RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000379445.7

CTXN3-201, Transcript of cortexin 3, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene CTXN3, Length 1,660 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTXN3-201ENST00000379445 TFCP2L1Q9NZI6 479 aa9.62□□□□□ -0.87
CTXN3-201ENST00000379445 POLKQ9UBT6 870 aa9.62□□□□□ -0.87
CTXN3-201ENST00000379445 TOGARAM1Q9Y4F4 1720 aa9.62□□□□□ -0.87
CTXN3-201ENST00000379445 TUBGCP6Q96RT7 1819 aa9.61□□□□□ -0.87
CTXN3-201ENST00000379445 PALLDQ8WX93 1383 aa9.61□□□□□ -0.87
CTXN3-201ENST00000379445 PPM1GO15355 546 aaPredicted RBP9.61□□□□□ -0.87
CTXN3-201ENST00000379445 HSPA5P11021 654 aaKnown RBP9.61□□□□□ -0.87
CTXN3-201ENST00000379445 EIF4G2P78344 907 aaKnown RBP eCLIP9.61□□□□□ -0.87
CTXN3-201ENST00000379445 EYA1Q99502 592 aa9.61□□□□□ -0.87
CTXN3-201ENST00000379445 ST18O60284 1047 aa9.6□□□□□ -0.87
CTXN3-201ENST00000379445 COL23A1Q86Y22 540 aaPredicted RBP9.6□□□□□ -0.87
CTXN3-201ENST00000379445 PDCD7Q8N8D1 485 aaKnown RBP9.6□□□□□ -0.87
CTXN3-201ENST00000379445 PLEKHG2Q9H7P9 1386 aa9.59□□□□□ -0.87
CTXN3-201ENST00000379445 POLD1P28340 1107 aa9.59□□□□□ -0.87
CTXN3-201ENST00000379445 PSEN1P49768 467 aa9.59□□□□□ -0.87
CTXN3-201ENST00000379445 EIF4A2Q14240 407 aaKnown RBP9.59□□□□□ -0.87
CTXN3-201ENST00000379445 MPRIPQ6WCQ1 1025 aa9.59□□□□□ -0.87
CTXN3-201ENST00000379445 ZC3H15Q8WU90 426 aaKnown RBP9.59□□□□□ -0.87
CTXN3-201ENST00000379445 BCLAF1Q9NYF8 920 aaKnown RBP eCLIP9.59□□□□□ -0.87
CTXN3-201ENST00000379445 KAT6BQ8WYB5 2073 aa9.59□□□□□ -0.87
CTXN3-201ENST00000379445 C5P01031 1676 aa9.58□□□□□ -0.88
CTXN3-201ENST00000379445 PIGBQ92521 554 aa9.58□□□□□ -0.88
CTXN3-201ENST00000379445 POLR3GLQ9BT43 218 aa9.58□□□□□ -0.88
CTXN3-201ENST00000379445 SPG7Q9UQ90 795 aa9.58□□□□□ -0.88
CTXN3-201ENST00000379445 IGSF1Q8N6C5 1336 aa9.58□□□□□ -0.88
CTXN3-201ENST00000379445 AMIGO3Q86WK7 504 aa9.58□□□□□ -0.88
CTXN3-201ENST00000379445 PANK3Q9H999 370 aa9.58□□□□□ -0.88
CTXN3-201ENST00000379445 STK25O00506 426 aa9.57□□□□□ -0.88
CTXN3-201ENST00000379445 PHKG2P15735 406 aa9.57□□□□□ -0.88
CTXN3-201ENST00000379445 TNNT2P45379 298 aaPredicted RBP9.57□□□□□ -0.88
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CTXN3-201ENST00000379445 NLGN2Q8NFZ4 835 aa9.57□□□□□ -0.88
