RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000428394.6

HCLS1-202, Transcript of hematopoietic cell-specific Lyn substrate 1, humanhuman

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Gene HCLS1, Length 1,560 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HCLS1-202ENST00000428394 USP42Q9H9J4 1324 aaKnown RBP20.42■□□□□ 0.86
HCLS1-202ENST00000428394 LETM1O95202 739 aaPredicted RBP20.42■□□□□ 0.86
HCLS1-202ENST00000428394 HSPA4P34932 840 aa20.42■□□□□ 0.86
HCLS1-202ENST00000428394 HSP90AA2PQ14568 343 aaPredicted RBP20.42■□□□□ 0.86
HCLS1-202ENST00000428394 UVSSAQ2YD98 709 aa20.42■□□□□ 0.86
HCLS1-202ENST00000428394 RBSNQ9H1K0 784 aa20.42■□□□□ 0.86
HCLS1-202ENST00000428394 HDAC5Q9UQL6 1122 aa20.42■□□□□ 0.86
HCLS1-202ENST00000428394 PKP1Q13835 747 aa20.42■□□□□ 0.86
HCLS1-202ENST00000428394 TAF7Q15545 349 aaPredicted RBP20.42■□□□□ 0.86
HCLS1-202ENST00000428394 OVOS2A0A0G2JMS6 1433 aa20.41■□□□□ 0.86
HCLS1-202ENST00000428394 UBTFL1P0CB47 393 aaPredicted RBP20.41■□□□□ 0.86
HCLS1-202ENST00000428394 PRIM1P49642 420 aaKnown RBP20.41■□□□□ 0.86
HCLS1-202ENST00000428394 POLA2Q14181 598 aa20.41■□□□□ 0.86
HCLS1-202ENST00000428394 MAP7D2Q96T17 732 aa20.41■□□□□ 0.86
HCLS1-202ENST00000428394 EXOC6BQ9Y2D4 811 aa20.41■□□□□ 0.86
HCLS1-202ENST00000428394 ZKSCAN5Q9Y2L8 839 aa20.41■□□□□ 0.86
HCLS1-202ENST00000428394 F6X3S4 739 aa20.4■□□□□ 0.86
HCLS1-202ENST00000428394 RAD50Q92878 1312 aa20.39■□□□□ 0.86
HCLS1-202ENST00000428394 APBB1O00213 710 aa20.39■□□□□ 0.85
HCLS1-202ENST00000428394 ANKLE2Q86XL3 938 aa20.39■□□□□ 0.85
HCLS1-202ENST00000428394 ANO2Q9NQ90 1003 aa20.39■□□□□ 0.85
HCLS1-202ENST00000428394 LTBP4Q8N2S1 1624 aa20.39■□□□□ 0.85
HCLS1-202ENST00000428394 CEMIPQ8WUJ3 1361 aa20.39■□□□□ 0.85
HCLS1-202ENST00000428394 LMO7Q8WWI1 1683 aa20.38■□□□□ 0.85
HCLS1-202ENST00000428394 TMEM63CQ9P1W3 806 aa20.38■□□□□ 0.85
HCLS1-202ENST00000428394 ATP6V1DQ9Y5K8 247 aa20.38■□□□□ 0.85
HCLS1-202ENST00000428394 TTC41PQ6P2S7 1318 aa20.38■□□□□ 0.85
HCLS1-202ENST00000428394 CHD2O14647 1828 aaKnown RBP20.38■□□□□ 0.85
HCLS1-202ENST00000428394 KIF1BPQ96EK5 621 aa20.38■□□□□ 0.85
HCLS1-202ENST00000428394 TSPY26PQ9H489 355 aa20.38■□□□□ 0.85
HCLS1-202ENST00000428394 RGPD8O14715 1765 aaPredicted RBP20.38■□□□□ 0.85
