RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000347077.8

ZNF546-201, Transcript of zinc finger protein 546, humanhuman

APPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC

Gene ZNF546, Length 7,987 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF546-201ENST00000347077 MAP2K1Q02750 393 aaPredicted RBP6.98□□□□□ -1.29
ZNF546-201ENST00000347077 TMEM132AQ24JP5 1023 aa6.98□□□□□ -1.29
ZNF546-201ENST00000347077 ARHGAP45Q92619 1136 aa6.98□□□□□ -1.29
ZNF546-201ENST00000347077 LTV1Q96GA3 475 aaPredicted RBP6.98□□□□□ -1.29
ZNF546-201ENST00000347077 CCDC175P0C221 793 aa6.98□□□□□ -1.29
ZNF546-201ENST00000347077 IGHMBP2P38935 993 aaKnown RBP6.98□□□□□ -1.29
ZNF546-201ENST00000347077 ZMYM3Q14202 1370 aa6.98□□□□□ -1.29
ZNF546-201ENST00000347077 MTHFSP49914 203 aa6.98□□□□□ -1.29
ZNF546-201ENST00000347077 CCDC27Q2M243 656 aa6.98□□□□□ -1.29
ZNF546-201ENST00000347077 APBB1IPQ7Z5R6 666 aaPredicted RBP6.98□□□□□ -1.29
ZNF546-201ENST00000347077 PAF1Q8N7H5 531 aa6.98□□□□□ -1.29
ZNF546-201ENST00000347077 PIBF1Q8WXW3 757 aa6.98□□□□□ -1.29
ZNF546-201ENST00000347077 MCM4P33991 863 aa6.98□□□□□ -1.29
ZNF546-201ENST00000347077 EIF5P55010 431 aaKnown RBP6.98□□□□□ -1.29
ZNF546-201ENST00000347077 GIMAP7Q8NHV1 300 aa6.98□□□□□ -1.29
ZNF546-201ENST00000347077 ARFGAP2Q8N6H7 521 aa6.98□□□□□ -1.29
ZNF546-201ENST00000347077 NAP1L4Q99733 375 aaKnown RBP6.98□□□□□ -1.29
ZNF546-201ENST00000347077 HAUS2Q9NVX0 235 aa6.98□□□□□ -1.29
ZNF546-201ENST00000347077 KCNG1Q9UIX4 513 aa6.98□□□□□ -1.29
ZNF546-201ENST00000347077 NFE2L2Q16236 605 aa6.97□□□□□ -1.29
ZNF546-201ENST00000347077 GLT8D2Q9H1C3 349 aa6.97□□□□□ -1.29
ZNF546-201ENST00000347077 TOPBP1Q92547 1522 aa6.97□□□□□ -1.29
ZNF546-201ENST00000347077 NLRP6P59044 892 aa6.97□□□□□ -1.29
ZNF546-201ENST00000347077 DDX46Q7L014 1031 aaKnown RBP6.97□□□□□ -1.29
ZNF546-201ENST00000347077 LMBR1Q8WVP7 490 aa6.97□□□□□ -1.29
ZNF546-201ENST00000347077 CEP83Q9Y592 693 aa6.97□□□□□ -1.29
ZNF546-201ENST00000347077 STX1AQ16623 288 aa6.97□□□□□ -1.29
ZNF546-201ENST00000347077 CCDC61Q9Y6R9 512 aa6.97□□□□□ -1.29
ZNF546-201ENST00000347077 MEX3CQ5U5Q3 659 aaKnown RBP6.97□□□□□ -1.29
ZNF546-201ENST00000347077 ANKS4BQ8N8V4 417 aa6.97□□□□□ -1.29
