RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000413035.5

IPO9-AS1-201, IPO9 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 3 BASIC

Gene IPO9-AS1, Length 839 nt, Biotype antisense RNA, Subcellular localisation Nucleus, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IPO9-AS1-201ENST00000413035 GNPATO15228 680 aa28.76■■■□□ 2.19
IPO9-AS1-201ENST00000413035 STARD3NLO95772 234 aa28.76■■■□□ 2.19
IPO9-AS1-201ENST00000413035 GOLGA2Q08379 1002 aa28.76■■■□□ 2.19
IPO9-AS1-201ENST00000413035 R3HDM1Q15032 1099 aaKnown RBP28.76■■■□□ 2.19
IPO9-AS1-201ENST00000413035 RC3H1Q5TC82 1133 aaKnown RBP28.76■■■□□ 2.19
IPO9-AS1-201ENST00000413035 MYH16Q9H6N6 1097 aa28.75■■■□□ 2.19
IPO9-AS1-201ENST00000413035 CCDC87Q9NVE4 849 aa28.75■■■□□ 2.19
IPO9-AS1-201ENST00000413035 TFCP2L1Q9NZI6 479 aa28.75■■■□□ 2.19
IPO9-AS1-201ENST00000413035 USP16Q9Y5T5 823 aa28.75■■■□□ 2.19
IPO9-AS1-201ENST00000413035 INTS5Q6P9B9 1019 aaKnown RBP28.74■■■□□ 2.19
IPO9-AS1-201ENST00000413035 ZBTB1Q9Y2K1 713 aa28.74■■■□□ 2.19
IPO9-AS1-201ENST00000413035 PSDA5PKW4 1024 aaPredicted RBP28.73■■■□□ 2.19
IPO9-AS1-201ENST00000413035 AMIGO3Q86WK7 504 aa28.73■■■□□ 2.19
IPO9-AS1-201ENST00000413035 CASZ1Q86V15 1759 aa28.72■■■□□ 2.19
IPO9-AS1-201ENST00000413035 ZBED9Q6R2W3 1325 aa28.71■■■□□ 2.19
IPO9-AS1-201ENST00000413035 PNPLA7Q6ZV29 1317 aa28.71■■■□□ 2.19
IPO9-AS1-201ENST00000413035 E9PSI1 815 aa28.71■■■□□ 2.19
IPO9-AS1-201ENST00000413035 PHF14O94880 888 aa28.7■■■□□ 2.18
IPO9-AS1-201ENST00000413035 HOXB7P09629 217 aa28.7■■■□□ 2.18
IPO9-AS1-201ENST00000413035 DUSP27Q5VZP5 1158 aa28.7■■■□□ 2.18
IPO9-AS1-201ENST00000413035 RTCBQ9Y3I0 505 aaKnown RBP28.7■■■□□ 2.18
IPO9-AS1-201ENST00000413035 RPS6KA4O75676 772 aa28.69■■■□□ 2.18
IPO9-AS1-201ENST00000413035 A1BGP04217 495 aa28.69■■■□□ 2.18
IPO9-AS1-201ENST00000413035 SSFA2P28290 1259 aa28.69■■■□□ 2.18
IPO9-AS1-201ENST00000413035 SMIM5Q71RC9 77 aa28.69■■■□□ 2.18
IPO9-AS1-201ENST00000413035 C8orf58Q8NAV2 365 aa28.69■■■□□ 2.18
IPO9-AS1-201ENST00000413035 CDCA7LQ96GN5 454 aa28.69■■■□□ 2.18
IPO9-AS1-201ENST00000413035 C4AP0C0L4 1744 aa28.69■■■□□ 2.18
IPO9-AS1-201ENST00000413035 SOS1Q07889 1333 aaPredicted RBP28.69■■■□□ 2.18
IPO9-AS1-201ENST00000413035 SLFN5Q08AF3 891 aa28.68■■■□□ 2.18
IPO9-AS1-201ENST00000413035 RPL17-C18orf32A0A0A6YYL6 228 aaKnown RBP28.67■■■□□ 2.18
