RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000455157.6

SSUH2-208, Transcript of ssu-2 homolog (C. elegans), human

TSL 2

Gene SSUH2, Length 3,219 nt, Biotype nonsense mediated decay.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
SSUH2-208	ENST00000455157	BRD1	O95696	1058 aa		13.6	□□□□□ -0.23
SSUH2-208	ENST00000455157	CHML	P26374	656 aa		13.6	□□□□□ -0.23
SSUH2-208	ENST00000455157	SLFN14	P0C7P3	912 aa		13.6	□□□□□ -0.23
SSUH2-208	ENST00000455157	CAPN2	P17655	700 aa		13.6	□□□□□ -0.23
SSUH2-208	ENST00000455157	CWC27	Q6UX04	472 aa	Known RBP	13.6	□□□□□ -0.23
SSUH2-208	ENST00000455157	DRC7	Q8IY82	874 aa		13.6	□□□□□ -0.23
SSUH2-208	ENST00000455157	CD163L1	Q9NR16	1453 aa		13.59	□□□□□ -0.23
SSUH2-208	ENST00000455157	ARHGEF28	Q8N1W1	1705 aa	Known RBP	13.59	□□□□□ -0.23
SSUH2-208	ENST00000455157	FLII	Q13045	1269 aa		13.59	□□□□□ -0.23
SSUH2-208	ENST00000455157	CHAF1A	Q13111	956 aa	Predicted RBP	13.59	□□□□□ -0.23
SSUH2-208	ENST00000455157	NGDN	Q8NEJ9	315 aa	Known RBP	13.59	□□□□□ -0.23
SSUH2-208	ENST00000455157	PIBF1	Q8WXW3	757 aa		13.59	□□□□□ -0.23
SSUH2-208	ENST00000455157	GOLGA6L4	A6NEF3	574 aa		13.59	□□□□□ -0.23
SSUH2-208	ENST00000455157	ADCY5	O95622	1261 aa		13.59	□□□□□ -0.23
SSUH2-208	ENST00000455157	NEXMIF	Q5QGS0	1516 aa		13.59	□□□□□ -0.23
SSUH2-208	ENST00000455157	PTPRM	P28827	1452 aa		13.58	□□□□□ -0.23
SSUH2-208	ENST00000455157	CCDC30	Q5VVM6	783 aa		13.58	□□□□□ -0.23
SSUH2-208	ENST00000455157	UNC5CL	Q8IV45	518 aa		13.58	□□□□□ -0.23
SSUH2-208	ENST00000455157	SPG7	Q9UQ90	795 aa		13.58	□□□□□ -0.23
SSUH2-208	ENST00000455157	MTHFSD	Q2M296	383 aa	Known RBP	13.58	□□□□□ -0.24
SSUH2-208	ENST00000455157	DIAPH3	Q9NSV4	1193 aa		13.58	□□□□□ -0.24
SSUH2-208	ENST00000455157	CPA1	P15085	419 aa		13.57	□□□□□ -0.24
SSUH2-208	ENST00000455157	NOLC1	Q14978	699 aa	Known RBP eCLIP	13.57	□□□□□ -0.24
SSUH2-208	ENST00000455157	GIMAP6	Q6P9H5	292 aa		13.57	□□□□□ -0.24
SSUH2-208	ENST00000455157	MLH3	Q9UHC1	1453 aa		13.57	□□□□□ -0.24
SSUH2-208	ENST00000455157	EDC4	Q6P2E9	1401 aa	Known RBP	13.57	□□□□□ -0.24
SSUH2-208	ENST00000455157	ATP10D	Q9P241	1426 aa		13.57	□□□□□ -0.24
SSUH2-208	ENST00000455157	ZFP91-CNTF	A0A0A6YYC7	529 aa	Predicted RBP	13.56	□□□□□ -0.24
SSUH2-208	ENST00000455157	SRGAP3	O43295	1099 aa		13.56	□□□□□ -0.24
SSUH2-208	ENST00000455157	TRIM34	Q9BYJ4	488 aa		13.56	□□□□□ -0.24
SSUH2-208	ENST00000455157	SRCIN1	Q9C0H9	1055 aa		13.56	□□□□□ -0.24
