RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000465525.6

PTPRU-206, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type U, humanhuman

TSL 2

Gene PTPRU, Length 1,650 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRU-206ENST00000465525 TNS1Q9HBL0 1735 aaKnown RBP22.05■■□□□ 1.12
PTPRU-206ENST00000465525 CACNA1FO60840 1977 aa22.05■■□□□ 1.12
PTPRU-206ENST00000465525 SLC4A2P04920 1241 aa22.05■■□□□ 1.12
PTPRU-206ENST00000465525 STK31Q9BXU1 1019 aa22.05■■□□□ 1.12
PTPRU-206ENST00000465525 LY75O60449 1722 aa22.05■■□□□ 1.12
PTPRU-206ENST00000465525 RNF123Q5XPI4 1314 aa22.05■■□□□ 1.12
PTPRU-206ENST00000465525 CANXP27824 592 aaKnown RBP22.04■■□□□ 1.12
PTPRU-206ENST00000465525 UPF1Q92900 1129 aaKnown RBP eCLIP22.04■■□□□ 1.121e-7■■■■■ 45.9
PTPRU-206ENST00000465525 NOB1Q9ULX3 412 aaKnown RBP22.04■■□□□ 1.12
PTPRU-206ENST00000465525 TNNQ9UQP3 1299 aa22.04■■□□□ 1.12
PTPRU-206ENST00000465525 ATP6V1AP38606 617 aa22.04■■□□□ 1.12
PTPRU-206ENST00000465525 BAG6P46379 1132 aa22.04■■□□□ 1.12
PTPRU-206ENST00000465525 PROSER3Q2NL68 480 aa22.04■■□□□ 1.12
PTPRU-206ENST00000465525 G2E3Q7L622 706 aa22.04■■□□□ 1.12
PTPRU-206ENST00000465525 TEX13AQ9BXU3 409 aaPredicted RBP22.04■■□□□ 1.12
PTPRU-206ENST00000465525 SLC27A3Q5K4L6 730 aa22.03■■□□□ 1.12
PTPRU-206ENST00000465525 CCNL1Q9UK58 526 aaPredicted RBP22.03■■□□□ 1.12
PTPRU-206ENST00000465525 ITPK1Q13572 414 aa22.02■■□□□ 1.12
PTPRU-206ENST00000465525 A1BGP04217 495 aa22.01■■□□□ 1.11
PTPRU-206ENST00000465525 MYL6BP14649 208 aa22.01■■□□□ 1.11
PTPRU-206ENST00000465525 HMGB2P26583 209 aaKnown RBP22.01■■□□□ 1.11
PTPRU-206ENST00000465525 TXNRD1Q16881 649 aa22.01■■□□□ 1.11
PTPRU-206ENST00000465525 C20orf194Q5TEA3 1177 aa22.01■■□□□ 1.11
PTPRU-206ENST00000465525 EN1Q05925 392 aaPredicted RBP22.01■■□□□ 1.11
PTPRU-206ENST00000465525 PROM2Q8N271 834 aa22.01■■□□□ 1.11
PTPRU-206ENST00000465525 CAMKK2Q96RR4 588 aa22.01■■□□□ 1.11
PTPRU-206ENST00000465525 PHAXQ9H814 394 aaKnown RBP22.01■■□□□ 1.11
PTPRU-206ENST00000465525 COL5A3P25940 1745 aaPredicted RBP22■■□□□ 1.11
PTPRU-206ENST00000465525 KIF16BQ96L93 1317 aa22■■□□□ 1.11
PTPRU-206ENST00000465525 PDIA6Q15084 440 aa22■■□□□ 1.11
PTPRU-206ENST00000465525 CHMP4AQ9BY43 222 aa22■■□□□ 1.11
