RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000439415.1

CBX1P4-201, Transcript of chromobox 1 pseudogene 4, humanhuman

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Gene CBX1P4, Length 457 nt, Biotype processed pseudogene.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CBX1P4-201ENST00000439415 EPHA4P54764 986 aa6.74□□□□□ -1.33
CBX1P4-201ENST00000439415 GDF10P55107 478 aa6.74□□□□□ -1.33
CBX1P4-201ENST00000439415 COX20Q5RI15 118 aa6.74□□□□□ -1.33
CBX1P4-201ENST00000439415 EGFLAMQ63HQ2 1017 aa6.74□□□□□ -1.33
CBX1P4-201ENST00000439415 VPS37DQ86XT2 251 aa6.74□□□□□ -1.33
CBX1P4-201ENST00000439415 TRMT44Q8IYL2 757 aaKnown RBP6.74□□□□□ -1.33
CBX1P4-201ENST00000439415 STAG2Q8N3U4 1231 aa6.74□□□□□ -1.33
CBX1P4-201ENST00000439415 ZNF511Q8NB15 262 aa6.74□□□□□ -1.33
CBX1P4-201ENST00000439415 CRELD1Q96HD1 420 aa6.74□□□□□ -1.33
CBX1P4-201ENST00000439415 TSPAN10Q9H1Z9 355 aaPredicted RBP6.74□□□□□ -1.33
CBX1P4-201ENST00000439415 WDR3Q9UNX4 943 aaKnown RBP eCLIP6.74□□□□□ -1.33
CBX1P4-201ENST00000439415 A0A1W2PRU2 124 aa6.73□□□□□ -1.33
CBX1P4-201ENST00000439415 TNFRSF10BO14763 440 aa6.73□□□□□ -1.33
CBX1P4-201ENST00000439415 PPP1R12BO60237 982 aaPredicted RBP6.73□□□□□ -1.33
CBX1P4-201ENST00000439415 SCNN1DP51172 638 aa6.73□□□□□ -1.33
CBX1P4-201ENST00000439415 PPP1R18Q6NYC8 613 aa6.73□□□□□ -1.33
CBX1P4-201ENST00000439415 FBF1Q8TES7 1133 aa6.73□□□□□ -1.33
CBX1P4-201ENST00000439415 TRIM52Q96A61 297 aa6.73□□□□□ -1.33
CBX1P4-201ENST00000439415 PIF1Q9H611 641 aa6.73□□□□□ -1.33
CBX1P4-201ENST00000439415 ZSWIM4Q9H7M6 989 aa6.73□□□□□ -1.33
CBX1P4-201ENST00000439415 DDX41Q9UJV9 622 aaKnown RBP6.73□□□□□ -1.33
CBX1P4-201ENST00000439415 TBX22Q9Y458 520 aa6.73□□□□□ -1.33
CBX1P4-201ENST00000439415 AK5Q9Y6K8 562 aa6.73□□□□□ -1.33
CBX1P4-201ENST00000439415 TTBK1Q5TCY1 1321 aaPredicted RBP6.73□□□□□ -1.33
CBX1P4-201ENST00000439415 GOLGA8CPA6NN73 597 aa6.72□□□□□ -1.33
CBX1P4-201ENST00000439415 ADH1BP00325 375 aa6.72□□□□□ -1.33
CBX1P4-201ENST00000439415 USP5P45974 858 aa6.72□□□□□ -1.33
CBX1P4-201ENST00000439415 SCTRP47872 440 aa6.72□□□□□ -1.33
CBX1P4-201ENST00000439415 RAB15P59190 212 aa6.72□□□□□ -1.33
CBX1P4-201ENST00000439415 LINC01559Q495D7 138 aa6.72□□□□□ -1.33
CBX1P4-201ENST00000439415 GJD3Q8N144 294 aa6.72□□□□□ -1.33
