RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000421540.1

NFS1-207, Transcript of NFS1, cysteine desulfurase, humanhuman

TSL 5

Gene NFS1, Length 563 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NFS1-207ENST00000421540 KCNQ3O43525 872 aa26.01■■□□□ 1.75
NFS1-207ENST00000421540 FKBP8Q14318 412 aa26.01■■□□□ 1.75
NFS1-207ENST00000421540 CICQ96RK0 1608 aaPredicted RBP26.01■■□□□ 1.75
NFS1-207ENST00000421540 A0A087WZG4 1122 aa26■■□□□ 1.75
NFS1-207ENST00000421540 USPL1Q5W0Q7 1092 aa26■■□□□ 1.75
NFS1-207ENST00000421540 NARFQ9UHQ1 456 aa26■■□□□ 1.75
NFS1-207ENST00000421540 COL15A1P39059 1388 aa25.99■■□□□ 1.75
NFS1-207ENST00000421540 MYH14Q7Z406 1995 aaKnown RBP25.99■■□□□ 1.75
NFS1-207ENST00000421540 PNISRQ8TF01 805 aaKnown RBP25.99■■□□□ 1.75
NFS1-207ENST00000421540 SNRPA1P09661 255 aaKnown RBP25.98■■□□□ 1.75
NFS1-207ENST00000421540 TGFB2P61812 414 aa25.98■■□□□ 1.75
NFS1-207ENST00000421540 WDR43Q15061 677 aaKnown RBP eCLIP25.98■■□□□ 1.75
NFS1-207ENST00000421540 PRKRIP1Q9H875 184 aaPredicted RBP25.98■■□□□ 1.75
NFS1-207ENST00000421540 YBX3P16989 372 aaKnown RBP eCLIP25.97■■□□□ 1.752e-6■■■■□ 20.2
NFS1-207ENST00000421540 EIF5P55010 431 aaKnown RBP25.96■■□□□ 1.75
NFS1-207ENST00000421540 ZNF330Q9Y3S2 320 aaPredicted RBP25.96■■□□□ 1.75
NFS1-207ENST00000421540 VIRMAQ69YN4 1812 aaKnown RBP25.95■■□□□ 1.75
NFS1-207ENST00000421540 IL6STP40189 918 aaPredicted RBP25.95■■□□□ 1.74
NFS1-207ENST00000421540 A1BGP04217 495 aa25.94■■□□□ 1.74
NFS1-207ENST00000421540 TM4SF1P30408 202 aa25.94■■□□□ 1.74
NFS1-207ENST00000421540 RIPK4P57078 832 aa25.94■■□□□ 1.74
NFS1-207ENST00000421540 UBR2Q8IWV8 1755 aa25.93■■□□□ 1.74
NFS1-207ENST00000421540 MIS18AQ9NYP9 233 aa25.93■■□□□ 1.74
NFS1-207ENST00000421540 USP16Q9Y5T5 823 aa25.93■■□□□ 1.74
NFS1-207ENST00000421540 DDR1Q08345 913 aa25.91■■□□□ 1.74
NFS1-207ENST00000421540 LMOD3Q0VAK6 560 aa25.91■■□□□ 1.74
NFS1-207ENST00000421540 WWC3Q9ULE0 1092 aa25.91■■□□□ 1.74
NFS1-207ENST00000421540 SIPA1L3O60292 1781 aaPredicted RBP25.9■■□□□ 1.74
NFS1-207ENST00000421540 A0A0G2JLW4 131 aa25.9■■□□□ 1.74
NFS1-207ENST00000421540 POLRMTO00411 1230 aaKnown RBP25.9■■□□□ 1.74
NFS1-207ENST00000421540 THUMPD2Q9BTF0 503 aaKnown RBP25.9■■□□□ 1.74