IPO9-AS1-201ENST00000413035 CANXP27824 592 aaKnown RBP28.67■■■□□ 2.18
IPO9-AS1-201ENST00000413035 COL15A1P39059 1388 aa28.66■■■□□ 2.18
IPO9-AS1-201ENST00000413035 ELL2O00472 640 aaPredicted RBP28.66■■■□□ 2.18
IPO9-AS1-201ENST00000413035 EIF2S2P20042 333 aaKnown RBP28.66■■■□□ 2.18
IPO9-AS1-201ENST00000413035 PIP4K2AP48426 406 aaPredicted RBP28.66■■■□□ 2.18
IPO9-AS1-201ENST00000413035 TSPYL6Q8N831 410 aa28.66■■■□□ 2.18
IPO9-AS1-201ENST00000413035 EXOSC9Q06265 439 aaKnown RBP28.65■■■□□ 2.18
IPO9-AS1-201ENST00000413035 HDGFL1Q5TGJ6 251 aa28.65■■■□□ 2.18
IPO9-AS1-201ENST00000413035 ADRA2BP18089 450 aa28.64■■■□□ 2.18
IPO9-AS1-201ENST00000413035 COL23A1Q86Y22 540 aaPredicted RBP28.64■■■□□ 2.18
IPO9-AS1-201ENST00000413035 FLAD1Q8NFF5 587 aa28.64■■■□□ 2.18
IPO9-AS1-201ENST00000413035 NECTIN2Q92692 538 aa28.64■■■□□ 2.18
IPO9-AS1-201ENST00000413035 PDGFDQ9GZP0 370 aaPredicted RBP28.64■■■□□ 2.18
IPO9-AS1-201ENST00000413035 ERBB4Q15303 1308 aa28.64■■■□□ 2.17
IPO9-AS1-201ENST00000413035 NBPF26B4DH59 902 aa28.63■■■□□ 2.17
IPO9-AS1-201ENST00000413035 TWISTNBQ3B726 338 aaPredicted RBP28.63■■■□□ 2.17
IPO9-AS1-201ENST00000413035 NBPF10Q6P3W6 841 aaKnown RBP28.63■■■□□ 2.17
IPO9-AS1-201ENST00000413035 NBPF15Q8N660 670 aa28.63■■■□□ 2.17
IPO9-AS1-201ENST00000413035 IL6STP40189 918 aaPredicted RBP28.62■■■□□ 2.17
IPO9-AS1-201ENST00000413035 EIF5P55010 431 aaKnown RBP28.61■■■□□ 2.17
IPO9-AS1-201ENST00000413035 TRMT2AQ8IZ69 625 aaKnown RBP28.61■■■□□ 2.17
IPO9-AS1-201ENST00000413035 ZNF330Q9Y3S2 320 aaPredicted RBP28.61■■■□□ 2.17
IPO9-AS1-201ENST00000413035 MSH5O43196 834 aa28.6■■■□□ 2.17
IPO9-AS1-201ENST00000413035 TRAPPC3LQ5T215 181 aa28.6■■■□□ 2.17
IPO9-AS1-201ENST00000413035 SCN7AQ01118 1682 aa28.59■■■□□ 2.17
IPO9-AS1-201ENST00000413035 ARHGEF1Q92888 912 aaKnown RBP28.59■■■□□ 2.17
IPO9-AS1-201ENST00000413035 CHPF2Q9P2E5 772 aa28.58■■■□□ 2.17
IPO9-AS1-201ENST00000413035 MYL6BP14649 208 aa28.57■■■□□ 2.16
IPO9-AS1-201ENST00000413035 PDIA6Q15084 440 aa28.57■■■□□ 2.16
IPO9-AS1-201ENST00000413035 PROSER3Q2NL68 480 aa28.57■■■□□ 2.16
IPO9-AS1-201ENST00000413035 ANXA1P04083 346 aa28.56■■■□□ 2.16
IPO9-AS1-201ENST00000413035 RFC4P35249 363 aa28.56■■■□□ 2.16
IPO9-AS1-201ENST00000413035 BCORQ6W2J9 1755 aa28.56■■■□□ 2.16
IPO9-AS1-201ENST00000413035 YTHDC1Q96MU7 727 aaKnown RBP28.56■■■□□ 2.16
