RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000440825.6

FAAP20-210, Transcript of FA core complex associated protein 20, humanhuman

TSL 3

Gene FAAP20, Length 855 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAAP20-210ENST00000440825 ZPR1O75312 459 aa36.71■■■■□ 3.47
FAAP20-210ENST00000440825 UTRNP46939 3433 aa36.7■■■■□ 3.47
FAAP20-210ENST00000440825 DLG5Q8TDM6 1919 aa36.7■■■■□ 3.47
FAAP20-210ENST00000440825 NFE2L2Q16236 605 aa36.7■■■■□ 3.47
FAAP20-210ENST00000440825 PARP3Q9Y6F1 533 aa36.7■■■■□ 3.47
FAAP20-210ENST00000440825 COL15A1P39059 1388 aa36.69■■■■□ 3.46
FAAP20-210ENST00000440825 FKBP8Q14318 412 aa36.69■■■■□ 3.46
FAAP20-210ENST00000440825 WWC3Q9ULE0 1092 aa36.69■■■■□ 3.46
FAAP20-210ENST00000440825 USPL1Q5W0Q7 1092 aa36.68■■■■□ 3.46
FAAP20-210ENST00000440825 TEX13AQ9BXU3 409 aaPredicted RBP36.68■■■■□ 3.46
FAAP20-210ENST00000440825 ZNF330Q9Y3S2 320 aaPredicted RBP36.68■■■■□ 3.46
FAAP20-210ENST00000440825 PRKRIP1Q9H875 184 aaPredicted RBP36.67■■■■□ 3.46
FAAP20-210ENST00000440825 MIS18AQ9NYP9 233 aa36.66■■■■□ 3.46
FAAP20-210ENST00000440825 GOLGB1Q14789 3259 aaKnown RBP36.65■■■■□ 3.46
FAAP20-210ENST00000440825 TAF7Q15545 349 aaPredicted RBP36.65■■■■□ 3.46
FAAP20-210ENST00000440825 YBX3P16989 372 aaKnown RBP eCLIP36.64■■■■□ 3.46
FAAP20-210ENST00000440825 WDR43Q15061 677 aaKnown RBP eCLIP36.64■■■■□ 3.46
FAAP20-210ENST00000440825 THUMPD2Q9BTF0 503 aaKnown RBP36.64■■■■□ 3.46
FAAP20-210ENST00000440825 CCDC146Q8IYE0 955 aa36.62■■■■□ 3.45
FAAP20-210ENST00000440825 A1BGP04217 495 aa36.61■■■■□ 3.45
FAAP20-210ENST00000440825 NARFQ9UHQ1 456 aa36.61■■■■□ 3.45
FAAP20-210ENST00000440825 PRAMEF22A3QJZ6 481 aa36.6■■■■□ 3.45
FAAP20-210ENST00000440825 DDR1Q08345 913 aa36.58■■■■□ 3.45
FAAP20-210ENST00000440825 NPM2Q86SE8 214 aaKnown RBP36.58■■■■□ 3.45
FAAP20-210ENST00000440825 USP16Q9Y5T5 823 aa36.58■■■■□ 3.45
FAAP20-210ENST00000440825 SNRPA1P09661 255 aaKnown RBP36.57■■■■□ 3.44
FAAP20-210ENST00000440825 EIF5P55010 431 aaKnown RBP36.57■■■■□ 3.44
FAAP20-210ENST00000440825 RIPK4P57078 832 aa36.57■■■■□ 3.44
FAAP20-210ENST00000440825 CHD4Q14839 1912 aa36.56■■■■□ 3.44
FAAP20-210ENST00000440825 A0A087WZG4 1122 aa36.56■■■■□ 3.44
FAAP20-210ENST00000440825 GRIN3BO60391 1043 aa36.56■■■■□ 3.44