HCLS1-202ENST00000428394 PNMA6EA0A0J9YXQ4 647 aa20.37■□□□□ 0.85
HCLS1-202ENST00000428394 TRIM6-TRIM34B2RNG4 842 aa20.37■□□□□ 0.85
HCLS1-202ENST00000428394 NCAPD2Q15021 1401 aa20.37■□□□□ 0.85
HCLS1-202ENST00000428394 KIAA1211Q6ZU35 1233 aa20.37■□□□□ 0.85
HCLS1-202ENST00000428394 NGDNQ8NEJ9 315 aaKnown RBP20.37■□□□□ 0.85
HCLS1-202ENST00000428394 USP44Q9H0E7 712 aa20.37■□□□□ 0.85
HCLS1-202ENST00000428394 FOXO3O43524 673 aa20.36■□□□□ 0.85
HCLS1-202ENST00000428394 HOXC9P31274 260 aa20.36■□□□□ 0.85
HCLS1-202ENST00000428394 MTERF4Q7Z6M4 381 aaKnown RBP20.36■□□□□ 0.85
HCLS1-202ENST00000428394 LRRFIP2Q9Y608 721 aaKnown RBP20.36■□□□□ 0.85
HCLS1-202ENST00000428394 NPHP4O75161 1426 aaPredicted RBP20.35■□□□□ 0.85
HCLS1-202ENST00000428394 CNTROBQ8N137 903 aa20.35■□□□□ 0.85
HCLS1-202ENST00000428394 PDCL3Q9H2J4 239 aa20.35■□□□□ 0.85
HCLS1-202ENST00000428394 ZSCAN21Q9Y5A6 473 aaPredicted RBP20.35■□□□□ 0.85
HCLS1-202ENST00000428394 SGSM2O43147 1006 aa20.34■□□□□ 0.85
HCLS1-202ENST00000428394 MTX1Q13505 466 aa20.34■□□□□ 0.85
HCLS1-202ENST00000428394 RUFY2Q8WXA3 655 aa20.34■□□□□ 0.85
HCLS1-202ENST00000428394 AMOTL2Q9Y2J4 779 aa20.34■□□□□ 0.85
HCLS1-202ENST00000428394 SYCE3A1L190 88 aa20.34■□□□□ 0.85
HCLS1-202ENST00000428394 RILPL2Q969X0 211 aa20.34■□□□□ 0.85
HCLS1-202ENST00000428394 MIS18AQ9NYP9 233 aa20.34■□□□□ 0.85
HCLS1-202ENST00000428394 PALD1Q9ULE6 856 aa20.34■□□□□ 0.85
HCLS1-202ENST00000428394 LTN1O94822 1766 aa20.33■□□□□ 0.84
HCLS1-202ENST00000428394 RPAP1Q9BWH6 1393 aaPredicted RBP20.33■□□□□ 0.84
HCLS1-202ENST00000428394 HDGFL1Q5TGJ6 251 aa20.33■□□□□ 0.84
HCLS1-202ENST00000428394 RHPN1Q8TCX5 695 aa20.32■□□□□ 0.84
HCLS1-202ENST00000428394 ZSCAN31Q96LW9 406 aaPredicted RBP20.32■□□□□ 0.84
HCLS1-202ENST00000428394 TM6SF1Q9BZW5 370 aa20.32■□□□□ 0.84
HCLS1-202ENST00000428394 ERC1Q8IUD2 1116 aa20.31■□□□□ 0.84
HCLS1-202ENST00000428394 IL17REQ8NFR9 667 aa20.31■□□□□ 0.84
HCLS1-202ENST00000428394 PI4K2BQ8TCG2 481 aa20.31■□□□□ 0.84
HCLS1-202ENST00000428394 RBM27Q9P2N5 1060 aaKnown RBP20.31■□□□□ 0.84
HCLS1-202ENST00000428394 GLRX3O76003 335 aaKnown RBP20.3■□□□□ 0.84
HCLS1-202ENST00000428394 CCDC183Q5T5S1 534 aa20.3■□□□□ 0.84
HCLS1-202ENST00000428394 KCNB2Q92953 911 aa20.3■□□□□ 0.84