IPO9-AS1-201ENST00000413035 USP42Q9H9J4 1324 aaKnown RBP28.55■■■□□ 2.16
IPO9-AS1-201ENST00000413035 NPM2Q86SE8 214 aaKnown RBP28.55■■■□□ 2.16
IPO9-AS1-201ENST00000413035 DDX21Q9NR30 783 aaKnown RBP eCLIP28.55■■■□□ 2.16
IPO9-AS1-201ENST00000413035 A0A087WZG4 1122 aa28.54■■■□□ 2.16
IPO9-AS1-201ENST00000413035 VAMP4O75379 141 aa28.54■■■□□ 2.16
IPO9-AS1-201ENST00000413035 CCDC30Q5VVM6 783 aa28.54■■■□□ 2.16
IPO9-AS1-201ENST00000413035 LRP10Q7Z4F1 713 aa28.54■■■□□ 2.16
IPO9-AS1-201ENST00000413035 DBF4Q9UBU7 674 aaPredicted RBP28.54■■■□□ 2.16
IPO9-AS1-201ENST00000413035 SRP68Q9UHB9 627 aaKnown RBP28.54■■■□□ 2.16
IPO9-AS1-201ENST00000413035 ZBTB7AO95365 584 aa28.53■■■□□ 2.16
IPO9-AS1-201ENST00000413035 SLC16A10Q8TF71 515 aa28.53■■■□□ 2.16
IPO9-AS1-201ENST00000413035 CHMP4AQ9BY43 222 aa28.53■■■□□ 2.16
IPO9-AS1-201ENST00000413035 DZIP3Q86Y13 1208 aaKnown RBP28.52■■■□□ 2.16
IPO9-AS1-201ENST00000413035 MTFR1LQ9H019 292 aa28.51■■■□□ 2.15
IPO9-AS1-201ENST00000413035 NARFQ9UHQ1 456 aa28.51■■■□□ 2.15
IPO9-AS1-201ENST00000413035 TCERG1O14776 1098 aaKnown RBP28.5■■■□□ 2.15
IPO9-AS1-201ENST00000413035 MSL1Q68DK7 614 aa28.5■■■□□ 2.15
IPO9-AS1-201ENST00000413035 TBC1D2BQ9UPU7 963 aa28.5■■■□□ 2.15
IPO9-AS1-201ENST00000413035 COL24A1Q17RW2 1714 aa28.49■■■□□ 2.15
IPO9-AS1-201ENST00000413035 ZPR1O75312 459 aa28.49■■■□□ 2.15
IPO9-AS1-201ENST00000413035 ARXQ96QS3 562 aa28.49■■■□□ 2.15
IPO9-AS1-201ENST00000413035 STK31Q9BXU1 1019 aa28.49■■■□□ 2.15
IPO9-AS1-201ENST00000413035 CAMTA2O94983 1202 aa28.48■■■□□ 2.15
IPO9-AS1-201ENST00000413035 GYS1P13807 737 aa28.48■■■□□ 2.15
IPO9-AS1-201ENST00000413035 USPL1Q5W0Q7 1092 aa28.48■■■□□ 2.15
IPO9-AS1-201ENST00000413035 TTLL7Q6ZT98 887 aa28.48■■■□□ 2.15
IPO9-AS1-201ENST00000413035 HYPKQ9NX55 129 aa28.48■■■□□ 2.15
IPO9-AS1-201ENST00000413035 XAGE3Q8WTP9 111 aa28.47■■■□□ 2.15
IPO9-AS1-201ENST00000413035 KIF6Q6ZMV9 814 aa28.46■■■□□ 2.15
IPO9-AS1-201ENST00000413035 CT47B1P0C2W7 299 aaPredicted RBP28.45■■■□□ 2.14
IPO9-AS1-201ENST00000413035 BCL2L12Q9HB09 334 aa28.45■■■□□ 2.14
IPO9-AS1-201ENST00000413035 ATF5Q9Y2D1 282 aaPredicted RBP28.45■■■□□ 2.14
IPO9-AS1-201ENST00000413035 MAP3K15Q6ZN16 1313 aa28.44■■■□□ 2.14
IPO9-AS1-201ENST00000413035 AIMP1Q12904 312 aaKnown RBP28.44■■■□□ 2.14
IPO9-AS1-201ENST00000413035 FKBP8Q14318 412 aa28.44■■■□□ 2.14
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 21.6 ms