RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000468018.5

ATG4B-215, Transcript of autophagy related 4B cysteine peptidase, humanhuman

TSL 5

Gene ATG4B, Length 721 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATG4B-215ENST00000468018 SCN7AQ01118 1682 aa20.07■□□□□ 0.8
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ATG4B-215ENST00000468018 COL15A1P39059 1388 aa20.06■□□□□ 0.8
ATG4B-215ENST00000468018 BCORQ6W2J9 1755 aa20.06■□□□□ 0.8
ATG4B-215ENST00000468018 NRXN2Q9P2S2 1712 aa20.05■□□□□ 0.8
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ATG4B-215ENST00000468018 STARD3NLO95772 234 aa20.05■□□□□ 0.8
ATG4B-215ENST00000468018 TMPOP42166 694 aaKnown RBP20.05■□□□□ 0.8
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ATG4B-215ENST00000468018 NLGN2Q8NFZ4 835 aa20.05■□□□□ 0.8
ATG4B-215ENST00000468018 CD2APQ9Y5K6 639 aa20.05■□□□□ 0.8
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ATG4B-215ENST00000468018 SRP68Q9UHB9 627 aaKnown RBP20.04■□□□□ 0.8
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ATG4B-215ENST00000468018 MMP10P09238 476 aa20.03■□□□□ 0.8
ATG4B-215ENST00000468018 WDR43Q15061 677 aaKnown RBP eCLIP20.03■□□□□ 0.8
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ATG4B-215ENST00000468018 N4BP2Q86UW6 1770 aaPredicted RBP20■□□□□ 0.79
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ATG4B-215ENST00000468018 A0A087WZG4 1122 aa19.96■□□□□ 0.79
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ATG4B-215ENST00000468018 NBPF15Q8N660 670 aa19.94■□□□□ 0.78
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ATG4B-215ENST00000468018 NUP98P52948 1817 aa19.92■□□□□ 0.78
ATG4B-215ENST00000468018 ANKRD31Q8N7Z5 1873 aa19.92■□□□□ 0.78
ATG4B-215ENST00000468018 CHL1O00533 1208 aa19.91■□□□□ 0.78
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ATG4B-215ENST00000468018 APAF1O14727 1248 aa19.9■□□□□ 0.78
ATG4B-215ENST00000468018 PIP4K2AP48426 406 aaPredicted RBP19.9■□□□□ 0.78
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ATG4B-215ENST00000468018 TBC1D9BQ66K14 1250 aa19.88■□□□□ 0.77
ATG4B-215ENST00000468018 DZIP3Q86Y13 1208 aaKnown RBP19.88■□□□□ 0.77
ATG4B-215ENST00000468018 ERBB4Q15303 1308 aa19.87■□□□□ 0.77
ATG4B-215ENST00000468018 ZNF853P0CG23 659 aa19.86■□□□□ 0.77
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ATG4B-215ENST00000468018 LRP10Q7Z4F1 713 aa19.86■□□□□ 0.77
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ATG4B-215ENST00000468018 ZNF330Q9Y3S2 320 aaPredicted RBP19.86■□□□□ 0.77
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ATG4B-215ENST00000468018 CARMIL3Q8ND23 1372 aa19.84■□□□□ 0.77
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ATG4B-215ENST00000468018 NPM2Q86SE8 214 aaKnown RBP19.84■□□□□ 0.77
ATG4B-215ENST00000468018 COL11A2P13942 1736 aaPredicted RBP19.84■□□□□ 0.77
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ATG4B-215ENST00000468018 PDIA6Q15084 440 aa19.83■□□□□ 0.77
ATG4B-215ENST00000468018 PELP1Q8IZL8 1130 aaKnown RBP19.83■□□□□ 0.77
ATG4B-215ENST00000468018 CCDC27Q2M243 656 aa19.82■□□□□ 0.76
ATG4B-215ENST00000468018 ANKRD36CQ5JPF3 1778 aa19.82■□□□□ 0.76
ATG4B-215ENST00000468018 HOXB7P09629 217 aa19.81■□□□□ 0.76
ATG4B-215ENST00000468018 KRT24Q2M2I5 525 aa19.81■□□□□ 0.76
ATG4B-215ENST00000468018 IFT57Q9NWB7 429 aa19.81■□□□□ 0.76
ATG4B-215ENST00000468018 ARFGEF2Q9Y6D5 1785 aa19.8■□□□□ 0.76
ATG4B-215ENST00000468018 ATP10DQ9P241 1426 aa19.8■□□□□ 0.76
ATG4B-215ENST00000468018 ERVV-1B6SEH8 477 aa19.8■□□□□ 0.76
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