RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000464936.5

CEP170-209, Transcript of centrosomal protein 170, human

TSL 5

Gene CEP170, Length 741 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
CEP170-209	ENST00000464936	SPAG9	O60271	1321 aa	Known RBP	7.29	□□□□□ -1.24
CEP170-209	ENST00000464936	VSIG8	P0DPA2	414 aa		7.29	□□□□□ -1.24
CEP170-209	ENST00000464936	CNTNAP3B	Q96NU0	1288 aa		7.29	□□□□□ -1.24
CEP170-209	ENST00000464936	CNTNAP3	Q9BZ76	1288 aa		7.29	□□□□□ -1.24
CEP170-209	ENST00000464936	CYLD	Q9NQC7	956 aa		7.29	□□□□□ -1.24
CEP170-209	ENST00000464936	LRRIQ1	Q96JM4	1722 aa		7.29	□□□□□ -1.24
CEP170-209	ENST00000464936	PLA2R1	Q13018	1463 aa		7.29	□□□□□ -1.24
CEP170-209	ENST00000464936	TMEM259	Q4ZIN3	620 aa		7.28	□□□□□ -1.24
CEP170-209	ENST00000464936	GGT6	Q6P531	493 aa		7.28	□□□□□ -1.24
CEP170-209	ENST00000464936	GPR161	Q8N6U8	529 aa	Known RBP	7.28	□□□□□ -1.24
CEP170-209	ENST00000464936	ABCC1	P33527	1531 aa		7.27	□□□□□ -1.25
CEP170-209	ENST00000464936	ADD1	P35611	737 aa	Known RBP	7.27	□□□□□ -1.25
CEP170-209	ENST00000464936	VWA5B2	Q8N398	1253 aa		7.27	□□□□□ -1.25
CEP170-209	ENST00000464936	TRIM34	Q9BYJ4	488 aa		7.27	□□□□□ -1.25
CEP170-209	ENST00000464936	TCOF1	Q13428	1488 aa	Known RBP	7.27	□□□□□ -1.25
CEP170-209	ENST00000464936	MROH2A	A6NES4	1674 aa		7.26	□□□□□ -1.25
CEP170-209	ENST00000464936	CEP170B	Q9Y4F5	1589 aa	Predicted RBP	7.26	□□□□□ -1.25
CEP170-209	ENST00000464936	ADH1A	P07327	375 aa		7.26	□□□□□ -1.25
CEP170-209	ENST00000464936	COL25A1	Q9BXS0	654 aa	Predicted RBP	7.26	□□□□□ -1.25
CEP170-209	ENST00000464936	SUPT6H	Q7KZ85	1726 aa	Known RBP	7.26	□□□□□ -1.25
CEP170-209	ENST00000464936	CPS1	P31327	1500 aa		7.26	□□□□□ -1.25
CEP170-209	ENST00000464936	PTPRK	Q15262	1439 aa		7.26	□□□□□ -1.25
CEP170-209	ENST00000464936	ZBBX	A8MT70	800 aa		7.25	□□□□□ -1.25
CEP170-209	ENST00000464936	MEN1	O00255	615 aa		7.25	□□□□□ -1.25
CEP170-209	ENST00000464936	GIGYF1	O75420	1035 aa	Predicted RBP	7.25	□□□□□ -1.25
CEP170-209	ENST00000464936	HNRNPM	P52272	730 aa	Known RBP eCLIP	7.25	□□□□□ -1.25
CEP170-209	ENST00000464936	PRICKLE2	Q7Z3G6	844 aa		7.25	□□□□□ -1.25
CEP170-209	ENST00000464936	ANKLE2	Q86XL3	938 aa		7.25	□□□□□ -1.25
CEP170-209	ENST00000464936	RNF217	Q8TC41	542 aa		7.25	□□□□□ -1.25
CEP170-209	ENST00000464936	MYO3A	Q8NEV4	1616 aa		7.25	□□□□□ -1.25
CEP170-209	ENST00000464936	A2ML1	A8K2U0	1454 aa		7.24	□□□□□ -1.25
CEP170-209	ENST00000464936	SHANK2	Q9UPX8	1470 aa		7.24	□□□□□ -1.25
