RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000318066.6

UBE2N-201, Transcript of ubiquitin conjugating enzyme E2 N, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene UBE2N, Length 5,186 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE2N-201ENST00000318066 MAP2K1Q02750 393 aaPredicted RBP22.05■■□□□ 1.12
UBE2N-201ENST00000318066 CAMK4Q16566 473 aa22.05■■□□□ 1.12
UBE2N-201ENST00000318066 TOP2BQ02880 1626 aa22.05■■□□□ 1.12
UBE2N-201ENST00000318066 TOPBP1Q92547 1522 aa22.04■■□□□ 1.12
UBE2N-201ENST00000318066 SMC1AQ14683 1233 aaKnown RBP22.04■■□□□ 1.12
UBE2N-201ENST00000318066 LUZP1Q86V48 1076 aa22.04■■□□□ 1.12
UBE2N-201ENST00000318066 CCDC150Q8NCX0 1101 aa22.04■■□□□ 1.12
UBE2N-201ENST00000318066 GIMAP7Q8NHV1 300 aa22.04■■□□□ 1.12
UBE2N-201ENST00000318066 METTL24Q5JXM2 366 aa22.04■■□□□ 1.12
UBE2N-201ENST00000318066 UBE2HP62256 183 aa22.03■■□□□ 1.12
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UBE2N-201ENST00000318066 TMEM266Q2M3C6 531 aa22.03■■□□□ 1.12
UBE2N-201ENST00000318066 IQCA1Q86XH1 822 aa22.03■■□□□ 1.12
UBE2N-201ENST00000318066 NUDT16Q96DE0 195 aaKnown RBP22.03■■□□□ 1.12
UBE2N-201ENST00000318066 NAPBQ9H115 298 aa22.03■■□□□ 1.12
UBE2N-201ENST00000318066 DYDC1Q8WWB3 177 aa22.03■■□□□ 1.12
UBE2N-201ENST00000318066 TAOK3Q9H2K8 898 aa22.03■■□□□ 1.12
UBE2N-201ENST00000318066 EHBP1Q8NDI1 1231 aa22.03■■□□□ 1.12
UBE2N-201ENST00000318066 GOLGA6L10A0A0M3HER8 536 aa22.03■■□□□ 1.12
UBE2N-201ENST00000318066 ZNF652Q9Y2D9 606 aa22.03■■□□□ 1.12
UBE2N-201ENST00000318066 HMGXB3Q12766 1538 aa22.02■■□□□ 1.12
UBE2N-201ENST00000318066 MAP3K1Q13233 1512 aa22.02■■□□□ 1.12
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UBE2N-201ENST00000318066 ALS2CR12Q96Q35 445 aa22.02■■□□□ 1.12
UBE2N-201ENST00000318066 STRN4Q9NRL3 753 aa22.02■■□□□ 1.11
UBE2N-201ENST00000318066 SSFA2P28290 1259 aa22.01■■□□□ 1.11
UBE2N-201ENST00000318066 ZSCAN16Q9H4T2 348 aaPredicted RBP22.01■■□□□ 1.11
UBE2N-201ENST00000318066 HYPKQ9NX55 129 aa22.01■■□□□ 1.11
UBE2N-201ENST00000318066 FAM114A1Q8IWE2 563 aa22.01■■□□□ 1.11
UBE2N-201ENST00000318066 CNNM3Q8NE01 707 aa22.01■■□□□ 1.11
UBE2N-201ENST00000318066 POGZQ7Z3K3 1410 aa22.01■■□□□ 1.11
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UBE2N-201ENST00000318066 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa22.01■■□□□ 1.11
UBE2N-201ENST00000318066 STX6O43752 255 aa22.01■■□□□ 1.11
UBE2N-201ENST00000318066 AMPD3Q01432 767 aa22.01■■□□□ 1.11
UBE2N-201ENST00000318066 ANKLE2Q86XL3 938 aa22.01■■□□□ 1.11
UBE2N-201ENST00000318066 CCDC171Q6TFL3 1326 aa22.01■■□□□ 1.11
UBE2N-201ENST00000318066 ERICH4A6NGS2 130 aa22■■□□□ 1.11
UBE2N-201ENST00000318066 CAVIN4Q5BKX8 364 aa22■■□□□ 1.11
UBE2N-201ENST00000318066 PRDM11Q9NQV5 511 aa22■■□□□ 1.11
UBE2N-201ENST00000318066 ECHDC1Q9NTX5 307 aa22■■□□□ 1.11