CBX1P4-201ENST00000439415 KCTD15Q96SI1 283 aaPredicted RBP6.72□□□□□ -1.33
CBX1P4-201ENST00000439415 C2orf49Q9BVC5 232 aaPredicted RBP6.72□□□□□ -1.33
CBX1P4-201ENST00000439415 STK10O94804 968 aaKnown RBP6.71□□□□□ -1.34
CBX1P4-201ENST00000439415 INHAP05111 366 aa6.71□□□□□ -1.34
CBX1P4-201ENST00000439415 BRD2P25440 801 aaKnown RBP6.71□□□□□ -1.34
CBX1P4-201ENST00000439415 ERVK-9P63128 1117 aa6.71□□□□□ -1.34
CBX1P4-201ENST00000439415 RACK1P63244 317 aaKnown RBP6.71□□□□□ -1.34
CBX1P4-201ENST00000439415 ZNF394Q53GI3 561 aa6.71□□□□□ -1.34
CBX1P4-201ENST00000439415 CC2D2BQ6DHV5 1058 aa6.71□□□□□ -1.34
CBX1P4-201ENST00000439415 SLC4A9Q96Q91 983 aa6.71□□□□□ -1.34
CBX1P4-201ENST00000439415 OSBPL2Q9H1P3 480 aa6.71□□□□□ -1.34
CBX1P4-201ENST00000439415 SERTAD1Q9UHV2 236 aa6.71□□□□□ -1.34
CBX1P4-201ENST00000439415 POLIQ9UNA4 740 aa6.71□□□□□ -1.34
CBX1P4-201ENST00000439415 ZBTB24O43167 697 aaPredicted RBP6.7□□□□□ -1.34
CBX1P4-201ENST00000439415 CTSHP09668 335 aa6.7□□□□□ -1.34
CBX1P4-201ENST00000439415 MZF1P28698 734 aaPredicted RBP6.7□□□□□ -1.34
CBX1P4-201ENST00000439415 BCAMP50895 628 aa6.7□□□□□ -1.34
CBX1P4-201ENST00000439415 COPS2P61201 443 aa6.7□□□□□ -1.34
CBX1P4-201ENST00000439415 USP48Q86UV5 1035 aa6.7□□□□□ -1.34
CBX1P4-201ENST00000439415 MYO19Q96H55 970 aa6.7□□□□□ -1.34
CBX1P4-201ENST00000439415 SPACA7Q96KW9 195 aa6.7□□□□□ -1.34
CBX1P4-201ENST00000439415 QTRT2Q9H974 415 aaKnown RBP6.7□□□□□ -1.34
CBX1P4-201ENST00000439415 ERVH48-1M5A8F1 160 aa6.69□□□□□ -1.34
CBX1P4-201ENST00000439415 MARCH6O60337 910 aa6.69□□□□□ -1.34
CBX1P4-201ENST00000439415 CLSTN1O94985 981 aa6.69□□□□□ -1.34
CBX1P4-201ENST00000439415 PTPN12Q05209 780 aaKnown RBP6.69□□□□□ -1.34
CBX1P4-201ENST00000439415 ZNF746Q6NUN9 644 aaPredicted RBP6.69□□□□□ -1.34
CBX1P4-201ENST00000439415 HS2ST1Q7LGA3 356 aa6.69□□□□□ -1.34
CBX1P4-201ENST00000439415 ATCAYQ86WG3 371 aa6.69□□□□□ -1.34
CBX1P4-201ENST00000439415 NLGN1Q8N2Q7 840 aa6.69□□□□□ -1.34
CBX1P4-201ENST00000439415 CSRNP1Q96S65 589 aa6.69□□□□□ -1.34
CBX1P4-201ENST00000439415 CFHR5Q9BXR6 569 aa6.69□□□□□ -1.34
CBX1P4-201ENST00000439415 OSBPL3Q9H4L5 887 aa6.69□□□□□ -1.34
CBX1P4-201ENST00000439415 LRFN2Q9ULH4 789 aa6.69□□□□□ -1.34
CBX1P4-201ENST00000439415 SPG7Q9UQ90 795 aa6.69□□□□□ -1.34
