RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000259351.9

RALGPS1-201, Transcript of Ral GEF with PH domain and SH3 binding motif 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene RALGPS1, Length 6,336 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RALGPS1-201ENST00000259351 CLIP2Q9UDT6 1046 aa15.03■□□□□ -0
RALGPS1-201ENST00000259351 ZNF213O14771 459 aa15.03■□□□□ -0
RALGPS1-201ENST00000259351 URI1O94763 535 aaPredicted RBP15.03■□□□□ -0
RALGPS1-201ENST00000259351 BMP2KLQ5H9B9 411 aa15.03■□□□□ -0
RALGPS1-201ENST00000259351 CPLX3Q8WVH0 158 aa15.03■□□□□ -0
RALGPS1-201ENST00000259351 PI4KAP2A4QPH2 592 aa15.02■□□□□ -0
RALGPS1-201ENST00000259351 GOLGA8BA8MQT2 603 aa15.02■□□□□ -0
RALGPS1-201ENST00000259351 PDIA4P13667 645 aaKnown RBP15.02■□□□□ -0
RALGPS1-201ENST00000259351 GJB2P29033 226 aa15.02■□□□□ -0
RALGPS1-201ENST00000259351 CEBPAP49715 358 aaPredicted RBP15.02■□□□□ -0
RALGPS1-201ENST00000259351 PI4KAP1Q8N8J0 262 aa15.02■□□□□ -0
RALGPS1-201ENST00000259351 PANK2Q9BZ23 570 aa15.02■□□□□ -0
RALGPS1-201ENST00000259351 MKNK2Q9HBH9 465 aa15.02■□□□□ -0
RALGPS1-201ENST00000259351 TRMT112Q9UI30 125 aaKnown RBP15.02■□□□□ -0
RALGPS1-201ENST00000259351 KIAA0586Q9BVV6 1533 aa15.02■□□□□ -0
RALGPS1-201ENST00000259351 GOLIM4O00461 696 aa15.02■□□□□ -0
RALGPS1-201ENST00000259351 HAND2P61296 217 aa15.02■□□□□ -0
RALGPS1-201ENST00000259351 PPP1R42Q7Z4L9 355 aa15.02■□□□□ -0
RALGPS1-201ENST00000259351 CCDC144CPQ8IYA2 1237 aa15.02■□□□□ -0
RALGPS1-201ENST00000259351 PLCD4Q9BRC7 762 aa15.02■□□□□ -0
RALGPS1-201ENST00000259351 ECHDC1Q9NTX5 307 aa15.02■□□□□ -0
RALGPS1-201ENST00000259351 CEP131Q9UPN4 1083 aa15.02■□□□□ -0
RALGPS1-201ENST00000259351 PHF8Q9UPP1 1060 aa15.02■□□□□ -0
RALGPS1-201ENST00000259351 MAP3K2Q9Y2U5 619 aa15.02■□□□□ -0
RALGPS1-201ENST00000259351 POLR3DP05423 398 aaPredicted RBP15.02□□□□□ -0.01
RALGPS1-201ENST00000259351 ENOX2Q16206 610 aaKnown RBP15.02□□□□□ -0.01
RALGPS1-201ENST00000259351 C16orf45Q96MC5 204 aaPredicted RBP15.02□□□□□ -0.01
RALGPS1-201ENST00000259351 BAG4O95429 457 aaKnown RBP15.01□□□□□ -0.01
RALGPS1-201ENST00000259351 FSIP1Q8NA03 581 aa15.01□□□□□ -0.01
RALGPS1-201ENST00000259351 PRDM10Q9NQV6 1147 aa15.01□□□□□ -0.01
RALGPS1-201ENST00000259351 PCDHB15Q9Y5E8 787 aa15.01□□□□□ -0.01