HCLS1-202ENST00000428394 TTC14Q96N46 770 aa20.3■□□□□ 0.84
HCLS1-202ENST00000428394 SH2B1Q9NRF2 756 aaPredicted RBP20.3■□□□□ 0.84
HCLS1-202ENST00000428394 LIMCH1Q9UPQ0 1083 aa20.3■□□□□ 0.84
HCLS1-202ENST00000428394 GPATCH3Q96I76 525 aa20.29■□□□□ 0.84
HCLS1-202ENST00000428394 NFAT5O94916 1531 aa20.29■□□□□ 0.84
HCLS1-202ENST00000428394 ALDH1L1O75891 902 aa20.29■□□□□ 0.84
HCLS1-202ENST00000428394 NLRP6P59044 892 aa20.29■□□□□ 0.84
HCLS1-202ENST00000428394 UBAP1LF5GYI3 381 aa20.28■□□□□ 0.84
HCLS1-202ENST00000428394 HIP1O00291 1037 aa20.28■□□□□ 0.84
HCLS1-202ENST00000428394 ZSCAN22P10073 491 aaPredicted RBP20.28■□□□□ 0.84
HCLS1-202ENST00000428394 UBE2HP62256 183 aa20.28■□□□□ 0.84
HCLS1-202ENST00000428394 PPP1R42Q7Z4L9 355 aa20.28■□□□□ 0.84
HCLS1-202ENST00000428394 LSG1Q9H089 658 aaKnown RBP20.28■□□□□ 0.84
HCLS1-202ENST00000428394 EIF2AK3Q9NZJ5 1116 aaKnown RBP20.28■□□□□ 0.84
HCLS1-202ENST00000428394 SURF6O75683 361 aaKnown RBP20.27■□□□□ 0.84
HCLS1-202ENST00000428394 DYNC1I1O14576 645 aa20.26■□□□□ 0.83
HCLS1-202ENST00000428394 TPM3P06753 285 aa20.26■□□□□ 0.83
HCLS1-202ENST00000428394 DNAAF4Q8WXU2 420 aa20.26■□□□□ 0.83
HCLS1-202ENST00000428394 SNX14Q9Y5W7 946 aa20.26■□□□□ 0.83
HCLS1-202ENST00000428394 CAMTA1Q9Y6Y1 1673 aa20.26■□□□□ 0.83
HCLS1-202ENST00000428394 BEND3Q5T5X7 828 aa20.25■□□□□ 0.83
HCLS1-202ENST00000428394 VPS53Q5VIR6 699 aa20.25■□□□□ 0.83
HCLS1-202ENST00000428394 SLC26A8Q96RN1 970 aa20.25■□□□□ 0.83
HCLS1-202ENST00000428394 ZNF335Q9H4Z2 1342 aaPredicted RBP20.25■□□□□ 0.83
HCLS1-202ENST00000428394 EIF4A1P60842 406 aaKnown RBP20.25■□□□□ 0.83
HCLS1-202ENST00000428394 KIAA2012Q0VF49 1180 aa20.25■□□□□ 0.83
HCLS1-202ENST00000428394 SASS6Q6UVJ0 657 aa20.25■□□□□ 0.83
HCLS1-202ENST00000428394 IP6K1Q92551 441 aa20.25■□□□□ 0.83
HCLS1-202ENST00000428394 SRGAP3O43295 1099 aa20.24■□□□□ 0.83
HCLS1-202ENST00000428394 USP48Q86UV5 1035 aa20.24■□□□□ 0.83
HCLS1-202ENST00000428394 UNC5CLQ8IV45 518 aa20.24■□□□□ 0.83
HCLS1-202ENST00000428394 SNRKQ9NRH2 765 aa20.24■□□□□ 0.83
HCLS1-202ENST00000428394 NSFL1CQ9UNZ2 370 aaKnown RBP20.24■□□□□ 0.83
HCLS1-202ENST00000428394 CCDC171Q6TFL3 1326 aa20.24■□□□□ 0.83
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