ZNF546-201ENST00000347077 CTCFLQ8NI51 663 aaPredicted RBP6.97□□□□□ -1.29
ZNF546-201ENST00000347077 CCDC110Q8TBZ0 833 aa6.97□□□□□ -1.29
ZNF546-201ENST00000347077 CUL5Q93034 780 aa6.97□□□□□ -1.29
ZNF546-201ENST00000347077 NEBLO76041 1014 aa6.97□□□□□ -1.29
ZNF546-201ENST00000347077 IFIT1P09914 478 aaKnown RBP6.97□□□□□ -1.29
ZNF546-201ENST00000347077 NBPF7P0C2Y1 421 aaPredicted RBP6.97□□□□□ -1.29
ZNF546-201ENST00000347077 MAP3K12Q12852 859 aa6.97□□□□□ -1.29
ZNF546-201ENST00000347077 CFAP74Q9C0B2 1584 aa6.96□□□□□ -1.29
ZNF546-201ENST00000347077 FSD2A1L4K1 749 aa6.96□□□□□ -1.29
ZNF546-201ENST00000347077 FERP16591 822 aa6.96□□□□□ -1.29
ZNF546-201ENST00000347077 PIP4K2BP78356 416 aa6.96□□□□□ -1.29
ZNF546-201ENST00000347077 BMS1Q14692 1282 aaKnown RBP6.96□□□□□ -1.29
ZNF546-201ENST00000347077 CAVIN4Q5BKX8 364 aa6.96□□□□□ -1.29
ZNF546-201ENST00000347077 ABTB2Q8N961 1025 aa6.96□□□□□ -1.29
ZNF546-201ENST00000347077 MSANTD4Q8NCY6 345 aa6.96□□□□□ -1.29
ZNF546-201ENST00000347077 ANKRD24Q8TF21 1146 aa6.96□□□□□ -1.29
ZNF546-201ENST00000347077 CCDC77Q9BR77 488 aa6.96□□□□□ -1.29
ZNF546-201ENST00000347077 SELENOOQ9BVL4 669 aa6.96□□□□□ -1.29
ZNF546-201ENST00000347077 PDRG1Q9NUG6 133 aa6.96□□□□□ -1.29
ZNF546-201ENST00000347077 SWAP70Q9UH65 585 aa6.96□□□□□ -1.29
ZNF546-201ENST00000347077 ATP2A1O14983 1001 aa6.96□□□□□ -1.29
ZNF546-201ENST00000347077 FAM193AP78312 1265 aa6.96□□□□□ -1.29
ZNF546-201ENST00000347077 TSNARE1Q96NA8 513 aa6.96□□□□□ -1.29
ZNF546-201ENST00000347077 RASAL2Q9UJF2 1139 aa6.96□□□□□ -1.29
ZNF546-201ENST00000347077 PPIP5K1Q6PFW1 1433 aa6.96□□□□□ -1.29
ZNF546-201ENST00000347077 ARHGEF12Q9NZN5 1544 aa6.96□□□□□ -1.3
ZNF546-201ENST00000347077 DUSP27Q5VZP5 1158 aa6.96□□□□□ -1.3
ZNF546-201ENST00000347077 RAD50Q92878 1312 aa6.96□□□□□ -1.3
ZNF546-201ENST00000347077 BICDL1Q6ZP65 573 aa6.96□□□□□ -1.3
ZNF546-201ENST00000347077 RNF214Q8ND24 703 aa6.96□□□□□ -1.3
ZNF546-201ENST00000347077 ERMNQ8TAM6 284 aa6.96□□□□□ -1.3
ZNF546-201ENST00000347077 CNNM2Q9H8M5 875 aa6.96□□□□□ -1.3
ZNF546-201ENST00000347077 TCP11L1Q9NUJ3 509 aa6.96□□□□□ -1.3
ZNF546-201ENST00000347077 CCDC14Q49A88 953 aa6.96□□□□□ -1.3
ZNF546-201ENST00000347077 CASQ1P31415 396 aa6.96□□□□□ -1.3
ZNF546-201ENST00000347077 ACTN2P35609 894 aa6.96□□□□□ -1.3