PTPRU-206ENST00000465525 DBF4Q9UBU7 674 aaPredicted RBP22■■□□□ 1.11
PTPRU-206ENST00000465525 CICQ96RK0 1608 aaPredicted RBP22■■□□□ 1.11
PTPRU-206ENST00000465525 ZNF831Q5JPB2 1677 aa21.99■■□□□ 1.11
PTPRU-206ENST00000465525 GOLGA6L2Q8N9W4 650 aaPredicted RBP21.99■■□□□ 1.11
PTPRU-206ENST00000465525 CLUAP1Q96AJ1 413 aa21.99■■□□□ 1.11
PTPRU-206ENST00000465525 TAF1LQ8IZX4 1826 aa21.98■■□□□ 1.11
PTPRU-206ENST00000465525 NBPF26B4DH59 902 aa21.98■■□□□ 1.11
PTPRU-206ENST00000465525 STARD3NLO95772 234 aa21.98■■□□□ 1.11
PTPRU-206ENST00000465525 CYP19A1P11511 503 aaPredicted RBP21.98■■□□□ 1.11
PTPRU-206ENST00000465525 BRPF1P55201 1214 aaPredicted RBP21.98■■□□□ 1.11
PTPRU-206ENST00000465525 NBPF14Q5TI25 921 aa21.98■■□□□ 1.11
PTPRU-206ENST00000465525 ZKSCAN2Q63HK3 967 aa21.98■■□□□ 1.11
PTPRU-206ENST00000465525 NBPF10Q6P3W6 841 aaKnown RBP21.98■■□□□ 1.11
PTPRU-206ENST00000465525 DEFB132Q7Z7B7 95 aa21.98■■□□□ 1.11
PTPRU-206ENST00000465525 NBPF15Q8N660 670 aa21.98■■□□□ 1.11
PTPRU-206ENST00000465525 LRRC4BQ9NT99 713 aa21.98■■□□□ 1.11
PTPRU-206ENST00000465525 EZH2Q15910 746 aaKnown RBP21.98■■□□□ 1.11
PTPRU-206ENST00000465525 DDX21Q9NR30 783 aaKnown RBP eCLIP21.98■■□□□ 1.11
PTPRU-206ENST00000465525 RGPD3A6NKT7 1758 aaPredicted RBP21.97■■□□□ 1.11
PTPRU-206ENST00000465525 RGPD4Q7Z3J3 1758 aa21.97■■□□□ 1.11
PTPRU-206ENST00000465525 MYH14Q7Z406 1995 aaKnown RBP21.97■■□□□ 1.11
PTPRU-206ENST00000465525 TRIM27P14373 513 aa21.97■■□□□ 1.11
PTPRU-206ENST00000465525 FLIIQ13045 1269 aa21.96■■□□□ 1.11
PTPRU-206ENST00000465525 LINC00116Q8NCU8 138 aa21.96■■□□□ 1.11
PTPRU-206ENST00000465525 PANK1Q8TE04 598 aa21.96■■□□□ 1.11
PTPRU-206ENST00000465525 NEFLP07196 543 aa21.95■■□□□ 1.1
PTPRU-206ENST00000465525 AIMP1Q12904 312 aaKnown RBP21.95■■□□□ 1.1
PTPRU-206ENST00000465525 ATF7IPQ6VMQ6 1270 aa21.95■■□□□ 1.1
PTPRU-206ENST00000465525 ZNF330Q9Y3S2 320 aaPredicted RBP21.95■■□□□ 1.1
PTPRU-206ENST00000465525 IPO8O15397 1037 aaKnown RBP21.95■■□□□ 1.1
PTPRU-206ENST00000465525 RLBP1P12271 317 aa21.95■■□□□ 1.1
PTPRU-206ENST00000465525 HYPKQ9NX55 129 aa21.95■■□□□ 1.1
PTPRU-206ENST00000465525 CRKLP46109 303 aaKnown RBP21.94■■□□□ 1.1
PTPRU-206ENST00000465525 FKBP5Q13451 457 aaPredicted RBP21.94■■□□□ 1.1
