RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000466015.1

EHD1-208, Transcript of EH domain containing 1, humanhuman

TSL 2

Gene EHD1, Length 1,290 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EHD1-208ENST00000466015 COL24A1Q17RW2 1714 aa25.01■■□□□ 1.59
EHD1-208ENST00000466015 RIPK4P57078 832 aa25.01■■□□□ 1.59
EHD1-208ENST00000466015 PNISRQ8TF01 805 aaKnown RBP25.01■■□□□ 1.59
EHD1-208ENST00000466015 CICQ96RK0 1608 aaPredicted RBP25.01■■□□□ 1.59
EHD1-208ENST00000466015 VIRMAQ69YN4 1812 aaKnown RBP25■■□□□ 1.59
EHD1-208ENST00000466015 ZNF330Q9Y3S2 320 aaPredicted RBP25■■□□□ 1.59
EHD1-208ENST00000466015 PARP3Q9Y6F1 533 aa25■■□□□ 1.59
EHD1-208ENST00000466015 USP42Q9H9J4 1324 aaKnown RBP25■■□□□ 1.59
EHD1-208ENST00000466015 SNRPA1P09661 255 aaKnown RBP24.99■■□□□ 1.59
EHD1-208ENST00000466015 LMOD3Q0VAK6 560 aa24.99■■□□□ 1.59
EHD1-208ENST00000466015 THUMPD2Q9BTF0 503 aaKnown RBP24.99■■□□□ 1.59
EHD1-208ENST00000466015 MIS18AQ9NYP9 233 aa24.99■■□□□ 1.59
EHD1-208ENST00000466015 COL15A1P39059 1388 aa24.98■■□□□ 1.59
EHD1-208ENST00000466015 RUNDC1Q96C34 613 aa24.98■■□□□ 1.59
EHD1-208ENST00000466015 ADAMTS8Q9UP79 889 aa24.98■■□□□ 1.59
EHD1-208ENST00000466015 A0A087WZG4 1122 aa24.97■■□□□ 1.59
EHD1-208ENST00000466015 NEUROD2Q15784 382 aa24.97■■□□□ 1.59
EHD1-208ENST00000466015 UBR2Q8IWV8 1755 aa24.96■■□□□ 1.59
EHD1-208ENST00000466015 ANP32CO43423 234 aa24.96■■□□□ 1.59
EHD1-208ENST00000466015 TMPOP42166 694 aaKnown RBP24.96■■□□□ 1.59
EHD1-208ENST00000466015 FKBP8Q14318 412 aa24.96■■□□□ 1.59
EHD1-208ENST00000466015 USPL1Q5W0Q7 1092 aa24.96■■□□□ 1.59
EHD1-208ENST00000466015 NARFQ9UHQ1 456 aa24.96■■□□□ 1.59
EHD1-208ENST00000466015 RRP7AQ9Y3A4 280 aaKnown RBP24.96■■□□□ 1.59
EHD1-208ENST00000466015 SIPA1L3O60292 1781 aaPredicted RBP24.95■■□□□ 1.59
EHD1-208ENST00000466015 MYH14Q7Z406 1995 aaKnown RBP24.94■■□□□ 1.58
EHD1-208ENST00000466015 A1BGP04217 495 aa24.94■■□□□ 1.58
EHD1-208ENST00000466015 IL6STP40189 918 aaPredicted RBP24.93■■□□□ 1.58
EHD1-208ENST00000466015 EIF5P55010 431 aaKnown RBP24.93■■□□□ 1.58
EHD1-208ENST00000466015 USP16Q9Y5T5 823 aa24.93■■□□□ 1.58
EHD1-208ENST00000466015 YY1P25490 414 aa24.92■■□□□ 1.58
EHD1-208ENST00000466015 PRAMEF22A3QJZ6 481 aa24.91■■□□□ 1.58
EHD1-208ENST00000466015 TSPYL4Q9UJ04 414 aa24.91■■□□□ 1.58
EHD1-208ENST00000466015 C4AP0C0L4 1744 aa24.89■■□□□ 1.58
EHD1-208ENST00000466015 GRIN3BO60391 1043 aa24.88■■□□□ 1.57
EHD1-208ENST00000466015 TBC1D2BQ9UPU7 963 aa24.88■■□□□ 1.57
EHD1-208ENST00000466015 PIP4K2AP48426 406 aaPredicted RBP24.87■■□□□ 1.57
EHD1-208ENST00000466015 EIF4A1P60842 406 aaKnown RBP24.87■■□□□ 1.57
EHD1-208ENST00000466015 DDR1Q08345 913 aa24.87■■□□□ 1.57
EHD1-208ENST00000466015 TM4SF1P30408 202 aa24.86■■□□□ 1.57
EHD1-208ENST00000466015 TGFB2P61812 414 aa24.86■■□□□ 1.57
EHD1-208ENST00000466015 WWC3Q9ULE0 1092 aa24.86■■□□□ 1.57
EHD1-208ENST00000466015 NFIXQ14938 502 aa24.85■■□□□ 1.57
EHD1-208ENST00000466015 BICDL1Q6ZP65 573 aa24.85■■□□□ 1.57
EHD1-208ENST00000466015 DZIP3Q86Y13 1208 aaKnown RBP24.85■■□□□ 1.57
EHD1-208ENST00000466015 BABAM1Q9NWV8 329 aa24.85■■□□□ 1.57
EHD1-208ENST00000466015 LAS1LQ9Y4W2 734 aaKnown RBP24.85■■□□□ 1.57
EHD1-208ENST00000466015 POLRMTO00411 1230 aaKnown RBP24.84■■□□□ 1.57
