RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000340994.4

PKHD1-201, Transcript of PKHD1, fibrocystin/polyductin, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 5 BASIC

Gene PKHD1, Length 11,589 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKHD1-201ENST00000340994 ABCC11Q96J66 1382 aa9.48□□□□□ -0.89
PKHD1-201ENST00000340994 LRSAM1Q6UWE0 723 aa9.48□□□□□ -0.89
PKHD1-201ENST00000340994 CACNA2D4Q7Z3S7 1137 aa9.48□□□□□ -0.89
PKHD1-201ENST00000340994 CEP57Q86XR8 500 aa9.48□□□□□ -0.89
PKHD1-201ENST00000340994 SLU7O95391 586 aaKnown RBP9.48□□□□□ -0.89
PKHD1-201ENST00000340994 ATP11AP98196 1134 aa9.48□□□□□ -0.89
PKHD1-201ENST00000340994 GPRASP1Q5JY77 1395 aa9.48□□□□□ -0.89
PKHD1-201ENST00000340994 ANAPC4Q9UJX5 808 aa9.48□□□□□ -0.89
PKHD1-201ENST00000340994 UCHL5Q9Y5K5 329 aaKnown RBP eCLIP9.48□□□□□ -0.89
PKHD1-201ENST00000340994 TTC12Q9H892 705 aaPredicted RBP9.48□□□□□ -0.89
PKHD1-201ENST00000340994 ZBTB17Q13105 803 aa9.48□□□□□ -0.89
PKHD1-201ENST00000340994 CTAGE15A4D2H0 777 aa9.48□□□□□ -0.89
PKHD1-201ENST00000340994 RAB11FIP3O75154 756 aa9.48□□□□□ -0.89
PKHD1-201ENST00000340994 CTAGE8P0CG41 777 aa9.48□□□□□ -0.89
PKHD1-201ENST00000340994 TMEM132AQ24JP5 1023 aa9.48□□□□□ -0.89
PKHD1-201ENST00000340994 RIC3Q7Z5B4 369 aa9.48□□□□□ -0.89
PKHD1-201ENST00000340994 CTAGE6Q86UF2 777 aa9.48□□□□□ -0.89
PKHD1-201ENST00000340994 CTAGE4Q8IX94 777 aa9.48□□□□□ -0.89
PKHD1-201ENST00000340994 CASKIN1Q8WXD9 1431 aa9.48□□□□□ -0.89
PKHD1-201ENST00000340994 MYCBPQ99417 103 aaPredicted RBP9.47□□□□□ -0.89
PKHD1-201ENST00000340994 SAMD15Q9P1V8 674 aa9.47□□□□□ -0.89
PKHD1-201ENST00000340994 FAM76AQ8TAV0 307 aa9.47□□□□□ -0.89
PKHD1-201ENST00000340994 JAKMIP2Q96AA8 810 aa9.47□□□□□ -0.89
PKHD1-201ENST00000340994 CCDC141Q6ZP82 1450 aa9.47□□□□□ -0.89
PKHD1-201ENST00000340994 GBP1P32455 592 aa9.47□□□□□ -0.89
PKHD1-201ENST00000340994 NOLC1Q14978 699 aaKnown RBP eCLIP9.47□□□□□ -0.89
PKHD1-201ENST00000340994 CACNA2D3Q8IZS8 1091 aa9.47□□□□□ -0.89
PKHD1-201ENST00000340994 CCDC77Q9BR77 488 aa9.47□□□□□ -0.89
PKHD1-201ENST00000340994 NAA25Q14CX7 972 aa9.47□□□□□ -0.89
PKHD1-201ENST00000340994 CCDC12Q8WUD4 166 aaPredicted RBP9.47□□□□□ -0.89
PKHD1-201ENST00000340994 TSNARE1Q96NA8 513 aa9.47□□□□□ -0.89
