RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000403904.5

CSNK1E-204, Transcript of casein kinase 1 epsilon, human

APPRIS P1 TSL 5 BASIC

Gene CSNK1E, Length 1,580 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
CSNK1E-204	ENST00000403904	SOS1	Q07889	1333 aa	Predicted RBP	42.92	■■■■■ 4.46
CSNK1E-204	ENST00000403904	CYP19A1	P11511	503 aa	Predicted RBP	42.92	■■■■■ 4.46
CSNK1E-204	ENST00000403904	STARD3NL	O95772	234 aa		42.91	■■■■■ 4.46
CSNK1E-204	ENST00000403904	HDGFL1	Q5TGJ6	251 aa		42.9	■■■■■ 4.46
CSNK1E-204	ENST00000403904	RREB1	Q92766	1687 aa		42.87	■■■■■ 4.45
CSNK1E-204	ENST00000403904	A1BG	P04217	495 aa		42.86	■■■■■ 4.45
CSNK1E-204	ENST00000403904	MYH14	Q7Z406	1995 aa	Known RBP	42.86	■■■■■ 4.45
CSNK1E-204	ENST00000403904	TCERG1	O14776	1098 aa	Known RBP	42.85	■■■■■ 4.45
CSNK1E-204	ENST00000403904	CT47B1	P0C2W7	299 aa	Predicted RBP	42.85	■■■■■ 4.45
CSNK1E-204	ENST00000403904	CRKL	P46109	303 aa	Known RBP	42.85	■■■■■ 4.45
CSNK1E-204	ENST00000403904	C4B	P0C0L5	1744 aa		42.84	■■■■■ 4.45
CSNK1E-204	ENST00000403904	PIP4K2A	P48426	406 aa	Predicted RBP	42.83	■■■■■ 4.45
CSNK1E-204	ENST00000403904	CCDC30	Q5VVM6	783 aa		42.82	■■■■■ 4.45
CSNK1E-204	ENST00000403904	INTS5	Q6P9B9	1019 aa	Known RBP	42.82	■■■■■ 4.44
CSNK1E-204	ENST00000403904	CCDC87	Q9NVE4	849 aa		42.81	■■■■■ 4.44
CSNK1E-204	ENST00000403904	NUP188	Q5SRE5	1749 aa		42.8	■■■■■ 4.44
CSNK1E-204	ENST00000403904	CHPF2	Q9P2E5	772 aa		42.8	■■■■■ 4.44
CSNK1E-204	ENST00000403904	ZBTB1	Q9Y2K1	713 aa		42.8	■■■■■ 4.44
CSNK1E-204	ENST00000403904	CNTNAP4	Q9C0A0	1308 aa		42.8	■■■■■ 4.44
CSNK1E-204	ENST00000403904	CHMP4A	Q9BY43	222 aa		42.79	■■■■■ 4.44
CSNK1E-204	ENST00000403904	CANX	P27824	592 aa	Known RBP	42.78	■■■■■ 4.44
CSNK1E-204	ENST00000403904	NBPF26	B4DH59	902 aa		42.78	■■■■■ 4.44
CSNK1E-204	ENST00000403904	RC3H1	Q5TC82	1133 aa	Known RBP	42.78	■■■■■ 4.44
CSNK1E-204	ENST00000403904	NBPF14	Q5TI25	921 aa		42.78	■■■■■ 4.44
CSNK1E-204	ENST00000403904	NBPF10	Q6P3W6	841 aa	Known RBP	42.78	■■■■■ 4.44
CSNK1E-204	ENST00000403904	NBPF15	Q8N660	670 aa		42.78	■■■■■ 4.44
CSNK1E-204	ENST00000403904	ANXA1	P04083	346 aa		42.77	■■■■■ 4.44
CSNK1E-204	ENST00000403904	HMGB2	P26583	209 aa	Known RBP	42.77	■■■■■ 4.44
CSNK1E-204	ENST00000403904	PDIA6	Q15084	440 aa		42.77	■■■■■ 4.44
CSNK1E-204	ENST00000403904	ZNF428	Q96B54	188 aa		42.77	■■■■■ 4.44
CSNK1E-204	ENST00000403904	PROSER3	Q2NL68	480 aa		42.76	■■■■■ 4.44
