RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000418244.5

FOXD3-AS1-201, FOXD3 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene FOXD3-AS1, Length 941 nt, Biotype antisense RNA, Subcellular localisation Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXD3-AS1-201ENST00000418244 ANP32CO43423 234 aa23.31■■□□□ 1.32
FOXD3-AS1-201ENST00000418244 KCNQ3O43525 872 aa23.31■■□□□ 1.32
FOXD3-AS1-201ENST00000418244 MSL1Q68DK7 614 aa23.31■■□□□ 1.32
FOXD3-AS1-201ENST00000418244 ARHGEF1Q92888 912 aaKnown RBP23.31■■□□□ 1.32
FOXD3-AS1-201ENST00000418244 CCDC146Q8IYE0 955 aa23.3■■□□□ 1.32
FOXD3-AS1-201ENST00000418244 TEX13AQ9BXU3 409 aaPredicted RBP23.3■■□□□ 1.32
FOXD3-AS1-201ENST00000418244 RIPK4P57078 832 aa23.29■■□□□ 1.32
FOXD3-AS1-201ENST00000418244 KLHL34Q8N239 644 aa23.29■■□□□ 1.32
FOXD3-AS1-201ENST00000418244 SOS1Q07889 1333 aaPredicted RBP23.29■■□□□ 1.32
FOXD3-AS1-201ENST00000418244 STARD3NLO95772 234 aa23.28■■□□□ 1.32
FOXD3-AS1-201ENST00000418244 LMOD3Q0VAK6 560 aa23.28■■□□□ 1.32
FOXD3-AS1-201ENST00000418244 PNISRQ8TF01 805 aaKnown RBP23.28■■□□□ 1.32
FOXD3-AS1-201ENST00000418244 CCDC184Q52MB2 194 aa23.27■■□□□ 1.32
FOXD3-AS1-201ENST00000418244 PELP1Q8IZL8 1130 aaKnown RBP23.27■■□□□ 1.32
FOXD3-AS1-201ENST00000418244 THUMPD2Q9BTF0 503 aaKnown RBP23.27■■□□□ 1.32
FOXD3-AS1-201ENST00000418244 ZBTB1Q9Y2K1 713 aa23.27■■□□□ 1.32
FOXD3-AS1-201ENST00000418244 RFC4P35249 363 aa23.26■■□□□ 1.31
FOXD3-AS1-201ENST00000418244 LAMB4A4D0S4 1761 aa23.25■■□□□ 1.31
FOXD3-AS1-201ENST00000418244 NLGN1Q8N2Q7 840 aa23.24■■□□□ 1.31
FOXD3-AS1-201ENST00000418244 USP42Q9H9J4 1324 aaKnown RBP23.24■■□□□ 1.31
FOXD3-AS1-201ENST00000418244 GYS1P13807 737 aa23.23■■□□□ 1.31
FOXD3-AS1-201ENST00000418244 MIS18AQ9NYP9 233 aa23.23■■□□□ 1.31
FOXD3-AS1-201ENST00000418244 RRP7AQ9Y3A4 280 aaKnown RBP23.23■■□□□ 1.31
FOXD3-AS1-201ENST00000418244 COL15A1P39059 1388 aa23.23■■□□□ 1.31
FOXD3-AS1-201ENST00000418244 SNRPA1P09661 255 aaKnown RBP23.22■■□□□ 1.31
FOXD3-AS1-201ENST00000418244 TRIM35Q9UPQ4 493 aa23.22■■□□□ 1.31
FOXD3-AS1-201ENST00000418244 EIF5P55010 431 aaKnown RBP23.21■■□□□ 1.31
FOXD3-AS1-201ENST00000418244 BABAM1Q9NWV8 329 aa23.21■■□□□ 1.31
FOXD3-AS1-201ENST00000418244 CANXP27824 592 aaKnown RBP23.2■■□□□ 1.3
FOXD3-AS1-201ENST00000418244 NEUROD2Q15784 382 aa23.2■■□□□ 1.3
FOXD3-AS1-201ENST00000418244 MRS2Q9HD23 443 aa23.2■■□□□ 1.3