EHD1-208ENST00000466015 GIGYF1O75420 1035 aaPredicted RBP24.84■■□□□ 1.57
EHD1-208ENST00000466015 YBX3P16989 372 aaKnown RBP eCLIP24.84■■□□□ 1.57
EHD1-208ENST00000466015 BCL2L12Q9HB09 334 aa24.84■■□□□ 1.57
EHD1-208ENST00000466015 MRS2Q9HD23 443 aa24.84■■□□□ 1.57
EHD1-208ENST00000466015 C10orf71Q711Q0 1435 aa24.84■■□□□ 1.57
EHD1-208ENST00000466015 DLG5Q8TDM6 1919 aa24.84■■□□□ 1.57
EHD1-208ENST00000466015 A0A0G2JLW4 131 aa24.82■■□□□ 1.56
EHD1-208ENST00000466015 APAF1O14727 1248 aa24.82■■□□□ 1.56
EHD1-208ENST00000466015 TRIM35Q9UPQ4 493 aa24.82■■□□□ 1.56
EHD1-208ENST00000466015 CCDC184Q52MB2 194 aa24.81■■□□□ 1.56
EHD1-208ENST00000466015 ZNF652Q9Y2D9 606 aa24.81■■□□□ 1.56
EHD1-208ENST00000466015 NPHP1O15259 732 aa24.8■■□□□ 1.56
EHD1-208ENST00000466015 SERPINB2P05120 415 aa24.8■■□□□ 1.56
EHD1-208ENST00000466015 NBPF26B4DH59 902 aa24.79■■□□□ 1.56
EHD1-208ENST00000466015 CAMTA2O94983 1202 aa24.79■■□□□ 1.56
EHD1-208ENST00000466015 DPEP1P16444 411 aa24.79■■□□□ 1.56
EHD1-208ENST00000466015 TBC1D9BQ66K14 1250 aa24.79■■□□□ 1.56
EHD1-208ENST00000466015 NBPF10Q6P3W6 841 aaKnown RBP24.79■■□□□ 1.56
EHD1-208ENST00000466015 NGEFQ8N5V2 710 aa24.79■■□□□ 1.56
EHD1-208ENST00000466015 NBPF15Q8N660 670 aa24.79■■□□□ 1.56
EHD1-208ENST00000466015 PXDNLA1KZ92 1463 aa24.78■■□□□ 1.56
EHD1-208ENST00000466015 SETDB2Q96T68 719 aa24.78■■□□□ 1.56
EHD1-208ENST00000466015 CALD1Q05682 793 aaKnown RBP24.77■■□□□ 1.56
EHD1-208ENST00000466015 BCS1LQ9Y276 419 aa24.77■■□□□ 1.56
EHD1-208ENST00000466015 KDM3BQ7LBC6 1761 aa24.76■■□□□ 1.55
EHD1-208ENST00000466015 MYL6BP14649 208 aa24.76■■□□□ 1.55
EHD1-208ENST00000466015 EIF2S2P20042 333 aaKnown RBP24.76■■□□□ 1.55
EHD1-208ENST00000466015 CHL1O00533 1208 aa24.75■■□□□ 1.55
EHD1-208ENST00000466015 CARMIL3Q8ND23 1372 aa24.75■■□□□ 1.55
EHD1-208ENST00000466015 CLEC4GQ6UXB4 293 aa24.74■■□□□ 1.55
EHD1-208ENST00000466015 KIF6Q6ZMV9 814 aa24.74■■□□□ 1.55
EHD1-208ENST00000466015 PIM2Q9P1W9 311 aa24.74■■□□□ 1.55
EHD1-208ENST00000466015 ERBB4Q15303 1308 aa24.73■■□□□ 1.55
EHD1-208ENST00000466015 CFAP44Q96MT7 982 aa24.73■■□□□ 1.55
EHD1-208ENST00000466015 UTRNP46939 3433 aa24.72■■□□□ 1.55
EHD1-208ENST00000466015 CHRNA5P30532 468 aa24.72■■□□□ 1.55
EHD1-208ENST00000466015 DALRD3Q5D0E6 543 aaKnown RBP24.71■■□□□ 1.55
EHD1-208ENST00000466015 CNBD1Q8NA66 436 aa24.71■■□□□ 1.55
EHD1-208ENST00000466015 SCN7AQ01118 1682 aa24.7■■□□□ 1.54
EHD1-208ENST00000466015 ST5P78524 1137 aa24.7■■□□□ 1.54
EHD1-208ENST00000466015 NBPF5PQ86XG9 351 aaPredicted RBP24.7■■□□□ 1.54
EHD1-208ENST00000466015 NECTIN2Q92692 538 aa24.7■■□□□ 1.54
EHD1-208ENST00000466015 NIP7Q9Y221 180 aaKnown RBP eCLIP24.7■■□□□ 1.54
EHD1-208ENST00000466015 RGL2O15211 777 aa24.69■■□□□ 1.54
EHD1-208ENST00000466015 GNAI1P63096 354 aa24.69■■□□□ 1.54
EHD1-208ENST00000466015 C2CD5Q86YS7 1000 aa24.69■■□□□ 1.54
EHD1-208ENST00000466015 LAMB4A4D0S4 1761 aa24.69■■□□□ 1.54
EHD1-208ENST00000466015 H0YIN7 160 aa24.68■■□□□ 1.54
EHD1-208ENST00000466015 PRR5LQ6MZQ0 368 aa24.68■■□□□ 1.54
EHD1-208ENST00000466015 IFT57Q9NWB7 429 aa24.68■■□□□ 1.54
EHD1-208ENST00000466015 GOLGB1Q14789 3259 aaKnown RBP24.68■■□□□ 1.54
EHD1-208ENST00000466015 KIF13BQ9NQT8 1826 aa24.68■■□□□ 1.54
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