RALGPS1-201ENST00000259351 KIAA0754O94854 1291 aa15.01□□□□□ -0.01
RALGPS1-201ENST00000259351 DNA2P51530 1060 aa15.01□□□□□ -0.01
RALGPS1-201ENST00000259351 AMOTQ4VCS5 1084 aa15.01□□□□□ -0.01
RALGPS1-201ENST00000259351 WWC2Q6AWC2 1192 aa15.01□□□□□ -0.01
RALGPS1-201ENST00000259351 ISM2Q6H9L7 571 aa15.01□□□□□ -0.01
RALGPS1-201ENST00000259351 TBC1D32Q96NH3 1257 aa15.01□□□□□ -0.01
RALGPS1-201ENST00000259351 PTPN23Q9H3S7 1636 aa15.01□□□□□ -0.01
RALGPS1-201ENST00000259351 CBX1P83916 185 aa15.01□□□□□ -0.01
RALGPS1-201ENST00000259351 SLC12A7Q9Y666 1083 aa15.01□□□□□ -0.01
RALGPS1-201ENST00000259351 IFIT3O14879 490 aaKnown RBP15□□□□□ -0.01
RALGPS1-201ENST00000259351 STX6O43752 255 aa15□□□□□ -0.01
RALGPS1-201ENST00000259351 TOP1P11387 765 aaKnown RBP15□□□□□ -0.01
RALGPS1-201ENST00000259351 CAVIN4Q5BKX8 364 aa15□□□□□ -0.01
RALGPS1-201ENST00000259351 UBE3BQ7Z3V4 1068 aa15□□□□□ -0.01
RALGPS1-201ENST00000259351 MAP3K12Q12852 859 aa15□□□□□ -0.01
RALGPS1-201ENST00000259351 SEPT7Q16181 437 aaKnown RBP15□□□□□ -0.01
RALGPS1-201ENST00000259351 TCEANC2Q96MN5 208 aa15□□□□□ -0.01
RALGPS1-201ENST00000259351 RRP9O43818 475 aaKnown RBP15□□□□□ -0.01
RALGPS1-201ENST00000259351 CTCFLQ8NI51 663 aaPredicted RBP15□□□□□ -0.01
RALGPS1-201ENST00000259351 TXLNBQ8N3L3 684 aa14.99□□□□□ -0.01
RALGPS1-201ENST00000259351 PTPRCP08575 1304 aa14.99□□□□□ -0.01
RALGPS1-201ENST00000259351 NOS1P29475 1434 aa14.99□□□□□ -0.01
RALGPS1-201ENST00000259351 HSP90AB3PQ58FF7 597 aa14.99□□□□□ -0.01
RALGPS1-201ENST00000259351 TMCO3Q6UWJ1 677 aa14.99□□□□□ -0.01
RALGPS1-201ENST00000259351 SSR1P43307 286 aaKnown RBP14.99□□□□□ -0.01
RALGPS1-201ENST00000259351 TTC22Q5TAA0 569 aa14.99□□□□□ -0.01
RALGPS1-201ENST00000259351 KIF18AQ8NI77 898 aa14.99□□□□□ -0.01
RALGPS1-201ENST00000259351 MEIS3Q99687 375 aa14.99□□□□□ -0.01
RALGPS1-201ENST00000259351 HYPKQ9NX55 129 aa14.99□□□□□ -0.01
RALGPS1-201ENST00000259351 GOLGA8AA7E2F4 631 aa14.99□□□□□ -0.01
RALGPS1-201ENST00000259351 MAPK8IP2Q13387 824 aaPredicted RBP14.99□□□□□ -0.01
RALGPS1-201ENST00000259351 KIF4BQ2VIQ3 1234 aa14.99□□□□□ -0.01
RALGPS1-201ENST00000259351 CNNM3Q8NE01 707 aa14.99□□□□□ -0.01
RALGPS1-201ENST00000259351 TAF4BQ92750 862 aa14.99□□□□□ -0.01
RALGPS1-201ENST00000259351 EVI5LQ96CN4 794 aa14.99□□□□□ -0.01
RALGPS1-201ENST00000259351 ANKIB1Q9P2G1 1089 aa14.98□□□□□ -0.01