NFS1-207ENST00000421540 TMPOP42166 694 aaKnown RBP25.89■■□□□ 1.74
NFS1-207ENST00000421540 NFIXQ14938 502 aa25.89■■□□□ 1.74
NFS1-207ENST00000421540 TBC1D2BQ9UPU7 963 aa25.89■■□□□ 1.74
NFS1-207ENST00000421540 C10orf71Q711Q0 1435 aa25.88■■□□□ 1.73
NFS1-207ENST00000421540 C4AP0C0L4 1744 aa25.88■■□□□ 1.73
NFS1-207ENST00000421540 PRAMEF22A3QJZ6 481 aa25.88■■□□□ 1.73
NFS1-207ENST00000421540 ZNF316A6NFI3 1004 aaPredicted RBP25.88■■□□□ 1.73
NFS1-207ENST00000421540 RUNDC1Q96C34 613 aa25.88■■□□□ 1.73
NFS1-207ENST00000421540 BCL2L12Q9HB09 334 aa25.88■■□□□ 1.73
NFS1-207ENST00000421540 CCDC146Q8IYE0 955 aa25.87■■□□□ 1.73
NFS1-207ENST00000421540 ADAMTS8Q9UP79 889 aa25.87■■□□□ 1.73
NFS1-207ENST00000421540 UTRNP46939 3433 aa25.87■■□□□ 1.73
NFS1-207ENST00000421540 DPEP1P16444 411 aa25.86■■□□□ 1.73
NFS1-207ENST00000421540 BICDL1Q6ZP65 573 aa25.86■■□□□ 1.73
NFS1-207ENST00000421540 SERPINB2P05120 415 aa25.85■■□□□ 1.73
NFS1-207ENST00000421540 NEUROD2Q15784 382 aa25.85■■□□□ 1.73
NFS1-207ENST00000421540 DZIP3Q86Y13 1208 aaKnown RBP25.85■■□□□ 1.73
NFS1-207ENST00000421540 BCS1LQ9Y276 419 aa25.85■■□□□ 1.73
NFS1-207ENST00000421540 PXDNLA1KZ92 1463 aa25.85■■□□□ 1.73
NFS1-207ENST00000421540 EIF4A1P60842 406 aaKnown RBP25.84■■□□□ 1.73
NFS1-207ENST00000421540 ZNF784Q8NCA9 323 aaPredicted RBP25.84■■□□□ 1.73
NFS1-207ENST00000421540 TSPYL4Q9UJ04 414 aa25.84■■□□□ 1.73
NFS1-207ENST00000421540 PIP4K2AP48426 406 aaPredicted RBP25.83■■□□□ 1.73
NFS1-207ENST00000421540 PIM2Q9P1W9 311 aa25.83■■□□□ 1.73
NFS1-207ENST00000421540 RRP7AQ9Y3A4 280 aaKnown RBP25.83■■□□□ 1.73
NFS1-207ENST00000421540 GIGYF1O75420 1035 aaPredicted RBP25.82■■□□□ 1.72
NFS1-207ENST00000421540 BABAM1Q9NWV8 329 aa25.82■■□□□ 1.72
NFS1-207ENST00000421540 CAMTA2O94983 1202 aa25.81■■□□□ 1.72
NFS1-207ENST00000421540 TBC1D9BQ66K14 1250 aa25.81■■□□□ 1.72
NFS1-207ENST00000421540 SETDB2Q96T68 719 aa25.81■■□□□ 1.72
NFS1-207ENST00000421540 ZNF652Q9Y2D9 606 aa25.8■■□□□ 1.72
NFS1-207ENST00000421540 CLEC4GQ6UXB4 293 aa25.79■■□□□ 1.72
NFS1-207ENST00000421540 NBPF26B4DH59 902 aa25.78■■□□□ 1.72
NFS1-207ENST00000421540 NPHP1O15259 732 aa25.78■■□□□ 1.72
