RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000341935.9

CCR6-201, Transcript of C-C motif chemokine receptor 6, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene CCR6, Length 4,018 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCR6-201ENST00000341935 DZIP1LQ8IYY4 767 aaKnown RBP7.69□□□□□ -1.18
CCR6-201ENST00000341935 UBR2Q8IWV8 1755 aa7.69□□□□□ -1.18
CCR6-201ENST00000341935 ITGB4P16144 1822 aa7.69□□□□□ -1.18
CCR6-201ENST00000341935 ERVV-2B6SEH9 535 aa7.69□□□□□ -1.18
CCR6-201ENST00000341935 VPS72Q15906 364 aa7.69□□□□□ -1.18
CCR6-201ENST00000341935 MEX3CQ5U5Q3 659 aaKnown RBP7.69□□□□□ -1.18
CCR6-201ENST00000341935 BARGINQ6ZT62 677 aa7.68□□□□□ -1.18
CCR6-201ENST00000341935 ARHGAP45Q92619 1136 aa7.68□□□□□ -1.18
CCR6-201ENST00000341935 HEG1Q9ULI3 1381 aa7.68□□□□□ -1.18
CCR6-201ENST00000341935 CACNA1FO60840 1977 aa7.68□□□□□ -1.18
CCR6-201ENST00000341935 EXOC5O00471 708 aa7.68□□□□□ -1.18
CCR6-201ENST00000341935 HOXB7P09629 217 aa7.68□□□□□ -1.18
CCR6-201ENST00000341935 CCDC30Q5VVM6 783 aa7.68□□□□□ -1.18
CCR6-201ENST00000341935 B4GALNT3Q6L9W6 998 aa7.68□□□□□ -1.18
CCR6-201ENST00000341935 FTSJ3Q8IY81 847 aaKnown RBP7.68□□□□□ -1.18
CCR6-201ENST00000341935 ZNF592Q92610 1267 aa7.68□□□□□ -1.18
CCR6-201ENST00000341935 CLUAP1Q96AJ1 413 aa7.68□□□□□ -1.18
CCR6-201ENST00000341935 COG6Q9Y2V7 657 aa7.68□□□□□ -1.18
CCR6-201ENST00000341935 DOT1LQ8TEK3 1739 aa7.68□□□□□ -1.18
CCR6-201ENST00000341935 ZNF790Q6PG37 636 aa7.68□□□□□ -1.18
CCR6-201ENST00000341935 USP21Q9UK80 565 aa7.68□□□□□ -1.18
CCR6-201ENST00000341935 GLI3P10071 1580 aa7.68□□□□□ -1.18
CCR6-201ENST00000341935 LAMB4A4D0S4 1761 aa7.67□□□□□ -1.18
CCR6-201ENST00000341935 PATL2C9JE40 543 aaKnown RBP7.67□□□□□ -1.18
CCR6-201ENST00000341935 SLC4A2P04920 1241 aa7.67□□□□□ -1.18
CCR6-201ENST00000341935 SLC39A6Q13433 755 aa7.67□□□□□ -1.18
CCR6-201ENST00000341935 MVPQ14764 893 aaKnown RBP7.67□□□□□ -1.18
CCR6-201ENST00000341935 NECTIN2Q92692 538 aa7.67□□□□□ -1.18
CCR6-201ENST00000341935 STK31Q9BXU1 1019 aa7.67□□□□□ -1.18
CCR6-201ENST00000341935 THSD7AQ9UPZ6 1657 aa7.67□□□□□ -1.18
CCR6-201ENST00000341935 PTPRCP08575 1304 aa7.66□□□□□ -1.18
CCR6-201ENST00000341935 GIGYF1O75420 1035 aaPredicted RBP7.66□□□□□ -1.18
CCR6-201ENST00000341935 DDB1Q16531 1140 aa7.66□□□□□ -1.18
CCR6-201ENST00000341935 HDGFL1Q5TGJ6 251 aa7.66□□□□□ -1.18
CCR6-201ENST00000341935 TTC5Q8N0Z6 440 aa7.66□□□□□ -1.18
CCR6-201ENST00000341935 API5Q9BZZ5 524 aaKnown RBP7.66□□□□□ -1.18
CCR6-201ENST00000341935 KCPQ6ZWJ8 1503 aa7.66□□□□□ -1.18
CCR6-201ENST00000341935 RGS12O14924 1447 aa7.66□□□□□ -1.18
CCR6-201ENST00000341935 ABCC4O15439 1325 aa7.66□□□□□ -1.18
CCR6-201ENST00000341935 AFF2P51816 1311 aa7.66□□□□□ -1.18
CCR6-201ENST00000341935 TMEM57Q8N5G2 664 aa7.66□□□□□ -1.18
CCR6-201ENST00000341935 EIF2S2P20042 333 aaKnown RBP7.66□□□□□ -1.18
CCR6-201ENST00000341935 CICQ96RK0 1608 aaPredicted RBP7.66□□□□□ -1.18
CCR6-201ENST00000341935 NBR1Q14596 966 aa7.65□□□□□ -1.18
CCR6-201ENST00000341935 ITPRIPQ8IWB1 547 aa7.65□□□□□ -1.18
CCR6-201ENST00000341935 TMOD3Q9NYL9 352 aa7.65□□□□□ -1.18
CCR6-201ENST00000341935 ATRNO75882 1429 aa7.65□□□□□ -1.18
CCR6-201ENST00000341935 PRAMEF22A3QJZ6 481 aa7.65□□□□□ -1.18
CCR6-201ENST00000341935 FAM98CQ17RN3 349 aaKnown RBP7.65□□□□□ -1.18
