1.61
HOXB-AS3-208ENST00000476204 E9PSI1 815 aa25.09■■□□□ 1.61
HOXB-AS3-208ENST00000476204 IL6STP40189 918 aaPredicted RBP25.09■■□□□ 1.61
HOXB-AS3-208ENST00000476204 C5P01031 1676 aa25.09■■□□□ 1.61
HOXB-AS3-208ENST00000476204 CICQ96RK0 1608 aaPredicted RBP25.08■■□□□ 1.61
HOXB-AS3-208ENST00000476204 KDM3BQ7LBC6 1761 aa25.08■■□□□ 1.61
HOXB-AS3-208ENST00000476204 HNRNPUQ00839 825 aaKnown RBP eCLIP25.08■■□□□ 1.61
HOXB-AS3-208ENST00000476204 C4BP0C0L5 1744 aa25.08■■□□□ 1.61
HOXB-AS3-208ENST00000476204 ERBB4Q15303 1308 aa25.08■■□□□ 1.6
HOXB-AS3-208ENST00000476204 A1BGP04217 495 aa25.07■■□□□ 1.6
HOXB-AS3-208ENST00000476204 CANXP27824 592 aaKnown RBP25.07■■□□□ 1.6
HOXB-AS3-208ENST00000476204 DUSP27Q5VZP5 1158 aa25.07■■□□□ 1.6
HOXB-AS3-208ENST00000476204 COL23A1Q86Y22 540 aaPredicted RBP25.07■■□□□ 1.6
HOXB-AS3-208ENST00000476204 PNPLA7Q6ZV29 1317 aa25.07■■□□□ 1.6
HOXB-AS3-208ENST00000476204 PRAMEF22A3QJZ6 481 aa25.06■■□□□ 1.6
HOXB-AS3-208ENST00000476204 MSH5O43196 834 aa25.06■■□□□ 1.6
HOXB-AS3-208ENST00000476204 RFC4P35249 363 aa25.06■■□□□ 1.6
HOXB-AS3-208ENST00000476204 EIF5P55010 431 aaKnown RBP25.06■■□□□ 1.6
HOXB-AS3-208ENST00000476204 EIF2S2P20042 333 aaKnown RBP25.05■■□□□ 1.6
HOXB-AS3-208ENST00000476204 ARHGEF1Q92888 912 aaKnown RBP25.05■■□□□ 1.6
HOXB-AS3-208ENST00000476204 ZBTB1Q9Y2K1 713 aa25.05■■□□□ 1.6
HOXB-AS3-208ENST00000476204 SLFN5Q08AF3 891 aa25.04■■□□□ 1.6
HOXB-AS3-208ENST00000476204 TSR2Q969E8 191 aaKnown RBP25.04■■□□□ 1.6
HOXB-AS3-208ENST00000476204 PHF14O94880 888 aa25.03■■□□□ 1.6
HOXB-AS3-208ENST00000476204 MTFR1LQ9H019 292 aa25.03■■□□□ 1.6
HOXB-AS3-208ENST00000476204 TJP1Q07157 1748 aa25.03■■□□□ 1.6
HOXB-AS3-208ENST00000476204 ZPR1O75312 459 aa25.02■■□□□ 1.6
HOXB-AS3-208ENST00000476204 C8orf58Q8NAV2 365 aa25.02■■□□□ 1.6
HOXB-AS3-208ENST00000476204 COL5A3P25940 1745 aaPredicted RBP25.02■■□□□ 1.6
HOXB-AS3-208ENST00000476204 ELL2O00472 640 aaPredicted RBP25.01■■□□□ 1.59
HOXB-AS3-208ENST00000476204 HDGFL1Q5TGJ6 251 aa25.01■■□□□ 1.59
HOXB-AS3-208ENST00000476204 NLGN1Q8N2Q7 840 aa25.01■■□□□ 1.59
HOXB-AS3-208ENST00000476204 SPINK5Q9NQ38 1064 aaPredicted RBP25.01■■□□□ 1.59
HOXB-AS3-208ENST00000476204 FANCIQ9NVI1 1328 aa25.01■■□□□ 1.59
HOXB-AS3-208ENST00000476204 MYH14Q7Z406 1995 aaKnown RBP25■■□□□ 1.59
HOXB-AS3-208ENST00000476204 KRT24Q2M2I5 525 aa25■■□□□ 1.59
HOXB-AS3-208ENST00000476204 TWISTNBQ3B726 338 aaPredicted RBP25■■□□□ 1.59
HOXB-AS3-208ENST00000476204 CCDC30Q5VVM6 783 aa25■■□□□ 1.59
HOXB-AS3-208ENST00000476204 SPON1Q9HCB6 807 aa25■■□□□ 1.59
HOXB-AS3-208ENST00000476204 DDX21Q9NR30 783 aaKnown RBP eCLIP25■■□□□ 1.59
HOXB-AS3-208ENST00000476204 DBF4Q9UBU7 674 aaPredicted RBP25■■□□□ 1.59
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HOXB-AS3-208ENST00000476204 NBPF10Q6P3W6 841 aaKnown RBP24.99■■□□□ 1.59
