RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000452157.5

MIER3-208, Transcript of MIER family member 3, human

TSL 1 (best)

Gene MIER3, Length 5,240 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
MIER3-208	ENST00000452157	ESPN	B1AK53	854 aa		4.06	□□□□□ -1.76
MIER3-208	ENST00000452157	RFX1	P22670	979 aa		4.06	□□□□□ -1.76
MIER3-208	ENST00000452157	ZNF365	Q70YC5	407 aa		4.06	□□□□□ -1.76
MIER3-208	ENST00000452157	VPS52	Q8N1B4	723 aa		4.06	□□□□□ -1.76
MIER3-208	ENST00000452157	LRRC43	Q8N309	656 aa		4.06	□□□□□ -1.76
MIER3-208	ENST00000452157	OTUD6B	Q8N6M0	293 aa		4.06	□□□□□ -1.76
MIER3-208	ENST00000452157	CCDC94	Q9BW85	323 aa	Predicted RBP	4.06	□□□□□ -1.76
MIER3-208	ENST00000452157	TXNDC16	Q9P2K2	825 aa		4.06	□□□□□ -1.76
MIER3-208	ENST00000452157	DCAF1	Q9Y4B6	1507 aa		4.06	□□□□□ -1.76
MIER3-208	ENST00000452157	SPECC1L-ADORA2A	F8WAN1	911 aa		4.06	□□□□□ -1.76
MIER3-208	ENST00000452157	GIPC1	O14908	333 aa		4.06	□□□□□ -1.76
MIER3-208	ENST00000452157	DAPK3	O43293	454 aa		4.06	□□□□□ -1.76
MIER3-208	ENST00000452157	CRCP	O75575	148 aa		4.06	□□□□□ -1.76
MIER3-208	ENST00000452157	CDKL5	O76039	1030 aa		4.06	□□□□□ -1.76
MIER3-208	ENST00000452157	U2AF1L5	P0DN76	240 aa	Predicted RBP	4.06	□□□□□ -1.76
MIER3-208	ENST00000452157	GFAP	P14136	432 aa		4.06	□□□□□ -1.76
MIER3-208	ENST00000452157	ZNF76	P36508	570 aa		4.06	□□□□□ -1.76
MIER3-208	ENST00000452157	U2AF1	Q01081	240 aa	Known RBP eCLIP	4.06	□□□□□ -1.76
MIER3-208	ENST00000452157	XPC	Q01831	940 aa	Predicted RBP	4.06	□□□□□ -1.76
MIER3-208	ENST00000452157	NONO	Q15233	471 aa	Known RBP eCLIP	4.06	□□□□□ -1.76
MIER3-208	ENST00000452157	CCDC40	Q4G0X9	1142 aa		4.06	□□□□□ -1.76
MIER3-208	ENST00000452157	KIF6	Q6ZMV9	814 aa		4.06	□□□□□ -1.76
MIER3-208	ENST00000452157	EHBP1	Q8NDI1	1231 aa		4.06	□□□□□ -1.76
MIER3-208	ENST00000452157	TRIM7	Q9C029	511 aa		4.06	□□□□□ -1.76
MIER3-208	ENST00000452157	C9orf78	Q9NZ63	289 aa	Predicted RBP	4.06	□□□□□ -1.76
MIER3-208	ENST00000452157	THEG	Q9P2T0	379 aa		4.06	□□□□□ -1.76
MIER3-208	ENST00000452157	KTN1	Q86UP2	1357 aa	Known RBP	4.05	□□□□□ -1.76
MIER3-208	ENST00000452157	LMNA	P02545	664 aa	Known RBP	4.05	□□□□□ -1.76
MIER3-208	ENST00000452157	CEBPZ	Q03701	1054 aa	Known RBP	4.05	□□□□□ -1.76
MIER3-208	ENST00000452157	PDE1C	Q14123	709 aa	Predicted RBP	4.05	□□□□□ -1.76
MIER3-208	ENST00000452157	TSNAXIP1	Q2TAA8	658 aa		4.05	□□□□□ -1.76