CCR6-201ENST00000341935 G2E3Q7L622 706 aa7.65□□□□□ -1.18
CCR6-201ENST00000341935 FMNL2Q96PY5 1086 aa7.65□□□□□ -1.18
CCR6-201ENST00000341935 ZNF496Q96IT1 587 aaPredicted RBP7.65□□□□□ -1.19
CCR6-201ENST00000341935 DDX19BQ9UMR2 479 aa7.65□□□□□ -1.19
CCR6-201ENST00000341935 HMGB1P09429 215 aaKnown RBP7.64□□□□□ -1.19
CCR6-201ENST00000341935 MARCH10Q8NA82 808 aaPredicted RBP7.64□□□□□ -1.19
CCR6-201ENST00000341935 CHPF2Q9P2E5 772 aa7.64□□□□□ -1.19
CCR6-201ENST00000341935 SNRPA1P09661 255 aaKnown RBP7.64□□□□□ -1.19
CCR6-201ENST00000341935 FLIIQ13045 1269 aa7.64□□□□□ -1.19
CCR6-201ENST00000341935 PIGBQ92521 554 aa7.64□□□□□ -1.19
CCR6-201ENST00000341935 BCL9O00512 1426 aa7.64□□□□□ -1.19
CCR6-201ENST00000341935 PLCD3Q8N3E9 789 aa7.63□□□□□ -1.19
CCR6-201ENST00000341935 GTF3C5Q9Y5Q8 519 aaPredicted RBP7.63□□□□□ -1.19
CCR6-201ENST00000341935 SECISBP2LQ93073 1101 aaKnown RBP7.63□□□□□ -1.19
CCR6-201ENST00000341935 GJD4Q96KN9 370 aaPredicted RBP7.63□□□□□ -1.19
CCR6-201ENST00000341935 PHAXQ9H814 394 aaKnown RBP7.63□□□□□ -1.19
CCR6-201ENST00000341935 DBF4Q9UBU7 674 aaPredicted RBP7.63□□□□□ -1.19
CCR6-201ENST00000341935 PXDNLA1KZ92 1463 aa7.63□□□□□ -1.19
CCR6-201ENST00000341935 INTS3Q68E01 1043 aaKnown RBP7.62□□□□□ -1.19
CCR6-201ENST00000341935 FKBP5Q13451 457 aaPredicted RBP7.62□□□□□ -1.19
CCR6-201ENST00000341935 TRPC5Q9UL62 973 aaPredicted RBP7.62□□□□□ -1.19
CCR6-201ENST00000341935 ATG3Q9NT62 314 aa7.62□□□□□ -1.19
CCR6-201ENST00000341935 F6X3S4 739 aa7.62□□□□□ -1.19
CCR6-201ENST00000341935 ZBTB7BO15156 539 aaPredicted RBP7.62□□□□□ -1.19
CCR6-201ENST00000341935 PRIM1P49642 420 aaKnown RBP7.62□□□□□ -1.19
CCR6-201ENST00000341935 PDIA6Q15084 440 aa7.62□□□□□ -1.19
CCR6-201ENST00000341935 PROSER3Q2NL68 480 aa7.62□□□□□ -1.19
CCR6-201ENST00000341935 ZBTB40Q9NUA8 1239 aa7.62□□□□□ -1.19
CCR6-201ENST00000341935 HYPKQ9NX55 129 aa7.62□□□□□ -1.19
CCR6-201ENST00000341935 ASAP1Q9ULH1 1129 aa7.62□□□□□ -1.19
CCR6-201ENST00000341935 USP16Q9Y5T5 823 aa7.62□□□□□ -1.19
CCR6-201ENST00000341935 KDM2BQ8NHM5 1336 aa7.61□□□□□ -1.19
CCR6-201ENST00000341935 A0A0G2JS52 829 aa7.61□□□□□ -1.19
CCR6-201ENST00000341935 ANXA1P04083 346 aa7.61□□□□□ -1.19
CCR6-201ENST00000341935 SYTL4Q96C24 671 aaPredicted RBP7.61□□□□□ -1.19
CCR6-201ENST00000341935 DDX21Q9NR30 783 aaKnown RBP eCLIP7.61□□□□□ -1.19
CCR6-201ENST00000341935 TJP1Q07157 1748 aa7.61□□□□□ -1.19
CCR6-201ENST00000341935 PTCD1O75127 700 aaKnown RBP7.61□□□□□ -1.19
CCR6-201ENST00000341935 ACSBG1Q96GR2 724 aa7.61□□□□□ -1.19
CCR6-201ENST00000341935 NHSQ6T4R5 1651 aa7.61□□□□□ -1.19
CCR6-201ENST00000341935 PTMSP20962 102 aa7.61□□□□□ -1.19
CCR6-201ENST00000341935 CCT4P50991 539 aaKnown RBP7.61□□□□□ -1.19
CCR6-201ENST00000341935 QTRT2Q9H974 415 aaKnown RBP7.61□□□□□ -1.19
CCR6-201ENST00000341935 PCDHB15Q9Y5E8 787 aa7.61□□□□□ -1.19
CCR6-201ENST00000341935 SLC4A10Q6U841 1118 aa7.6□□□□□ -1.19
CCR6-201ENST00000341935 CENPQQ7L2Z9 268 aaPredicted RBP7.6□□□□□ -1.19
CCR6-201ENST00000341935 ONECUT3O60422 494 aaPredicted RBP7.6□□□□□ -1.19
CCR6-201ENST00000341935 ADCY9O60503 1353 aa7.6□□□□□ -1.19
CCR6-201ENST00000341935 MYL6BP14649 208 aa7.6□□□□□ -1.19
CCR6-201ENST00000341935 ARFGEF2Q9Y6D5 1785 aa7.6□□□□□ -1.19
CCR6-201ENST00000341935 IGHDP01880 384 aa7.59□□□□□ -1.19
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