FAAP20-210ENST00000440825 PIP4K2AP48426 406 aaPredicted RBP36.56■■■■□ 3.44
FAAP20-210ENST00000440825 C10orf71Q711Q0 1435 aa36.56■■■■□ 3.44
FAAP20-210ENST00000440825 RRP7AQ9Y3A4 280 aaKnown RBP36.55■■■■□ 3.44
FAAP20-210ENST00000440825 ZNF316A6NFI3 1004 aaPredicted RBP36.54■■■■□ 3.44
FAAP20-210ENST00000440825 NEUROD2Q15784 382 aa36.54■■■■□ 3.44
FAAP20-210ENST00000440825 PNISRQ8TF01 805 aaKnown RBP36.54■■■■□ 3.44
FAAP20-210ENST00000440825 IL6STP40189 918 aaPredicted RBP36.53■■■■□ 3.44
FAAP20-210ENST00000440825 TBC1D2BQ9UPU7 963 aa36.53■■■■□ 3.44
FAAP20-210ENST00000440825 N4BP2Q86UW6 1770 aaPredicted RBP36.53■■■■□ 3.44
FAAP20-210ENST00000440825 A0A0G2JLW4 131 aa36.52■■■■□ 3.44
FAAP20-210ENST00000440825 TM4SF1P30408 202 aa36.52■■■■□ 3.44
FAAP20-210ENST00000440825 TMPOP42166 694 aaKnown RBP36.52■■■■□ 3.44
FAAP20-210ENST00000440825 BCL2L12Q9HB09 334 aa36.52■■■■□ 3.44
FAAP20-210ENST00000440825 KIF13BQ9NQT8 1826 aa36.52■■■■□ 3.44
FAAP20-210ENST00000440825 PXDNLA1KZ92 1463 aa36.51■■■■□ 3.44
FAAP20-210ENST00000440825 POLRMTO00411 1230 aaKnown RBP36.51■■■■□ 3.44
FAAP20-210ENST00000440825 NFIXQ14938 502 aa36.51■■■■□ 3.44
FAAP20-210ENST00000440825 BICDL1Q6ZP65 573 aa36.51■■■■□ 3.44
FAAP20-210ENST00000440825 ADAMTS8Q9UP79 889 aa36.51■■■■□ 3.44
FAAP20-210ENST00000440825 TGFB2P61812 414 aa36.5■■■■□ 3.43
FAAP20-210ENST00000440825 RUNDC1Q96C34 613 aa36.49■■■■□ 3.43
FAAP20-210ENST00000440825 KDM3BQ7LBC6 1761 aa36.48■■■■□ 3.43
FAAP20-210ENST00000440825 DPEP1P16444 411 aa36.47■■■■□ 3.43
FAAP20-210ENST00000440825 LMOD3Q0VAK6 560 aa36.47■■■■□ 3.43
FAAP20-210ENST00000440825 KIAA1551Q9HCM1 1747 aa36.45■■■■□ 3.43
FAAP20-210ENST00000440825 TSPYL4Q9UJ04 414 aa36.45■■■■□ 3.43
FAAP20-210ENST00000440825 DZIP3Q86Y13 1208 aaKnown RBP36.44■■■■□ 3.42
FAAP20-210ENST00000440825 BCS1LQ9Y276 419 aa36.44■■■■□ 3.42
FAAP20-210ENST00000440825 EIF4A1P60842 406 aaKnown RBP36.43■■■■□ 3.42
FAAP20-210ENST00000440825 SCN7AQ01118 1682 aa36.42■■■■□ 3.42
FAAP20-210ENST00000440825 SERPINB2P05120 415 aa36.42■■■■□ 3.42
FAAP20-210ENST00000440825 TBC1D9BQ66K14 1250 aa36.42■■■■□ 3.42
FAAP20-210ENST00000440825 ZNF784Q8NCA9 323 aaPredicted RBP36.4■■■■□ 3.42
FAAP20-210ENST00000440825 AFDNP55196 1824 aaKnown RBP36.4■■■■□ 3.42