CTXN3-201ENST00000379445 SMARCC1Q92922 1105 aaPredicted RBP9.57□□□□□ -0.88
CTXN3-201ENST00000379445 WDR70Q9NW82 654 aa9.57□□□□□ -0.88
CTXN3-201ENST00000379445 EIF2AK3Q9NZJ5 1116 aaKnown RBP9.57□□□□□ -0.88
CTXN3-201ENST00000379445 GOLGA2Q08379 1002 aa9.56□□□□□ -0.88
CTXN3-201ENST00000379445 ZNF784Q8NCA9 323 aaPredicted RBP9.56□□□□□ -0.88
CTXN3-201ENST00000379445 C4BP0C0L5 1744 aa9.56□□□□□ -0.88
CTXN3-201ENST00000379445 MAP2P11137 1827 aaKnown RBP9.56□□□□□ -0.88
CTXN3-201ENST00000379445 HMGB2P26583 209 aaKnown RBP9.55□□□□□ -0.88
CTXN3-201ENST00000379445 MSL1Q68DK7 614 aa9.55□□□□□ -0.88
CTXN3-201ENST00000379445 IFNL2Q8IZJ0 200 aa9.55□□□□□ -0.88
CTXN3-201ENST00000379445 FLAD1Q8NFF5 587 aa9.55□□□□□ -0.88
CTXN3-201ENST00000379445 CCER1Q8TC90 406 aaPredicted RBP9.55□□□□□ -0.88
CTXN3-201ENST00000379445 ITGB4P16144 1822 aa9.55□□□□□ -0.88
CTXN3-201ENST00000379445 TAF1LQ8IZX4 1826 aa9.55□□□□□ -0.88
CTXN3-201ENST00000379445 LOC102724428A0A0B4J2F2 783 aa9.55□□□□□ -0.88
CTXN3-201ENST00000379445 SIK1P57059 783 aa9.55□□□□□ -0.88
CTXN3-201ENST00000379445 LINC00116Q8NCU8 138 aa9.55□□□□□ -0.88
CTXN3-201ENST00000379445 KCNV2Q8TDN2 545 aa9.55□□□□□ -0.88
CTXN3-201ENST00000379445 TMOD3Q9NYL9 352 aa9.55□□□□□ -0.88
CTXN3-201ENST00000379445 ASAP1Q9ULH1 1129 aa9.55□□□□□ -0.88
CTXN3-201ENST00000379445 KDRP35968 1356 aa9.54□□□□□ -0.88
CTXN3-201ENST00000379445 PDAP1Q13442 181 aaKnown RBP9.54□□□□□ -0.88
CTXN3-201ENST00000379445 ITPK1Q13572 414 aa9.54□□□□□ -0.88
CTXN3-201ENST00000379445 GPR162Q16538 588 aa9.54□□□□□ -0.88
CTXN3-201ENST00000379445 AK7Q96M32 723 aa9.54□□□□□ -0.88
CTXN3-201ENST00000379445 KDM6AO15550 1401 aaPredicted RBP9.53□□□□□ -0.88
CTXN3-201ENST00000379445 RPL17-C18orf32A0A0A6YYL6 228 aaKnown RBP9.53□□□□□ -0.88
CTXN3-201ENST00000379445 SSFA2P28290 1259 aa9.53□□□□□ -0.88
CTXN3-201ENST00000379445 SMIM5Q71RC9 77 aa9.53□□□□□ -0.88
CTXN3-201ENST00000379445 ATG3Q9NT62 314 aa9.53□□□□□ -0.88
CTXN3-201ENST00000379445 YBX3P16989 372 aaKnown RBP eCLIP9.52□□□□□ -0.89
CTXN3-201ENST00000379445 L3MBTL3Q96JM7 780 aaPredicted RBP9.52□□□□□ -0.89
CTXN3-201ENST00000379445 C1orf115Q9H7X2 142 aa9.52□□□□□ -0.89
CTXN3-201ENST00000379445 RYDENQ9NUL5 291 aaKnown RBP9.52□□□□□ -0.89
