RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000422596.1

TRDN-203, Transcript of triadin, humanhuman

TSL 3

Gene TRDN, Length 776 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRDN-203ENST00000422596 PCDHGA11Q9Y5H2 935 aa7.54□□□□□ -1.2
TRDN-203ENST00000422596 USP3Q9Y6I4 520 aa7.54□□□□□ -1.2
TRDN-203ENST00000422596 BNIP3LO60238 219 aa7.53□□□□□ -1.2
TRDN-203ENST00000422596 KANK4Q5T7N3 995 aaPredicted RBP7.53□□□□□ -1.2
TRDN-203ENST00000422596 C1orf229Q6ZS94 237 aaPredicted RBP7.53□□□□□ -1.2
TRDN-203ENST00000422596 ZNF295-AS1Q8N0V1 137 aa7.53□□□□□ -1.2
TRDN-203ENST00000422596 KLRG1Q96E93 195 aa7.53□□□□□ -1.2
TRDN-203ENST00000422596 ABHD17AQ96GS6 310 aa7.53□□□□□ -1.2
TRDN-203ENST00000422596 OXCT2Q9BYC2 517 aaPredicted RBP7.53□□□□□ -1.2
TRDN-203ENST00000422596 NSFL1CQ9UNZ2 370 aaKnown RBP7.53□□□□□ -1.2
TRDN-203ENST00000422596 C2CD2LO14523 706 aa7.52□□□□□ -1.21
TRDN-203ENST00000422596 ATP4AP20648 1035 aa7.52□□□□□ -1.21
TRDN-203ENST00000422596 MAP2K3P46734 347 aa7.52□□□□□ -1.21
TRDN-203ENST00000422596 LBRQ14739 615 aaKnown RBP7.52□□□□□ -1.21
TRDN-203ENST00000422596 EFHC2Q5JST6 749 aa7.52□□□□□ -1.21
TRDN-203ENST00000422596 KANK3Q6NY19 840 aa7.52□□□□□ -1.21
TRDN-203ENST00000422596 TRIM50Q86XT4 487 aa7.52□□□□□ -1.21
TRDN-203ENST00000422596 PBXIP1Q96AQ6 731 aa7.52□□□□□ -1.21
TRDN-203ENST00000422596 AIDAQ96BJ3 306 aa7.52□□□□□ -1.21
TRDN-203ENST00000422596 NDFIP2Q9NV92 336 aa7.52□□□□□ -1.21
TRDN-203ENST00000422596 ACIN1Q9UKV3 1341 aaKnown RBP7.52□□□□□ -1.21
TRDN-203ENST00000422596 OIP5O43482 229 aa7.51□□□□□ -1.21
TRDN-203ENST00000422596 ATP1A2P50993 1020 aa7.51□□□□□ -1.21
TRDN-203ENST00000422596 CTBSQ01459 385 aa7.51□□□□□ -1.21
TRDN-203ENST00000422596 SLC4A9Q96Q91 983 aa7.51□□□□□ -1.21
TRDN-203ENST00000422596 NIFKQ9BYG3 293 aaKnown RBP7.51□□□□□ -1.21
TRDN-203ENST00000422596 CRISPLD1Q9H336 500 aa7.51□□□□□ -1.21
TRDN-203ENST00000422596 DNAAF2Q9NVR5 837 aaKnown RBP7.51□□□□□ -1.21
TRDN-203ENST00000422596 IQSEC3Q9UPP2 1182 aaPredicted RBP7.51□□□□□ -1.21
TRDN-203ENST00000422596 PHF24Q9UPV7 400 aa7.51□□□□□ -1.21
TRDN-203ENST00000422596 DNMT3AQ9Y6K1 912 aaPredicted RBP7.51□□□□□ -1.21
TRDN-203ENST00000422596 SHISA8B8ZZ34 492 aa7.5□□□□□ -1.21
TRDN-203ENST00000422596 GPAT2Q6NUI2 795 aa7.5□□□□□ -1.21
TRDN-203ENST00000422596 LRRC4BQ9NT99 713 aa7.5□□□□□ -1.21
TRDN-203ENST00000422596 HCN2Q9UL51 889 aa7.5□□□□□ -1.21
TRDN-203ENST00000422596 ATXN7L1Q9ULK2 861 aaPredicted RBP7.5□□□□□ -1.21
TRDN-203ENST00000422596 TRBV21OR9-2A0A075B6F4 123 aaPredicted RBP7.49□□□□□ -1.21
TRDN-203ENST00000422596 A6NJY4 79 aa7.49□□□□□ -1.21
TRDN-203ENST00000422596 CDK2AP1O14519 115 aa7.49□□□□□ -1.21
TRDN-203ENST00000422596 FGFR3P22607 806 aa7.49□□□□□ -1.21
TRDN-203ENST00000422596 SNRPNP63162 240 aaKnown RBP7.49□□□□□ -1.21
TRDN-203ENST00000422596 GTF2IP78347 998 aa7.49□□□□□ -1.21
TRDN-203ENST00000422596 MTFR1Q15390 333 aa7.49□□□□□ -1.21
TRDN-203ENST00000422596 LARP1Q6PKG0 1096 aaKnown RBP7.49□□□□□ -1.21
TRDN-203ENST00000422596 BEND7Q8N7W2 519 aaPredicted RBP7.49□□□□□ -1.21
TRDN-203ENST00000422596 GALNT6Q8NCL4 622 aa7.49□□□□□ -1.21
TRDN-203ENST00000422596 ZCCHC2Q9C0B9 1178 aaKnown RBP7.49□□□□□ -1.21
TRDN-203ENST00000422596 PARP3Q9Y6F1 533 aa7.49□□□□□ -1.21
TRDN-203ENST00000422596 FAM196BA6NMK8 535 aa7.48□□□□□ -1.21
