RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000466097.1

SH3BP1-205, Transcript of SH3 domain binding protein 1, humanhuman

TSL 2

Gene SH3BP1, Length 777 nt, Biotype retained intron.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP1-205ENST00000466097 TMPOP42166 694 aaKnown RBP19.42■□□□□ 0.7
SH3BP1-205ENST00000466097 KLHL34Q8N239 644 aa19.42■□□□□ 0.7
SH3BP1-205ENST00000466097 SYT17Q9BSW7 474 aa19.42■□□□□ 0.7
SH3BP1-205ENST00000466097 KCNQ3O43525 872 aa19.41■□□□□ 0.7
SH3BP1-205ENST00000466097 LAMB4A4D0S4 1761 aa19.4■□□□□ 0.7
SH3BP1-205ENST00000466097 NLGN1Q8N2Q7 840 aa19.4■□□□□ 0.7
SH3BP1-205ENST00000466097 ZBTB1Q9Y2K1 713 aa19.4■□□□□ 0.7
SH3BP1-205ENST00000466097 SOS1Q07889 1333 aaPredicted RBP19.4■□□□□ 0.7
SH3BP1-205ENST00000466097 THUMPD2Q9BTF0 503 aaKnown RBP19.39■□□□□ 0.69
SH3BP1-205ENST00000466097 COL15A1P39059 1388 aa19.39■□□□□ 0.69
SH3BP1-205ENST00000466097 SNRPA1P09661 255 aaKnown RBP19.38■□□□□ 0.69
SH3BP1-205ENST00000466097 NEUROD2Q15784 382 aa19.38■□□□□ 0.69
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SH3BP1-205ENST00000466097 RRP7AQ9Y3A4 280 aaKnown RBP19.38■□□□□ 0.69
SH3BP1-205ENST00000466097 CHD4Q14839 1912 aa19.37■□□□□ 0.69
SH3BP1-205ENST00000466097 ZPR1O75312 459 aa19.37■□□□□ 0.69
SH3BP1-205ENST00000466097 GYS1P13807 737 aa19.37■□□□□ 0.69
SH3BP1-205ENST00000466097 CANXP27824 592 aaKnown RBP19.37■□□□□ 0.69
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SH3BP1-205ENST00000466097 MIS18AQ9NYP9 233 aa19.37■□□□□ 0.69
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SH3BP1-205ENST00000466097 A0A087WZG4 1122 aa19.35■□□□□ 0.69
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SH3BP1-205ENST00000466097 CCDC184Q52MB2 194 aa19.34■□□□□ 0.69
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SH3BP1-205ENST00000466097 TSPYL4Q9UJ04 414 aa19.34■□□□□ 0.69
SH3BP1-205ENST00000466097 CD2APQ9Y5K6 639 aa19.34■□□□□ 0.69
SH3BP1-205ENST00000466097 KIF13BQ9NQT8 1826 aa19.34■□□□□ 0.69
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SH3BP1-205ENST00000466097 PARP3Q9Y6F1 533 aa19.32■□□□□ 0.68
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SH3BP1-205ENST00000466097 APAF1O14727 1248 aa19.31■□□□□ 0.68
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SH3BP1-205ENST00000466097 USPL1Q5W0Q7 1092 aa19.31■□□□□ 0.68
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SH3BP1-205ENST00000466097 BCORQ6W2J9 1755 aa19.31■□□□□ 0.68
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SH3BP1-205ENST00000466097 C10orf71Q711Q0 1435 aa19.26■□□□□ 0.67
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SH3BP1-205ENST00000466097 TBC1D2BQ9UPU7 963 aa19.26■□□□□ 0.67
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SH3BP1-205ENST00000466097 PELP1Q8IZL8 1130 aaKnown RBP19.25■□□□□ 0.67
SH3BP1-205ENST00000466097 NRXN2Q9P2S2 1712 aa19.25■□□□□ 0.67
SH3BP1-205ENST00000466097 POLRMTO00411 1230 aaKnown RBP19.24■□□□□ 0.67
SH3BP1-205ENST00000466097 NFIXQ14938 502 aa19.24■□□□□ 0.67
SH3BP1-205ENST00000466097 BCL2L12Q9HB09 334 aa19.24■□□□□ 0.67
SH3BP1-205ENST00000466097 KIAA1551Q9HCM1 1747 aa19.24■□□□□ 0.67
SH3BP1-205ENST00000466097 NBPF26B4DH59 902 aa19.23■□□□□ 0.67
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SH3BP1-205ENST00000466097 NBPF15Q8N660 670 aa19.23■□□□□ 0.67
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SH3BP1-205ENST00000466097 ERBB4Q15303 1308 aa19.23■□□□□ 0.67
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SH3BP1-205ENST00000466097 ZNF652Q9Y2D9 606 aa19.22■□□□□ 0.67
SH3BP1-205ENST00000466097 NUP98P52948 1817 aa19.22■□□□□ 0.67
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SH3BP1-205ENST00000466097 GNAI1P63096 354 aa19.21■□□□□ 0.67
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SH3BP1-205ENST00000466097 PXDNLA1KZ92 1463 aa19.21■□□□□ 0.67
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SH3BP1-205ENST00000466097 TBC1D9BQ66K14 1250 aa19.2■□□□□ 0.66
SH3BP1-205ENST00000466097 ZNF784Q8NCA9 323 aaPredicted RBP19.2■□□□□ 0.66
SH3BP1-205ENST00000466097 CARMIL3Q8ND23 1372 aa19.19■□□□□ 0.66
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SH3BP1-205ENST00000466097 MYL6BP14649 208 aa19.18■□□□□ 0.66
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SH3BP1-205ENST00000466097 KIF6Q6ZMV9 814 aa19.18■□□□□ 0.66
SH3BP1-205ENST00000466097 FAM9BQ8IZU0 186 aa19.18■□□□□ 0.66
SH3BP1-205ENST00000466097 NGEFQ8N5V2 710 aa19.18■□□□□ 0.66
SH3BP1-205ENST00000466097 SETDB2Q96T68 719 aa19.18■□□□□ 0.66
SH3BP1-205ENST00000466097 MBIPQ9NS73 344 aa19.18■□□□□ 0.66
SH3BP1-205ENST00000466097 HOXB7P09629 217 aa19.17■□□□□ 0.66
SH3BP1-205ENST00000466097 ZNF853P0CG23 659 aa19.17■□□□□ 0.66
SH3BP1-205ENST00000466097 ARFGEF1Q9Y6D6 1849 aa19.16■□□□□ 0.66
SH3BP1-205ENST00000466097 NPHP1O15259 732 aa19.16■□□□□ 0.66
SH3BP1-205ENST00000466097 YBX3P16989 372 aaKnown RBP eCLIP19.16■□□□□ 0.66
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