RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000455321.1

PGGT1BP1-201, Transcript of protein geranylgeranyltransferase type I subunit beta pseudogene 1, humanhuman

BASIC

Gene PGGT1BP1, Length 1,023 nt, Biotype processed pseudogene.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PGGT1BP1-201ENST00000455321 PRMT3O60678 531 aa12.49□□□□□ -0.41
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PGGT1BP1-201ENST00000455321 OCLNQ16625 522 aa12.49□□□□□ -0.41
PGGT1BP1-201ENST00000455321 SH3RF1Q7Z6J0 888 aa12.49□□□□□ -0.41
PGGT1BP1-201ENST00000455321 RRP7BPQ9NSQ0 103 aa12.49□□□□□ -0.41
PGGT1BP1-201ENST00000455321 KIAA1522Q9P206 1035 aaPredicted RBP12.49□□□□□ -0.41
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PGGT1BP1-201ENST00000455321 PTPRKQ15262 1439 aa12.48□□□□□ -0.41
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PGGT1BP1-201ENST00000455321 FER1L4A9Z1Z3 1794 aa12.45□□□□□ -0.42
PGGT1BP1-201ENST00000455321 SHANK2Q9UPX8 1470 aa12.45□□□□□ -0.42
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PGGT1BP1-201ENST00000455321 ERFEQ4G0M1 354 aa12.44□□□□□ -0.42
PGGT1BP1-201ENST00000455321 GIPC2Q8TF65 315 aa12.44□□□□□ -0.42
PGGT1BP1-201ENST00000455321 PCDHGA11Q9Y5H2 935 aa12.44□□□□□ -0.42
PGGT1BP1-201ENST00000455321 PTPRMP28827 1452 aa12.44□□□□□ -0.42
PGGT1BP1-201ENST00000455321 RRBP1Q9P2E9 1410 aaKnown RBP12.44□□□□□ -0.42
PGGT1BP1-201ENST00000455321 SFI1A8K8P3 1242 aa12.43□□□□□ -0.42
PGGT1BP1-201ENST00000455321 H3BRB1 525 aa12.43□□□□□ -0.42
PGGT1BP1-201ENST00000455321 ICMTO60725 284 aa12.43□□□□□ -0.42
PGGT1BP1-201ENST00000455321 PSME1Q06323 249 aa12.43□□□□□ -0.42
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PGGT1BP1-201ENST00000455321 SLC10A4Q96EP9 437 aa12.42□□□□□ -0.42
PGGT1BP1-201ENST00000455321 ZPR1O75312 459 aa12.41□□□□□ -0.42
PGGT1BP1-201ENST00000455321 NCOA1Q15788 1441 aa12.41□□□□□ -0.42
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PGGT1BP1-201ENST00000455321 TLL1O43897 1013 aa12.4□□□□□ -0.42
PGGT1BP1-201ENST00000455321 ZNF211Q13398 564 aaPredicted RBP12.4□□□□□ -0.42
PGGT1BP1-201ENST00000455321 AGERQ15109 404 aa12.4□□□□□ -0.42
PGGT1BP1-201ENST00000455321 SEPT12Q8IYM1 358 aa12.4□□□□□ -0.42
PGGT1BP1-201ENST00000455321 ESF1Q9H501 851 aaKnown RBP12.4□□□□□ -0.42
PGGT1BP1-201ENST00000455321 DUOX2Q9NRD8 1548 aa12.4□□□□□ -0.42
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PGGT1BP1-201ENST00000455321 C21orf2O43822 256 aa12.39□□□□□ -0.43
PGGT1BP1-201ENST00000455321 BAP1Q92560 729 aa12.39□□□□□ -0.43
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PGGT1BP1-201ENST00000455321 ADGRL2O95490 1459 aa12.39□□□□□ -0.43
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PGGT1BP1-201ENST00000455321 PCDH10Q9P2E7 1040 aa12.38□□□□□ -0.43
PGGT1BP1-201ENST00000455321 USP35Q9P2H5 1018 aa12.38□□□□□ -0.43
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PGGT1BP1-201ENST00000455321 WEE1P30291 646 aa12.37□□□□□ -0.43
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PGGT1BP1-201ENST00000455321 FOXJ1Q92949 421 aa12.37□□□□□ -0.43
PGGT1BP1-201ENST00000455321 C1QTNF2Q9BXJ5 285 aa12.37□□□□□ -0.43
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PGGT1BP1-201ENST00000455321 C4orf48Q5BLP8 95 aa12.36□□□□□ -0.43
PGGT1BP1-201ENST00000455321 DCTN4Q9UJW0 460 aa12.36□□□□□ -0.43
PGGT1BP1-201ENST00000455321 MROH1Q8NDA8 1641 aa12.36□□□□□ -0.43
PGGT1BP1-201ENST00000455321 C3P01024 1663 aa12.35□□□□□ -0.43
PGGT1BP1-201ENST00000455321 PTCD1O75127 700 aaKnown RBP12.35□□□□□ -0.43
PGGT1BP1-201ENST00000455321 MAPK1P28482 360 aa12.35□□□□□ -0.43
PGGT1BP1-201ENST00000455321 FKBP4Q02790 459 aaKnown RBP eCLIP12.35□□□□□ -0.43
PGGT1BP1-201ENST00000455321 ASB16Q96NS5 453 aa12.35□□□□□ -0.43
PGGT1BP1-201ENST00000455321 ERBINQ96RT1 1412 aa12.35□□□□□ -0.43
PGGT1BP1-201ENST00000455321 WASHC2CQ9Y4E1 1318 aa12.35□□□□□ -0.43
PGGT1BP1-201ENST00000455321 RNF17Q9BXT8 1623 aaKnown RBP12.34□□□□□ -0.43
PGGT1BP1-201ENST00000455321 TCF3P15923 654 aa12.34□□□□□ -0.43
PGGT1BP1-201ENST00000455321 LINC01559Q495D7 138 aa12.34□□□□□ -0.43
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