HOXB-AS3-208ENST00000476204 TRMT2AQ8IZ69 625 aaKnown RBP24.99■■□□□ 1.59
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HOXB-AS3-208ENST00000476204 HYPKQ9NX55 129 aa24.96■■□□□ 1.59
HOXB-AS3-208ENST00000476204 COL15A1P39059 1388 aa24.95■■□□□ 1.59
HOXB-AS3-208ENST00000476204 ZBED9Q6R2W3 1325 aa24.95■■□□□ 1.58
HOXB-AS3-208ENST00000476204 PDIA6Q15084 440 aa24.95■■□□□ 1.58
HOXB-AS3-208ENST00000476204 SMIM5Q71RC9 77 aa24.95■■□□□ 1.58
HOXB-AS3-208ENST00000476204 TSPYL6Q8N831 410 aa24.95■■□□□ 1.58
HOXB-AS3-208ENST00000476204 ARXQ96QS3 562 aa24.95■■□□□ 1.58
HOXB-AS3-208ENST00000476204 ZNF330Q9Y3S2 320 aaPredicted RBP24.95■■□□□ 1.58
HOXB-AS3-208ENST00000476204 USP42Q9H9J4 1324 aaKnown RBP24.94■■□□□ 1.58
HOXB-AS3-208ENST00000476204 ZBTB7AO95365 584 aa24.94■■□□□ 1.58
HOXB-AS3-208ENST00000476204 MYL6BP14649 208 aa24.94■■□□□ 1.58
HOXB-AS3-208ENST00000476204 CLEC4GQ6UXB4 293 aa24.94■■□□□ 1.58
HOXB-AS3-208ENST00000476204 DZIP3Q86Y13 1208 aaKnown RBP24.94■■□□□ 1.58
HOXB-AS3-208ENST00000476204 ZNF428Q96B54 188 aa24.94■■□□□ 1.58
HOXB-AS3-208ENST00000476204 CDCA7LQ96GN5 454 aa24.94■■□□□ 1.58
HOXB-AS3-208ENST00000476204 STK31Q9BXU1 1019 aa24.94■■□□□ 1.58
HOXB-AS3-208ENST00000476204 POLD1P28340 1107 aa24.93■■□□□ 1.58
HOXB-AS3-208ENST00000476204 NECTIN2Q92692 538 aa24.93■■□□□ 1.58
HOXB-AS3-208ENST00000476204 TBC1D2BQ9UPU7 963 aa24.93■■□□□ 1.58
HOXB-AS3-208ENST00000476204 ATF5Q9Y2D1 282 aaPredicted RBP24.93■■□□□ 1.58
HOXB-AS3-208ENST00000476204 ERVV-1B6SEH8 477 aa24.92■■□□□ 1.58
HOXB-AS3-208ENST00000476204 CT47B1P0C2W7 299 aaPredicted RBP24.92■■□□□ 1.58
HOXB-AS3-208ENST00000476204 GYS1P13807 737 aa24.92■■□□□ 1.58
HOXB-AS3-208ENST00000476204 USPL1Q5W0Q7 1092 aa24.92■■□□□ 1.58
HOXB-AS3-208ENST00000476204 PIP4K2AP48426 406 aaPredicted RBP24.91■■□□□ 1.58
HOXB-AS3-208ENST00000476204 ZNF652Q9Y2D9 606 aa24.91■■□□□ 1.58
HOXB-AS3-208ENST00000476204 KIF6Q6ZMV9 814 aa24.9■■□□□ 1.58
HOXB-AS3-208ENST00000476204 CHPF2Q9P2E5 772 aa24.9■■□□□ 1.58
HOXB-AS3-208ENST00000476204 COPS6Q7L5N1 327 aa24.89■■□□□ 1.58
HOXB-AS3-208ENST00000476204 SRP68Q9UHB9 627 aaKnown RBP24.89■■□□□ 1.58
HOXB-AS3-208ENST00000476204 LAMB4A4D0S4 1761 aa24.89■■□□□ 1.57
HOXB-AS3-208ENST00000476204 CAMTA2O94983 1202 aa24.88■■□□□ 1.57
HOXB-AS3-208ENST00000476204 LRP10Q7Z4F1 713 aa24.88■■□□□ 1.57
HOXB-AS3-208ENST00000476204 CASZ1Q86V15 1759 aa24.87■■□□□ 1.57
HOXB-AS3-208ENST00000476204 TUBGCP6Q96RT7 1819 aa24.86■■□□□ 1.57
HOXB-AS3-208ENST00000476204 SLC4A2P04920 1241 aa24.86■■□□□ 1.57
HOXB-AS3-208ENST00000476204 TM4SF1P30408 202 aa24.86■■□□□ 1.57
HOXB-AS3-208ENST00000476204 MAP3K15Q6ZN16 1313 aa24.86■■□□□ 1.57
HOXB-AS3-208ENST00000476204 PTGER2P43116 358 aa24.85■■□□□ 1.57
HOXB-AS3-208ENST00000476204 AIMP1Q12904 312 aaKnown RBP24.85■■□□□ 1.57
HOXB-AS3-208ENST00000476204 FKBP8Q14318 412 aa24.85■■□□□ 1.57
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