CBX1P4-201ENST00000439415 CHMP3Q9Y3E7 222 aa6.69□□□□□ -1.34
CBX1P4-201ENST00000439415 PCDHGB7Q9Y5F8 929 aa6.69□□□□□ -1.34
CBX1P4-201ENST00000439415 ZBTB39O15060 712 aa6.68□□□□□ -1.34
CBX1P4-201ENST00000439415 STAU1O95793 577 aaKnown RBP6.68□□□□□ -1.34
CBX1P4-201ENST00000439415 NEFLP07196 543 aa6.68□□□□□ -1.34
CBX1P4-201ENST00000439415 EIF4BP23588 611 aaKnown RBP6.68□□□□□ -1.34
CBX1P4-201ENST00000439415 PSMA6P60900 246 aaKnown RBP6.68□□□□□ -1.34
CBX1P4-201ENST00000439415 FOXK2Q01167 660 aa6.68□□□□□ -1.34
CBX1P4-201ENST00000439415 INTS6LQ5JSJ4 861 aaKnown RBP6.68□□□□□ -1.34
CBX1P4-201ENST00000439415 NOL8Q76FK4 1167 aaKnown RBP6.68□□□□□ -1.34
CBX1P4-201ENST00000439415 MCF2L2Q86YR7 1114 aa6.68□□□□□ -1.34
CBX1P4-201ENST00000439415 SLC9A9Q8IVB4 645 aa6.68□□□□□ -1.34
CBX1P4-201ENST00000439415 STAC3Q96MF2 364 aa6.68□□□□□ -1.34
CBX1P4-201ENST00000439415 ETNK1Q9HBU6 452 aa6.68□□□□□ -1.34
CBX1P4-201ENST00000439415 SRA1Q9HD15 236 aaKnown RBP6.68□□□□□ -1.34
CBX1P4-201ENST00000439415 SCHIP1Q9P0W5 487 aaPredicted RBP6.68□□□□□ -1.34
CBX1P4-201ENST00000439415 ARID4BQ4LE39 1312 aaPredicted RBP6.68□□□□□ -1.34
CBX1P4-201ENST00000439415 TLL1O43897 1013 aa6.67□□□□□ -1.34
CBX1P4-201ENST00000439415 ZPR1O75312 459 aa6.67□□□□□ -1.34
CBX1P4-201ENST00000439415 FGRP09769 529 aa6.67□□□□□ -1.34
CBX1P4-201ENST00000439415 IGBP1P78318 339 aa6.67□□□□□ -1.34
CBX1P4-201ENST00000439415 DNM1Q05193 864 aaKnown RBP6.67□□□□□ -1.34
CBX1P4-201ENST00000439415 NFE2L2Q16236 605 aa6.67□□□□□ -1.34
CBX1P4-201ENST00000439415 PTPROQ16827 1216 aa6.67□□□□□ -1.34
CBX1P4-201ENST00000439415 ADGRD1Q6QNK2 874 aa6.67□□□□□ -1.34
CBX1P4-201ENST00000439415 EDEM1Q92611 657 aa6.67□□□□□ -1.34
CBX1P4-201ENST00000439415 BUD13Q9BRD0 619 aaKnown RBP eCLIP6.67□□□□□ -1.34
CBX1P4-201ENST00000439415 SLC6A16Q9GZN6 736 aa6.67□□□□□ -1.34
CBX1P4-201ENST00000439415 MAP4K5Q9Y4K4 846 aa6.67□□□□□ -1.34
CBX1P4-201ENST00000439415 A6NJY4 79 aa6.66□□□□□ -1.34
CBX1P4-201ENST00000439415 HRO43593 1189 aa6.66□□□□□ -1.34
CBX1P4-201ENST00000439415 RAB11FIP3O75154 756 aa6.66□□□□□ -1.34
CBX1P4-201ENST00000439415 PDGFAP04085 211 aa6.66□□□□□ -1.34
CBX1P4-201ENST00000439415 PCSK2P16519 638 aa6.66□□□□□ -1.34
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