NFS1-207ENST00000421540 KCNA3P22001 575 aa25.78■■□□□ 1.72
NFS1-207ENST00000421540 DALRD3Q5D0E6 543 aaKnown RBP25.78■■□□□ 1.72
NFS1-207ENST00000421540 NBPF10Q6P3W6 841 aaKnown RBP25.78■■□□□ 1.72
NFS1-207ENST00000421540 NBPF15Q8N660 670 aa25.78■■□□□ 1.72
NFS1-207ENST00000421540 CHRNA5P30532 468 aa25.77■■□□□ 1.72
NFS1-207ENST00000421540 CARMIL3Q8ND23 1372 aa25.76■■□□□ 1.71
NFS1-207ENST00000421540 GOLGB1Q14789 3259 aaKnown RBP25.75■■□□□ 1.71
NFS1-207ENST00000421540 CHD4Q14839 1912 aa25.75■■□□□ 1.71
NFS1-207ENST00000421540 ARHGAP27Q6ZUM4 889 aa25.75■■□□□ 1.71
NFS1-207ENST00000421540 KIF13BQ9NQT8 1826 aa25.74■■□□□ 1.71
NFS1-207ENST00000421540 H0YIN7 160 aa25.74■■□□□ 1.71
NFS1-207ENST00000421540 RGL2O15211 777 aa25.74■■□□□ 1.71
NFS1-207ENST00000421540 ANP32CO43423 234 aa25.74■■□□□ 1.71
NFS1-207ENST00000421540 NGEFQ8N5V2 710 aa25.74■■□□□ 1.71
NFS1-207ENST00000421540 TRIM35Q9UPQ4 493 aa25.74■■□□□ 1.71
NFS1-207ENST00000421540 LAS1LQ9Y4W2 734 aaKnown RBP25.74■■□□□ 1.71
NFS1-207ENST00000421540 DLG5Q8TDM6 1919 aa25.74■■□□□ 1.71
NFS1-207ENST00000421540 PDZRN3Q9UPQ7 1066 aa25.73■■□□□ 1.71
NFS1-207ENST00000421540 PDE6BP35913 854 aa25.72■■□□□ 1.71
NFS1-207ENST00000421540 C2CD5Q86YS7 1000 aa25.72■■□□□ 1.71
NFS1-207ENST00000421540 CNBD1Q8NA66 436 aa25.72■■□□□ 1.71
NFS1-207ENST00000421540 BRIP1Q9BX63 1249 aa25.72■■□□□ 1.71
NFS1-207ENST00000421540 MYL6BP14649 208 aa25.71■■□□□ 1.71
NFS1-207ENST00000421540 ST5P78524 1137 aa25.71■■□□□ 1.71
NFS1-207ENST00000421540 PRR5LQ6MZQ0 368 aa25.71■■□□□ 1.71
NFS1-207ENST00000421540 ERBB4Q15303 1308 aa25.7■■□□□ 1.71
NFS1-207ENST00000421540 CHL1O00533 1208 aa25.7■■□□□ 1.7
NFS1-207ENST00000421540 EIF2S2P20042 333 aaKnown RBP25.7■■□□□ 1.7
NFS1-207ENST00000421540 KIF6Q6ZMV9 814 aa25.7■■□□□ 1.7
NFS1-207ENST00000421540 APAF1O14727 1248 aa25.69■■□□□ 1.7
NFS1-207ENST00000421540 NBPF5PQ86XG9 351 aaPredicted RBP25.69■■□□□ 1.7
NFS1-207ENST00000421540 NIP7Q9Y221 180 aaKnown RBP eCLIP25.69■■□□□ 1.7
NFS1-207ENST00000421540 N4BP2Q86UW6 1770 aaPredicted RBP25.69■■□□□ 1.7
NFS1-207ENST00000421540 ERVV-1B6SEH8 477 aa25.68■■□□□ 1.7
NFS1-207ENST00000421540 TTLL6Q8N841 843 aa25.68■■□□□ 1.7
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 22.8 ms