PKHD1-201ENST00000340994 JADE2Q9NQC1 790 aa9.47□□□□□ -0.89
PKHD1-201ENST00000340994 TCHPQ9BT92 498 aa9.47□□□□□ -0.89
PKHD1-201ENST00000340994 ZSCAN23Q3MJ62 389 aa9.47□□□□□ -0.89
PKHD1-201ENST00000340994 GRIPAP1Q4V328 841 aa9.47□□□□□ -0.89
PKHD1-201ENST00000340994 SOGA3Q5TF21 947 aa9.47□□□□□ -0.89
PKHD1-201ENST00000340994 CCDC129Q6ZRS4 1044 aa9.47□□□□□ -0.89
PKHD1-201ENST00000340994 FAM200AQ8TCP9 573 aa9.47□□□□□ -0.89
PKHD1-201ENST00000340994 VCX3BQ9H321 246 aa9.47□□□□□ -0.89
PKHD1-201ENST00000340994 MAP3K9P80192 1104 aa9.46□□□□□ -0.89
PKHD1-201ENST00000340994 SETDB1Q15047 1291 aa9.46□□□□□ -0.89
PKHD1-201ENST00000340994 MICALL1Q8N3F8 863 aa9.46□□□□□ -0.89
PKHD1-201ENST00000340994 USP25Q9UHP3 1055 aa9.46□□□□□ -0.89
PKHD1-201ENST00000340994 ADAMTS8Q9UP79 889 aa9.46□□□□□ -0.89
PKHD1-201ENST00000340994 SPATS2Q86XZ4 545 aaKnown RBP9.46□□□□□ -0.89
PKHD1-201ENST00000340994 CCDC114Q96M63 670 aa9.46□□□□□ -0.89
PKHD1-201ENST00000340994 ZNF287Q9HBT7 754 aa9.46□□□□□ -0.89
PKHD1-201ENST00000340994 BCCIPQ9P287 314 aaKnown RBP eCLIP9.46□□□□□ -0.89
PKHD1-201ENST00000340994 SPDYE4A6NLX3 237 aa9.46□□□□□ -0.89
PKHD1-201ENST00000340994 DDX55Q8NHQ9 600 aaKnown RBP eCLIP9.46□□□□□ -0.89
PKHD1-201ENST00000340994 JAKMIP1Q96N16 626 aaKnown RBP9.46□□□□□ -0.89
PKHD1-201ENST00000340994 LRPPRCP42704 1394 aaKnown RBP9.46□□□□□ -0.89
PKHD1-201ENST00000340994 ATP5DP30049 168 aa9.46□□□□□ -0.89
PKHD1-201ENST00000340994 LARP1Q6PKG0 1096 aaKnown RBP9.46□□□□□ -0.89
PKHD1-201ENST00000340994 UBAC1Q9BSL1 405 aa9.46□□□□□ -0.89
PKHD1-201ENST00000340994 SELENOOQ9BVL4 669 aa9.46□□□□□ -0.89
PKHD1-201ENST00000340994 IQCGQ9H095 443 aaKnown RBP9.46□□□□□ -0.89
PKHD1-201ENST00000340994 NOB1Q9ULX3 412 aaKnown RBP9.46□□□□□ -0.9
PKHD1-201ENST00000340994 ZNF165P49910 485 aa9.46□□□□□ -0.9
PKHD1-201ENST00000340994 CAMK4Q16566 473 aa9.46□□□□□ -0.9
PKHD1-201ENST00000340994 TSGA10Q9BZW7 698 aa9.46□□□□□ -0.9
PKHD1-201ENST00000340994 TRAK1Q9UPV9 953 aa9.46□□□□□ -0.9
PKHD1-201ENST00000340994 TCP11L2Q8N4U5 519 aa9.46□□□□□ -0.9
PKHD1-201ENST00000340994 NUP133Q8WUM0 1156 aa9.46□□□□□ -0.9
PKHD1-201ENST00000340994 NEBLO76041 1014 aa9.46□□□□□ -0.9
PKHD1-201ENST00000340994 ALDH3A1P30838 453 aa9.46□□□□□ -0.9