SSUH2-208	ENST00000455157	ATP6V1D	Q9Y5K8	247 aa		13.56	□□□□□ -0.24
SSUH2-208	ENST00000455157	MMP14	P50281	582 aa		13.56	□□□□□ -0.24
SSUH2-208	ENST00000455157	CCDC183	Q5T5S1	534 aa		13.56	□□□□□ -0.24
SSUH2-208	ENST00000455157	CCDC83	Q8IWF9	413 aa		13.56	□□□□□ -0.24
SSUH2-208	ENST00000455157	KIF24	Q5T7B8	1368 aa		13.56	□□□□□ -0.24
SSUH2-208	ENST00000455157	CAST	P20810	708 aa	Known RBP	13.56	□□□□□ -0.24
SSUH2-208	ENST00000455157	ZSCAN21	Q9Y5A6	473 aa	Predicted RBP	13.56	□□□□□ -0.24
SSUH2-208	ENST00000455157	HDGFL1	Q5TGJ6	251 aa		13.55	□□□□□ -0.24
SSUH2-208	ENST00000455157	YEATS2	Q9ULM3	1422 aa		13.55	□□□□□ -0.24
SSUH2-208	ENST00000455157	FERMT3	Q86UX7	667 aa		13.55	□□□□□ -0.24
SSUH2-208	ENST00000455157	FAM184A	Q8NB25	1140 aa		13.55	□□□□□ -0.24
SSUH2-208	ENST00000455157	INTS4	Q96HW7	963 aa	Known RBP	13.55	□□□□□ -0.24
SSUH2-208	ENST00000455157	ACE	P12821	1306 aa		13.55	□□□□□ -0.24
SSUH2-208	ENST00000455157	STX6	O43752	255 aa		13.54	□□□□□ -0.24
SSUH2-208	ENST00000455157	ANAPC15	P60006	121 aa		13.54	□□□□□ -0.24
SSUH2-208	ENST00000455157	CNTROB	Q8N137	903 aa		13.54	□□□□□ -0.24
SSUH2-208	ENST00000455157	HDGF	P51858	240 aa	Known RBP	13.54	□□□□□ -0.24
SSUH2-208	ENST00000455157	ATP8B2	P98198	1209 aa		13.54	□□□□□ -0.24
SSUH2-208	ENST00000455157	SPTLC3	Q9NUV7	552 aa		13.54	□□□□□ -0.24
SSUH2-208	ENST00000455157	TTC21B	Q7Z4L5	1316 aa		13.54	□□□□□ -0.24
SSUH2-208	ENST00000455157	AK2	P54819	239 aa		13.53	□□□□□ -0.24
SSUH2-208	ENST00000455157	CAMK4	Q16566	473 aa		13.53	□□□□□ -0.24
SSUH2-208	ENST00000455157	PPP1R42	Q7Z4L9	355 aa		13.53	□□□□□ -0.24
SSUH2-208	ENST00000455157	JAKMIP1	Q96N16	626 aa	Known RBP	13.53	□□□□□ -0.24
SSUH2-208	ENST00000455157	TSPYL1	Q9H0U9	437 aa		13.53	□□□□□ -0.24
SSUH2-208	ENST00000455157	HECW2	Q9P2P5	1572 aa		13.53	□□□□□ -0.24
SSUH2-208	ENST00000455157	OSBPL3	Q9H4L5	887 aa		13.53	□□□□□ -0.24
SSUH2-208	ENST00000455157	YY1AP1	Q9H869	796 aa		13.53	□□□□□ -0.24
SSUH2-208	ENST00000455157	ARHGEF40	Q8TER5	1519 aa		13.53	□□□□□ -0.24
SSUH2-208	ENST00000455157	CTIF	O43310	598 aa	Known RBP	13.52	□□□□□ -0.24
SSUH2-208	ENST00000455157	ZSCAN22	P10073	491 aa	Predicted RBP	13.52	□□□□□ -0.24
SSUH2-208	ENST00000455157	CUL4A	Q13619	759 aa		13.52	□□□□□ -0.24
SSUH2-208	ENST00000455157	TERF2	Q15554	542 aa		13.52	□□□□□ -0.24
SSUH2-208	ENST00000455157	CALCOCO1	Q9P1Z2	691 aa		13.52	□□□□□ -0.24
SSUH2-208	ENST00000455157	MAP3K19	Q56UN5	1328 aa		13.52	□□□□□ -0.24
