RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000469389.5

SYP-204, Transcript of synaptophysin, humanhuman

TSL 4

Gene SYP, Length 581 nt, Biotype nonsense mediated decay.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYP-204ENST00000469389 HDGFL1Q5TGJ6 251 aa20.36■□□□□ 0.85
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SYP-204ENST00000469389 SMIM5Q71RC9 77 aa20.15■□□□□ 0.82
SYP-204ENST00000469389 SSH1Q8WYL5 1049 aa20.15■□□□□ 0.82
SYP-204ENST00000469389 BCL2L13Q9BXK5 485 aa20.15■□□□□ 0.82
SYP-204ENST00000469389 MAP3K15Q6ZN16 1313 aa20.15■□□□□ 0.82
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