FOXD3-AS1-201ENST00000418244 SRP68Q9UHB9 627 aaKnown RBP23.2■■□□□ 1.3
FOXD3-AS1-201ENST00000418244 USP16Q9Y5T5 823 aa23.2■■□□□ 1.3
FOXD3-AS1-201ENST00000418244 PRAMEF22A3QJZ6 481 aa23.19■■□□□ 1.3
FOXD3-AS1-201ENST00000418244 MMP10P09238 476 aa23.19■■□□□ 1.3
FOXD3-AS1-201ENST00000418244 IL6STP40189 918 aaPredicted RBP23.19■■□□□ 1.3
FOXD3-AS1-201ENST00000418244 NARFQ9UHQ1 456 aa23.19■■□□□ 1.3
FOXD3-AS1-201ENST00000418244 KIF13BQ9NQT8 1826 aa23.19■■□□□ 1.3
FOXD3-AS1-201ENST00000418244 EIF4A1P60842 406 aaKnown RBP23.18■■□□□ 1.3
FOXD3-AS1-201ENST00000418244 CD2APQ9Y5K6 639 aa23.18■■□□□ 1.3
FOXD3-AS1-201ENST00000418244 SCN7AQ01118 1682 aa23.17■■□□□ 1.3
FOXD3-AS1-201ENST00000418244 A0A087WZG4 1122 aa23.17■■□□□ 1.3
FOXD3-AS1-201ENST00000418244 GRIN3BO60391 1043 aa23.17■■□□□ 1.3
FOXD3-AS1-201ENST00000418244 A1BGP04217 495 aa23.17■■□□□ 1.3
FOXD3-AS1-201ENST00000418244 NLGN2Q8NFZ4 835 aa23.17■■□□□ 1.3
FOXD3-AS1-201ENST00000418244 APAF1O14727 1248 aa23.16■■□□□ 1.3
FOXD3-AS1-201ENST00000418244 ZPR1O75312 459 aa23.16■■□□□ 1.3
FOXD3-AS1-201ENST00000418244 FKBP8Q14318 412 aa23.16■■□□□ 1.3
FOXD3-AS1-201ENST00000418244 TSPYL4Q9UJ04 414 aa23.16■■□□□ 1.3
FOXD3-AS1-201ENST00000418244 USPL1Q5W0Q7 1092 aa23.15■■□□□ 1.3
FOXD3-AS1-201ENST00000418244 BCORQ6W2J9 1755 aa23.14■■□□□ 1.3
FOXD3-AS1-201ENST00000418244 BCL2L12Q9HB09 334 aa23.13■■□□□ 1.29
FOXD3-AS1-201ENST00000418244 CHL1O00533 1208 aa23.12■■□□□ 1.29
FOXD3-AS1-201ENST00000418244 TM4SF1P30408 202 aa23.12■■□□□ 1.29
FOXD3-AS1-201ENST00000418244 KIAA1551Q9HCM1 1747 aa23.11■■□□□ 1.29
FOXD3-AS1-201ENST00000418244 C10orf71Q711Q0 1435 aa23.11■■□□□ 1.29
FOXD3-AS1-201ENST00000418244 NBPF26B4DH59 902 aa23.11■■□□□ 1.29
FOXD3-AS1-201ENST00000418244 YBX3P16989 372 aaKnown RBP eCLIP23.11■■□□□ 1.29
FOXD3-AS1-201ENST00000418244 NBPF10Q6P3W6 841 aaKnown RBP23.11■■□□□ 1.29
FOXD3-AS1-201ENST00000418244 NBPF15Q8N660 670 aa23.11■■□□□ 1.29
FOXD3-AS1-201ENST00000418244 PARP3Q9Y6F1 533 aa23.11■■□□□ 1.29
FOXD3-AS1-201ENST00000418244 NRXN2Q9P2S2 1712 aa23.11■■□□□ 1.29
FOXD3-AS1-201ENST00000418244 AFDNP55196 1824 aaKnown RBP23.1■■□□□ 1.29
FOXD3-AS1-201ENST00000418244 DDR1Q08345 913 aa23.1■■□□□ 1.29
FOXD3-AS1-201ENST00000418244 NPM2Q86SE8 214 aaKnown RBP23.09■■□□□ 1.29
FOXD3-AS1-201ENST00000418244 ZNF330Q9Y3S2 320 aaPredicted RBP23.09■■□□□ 1.29