CSNK1E-204	ENST00000403904	DBF4	Q9UBU7	674 aa	Predicted RBP	42.76	■■■■■ 4.44
CSNK1E-204	ENST00000403904	MYL6B	P14649	208 aa		42.75	■■■■■ 4.43
CSNK1E-204	ENST00000403904	STK31	Q9BXU1	1019 aa		42.75	■■■■■ 4.43
CSNK1E-204	ENST00000403904	SSH1	Q8WYL5	1049 aa		42.74	■■■■■ 4.43
CSNK1E-204	ENST00000403904	AK7	Q96M32	723 aa		42.74	■■■■■ 4.43
CSNK1E-204	ENST00000403904	ERBB4	Q15303	1308 aa		42.74	■■■■■ 4.43
CSNK1E-204	ENST00000403904	RARS	P54136	660 aa	Known RBP	42.73	■■■■■ 4.43
CSNK1E-204	ENST00000403904	BCL2L13	Q9BXK5	485 aa		42.73	■■■■■ 4.43
CSNK1E-204	ENST00000403904	DDX21	Q9NR30	783 aa	Known RBP eCLIP	42.73	■■■■■ 4.43
CSNK1E-204	ENST00000403904	GNPAT	O15228	680 aa		42.73	■■■■■ 4.43
CSNK1E-204	ENST00000403904	ZNF827	Q17R98	1081 aa		42.72	■■■■■ 4.43
CSNK1E-204	ENST00000403904	SLC4A2	P04920	1241 aa		42.71	■■■■■ 4.43
CSNK1E-204	ENST00000403904	AKT1S1	Q96B36	256 aa		42.71	■■■■■ 4.43
CSNK1E-204	ENST00000403904	ALDH1L2	Q3SY69	923 aa		42.7	■■■■■ 4.43
CSNK1E-204	ENST00000403904	ZNF330	Q9Y3S2	320 aa	Predicted RBP	42.7	■■■■■ 4.43
CSNK1E-204	ENST00000403904	ANO8	Q9HCE9	1232 aa	Predicted RBP	42.69	■■■■■ 4.43
CSNK1E-204	ENST00000403904	CACNA1F	O60840	1977 aa		42.69	■■■■■ 4.42
CSNK1E-204	ENST00000403904	SMIM5	Q71RC9	77 aa		42.69	■■■■■ 4.42
CSNK1E-204	ENST00000403904	SMC4	Q9NTJ3	1288 aa		42.69	■■■■■ 4.42
CSNK1E-204	ENST00000403904	AMIGO3	Q86WK7	504 aa		42.68	■■■■■ 4.42
CSNK1E-204	ENST00000403904	RCAN3	Q9UKA8	241 aa		42.68	■■■■■ 4.42
CSNK1E-204	ENST00000403904	UBR3	Q6ZT12	1888 aa		42.67	■■■■■ 4.42
CSNK1E-204	ENST00000403904	RPS6KA4	O75676	772 aa		42.67	■■■■■ 4.42
CSNK1E-204	ENST00000403904	IL6ST	P40189	918 aa	Predicted RBP	42.67	■■■■■ 4.42
CSNK1E-204	ENST00000403904	LRP10	Q7Z4F1	713 aa		42.67	■■■■■ 4.42
CSNK1E-204	ENST00000403904	HYPK	Q9NX55	129 aa		42.66	■■■■■ 4.42
CSNK1E-204	ENST00000403904	RTCB	Q9Y3I0	505 aa	Known RBP	42.66	■■■■■ 4.42
CSNK1E-204	ENST00000403904	EIF5	P55010	431 aa	Known RBP	42.65	■■■■■ 4.42
CSNK1E-204	ENST00000403904	MRPL50	Q8N5N7	158 aa	Known RBP	42.65	■■■■■ 4.42
CSNK1E-204	ENST00000403904	BCAR3	O75815	825 aa		42.65	■■■■■ 4.42
CSNK1E-204	ENST00000403904	PHAX	Q9H814	394 aa	Known RBP	42.65	■■■■■ 4.42
CSNK1E-204	ENST00000403904	TFCP2L1	Q9NZI6	479 aa		42.65	■■■■■ 4.42
CSNK1E-204	ENST00000403904	STK32B	Q9NY57	414 aa		42.64	■■■■■ 4.42
CSNK1E-204	ENST00000403904	G2E3	Q7L622	706 aa		42.63	■■■■■ 4.41
CSNK1E-204	ENST00000403904	PHF14	O94880	888 aa		42.62	■■■■■ 4.41