TRDN-203ENST00000422596 ZBTB7BO15156 539 aaPredicted RBP7.48□□□□□ -1.21
TRDN-203ENST00000422596 ATG7O95352 703 aa7.48□□□□□ -1.21
TRDN-203ENST00000422596 BMP4P12644 408 aa7.48□□□□□ -1.21
TRDN-203ENST00000422596 RASA1P20936 1047 aa7.48□□□□□ -1.21
TRDN-203ENST00000422596 CDCA8Q53HL2 280 aa7.48□□□□□ -1.21
TRDN-203ENST00000422596 LARGE2Q8N3Y3 721 aa7.48□□□□□ -1.21
TRDN-203ENST00000422596 OGFOD1Q8N543 542 aa7.48□□□□□ -1.21
TRDN-203ENST00000422596 SERBP1Q8NC51 408 aaKnown RBP eCLIP7.48□□□□□ -1.21
TRDN-203ENST00000422596 A0A1W2PNR3 127 aa7.47□□□□□ -1.21
TRDN-203ENST00000422596 PHF20L1A8MW92 1017 aa7.47□□□□□ -1.21
TRDN-203ENST00000422596 CLDN10P78369 228 aa7.47□□□□□ -1.21
TRDN-203ENST00000422596 PTK7Q13308 1070 aa7.47□□□□□ -1.21
TRDN-203ENST00000422596 ELOAQ14241 798 aaKnown RBP7.47□□□□□ -1.21
TRDN-203ENST00000422596 SUZ12Q15022 739 aaKnown RBP7.47□□□□□ -1.21
TRDN-203ENST00000422596 DCAF5Q96JK2 942 aa7.47□□□□□ -1.21
TRDN-203ENST00000422596 ZNF358Q9NW07 568 aa7.47□□□□□ -1.21
TRDN-203ENST00000422596 CABP1Q9NZU7 370 aa7.47□□□□□ -1.21
TRDN-203ENST00000422596 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa7.47□□□□□ -1.21
TRDN-203ENST00000422596 ITGB2P05107 769 aa7.46□□□□□ -1.22
TRDN-203ENST00000422596 PSME1Q06323 249 aa7.46□□□□□ -1.22
TRDN-203ENST00000422596 ARSJQ5FYB0 599 aaPredicted RBP7.46□□□□□ -1.22
TRDN-203ENST00000422596 PODNQ7Z5L7 613 aa7.46□□□□□ -1.22
TRDN-203ENST00000422596 C1orf216Q8TAB5 229 aa7.46□□□□□ -1.22
TRDN-203ENST00000422596 EDARADDQ8WWZ3 215 aa7.46□□□□□ -1.22
TRDN-203ENST00000422596 GGA1Q9UJY5 639 aa7.46□□□□□ -1.22
TRDN-203ENST00000422596 PCDHGC4Q9Y5F7 938 aa7.46□□□□□ -1.22
TRDN-203ENST00000422596 DCDC2BA2VCK2 349 aa7.45□□□□□ -1.22
TRDN-203ENST00000422596 USP17L15C9J2P7 530 aa7.45□□□□□ -1.22
TRDN-203ENST00000422596 USP17L10C9JJH3 530 aa7.45□□□□□ -1.22
TRDN-203ENST00000422596 USP17L13C9JLJ4 530 aa7.45□□□□□ -1.22
TRDN-203ENST00000422596 USP17L12C9JPN9 530 aa7.45□□□□□ -1.22
TRDN-203ENST00000422596 USP17L11C9JVI0 530 aa7.45□□□□□ -1.22
TRDN-203ENST00000422596 USP17L21D6R901 530 aa7.45□□□□□ -1.22
TRDN-203ENST00000422596 USP17L18D6R9N7 530 aa7.45□□□□□ -1.22
TRDN-203ENST00000422596 USP17L22D6RA61 530 aa7.45□□□□□ -1.22
TRDN-203ENST00000422596 USP17L17D6RBQ6 530 aa7.45□□□□□ -1.22
TRDN-203ENST00000422596 USP17L19D6RCP7 530 aa7.45□□□□□ -1.22
TRDN-203ENST00000422596 USP17L20D6RJB6 530 aa7.45□□□□□ -1.22
TRDN-203ENST00000422596 ATXN7O15265 892 aaPredicted RBP7.45□□□□□ -1.22
TRDN-203ENST00000422596 USP17L24Q0WX57 530 aa7.45□□□□□ -1.22
TRDN-203ENST00000422596 NBPF1Q3BBV0 1214 aa7.45□□□□□ -1.22
TRDN-203ENST00000422596 CRTC2Q53ET0 693 aaPredicted RBP7.45□□□□□ -1.22
TRDN-203ENST00000422596 TBCELQ5QJ74 424 aa7.45□□□□□ -1.22
TRDN-203ENST00000422596 CCDC102BQ68D86 513 aa7.45□□□□□ -1.22
TRDN-203ENST00000422596 NLRP8Q86W28 1048 aa7.45□□□□□ -1.22
TRDN-203ENST00000422596 SIX5Q8N196 739 aa7.45□□□□□ -1.22
TRDN-203ENST00000422596 ZDHHC1Q8WTX9 485 aa7.45□□□□□ -1.22
TRDN-203ENST00000422596 ZIC5Q96T25 663 aa7.45□□□□□ -1.22
TRDN-203ENST00000422596 GDF2Q9UK05 429 aaPredicted RBP7.45□□□□□ -1.22
TRDN-203ENST00000422596 BACH1O14867 736 aa7.44□□□□□ -1.22
TRDN-203ENST00000422596 MAPTP10636 758 aaKnown RBP7.44□□□□□ -1.22
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