FOXD3-AS1-201ENST00000418244 PIP4K2AP48426 406 aaPredicted RBP23.08■■□□□ 1.29
FOXD3-AS1-201ENST00000418244 NCBP3Q53F19 620 aaKnown RBP23.08■■□□□ 1.29
FOXD3-AS1-201ENST00000418244 CFAP44Q96MT7 982 aa23.08■■□□□ 1.29
FOXD3-AS1-201ENST00000418244 TBC1D2BQ9UPU7 963 aa23.08■■□□□ 1.29
FOXD3-AS1-201ENST00000418244 POLRMTO00411 1230 aaKnown RBP23.07■■□□□ 1.28
FOXD3-AS1-201ENST00000418244 CAMTA2O94983 1202 aa23.07■■□□□ 1.28
FOXD3-AS1-201ENST00000418244 CALD1Q05682 793 aaKnown RBP23.07■■□□□ 1.28
FOXD3-AS1-201ENST00000418244 NFIXQ14938 502 aa23.07■■□□□ 1.28
FOXD3-AS1-201ENST00000418244 ERBB4Q15303 1308 aa23.07■■□□□ 1.28
FOXD3-AS1-201ENST00000418244 ZNF853P0CG23 659 aa23.06■■□□□ 1.28
FOXD3-AS1-201ENST00000418244 CCDC27Q2M243 656 aa23.06■■□□□ 1.28
FOXD3-AS1-201ENST00000418244 DZIP3Q86Y13 1208 aaKnown RBP23.06■■□□□ 1.28
FOXD3-AS1-201ENST00000418244 RGL2O15211 777 aa23.05■■□□□ 1.28
FOXD3-AS1-201ENST00000418244 GOLGB1Q14789 3259 aaKnown RBP23.05■■□□□ 1.28
FOXD3-AS1-201ENST00000418244 N4BP2Q86UW6 1770 aaPredicted RBP23.04■■□□□ 1.28
FOXD3-AS1-201ENST00000418244 IFT57Q9NWB7 429 aa23.04■■□□□ 1.28
FOXD3-AS1-201ENST00000418244 LAS1LQ9Y4W2 734 aaKnown RBP23.04■■□□□ 1.28
FOXD3-AS1-201ENST00000418244 PXDNLA1KZ92 1463 aa23.04■■□□□ 1.28
FOXD3-AS1-201ENST00000418244 BRCA1P38398 1863 aaKnown RBP23.03■■□□□ 1.28
FOXD3-AS1-201ENST00000418244 CEP350Q5VT06 3117 aa23.03■■□□□ 1.28
FOXD3-AS1-201ENST00000418244 ATP10DQ9P241 1426 aa23.03■■□□□ 1.28
FOXD3-AS1-201ENST00000418244 TGFB2P61812 414 aa23.03■■□□□ 1.28
FOXD3-AS1-201ENST00000418244 GPBP1L1Q9HC44 474 aaPredicted RBP23.03■■□□□ 1.28
FOXD3-AS1-201ENST00000418244 GNAI1P63096 354 aa23.02■■□□□ 1.28
FOXD3-AS1-201ENST00000418244 TBC1D9BQ66K14 1250 aa23.02■■□□□ 1.28
FOXD3-AS1-201ENST00000418244 CLEC4GQ6UXB4 293 aa23.02■■□□□ 1.28
FOXD3-AS1-201ENST00000418244 MBIPQ9NS73 344 aa23.02■■□□□ 1.28
FOXD3-AS1-201ENST00000418244 HOXB7P09629 217 aa23.01■■□□□ 1.27
FOXD3-AS1-201ENST00000418244 NUP98P52948 1817 aa23.01■■□□□ 1.27
FOXD3-AS1-201ENST00000418244 SERPINB2P05120 415 aa23■■□□□ 1.27
FOXD3-AS1-201ENST00000418244 KRT24Q2M2I5 525 aa23■■□□□ 1.27
FOXD3-AS1-201ENST00000418244 HSPA6P17066 643 aa22.99■■□□□ 1.27
FOXD3-AS1-201ENST00000418244 WWC1Q8IX03 1113 aa22.99■■□□□ 1.27
FOXD3-AS1-201ENST00000418244 ZNF652Q9Y2D9 606 aa22.99■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 16.5 ms