CEP170-209	ENST00000464936	CDC42BPB	Q9Y5S2	1711 aa		7.24	□□□□□ -1.25
CEP170-209	ENST00000464936	PREX2	Q70Z35	1606 aa		7.24	□□□□□ -1.25
CEP170-209	ENST00000464936	KIDINS220	Q9ULH0	1771 aa		7.24	□□□□□ -1.25
CEP170-209	ENST00000464936	ITGA6	P23229	1130 aa		7.24	□□□□□ -1.25
CEP170-209	ENST00000464936	PTGIR	P43119	386 aa		7.24	□□□□□ -1.25
CEP170-209	ENST00000464936	KRT76	Q01546	638 aa		7.24	□□□□□ -1.25
CEP170-209	ENST00000464936	SV2A	Q7L0J3	742 aa		7.24	□□□□□ -1.25
CEP170-209	ENST00000464936	ZNF142	P52746	1687 aa	Predicted RBP	7.24	□□□□□ -1.25
CEP170-209	ENST00000464936	ITSN2	Q9NZM3	1697 aa		7.24	□□□□□ -1.25
CEP170-209	ENST00000464936	A2M	P01023	1474 aa		7.24	□□□□□ -1.25
CEP170-209	ENST00000464936	ARHGAP35	Q9NRY4	1499 aa		7.24	□□□□□ -1.25
CEP170-209	ENST00000464936	CLTC	Q00610	1675 aa	Known RBP	7.23	□□□□□ -1.25
CEP170-209	ENST00000464936	SLC35F4	A4IF30	521 aa		7.23	□□□□□ -1.25
CEP170-209	ENST00000464936	LILRA1	O75019	489 aa		7.23	□□□□□ -1.25
CEP170-209	ENST00000464936	FBXO45	P0C2W1	286 aa		7.23	□□□□□ -1.25
CEP170-209	ENST00000464936	RHOQ	P17081	205 aa		7.23	□□□□□ -1.25
CEP170-209	ENST00000464936	CFDP1	Q9UEE9	299 aa	Predicted RBP	7.23	□□□□□ -1.25
CEP170-209	ENST00000464936	SAMD9L	Q8IVG5	1584 aa		7.23	□□□□□ -1.25
CEP170-209	ENST00000464936	CCDC18	Q5T9S5	1454 aa		7.23	□□□□□ -1.25
CEP170-209	ENST00000464936	SYCP2	Q9BX26	1530 aa		7.22	□□□□□ -1.25
CEP170-209	ENST00000464936	TNR	Q92752	1358 aa		7.22	□□□□□ -1.25
CEP170-209	ENST00000464936	ESPN	B1AK53	854 aa		7.22	□□□□□ -1.25
CEP170-209	ENST00000464936	ATP5J2-PTCD1	G3V325	749 aa		7.22	□□□□□ -1.25
CEP170-209	ENST00000464936	RNFT1	Q5M7Z0	435 aa		7.22	□□□□□ -1.25
CEP170-209	ENST00000464936	FOXD4L5	Q5VV16	416 aa	Predicted RBP	7.22	□□□□□ -1.25
CEP170-209	ENST00000464936	LYSMD3	Q7Z3D4	306 aa		7.22	□□□□□ -1.25
CEP170-209	ENST00000464936	THEMIS	Q8N1K5	641 aa	Predicted RBP	7.22	□□□□□ -1.25
CEP170-209	ENST00000464936	SVOP	Q8N4V2	548 aa		7.22	□□□□□ -1.25
CEP170-209	ENST00000464936	PLEKHH2	Q8IVE3	1493 aa		7.22	□□□□□ -1.25
CEP170-209	ENST00000464936	ATP7A	Q04656	1500 aa		7.22	□□□□□ -1.25
CEP170-209	ENST00000464936	GJD4	Q96KN9	370 aa	Predicted RBP	7.21	□□□□□ -1.26
CEP170-209	ENST00000464936	CCNB3	Q8WWL7	1395 aa		7.2	□□□□□ -1.26
CEP170-209	ENST00000464936	DROSHA	Q9NRR4	1374 aa	Known RBP eCLIP	7.2	□□□□□ -1.26
CEP170-209	ENST00000464936		A6NJR5	290 aa		7.2	□□□□□ -1.26
CEP170-209	ENST00000464936	MCM6	Q14566	821 aa		7.2	□□□□□ -1.26