UBE2N-201ENST00000318066 DNAAF4Q8WXU2 420 aa22■■□□□ 1.11
UBE2N-201ENST00000318066 TBC1D32Q96NH3 1257 aa22■■□□□ 1.11
UBE2N-201ENST00000318066 USP25Q9UHP3 1055 aa22■■□□□ 1.11
UBE2N-201ENST00000318066 ZNF213O14771 459 aa22■■□□□ 1.11
UBE2N-201ENST00000318066 ARHGAP45Q92619 1136 aa22■■□□□ 1.11
UBE2N-201ENST00000318066 TMOD2Q9NZR1 351 aa22■■□□□ 1.11
UBE2N-201ENST00000318066 DBF4Q9UBU7 674 aaPredicted RBP21.99■■□□□ 1.11
UBE2N-201ENST00000318066 SLC12A7Q9Y666 1083 aa21.99■■□□□ 1.11
UBE2N-201ENST00000318066 DDX54Q8TDD1 881 aaKnown RBP21.99■■□□□ 1.11
UBE2N-201ENST00000318066 CCDC12Q8WUD4 166 aaPredicted RBP21.99■■□□□ 1.11
UBE2N-201ENST00000318066 MRC2Q9UBG0 1479 aa21.99■■□□□ 1.11
UBE2N-201ENST00000318066 FSIP1Q8NA03 581 aa21.99■■□□□ 1.11
UBE2N-201ENST00000318066 SSRP1Q08945 709 aaKnown RBP21.99■■□□□ 1.11
UBE2N-201ENST00000318066 SMARCC1Q92922 1105 aaPredicted RBP21.99■■□□□ 1.11
UBE2N-201ENST00000318066 LRRC27Q9C0I9 530 aa21.99■■□□□ 1.11
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UBE2N-201ENST00000318066 A0A087WZG4 1122 aa21.98■■□□□ 1.11
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UBE2N-201ENST00000318066 TUBB4BP68371 445 aa21.97■■□□□ 1.11
UBE2N-201ENST00000318066 ZNF165P49910 485 aa21.97■■□□□ 1.11
UBE2N-201ENST00000318066 TTF1Q15361 905 aaPredicted RBP21.97■■□□□ 1.11
UBE2N-201ENST00000318066 TTC21BQ7Z4L5 1316 aa21.97■■□□□ 1.11
UBE2N-201ENST00000318066 BMP15O95972 392 aa21.97■■□□□ 1.11
UBE2N-201ENST00000318066 NUP88Q99567 741 aaPredicted RBP21.97■■□□□ 1.11
UBE2N-201ENST00000318066 BOLA2Q9H3K6 86 aa21.97■■□□□ 1.11
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UBE2N-201ENST00000318066 DDX12PQ92771 950 aa21.96■■□□□ 1.11
UBE2N-201ENST00000318066 ANAPC15P60006 121 aa21.96■■□□□ 1.11
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UBE2N-201ENST00000318066 TRIM27P14373 513 aa21.95■■□□□ 1.1
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UBE2N-201ENST00000318066 SLC5A1P13866 664 aa21.94■■□□□ 1.1
UBE2N-201ENST00000318066 STK11IPQ8N1F8 1099 aa21.94■■□□□ 1.1
UBE2N-201ENST00000318066 GOLGA8AA7E2F4 631 aa21.94■■□□□ 1.1
UBE2N-201ENST00000318066 GOLGA8BA8MQT2 603 aa21.94■■□□□ 1.1
UBE2N-201ENST00000318066 ZSCAN29Q8IWY8 852 aaPredicted RBP21.94■■□□□ 1.1
UBE2N-201ENST00000318066 EHMT1Q9H9B1 1298 aa21.94■■□□□ 1.1
UBE2N-201ENST00000318066 ABCF2Q9UG63 623 aa21.94■■□□□ 1.1
UBE2N-201ENST00000318066 IFI16Q16666 785 aaKnown RBP21.94■■□□□ 1.1
UBE2N-201ENST00000318066 CCDC102BQ68D86 513 aa21.94■■□□□ 1.1
UBE2N-201ENST00000318066 TBC1D9Q6ZT07 1266 aa21.94■■□□□ 1.1
UBE2N-201ENST00000318066 CBX1P83916 185 aa21.93■■□□□ 1.1
UBE2N-201ENST00000318066 LRSAM1Q6UWE0 723 aa21.93■■□□□ 1.1
UBE2N-201ENST00000318066 STXBP4Q6ZWJ1 553 aa21.93■■□□□ 1.1
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