CSNK1E-204	ENST00000403904	SLC15A2	Q16348	729 aa		42.62	■■■■■ 4.41
CSNK1E-204	ENST00000403904	TUBGCP6	Q96RT7	1819 aa		42.61	■■■■■ 4.41
CSNK1E-204	ENST00000403904	NPM2	Q86SE8	214 aa	Known RBP	42.61	■■■■■ 4.41
CSNK1E-204	ENST00000403904	AIMP1	Q12904	312 aa	Known RBP	42.6	■■■■■ 4.41
CSNK1E-204	ENST00000403904	XAGE3	Q8WTP9	111 aa		42.6	■■■■■ 4.41
CSNK1E-204	ENST00000403904	COL15A1	P39059	1388 aa		42.59	■■■■■ 4.41
CSNK1E-204	ENST00000403904	COPS6	Q7L5N1	327 aa		42.59	■■■■■ 4.41
CSNK1E-204	ENST00000403904	ARX	Q96QS3	562 aa		42.58	■■■■■ 4.41
CSNK1E-204	ENST00000403904	RPL17-C18orf32	A0A0A6YYL6	228 aa	Known RBP	42.57	■■■■■ 4.41
CSNK1E-204	ENST00000403904	SOCS7	O14512	581 aa		42.56	■■■■■ 4.4
CSNK1E-204	ENST00000403904	SSFA2	P28290	1259 aa		42.56	■■■■■ 4.4
CSNK1E-204	ENST00000403904	FLII	Q13045	1269 aa		42.56	■■■■■ 4.4
CSNK1E-204	ENST00000403904	TRAPPC3L	Q5T215	181 aa		42.56	■■■■■ 4.4
CSNK1E-204	ENST00000403904	TTLL7	Q6ZT98	887 aa		42.56	■■■■■ 4.4
CSNK1E-204	ENST00000403904	ARHGEF1	Q92888	912 aa	Known RBP	42.55	■■■■■ 4.4
CSNK1E-204	ENST00000403904	BRPF1	P55201	1214 aa	Predicted RBP	42.54	■■■■■ 4.4
CSNK1E-204	ENST00000403904	TBC1D2B	Q9UPU7	963 aa		42.54	■■■■■ 4.4
CSNK1E-204	ENST00000403904	ADRA2B	P18089	450 aa		42.52	■■■■■ 4.4
CSNK1E-204	ENST00000403904	DZIP3	Q86Y13	1208 aa	Known RBP	42.52	■■■■■ 4.4
CSNK1E-204	ENST00000403904	NOB1	Q9ULX3	412 aa	Known RBP	42.52	■■■■■ 4.4
CSNK1E-204	ENST00000403904	PNPLA7	Q6ZV29	1317 aa		42.51	■■■■■ 4.4
CSNK1E-204	ENST00000403904		A0A087WZG4	1122 aa		42.51	■■■■■ 4.4
CSNK1E-204	ENST00000403904	C4A	P0C0L4	1744 aa		42.51	■■■■■ 4.4
CSNK1E-204	ENST00000403904	CENPB	P07199	599 aa	Predicted RBP	42.49	■■■■■ 4.39
CSNK1E-204	ENST00000403904	FKBP5	Q13451	457 aa	Predicted RBP	42.49	■■■■■ 4.39
CSNK1E-204	ENST00000403904	FRAT1	Q92837	279 aa	Predicted RBP	42.49	■■■■■ 4.39
CSNK1E-204	ENST00000403904	RFC4	P35249	363 aa		42.48	■■■■■ 4.39
CSNK1E-204	ENST00000403904	COL23A1	Q86Y22	540 aa	Predicted RBP	42.48	■■■■■ 4.39
CSNK1E-204	ENST00000403904	QSER1	Q2KHR3	1735 aa		42.48	■■■■■ 4.39
CSNK1E-204	ENST00000403904	KIF16B	Q96L93	1317 aa		42.48	■■■■■ 4.39
CSNK1E-204	ENST00000403904	KIF6	Q6ZMV9	814 aa		42.48	■■■■■ 4.39
CSNK1E-204	ENST00000403904	FLAD1	Q8NFF5	587 aa		42.47	■■■■■ 4.39
CSNK1E-204	ENST00000403904	ANKRD13D	Q6ZTN6	518 aa		42.46	■■■■■ 4.39
CSNK1E-204	ENST00000403904	ZBTB3	Q9H5J0	574 aa		42.46	■■■■■ 4.39

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