ZNF546-201ENST00000347077 UBE2HP62256 183 aa6.95□□□□□ -1.3
ZNF546-201ENST00000347077 SF3B2Q13435 895 aaKnown RBP6.95□□□□□ -1.3
ZNF546-201ENST00000347077 CCDC155Q8N6L0 562 aa6.95□□□□□ -1.3
ZNF546-201ENST00000347077 CLIP2Q9UDT6 1046 aa6.95□□□□□ -1.3
ZNF546-201ENST00000347077 ANKLE2Q86XL3 938 aa6.95□□□□□ -1.3
ZNF546-201ENST00000347077 CALML4Q96GE6 196 aa6.95□□□□□ -1.3
ZNF546-201ENST00000347077 SCAF11Q99590 1463 aaKnown RBP6.95□□□□□ -1.3
ZNF546-201ENST00000347077 DUOX2Q9NRD8 1548 aa6.95□□□□□ -1.3
ZNF546-201ENST00000347077 GNAT3A8MTJ3 354 aa6.95□□□□□ -1.3
ZNF546-201ENST00000347077 GSTO1P78417 241 aa6.95□□□□□ -1.3
ZNF546-201ENST00000347077 BMP2KLQ5H9B9 411 aa6.95□□□□□ -1.3
ZNF546-201ENST00000347077 SEPT11Q9NVA2 429 aaKnown RBP6.95□□□□□ -1.3
ZNF546-201ENST00000347077 FYB1O15117 783 aa6.95□□□□□ -1.3
ZNF546-201ENST00000347077 NT5C2P49902 561 aa6.95□□□□□ -1.3
ZNF546-201ENST00000347077 EVI5LQ96CN4 794 aa6.95□□□□□ -1.3
ZNF546-201ENST00000347077 NAP1L3Q99457 506 aaPredicted RBP6.95□□□□□ -1.3
ZNF546-201ENST00000347077 RRP7AQ9Y3A4 280 aaKnown RBP6.95□□□□□ -1.3
ZNF546-201ENST00000347077 OPA1O60313 960 aa6.95□□□□□ -1.3
ZNF546-201ENST00000347077 PRPF40AO75400 957 aaKnown RBP6.95□□□□□ -1.3
ZNF546-201ENST00000347077 TOP1P11387 765 aaKnown RBP6.95□□□□□ -1.3
ZNF546-201ENST00000347077 CABP4P57796 275 aa6.95□□□□□ -1.3
ZNF546-201ENST00000347077 KCNG4Q8TDN1 519 aa6.95□□□□□ -1.3
ZNF546-201ENST00000347077 BABAM1Q9NWV8 329 aa6.95□□□□□ -1.3
ZNF546-201ENST00000347077 NLRP2Q9NX02 1062 aa6.95□□□□□ -1.3
ZNF546-201ENST00000347077 LIMCH1Q9UPQ0 1083 aa6.95□□□□□ -1.3
ZNF546-201ENST00000347077 ATP5DP30049 168 aa6.95□□□□□ -1.3
ZNF546-201ENST00000347077 TDO2P48775 406 aa6.95□□□□□ -1.3
ZNF546-201ENST00000347077 WDR78Q5VTH9 848 aa6.95□□□□□ -1.3
ZNF546-201ENST00000347077 ADGBQ8N7X0 1667 aa6.95□□□□□ -1.3
ZNF546-201ENST00000347077 ANKRD36BQ8N2N9 1353 aa6.95□□□□□ -1.3
ZNF546-201ENST00000347077 CFAP43Q8NDM7 1665 aa6.95□□□□□ -1.3
ZNF546-201ENST00000347077 BAG3O95817 575 aa6.94□□□□□ -1.3
ZNF546-201ENST00000347077 CACNA2D4Q7Z3S7 1137 aa6.94□□□□□ -1.3
ZNF546-201ENST00000347077 FOXD4L1Q9NU39 408 aa6.94□□□□□ -1.3
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 104.3 ms