CEP170-209	ENST00000464936	RIPOR1	Q6ZS17	1223 aa		7.2	□□□□□ -1.26
CEP170-209	ENST00000464936	SEPT12	Q8IYM1	358 aa		7.2	□□□□□ -1.26
CEP170-209	ENST00000464936	TRIM52	Q96A61	297 aa		7.2	□□□□□ -1.26
CEP170-209	ENST00000464936	DNMT1	P26358	1616 aa	Known RBP	7.19	□□□□□ -1.26
CEP170-209	ENST00000464936	NPHP4	O75161	1426 aa	Predicted RBP	7.19	□□□□□ -1.26
CEP170-209	ENST00000464936	CASKIN1	Q8WXD9	1431 aa		7.19	□□□□□ -1.26
CEP170-209	ENST00000464936	KIAA1107	Q9UPP5	1409 aa		7.19	□□□□□ -1.26
CEP170-209	ENST00000464936	CDC42BPA	Q5VT25	1732 aa		7.19	□□□□□ -1.26
CEP170-209	ENST00000464936	FAM135A	Q9P2D6	1515 aa		7.19	□□□□□ -1.26
CEP170-209	ENST00000464936	KIF3B	O15066	747 aa		7.19	□□□□□ -1.26
CEP170-209	ENST00000464936	SLC27A3	Q5K4L6	730 aa		7.19	□□□□□ -1.26
CEP170-209	ENST00000464936	KDF1	Q8NAX2	398 aa	Predicted RBP	7.19	□□□□□ -1.26
CEP170-209	ENST00000464936	NANOS1	Q8WY41	292 aa	Known RBP	7.19	□□□□□ -1.26
CEP170-209	ENST00000464936	NLRP3	Q96P20	1036 aa		7.19	□□□□□ -1.26
CEP170-209	ENST00000464936	PCDHB11	Q9Y5F2	797 aa		7.19	□□□□□ -1.26
CEP170-209	ENST00000464936	PLXNC1	O60486	1568 aa		7.19	□□□□□ -1.26
CEP170-209	ENST00000464936	WASHC2C	Q9Y4E1	1318 aa		7.19	□□□□□ -1.26
CEP170-209	ENST00000464936	SENP3-EIF4A1	A0A087X0R7	540 aa		7.18	□□□□□ -1.26
CEP170-209	ENST00000464936	GAS2L1	Q99501	681 aa	Predicted RBP	7.18	□□□□□ -1.26
CEP170-209	ENST00000464936	ZNF330	Q9Y3S2	320 aa	Predicted RBP	7.18	□□□□□ -1.26
CEP170-209	ENST00000464936	POLR1A	O95602	1720 aa	Predicted RBP	7.18	□□□□□ -1.26
CEP170-209	ENST00000464936	GPATCH8	Q9UKJ3	1502 aa	Known RBP	7.17	□□□□□ -1.26
CEP170-209	ENST00000464936	NEURL4	Q96JN8	1562 aa		7.17	□□□□□ -1.26
CEP170-209	ENST00000464936		A0A1W2PRU2	124 aa		7.17	□□□□□ -1.26
CEP170-209	ENST00000464936	NR1H3	Q13133	447 aa		7.17	□□□□□ -1.26
CEP170-209	ENST00000464936	RNF20	Q5VTR2	975 aa		7.17	□□□□□ -1.26
CEP170-209	ENST00000464936	CC2D2B	Q6DHV5	1058 aa		7.17	□□□□□ -1.26
CEP170-209	ENST00000464936	WHAMM	Q8TF30	809 aa		7.17	□□□□□ -1.26
CEP170-209	ENST00000464936	C1orf115	Q9H7X2	142 aa		7.17	□□□□□ -1.26
CEP170-209	ENST00000464936	SNRK	Q9NRH2	765 aa		7.17	□□□□□ -1.26
CEP170-209	ENST00000464936	CUEDC1	Q9NWM3	386 aa	Predicted RBP	7.17	□□□□□ -1.26
CEP170-209	ENST00000464936	ADAMTS8	Q9UP79	889 aa		7.17	□□□□□ -1.26
CEP170-209	ENST00000464936	NDUFB9	Q9Y6M9	179 aa		7.17	□□□□□ -1.26

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 9.9 ms