RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000402738.5

HERC3-202, Transcript of HECT and RLD domain containing E3 ubiquitin protein ligase 3, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene HERC3, Length 4,974 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERC3-202ENST00000402738 DRC1Q96MC2 740 aa11.37□□□□□ -0.59
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HERC3-202ENST00000402738 SPECC1Q5M775 1068 aa11.35□□□□□ -0.59
HERC3-202ENST00000402738 BCL2L12Q9HB09 334 aa11.35□□□□□ -0.59
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HERC3-202ENST00000402738 ELF2Q15723 593 aa11.33□□□□□ -0.6
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HERC3-202ENST00000402738 HSF2BPO75031 334 aa11.33□□□□□ -0.6
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HERC3-202ENST00000402738 CCT2P78371 535 aaKnown RBP11.33□□□□□ -0.6
HERC3-202ENST00000402738 CCDC158Q5M9N0 1113 aa11.33□□□□□ -0.6
HERC3-202ENST00000402738 NUTM2GQ5VZR2 741 aa11.33□□□□□ -0.6
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HERC3-202ENST00000402738 F13A1P00488 732 aa11.33□□□□□ -0.6
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HERC3-202ENST00000402738 F6X3S4 739 aa11.32□□□□□ -0.6
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HERC3-202ENST00000402738 PUF60Q9UHX1 559 aaKnown RBP11.31□□□□□ -0.6
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HERC3-202ENST00000402738 HYPKQ9NX55 129 aa11.31□□□□□ -0.6
HERC3-202ENST00000402738 RHOXF2BP0C7M4 288 aa11.31□□□□□ -0.6
HERC3-202ENST00000402738 ANKRD18AQ8IVF6 992 aa11.31□□□□□ -0.6
HERC3-202ENST00000402738 RHOXF2Q9BQY4 288 aa11.31□□□□□ -0.6
HERC3-202ENST00000402738 DDX24Q9GZR7 859 aaKnown RBP eCLIP11.31□□□□□ -0.6
HERC3-202ENST00000402738 MSL1Q68DK7 614 aa11.3□□□□□ -0.6
HERC3-202ENST00000402738 CEP112Q8N8E3 955 aa11.3□□□□□ -0.6
HERC3-202ENST00000402738 DROSHAQ9NRR4 1374 aaKnown RBP eCLIP11.3□□□□□ -0.6
HERC3-202ENST00000402738 ZNF500O60304 480 aaPredicted RBP11.3□□□□□ -0.6
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