CTXN3-201ENST00000379445 UBR3Q6ZT12 1888 aa9.52□□□□□ -0.89
CTXN3-201ENST00000379445 SNPHO15079 494 aa9.51□□□□□ -0.89
CTXN3-201ENST00000379445 PHF14O94880 888 aa9.51□□□□□ -0.89
CTXN3-201ENST00000379445 MORC1Q86VD1 984 aa9.51□□□□□ -0.89
CTXN3-201ENST00000379445 AEBP1Q8IUX7 1158 aa9.51□□□□□ -0.89
CTXN3-201ENST00000379445 SLC4A9Q96Q91 983 aa9.51□□□□□ -0.89
CTXN3-201ENST00000379445 CD2APQ9Y5K6 639 aa9.51□□□□□ -0.89
CTXN3-201ENST00000379445 KIF7Q2M1P5 1343 aa9.51□□□□□ -0.89
CTXN3-201ENST00000379445 ERVV-2B6SEH9 535 aa9.51□□□□□ -0.89
CTXN3-201ENST00000379445 ATP6V1AP38606 617 aa9.51□□□□□ -0.89
CTXN3-201ENST00000379445 DCAF5Q96JK2 942 aa9.51□□□□□ -0.89
CTXN3-201ENST00000379445 APBB1O00213 710 aa9.5□□□□□ -0.89
CTXN3-201ENST00000379445 GNPATO15228 680 aa9.5□□□□□ -0.89
CTXN3-201ENST00000379445 HSP90AB1P08238 724 aaKnown RBP9.5□□□□□ -0.89
CTXN3-201ENST00000379445 IL13P35225 146 aa9.5□□□□□ -0.89
CTXN3-201ENST00000379445 AMOTQ4VCS5 1084 aa9.5□□□□□ -0.89
CTXN3-201ENST00000379445 PLEKHO1Q53GL0 409 aaPredicted RBP9.5□□□□□ -0.89
CTXN3-201ENST00000379445 ZNF530Q6P9A1 599 aaPredicted RBP9.5□□□□□ -0.89
CTXN3-201ENST00000379445 TMEM121BQ9BXQ6 578 aaPredicted RBP9.5□□□□□ -0.89
CTXN3-201ENST00000379445 KNSTRNQ9Y448 316 aa9.5□□□□□ -0.89
CTXN3-201ENST00000379445 CHD4Q14839 1912 aa9.49□□□□□ -0.89
CTXN3-201ENST00000379445 ZNF831Q5JPB2 1677 aa9.49□□□□□ -0.89
CTXN3-201ENST00000379445 GRIN3BO60391 1043 aa9.48□□□□□ -0.89
CTXN3-201ENST00000379445 SULT6B1Q6IMI4 303 aa9.48□□□□□ -0.89
CTXN3-201ENST00000379445 CNTNAP4Q9C0A0 1308 aa9.48□□□□□ -0.89
CTXN3-201ENST00000379445 PER1O15534 1290 aaPredicted RBP9.48□□□□□ -0.89
CTXN3-201ENST00000379445 C3orf67Q6ZVT6 689 aa9.48□□□□□ -0.89
CTXN3-201ENST00000379445 NECTIN2Q92692 538 aa9.48□□□□□ -0.89
CTXN3-201ENST00000379445 STK24Q9Y6E0 443 aa9.48□□□□□ -0.89
CTXN3-201ENST00000379445 ZFP91-CNTFA0A0A6YYC7 529 aaPredicted RBP9.47□□□□□ -0.89
CTXN3-201ENST00000379445 MTHFSP49914 203 aa9.47□□□□□ -0.89
CTXN3-201ENST00000379445 CABP4P57796 275 aa9.47□□□□□ -0.89
CTXN3-201ENST00000379445 C1orf141Q5JVX7 400 aa9.47□□□□□ -0.89
CTXN3-201ENST00000379445 RC3H1Q5TC82 1133 aaKnown RBP9.47□□□□□ -0.89
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