SSUH2-208	ENST00000455157	MAP2	P11137	1827 aa	Known RBP	13.52	□□□□□ -0.24
SSUH2-208	ENST00000455157	SYT1	P21579	422 aa		13.52	□□□□□ -0.24
SSUH2-208	ENST00000455157	DNM1	Q05193	864 aa	Known RBP	13.52	□□□□□ -0.24
SSUH2-208	ENST00000455157	LIMCH1	Q9UPQ0	1083 aa		13.52	□□□□□ -0.24
SSUH2-208	ENST00000455157	GOLGA6L6	A8MZA4	724 aa		13.52	□□□□□ -0.25
SSUH2-208	ENST00000455157	NLRP6	P59044	892 aa		13.52	□□□□□ -0.25
SSUH2-208	ENST00000455157	ANXA1	P04083	346 aa		13.51	□□□□□ -0.25
SSUH2-208	ENST00000455157	UBE2H	P62256	183 aa		13.51	□□□□□ -0.25
SSUH2-208	ENST00000455157	PRPF40B	Q6NWY9	871 aa	Known RBP	13.51	□□□□□ -0.25
SSUH2-208	ENST00000455157	SLC26A8	Q96RN1	970 aa		13.51	□□□□□ -0.25
SSUH2-208	ENST00000455157	FRMPD1	Q5SYB0	1578 aa		13.51	□□□□□ -0.25
SSUH2-208	ENST00000455157	RIOK3	O14730	519 aa	Known RBP	13.51	□□□□□ -0.25
SSUH2-208	ENST00000455157	CDK12	Q9NYV4	1490 aa	Predicted RBP	13.51	□□□□□ -0.25
SSUH2-208	ENST00000455157	CTNNA3	Q9UI47	895 aa		13.51	□□□□□ -0.25
SSUH2-208	ENST00000455157	KIAA0232	Q92628	1395 aa		13.51	□□□□□ -0.25
SSUH2-208	ENST00000455157	GJB2	P29033	226 aa		13.51	□□□□□ -0.25
SSUH2-208	ENST00000455157	PSEN1	P49768	467 aa		13.51	□□□□□ -0.25
SSUH2-208	ENST00000455157	NECAB1	Q8N987	351 aa		13.51	□□□□□ -0.25
SSUH2-208	ENST00000455157	RHPN1	Q8TCX5	695 aa		13.51	□□□□□ -0.25
SSUH2-208	ENST00000455157	ZBTB9	Q96C00	473 aa		13.51	□□□□□ -0.25
SSUH2-208	ENST00000455157	IL25	Q9H293	177 aa		13.51	□□□□□ -0.25
SSUH2-208	ENST00000455157	PHAX	Q9H814	394 aa	Known RBP	13.51	□□□□□ -0.25
SSUH2-208	ENST00000455157	ATP7B	P35670	1465 aa		13.5	□□□□□ -0.25
SSUH2-208	ENST00000455157	ZKSCAN1	P17029	563 aa	Predicted RBP	13.5	□□□□□ -0.25
SSUH2-208	ENST00000455157	FAM69C	Q0P6D2	419 aa		13.5	□□□□□ -0.25
SSUH2-208	ENST00000455157	USHBP1	Q8N6Y0	703 aa		13.5	□□□□□ -0.25
SSUH2-208	ENST00000455157	DDX41	Q9UJV9	622 aa	Known RBP	13.5	□□□□□ -0.25
SSUH2-208	ENST00000455157	GNAT3	A8MTJ3	354 aa		13.5	□□□□□ -0.25
SSUH2-208	ENST00000455157	IFIT2	P09913	472 aa	Known RBP	13.5	□□□□□ -0.25
SSUH2-208	ENST00000455157	RUFY2	Q8WXA3	655 aa		13.5	□□□□□ -0.25
SSUH2-208	ENST00000455157	PDRG1	Q9NUG6	133 aa		13.5	□□□□□ -0.25
SSUH2-208	ENST00000455157	C9orf78	Q9NZ63	289 aa	Predicted RBP	13.5	□□□□□ -0.25
SSUH2-208	ENST00000455157	PIK3C2B	O00750	1634 aa		13.5	□□□□□ -0.25
SSUH2-208	ENST00000455157	AATK	Q6ZMQ8	1374 aa		13.49	□□□□□ -0.25

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