PTPRU-206ENST00000465525 ZBTB1Q9Y2K1 713 aa21.94■■□□□ 1.1
PTPRU-206ENST00000465525 RREB1Q92766 1687 aa21.93■■□□□ 1.1
PTPRU-206ENST00000465525 F6X3S4 739 aa21.93■■□□□ 1.1
PTPRU-206ENST00000465525 FKBP8Q14318 412 aa21.93■■□□□ 1.1
PTPRU-206ENST00000465525 LRP10Q7Z4F1 713 aa21.93■■□□□ 1.1
PTPRU-206ENST00000465525 XAGE3Q8WTP9 111 aa21.93■■□□□ 1.1
PTPRU-206ENST00000465525 ERBB4Q15303 1308 aa21.92■■□□□ 1.1
PTPRU-206ENST00000465525 RC3H1Q5TC82 1133 aaKnown RBP21.92■■□□□ 1.1
PTPRU-206ENST00000465525 INTS5Q6P9B9 1019 aaKnown RBP21.92■■□□□ 1.1
PTPRU-206ENST00000465525 CCDC87Q9NVE4 849 aa21.92■■□□□ 1.1
PTPRU-206ENST00000465525 PTPRCP08575 1304 aa21.92■■□□□ 1.1
PTPRU-206ENST00000465525 DZIP1LQ8IYY4 767 aaKnown RBP21.91■■□□□ 1.1
PTPRU-206ENST00000465525 CNTNAP4Q9C0A0 1308 aa21.91■■□□□ 1.1
PTPRU-206ENST00000465525 COPS6Q7L5N1 327 aa21.91■■□□□ 1.1
PTPRU-206ENST00000465525 FTSJ3Q8IY81 847 aaKnown RBP21.91■■□□□ 1.1
PTPRU-206ENST00000465525 ARHGAP45Q92619 1136 aa21.91■■□□□ 1.1
PTPRU-206ENST00000465525 CRBNQ96SW2 442 aa21.91■■□□□ 1.1
PTPRU-206ENST00000465525 API5Q9BZZ5 524 aaKnown RBP21.91■■□□□ 1.1
PTPRU-206ENST00000465525 C4BP0C0L5 1744 aa21.9■■□□□ 1.1
PTPRU-206ENST00000465525 COG6Q9Y2V7 657 aa21.89■■□□□ 1.1
PTPRU-206ENST00000465525 PDE3AQ14432 1141 aa21.88■■□□□ 1.09
PTPRU-206ENST00000465525 TTLL7Q6ZT98 887 aa21.88■■□□□ 1.09
PTPRU-206ENST00000465525 SMIM5Q71RC9 77 aa21.88■■□□□ 1.09
PTPRU-206ENST00000465525 ARFGEF2Q9Y6D5 1785 aa21.88■■□□□ 1.09
PTPRU-206ENST00000465525 ADCY9O60503 1353 aa21.88■■□□□ 1.09
PTPRU-206ENST00000465525 SLC4A10Q6U841 1118 aa21.88■■□□□ 1.09
PTPRU-206ENST00000465525 TMEM57Q8N5G2 664 aa21.88■■□□□ 1.09
PTPRU-206ENST00000465525 ARXQ96QS3 562 aa21.88■■□□□ 1.09
PTPRU-206ENST00000465525 ABCC4O15439 1325 aa21.87■■□□□ 1.09
PTPRU-206ENST00000465525 PI4KAP2A4QPH2 592 aa21.87■■□□□ 1.09
PTPRU-206ENST00000465525 PI4KAP1Q8N8J0 262 aa21.87■■□□□ 1.09
PTPRU-206ENST00000465525 EXOC6Q8TAG9 804 aa21.87■■□□□ 1.09
PTPRU-206ENST00000465525 AK7Q96M32 723 aa21.87■■□□□ 1.09
PTPRU-206ENST00000465525 GTF3C3Q9Y5Q9 886 aa21.87■■□□□ 1.09
PTPRU-206ENST00000465525 NUP188Q5SRE5 1749 aa21.86■■□□□ 1.09
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