PKHD1-201ENST00000340994 VCXQ9H320 206 aa9.46□□□□□ -0.9
PKHD1-201ENST00000340994 ZSCAN16Q9H4T2 348 aaPredicted RBP9.46□□□□□ -0.9
PKHD1-201ENST00000340994 SCLT1Q96NL6 688 aa9.46□□□□□ -0.9
PKHD1-201ENST00000340994 LIMCH1Q9UPQ0 1083 aa9.46□□□□□ -0.9
PKHD1-201ENST00000340994 A0A1W2PRG0 241 aa9.45□□□□□ -0.9
PKHD1-201ENST00000340994 TMC6Q7Z403 805 aa9.45□□□□□ -0.9
PKHD1-201ENST00000340994 CECR2Q9BXF3 1484 aa9.45□□□□□ -0.9
PKHD1-201ENST00000340994 CCDC160A6NGH7 325 aa9.45□□□□□ -0.9
PKHD1-201ENST00000340994 HNRNPMP52272 730 aaKnown RBP eCLIP9.45□□□□□ -0.9
PKHD1-201ENST00000340994 GNG11P61952 73 aa9.45□□□□□ -0.9
PKHD1-201ENST00000340994 SEPT14Q6ZU15 432 aa9.45□□□□□ -0.9
PKHD1-201ENST00000340994 TTC39AQ5SRH9 613 aa9.45□□□□□ -0.9
PKHD1-201ENST00000340994 RMND1Q9NWS8 449 aa9.45□□□□□ -0.9
PKHD1-201ENST00000340994 PPFIBP2Q8ND30 876 aa9.45□□□□□ -0.9
PKHD1-201ENST00000340994 SPAG1Q07617 926 aa9.45□□□□□ -0.9
PKHD1-201ENST00000340994 PPP1R14CQ8TAE6 165 aa9.45□□□□□ -0.9
PKHD1-201ENST00000340994 PNISRQ8TF01 805 aaKnown RBP9.45□□□□□ -0.9
PKHD1-201ENST00000340994 ZWINTO95229 277 aa9.45□□□□□ -0.9
PKHD1-201ENST00000340994 RPAP2Q8IXW5 612 aaPredicted RBP9.45□□□□□ -0.9
PKHD1-201ENST00000340994 LTV1Q96GA3 475 aaPredicted RBP9.45□□□□□ -0.9
PKHD1-201ENST00000340994 ATP2A1O14983 1001 aa9.45□□□□□ -0.9
PKHD1-201ENST00000340994 LUC7L3O95232 432 aaKnown RBP9.45□□□□□ -0.9
PKHD1-201ENST00000340994 ATP2B1P20020 1258 aa9.45□□□□□ -0.9
PKHD1-201ENST00000340994 SUDS3Q9H7L9 328 aaPredicted RBP9.45□□□□□ -0.9
PKHD1-201ENST00000340994 HOMER2Q9NSB8 354 aa9.45□□□□□ -0.9
PKHD1-201ENST00000340994 KIAA0753Q2KHM9 967 aa9.44□□□□□ -0.9
PKHD1-201ENST00000340994 TWISTNBQ3B726 338 aaPredicted RBP9.44□□□□□ -0.9
PKHD1-201ENST00000340994 STMN2Q93045 179 aa9.44□□□□□ -0.9
PKHD1-201ENST00000340994 MAP4K4O95819 1239 aaPredicted RBP9.44□□□□□ -0.9
PKHD1-201ENST00000340994 TRERF1Q96PN7 1200 aa9.44□□□□□ -0.9
PKHD1-201ENST00000340994 FAM114A2Q9NRY5 505 aa9.44□□□□□ -0.9
PKHD1-201ENST00000340994 ERBINQ96RT1 1412 aa9.44□□□□□ -0.9
PKHD1-201ENST00000340994 ANKRD50Q9ULJ7 1429 aa9.44□□□□□ -0.9
PKHD1-201ENST00000340994 AK9Q5TCS8 1911 aa9.44□□□□□ -0.9
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 53.4 ms