RALGPS1-201ENST00000259351 SEC63Q9UGP8 760 aaKnown RBP14.98□□□□□ -0.01
RALGPS1-201ENST00000259351 CCDC196A0A1B0GTZ2 297 aa14.98□□□□□ -0.01
RALGPS1-201ENST00000259351 HMGB1P09429 215 aaKnown RBP14.98□□□□□ -0.01
RALGPS1-201ENST00000259351 TNNT1P13805 278 aa14.98□□□□□ -0.01
RALGPS1-201ENST00000259351 DZIP1Q86YF9 867 aaKnown RBP14.98□□□□□ -0.01
RALGPS1-201ENST00000259351 PKNOX2Q96KN3 472 aa14.98□□□□□ -0.01
RALGPS1-201ENST00000259351 UBA5Q9GZZ9 404 aa14.98□□□□□ -0.01
RALGPS1-201ENST00000259351 NECAB1Q8N987 351 aa14.98□□□□□ -0.01
RALGPS1-201ENST00000259351 ADCY5O95622 1261 aa14.98□□□□□ -0.01
RALGPS1-201ENST00000259351 MATR3P43243 847 aaKnown RBP eCLIP14.98□□□□□ -0.01
RALGPS1-201ENST00000259351 USP16Q9Y5T5 823 aa14.98□□□□□ -0.01
RALGPS1-201ENST00000259351 ADAMTS2O95450 1211 aa14.97□□□□□ -0.01
RALGPS1-201ENST00000259351 SLC4A8Q2Y0W8 1093 aa14.97□□□□□ -0.01
RALGPS1-201ENST00000259351 MICU3Q86XE3 530 aa14.97□□□□□ -0.01
RALGPS1-201ENST00000259351 IQCA1Q86XH1 822 aa14.97□□□□□ -0.01
RALGPS1-201ENST00000259351 SDSP20132 328 aa14.97□□□□□ -0.01
RALGPS1-201ENST00000259351 IQCEQ6IPM2 695 aa14.97□□□□□ -0.01
RALGPS1-201ENST00000259351 ZNF397Q8NF99 534 aaPredicted RBP14.97□□□□□ -0.01
RALGPS1-201ENST00000259351 RPRD2Q5VT52 1461 aaKnown RBP14.97□□□□□ -0.01
RALGPS1-201ENST00000259351 TNNQ9UQP3 1299 aa14.97□□□□□ -0.01
RALGPS1-201ENST00000259351 CD109Q6YHK3 1445 aa14.96□□□□□ -0.01
RALGPS1-201ENST00000259351 ZSCAN12O43309 604 aa14.96□□□□□ -0.01
RALGPS1-201ENST00000259351 HCLS1P14317 486 aaPredicted RBP14.96□□□□□ -0.01
RALGPS1-201ENST00000259351 CCDC148Q8NFR7 591 aa14.96□□□□□ -0.01
RALGPS1-201ENST00000259351 IBSPP21815 317 aaPredicted RBP14.96□□□□□ -0.01
RALGPS1-201ENST00000259351 SPA17Q15506 151 aa14.96□□□□□ -0.01
RALGPS1-201ENST00000259351 LDHAL6AQ6ZMR3 332 aa14.96□□□□□ -0.01
RALGPS1-201ENST00000259351 CRACR2BQ8N4Y2 399 aaPredicted RBP14.96□□□□□ -0.01
RALGPS1-201ENST00000259351 LRRC2Q9BYS8 371 aa14.96□□□□□ -0.01
RALGPS1-201ENST00000259351 GIMAP6Q6P9H5 292 aa14.96□□□□□ -0.01
RALGPS1-201ENST00000259351 ANKRD18BA2A2Z9 1011 aa14.96□□□□□ -0.02
RALGPS1-201ENST00000259351 ZNF165P49910 485 aa14.96□□□□□ -0.02
RALGPS1-201ENST00000259351 CRACR2AQ9BSW2 395 aa14.96□□□□□ -0.02
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 26.2 ms