FAAP20-210ENST00000440825 LAMB4A4D0S4 1761 aa36.4■■■■□ 3.42
FAAP20-210ENST00000440825 GIGYF1O75420 1035 aaPredicted RBP36.39■■■■□ 3.42
FAAP20-210ENST00000440825 CAMTA2O94983 1202 aa36.39■■■■□ 3.42
FAAP20-210ENST00000440825 NBPF26B4DH59 902 aa36.38■■■■□ 3.41
FAAP20-210ENST00000440825 CHRNA5P30532 468 aa36.38■■■■□ 3.41
FAAP20-210ENST00000440825 NBPF10Q6P3W6 841 aaKnown RBP36.38■■■■□ 3.41
FAAP20-210ENST00000440825 NBPF15Q8N660 670 aa36.38■■■■□ 3.41
FAAP20-210ENST00000440825 LAS1LQ9Y4W2 734 aaKnown RBP36.37■■■■□ 3.41
FAAP20-210ENST00000440825 NGEFQ8N5V2 710 aa36.36■■■■□ 3.41
FAAP20-210ENST00000440825 KCNA3P22001 575 aa36.34■■■■□ 3.41
FAAP20-210ENST00000440825 BCORQ6W2J9 1755 aa36.33■■■■□ 3.41
FAAP20-210ENST00000440825 NPHP1O15259 732 aa36.33■■■■□ 3.41
FAAP20-210ENST00000440825 SETDB2Q96T68 719 aa36.33■■■■□ 3.41
FAAP20-210ENST00000440825 PIM2Q9P1W9 311 aa36.33■■■■□ 3.41
FAAP20-210ENST00000440825 TRIM35Q9UPQ4 493 aa36.33■■■■□ 3.41
FAAP20-210ENST00000440825 CARMIL3Q8ND23 1372 aa36.32■■■■□ 3.4
FAAP20-210ENST00000440825 NRXN2Q9P2S2 1712 aa36.32■■■■□ 3.4
FAAP20-210ENST00000440825 CCDC184Q52MB2 194 aa36.32■■■■□ 3.4
FAAP20-210ENST00000440825 ANP32CO43423 234 aa36.31■■■■□ 3.4
FAAP20-210ENST00000440825 CCDC24Q8N4L8 307 aa36.31■■■■□ 3.4
FAAP20-210ENST00000440825 MYL6BP14649 208 aa36.3■■■■□ 3.4
FAAP20-210ENST00000440825 ZNF652Q9Y2D9 606 aa36.3■■■■□ 3.4
FAAP20-210ENST00000440825 BRCA1P38398 1863 aaKnown RBP36.29■■■■□ 3.4
FAAP20-210ENST00000440825 APAF1O14727 1248 aa36.28■■■■□ 3.4
FAAP20-210ENST00000440825 EIF2S2P20042 333 aaKnown RBP36.28■■■■□ 3.4
FAAP20-210ENST00000440825 DALRD3Q5D0E6 543 aaKnown RBP36.28■■■■□ 3.4
FAAP20-210ENST00000440825 ARHGAP27Q6ZUM4 889 aa36.28■■■■□ 3.4
FAAP20-210ENST00000440825 BABAM1Q9NWV8 329 aa36.27■■■■□ 3.4
FAAP20-210ENST00000440825 PRR5LQ6MZQ0 368 aa36.25■■■■□ 3.39
FAAP20-210ENST00000440825 C2CD5Q86YS7 1000 aa36.25■■■■□ 3.39
FAAP20-210ENST00000440825 CLEC4GQ6UXB4 293 aa36.24■■■■□ 3.39
FAAP20-210ENST00000440825 CNBD1Q8NA66 436 aa36.24■■■■□ 3.39
FAAP20-210ENST00000440825 NECTIN2Q92692 538 aa36.23■■■■□ 3.39
FAAP20-210ENST00000440825 NIP7Q9Y221 180 aaKnown RBP eCLIP36.22■■■■□ 3.39
FAAP20-210ENST00000440825 FAM177BA6PVY3 158 aa36.21■■■■□ 3.39
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 69.3 ms