MIER3-208	ENST00000452157	RGL3	Q3MIN7	710 aa		4.05	□□□□□ -1.76
MIER3-208	ENST00000452157	PDXDC1	Q6P996	788 aa		4.05	□□□□□ -1.76
MIER3-208	ENST00000452157	PALM2	Q8IXS6	379 aa		4.05	□□□□□ -1.76
MIER3-208	ENST00000452157	SDAD1	Q9NVU7	687 aa	Known RBP eCLIP	4.05	□□□□□ -1.76
MIER3-208	ENST00000452157	USP25	Q9UHP3	1055 aa		4.05	□□□□□ -1.76
MIER3-208	ENST00000452157	RCAN3	Q9UKA8	241 aa		4.05	□□□□□ -1.76
MIER3-208	ENST00000452157		A0A1B0GUL7	405 aa		4.05	□□□□□ -1.76
MIER3-208	ENST00000452157	ERCC3	P19447	782 aa		4.05	□□□□□ -1.76
MIER3-208	ENST00000452157	TMCO5A	Q8N6Q1	288 aa		4.05	□□□□□ -1.76
MIER3-208	ENST00000452157	WASF1	Q92558	559 aa		4.05	□□□□□ -1.76
MIER3-208	ENST00000452157	UTP14A	Q9BVJ6	771 aa	Known RBP	4.05	□□□□□ -1.76
MIER3-208	ENST00000452157	ERICH4	A6NGS2	130 aa		4.05	□□□□□ -1.76
MIER3-208	ENST00000452157	CCDC69	A6NI79	296 aa		4.05	□□□□□ -1.76
MIER3-208	ENST00000452157	SOX12	O15370	315 aa		4.05	□□□□□ -1.76
MIER3-208	ENST00000452157	SMIM24	O75264	130 aa		4.05	□□□□□ -1.76
MIER3-208	ENST00000452157	TNNT1	P13805	278 aa		4.05	□□□□□ -1.76
MIER3-208	ENST00000452157	IBSP	P21815	317 aa	Predicted RBP	4.05	□□□□□ -1.76
MIER3-208	ENST00000452157	NEDD9	Q14511	834 aa		4.05	□□□□□ -1.76
MIER3-208	ENST00000452157	KIAA0753	Q2KHM9	967 aa		4.05	□□□□□ -1.76
MIER3-208	ENST00000452157	SRGAP1	Q7Z6B7	1085 aa		4.05	□□□□□ -1.76
MIER3-208	ENST00000452157	PATL1	Q86TB9	770 aa	Known RBP	4.05	□□□□□ -1.76
MIER3-208	ENST00000452157	CCDC125	Q86Z20	511 aa		4.05	□□□□□ -1.76
MIER3-208	ENST00000452157	HELB	Q8NG08	1087 aa	Predicted RBP	4.05	□□□□□ -1.76
MIER3-208	ENST00000452157	CCDC124	Q96CT7	223 aa	Known RBP	4.05	□□□□□ -1.76
MIER3-208	ENST00000452157	CCDC138	Q96M89	665 aa		4.05	□□□□□ -1.76
MIER3-208	ENST00000452157	RAB34	Q9BZG1	259 aa		4.05	□□□□□ -1.76
MIER3-208	ENST00000452157	NACAP1	Q9BZK3	213 aa		4.05	□□□□□ -1.76
MIER3-208	ENST00000452157	TERF2IP	Q9NYB0	399 aa		4.05	□□□□□ -1.76
MIER3-208	ENST00000452157	RSF1	Q96T23	1441 aa	Predicted RBP	4.05	□□□□□ -1.76
MIER3-208	ENST00000452157	RAB11FIP3	O75154	756 aa		4.05	□□□□□ -1.76
MIER3-208	ENST00000452157	CTAGE8	P0CG41	777 aa		4.05	□□□□□ -1.76
MIER3-208	ENST00000452157	TUBB4B	P68371	445 aa		4.05	□□□□□ -1.76
MIER3-208	ENST00000452157	CTAGE4	Q8IX94	777 aa		4.05	□□□□□ -1.76
MIER3-208	ENST00000452157	DDX24	Q9GZR7	859 aa	Known RBP eCLIP	4.05	□□□□□ -1.76
MIER3-208	ENST00000452157	FAN1	Q9Y2M0	1017 aa		4.05	□□□□□ -1.76
MIER3-208	ENST00000452157	SLMAP	Q14BN4	828 aa		4.04	□□□□□ -1.76
MIER3-208	ENST00000452157	ANKRD1	Q15327	319 aa		4.04	□□□□□ -1.76
MIER3-208	ENST00000452157	CCDC121	Q6ZUS5	278 aa		4.04	□□□□□ -1.76
MIER3-208	ENST00000452157	FAM169A	Q9Y6X4	670 aa		4.04	□□□□□ -1.76
MIER3-208	ENST00000452157	FMNL1	O95466	1100 aa	Predicted RBP	4.04	□□□□□ -1.76
MIER3-208	ENST00000452157	GBP1	P32455	592 aa		4.04	□□□□□ -1.76
MIER3-208	ENST00000452157	ATP11A	P98196	1134 aa		4.04	□□□□□ -1.76
MIER3-208	ENST00000452157	AAMP	Q13685	434 aa		4.04	□□□□□ -1.76
MIER3-208	ENST00000452157	HLTF	Q14527	1009 aa	Known RBP eCLIP	4.04	□□□□□ -1.76
MIER3-208	ENST00000452157	WHAMMP3	Q1A5X7	153 aa		4.04	□□□□□ -1.76
MIER3-208	ENST00000452157	MUM1L1	Q5H9M0	696 aa		4.04	□□□□□ -1.76
MIER3-208	ENST00000452157	MICALL1	Q8N3F8	863 aa		4.04	□□□□□ -1.76
MIER3-208	ENST00000452157	FNBP4	Q8N3X1	1017 aa	Predicted RBP	4.04	□□□□□ -1.76
MIER3-208	ENST00000452157	ARFGAP2	Q8N6H7	521 aa		4.04	□□□□□ -1.76
MIER3-208	ENST00000452157	CCDC63	Q8NA47	563 aa		4.04	□□□□□ -1.76
MIER3-208	ENST00000452157	PHAX	Q9H814	394 aa	Known RBP	4.04	□□□□□ -1.76
MIER3-208	ENST00000452157	ZSCAN32	Q9NX65	697 aa		4.04	□□□□□ -1.76
MIER3-208	ENST00000452157	ZMYND8	Q9ULU4	1186 aa	Predicted RBP	4.04	□□□□□ -1.76
MIER3-208	ENST00000452157	HNRNPCL2	B2RXH8	293 aa		4.04	□□□□□ -1.76
MIER3-208	ENST00000452157	ARHGEF9	O43307	516 aa		4.04	□□□□□ -1.76
MIER3-208	ENST00000452157	HNRNPCL1	O60812	293 aa	Known RBP	4.04	□□□□□ -1.76
MIER3-208	ENST00000452157	XRCC6	P12956	609 aa	Known RBP eCLIP	4.04	□□□□□ -1.76
MIER3-208	ENST00000452157	NAA25	Q14CX7	972 aa		4.04	□□□□□ -1.76
MIER3-208	ENST00000452157	NFKBIB	Q15653	356 aa		4.04	□□□□□ -1.76
MIER3-208	ENST00000452157	WASHC4	Q2M389	1173 aa		4.04	□□□□□ -1.76
MIER3-208	ENST00000452157	SPTY2D1	Q68D10	685 aa	Predicted RBP	4.04	□□□□□ -1.76
MIER3-208	ENST00000452157	MAATS1	Q7Z4T9	603 aa		4.04	□□□□□ -1.76
MIER3-208	ENST00000452157	CTCFL	Q8NI51	663 aa	Predicted RBP	4.04	□□□□□ -1.76
MIER3-208	ENST00000452157	ZNF287	Q9HBT7	754 aa		4.04	□□□□□ -1.76
MIER3-208	ENST00000452157	LUC7L3	O95232	432 aa	Known RBP	4.04	□□□□□ -1.76
MIER3-208	ENST00000452157	KRT3	P12035	628 aa		4.04	□□□□□ -1.76
MIER3-208	ENST00000452157	ATP5D	P30049	168 aa		4.04	□□□□□ -1.76
MIER3-208	ENST00000452157	AMPH	P49418	695 aa		4.04	□□□□□ -1.76
MIER3-208	ENST00000452157	NUCB1	Q02818	461 aa		4.04	□□□□□ -1.76

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