RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000256413.7

CTIF-201, Transcript of cap binding complex dependent translation initiation factor, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene CTIF, Length 5,750 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTIF-201ENST00000256413 SRGAP3O43295 1099 aa18.59■□□□□ 0.57
CTIF-201ENST00000256413 ZSCAN22P10073 491 aaPredicted RBP18.59■□□□□ 0.57
CTIF-201ENST00000256413 ALDH1L2Q3SY69 923 aa18.59■□□□□ 0.57
CTIF-201ENST00000256413 FYB1O15117 783 aa18.59■□□□□ 0.57
CTIF-201ENST00000256413 RAB11FIP3O75154 756 aa18.59■□□□□ 0.57
CTIF-201ENST00000256413 PTGS1P23219 599 aa18.59■□□□□ 0.57
CTIF-201ENST00000256413 HLTFQ14527 1009 aaKnown RBP eCLIP18.59■□□□□ 0.57
CTIF-201ENST00000256413 NUTM1Q86Y26 1132 aa18.59■□□□□ 0.57
CTIF-201ENST00000256413 CEP131Q9UPN4 1083 aa18.59■□□□□ 0.57
CTIF-201ENST00000256413 ERO1AQ96HE7 468 aa18.59■□□□□ 0.57
CTIF-201ENST00000256413 SIL1Q9H173 461 aa18.59■□□□□ 0.57
CTIF-201ENST00000256413 BIN1O00499 593 aa18.58■□□□□ 0.57
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CTIF-201ENST00000256413 NCOA1Q15788 1441 aa18.57■□□□□ 0.56
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CTIF-201ENST00000256413 A0A1B0GUA9 196 aa18.56■□□□□ 0.56
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CTIF-201ENST00000256413 MTMR7Q9Y216 660 aa18.56■□□□□ 0.56
CTIF-201ENST00000256413 GPRASP1Q5JY77 1395 aa18.56■□□□□ 0.56
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CTIF-201ENST00000256413 ALS2CR12Q96Q35 445 aa18.55■□□□□ 0.56
CTIF-201ENST00000256413 SLC12A5Q9H2X9 1139 aa18.55■□□□□ 0.56
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CTIF-201ENST00000256413 TRIM27P14373 513 aa18.55■□□□□ 0.56
CTIF-201ENST00000256413 CCDC158Q5M9N0 1113 aa18.55■□□□□ 0.56
CTIF-201ENST00000256413 DDX24Q9GZR7 859 aaKnown RBP eCLIP18.55■□□□□ 0.566e-6■■■□□ 19.2
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CTIF-201ENST00000256413 CCDC57Q2TAC2 916 aa18.54■□□□□ 0.56
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CTIF-201ENST00000256413 C8orf76Q96K31 380 aa18.54■□□□□ 0.56
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CTIF-201ENST00000256413 KIF1BPQ96EK5 621 aa18.54■□□□□ 0.56
CTIF-201ENST00000256413 DNA2P51530 1060 aa18.53■□□□□ 0.56
CTIF-201ENST00000256413 NAA25Q14CX7 972 aa18.53■□□□□ 0.56
CTIF-201ENST00000256413 UBASH3AP57075 661 aa18.53■□□□□ 0.56
CTIF-201ENST00000256413 PPM1EQ8WY54 764 aa18.53■□□□□ 0.56
CTIF-201ENST00000256413 POGZQ7Z3K3 1410 aa18.53■□□□□ 0.56
CTIF-201ENST00000256413 HDAC1Q13547 482 aaPredicted RBP18.53■□□□□ 0.56
CTIF-201ENST00000256413 TTC22Q5TAA0 569 aa18.53■□□□□ 0.56
CTIF-201ENST00000256413 JADE2Q9NQC1 790 aa18.53■□□□□ 0.56
CTIF-201ENST00000256413 GUCY1B3Q02153 619 aa18.53■□□□□ 0.56
CTIF-201ENST00000256413 ZNF526Q8TF50 670 aaPredicted RBP18.53■□□□□ 0.56
CTIF-201ENST00000256413 NUP133Q8WUM0 1156 aa18.53■□□□□ 0.56
CTIF-201ENST00000256413 HYPKQ9NX55 129 aa18.53■□□□□ 0.56
CTIF-201ENST00000256413 SYT10Q6XYQ8 523 aa18.53■□□□□ 0.56
CTIF-201ENST00000256413 CLGNO14967 610 aa18.52■□□□□ 0.56
CTIF-201ENST00000256413 SCLT1Q96NL6 688 aa18.52■□□□□ 0.56
CTIF-201ENST00000256413 ERICH3Q5RHP9 1530 aa18.52■□□□□ 0.56
CTIF-201ENST00000256413 PHACTR2O75167 634 aa18.52■□□□□ 0.56
CTIF-201ENST00000256413 DNAJC25Q9H1X3 360 aa18.52■□□□□ 0.56
CTIF-201ENST00000256413 NUCB1Q02818 461 aa18.52■□□□□ 0.56
CTIF-201ENST00000256413 TMEM132EQ6IEE7 984 aa18.52■□□□□ 0.56
CTIF-201ENST00000256413 CCDC114Q96M63 670 aa18.52■□□□□ 0.55
CTIF-201ENST00000256413 TYRO3Q06418 890 aa18.51■□□□□ 0.55
CTIF-201ENST00000256413 DMTNQ08495 405 aa18.51■□□□□ 0.55
CTIF-201ENST00000256413 MATR3P43243 847 aaKnown RBP eCLIP18.51■□□□□ 0.553e-6■■■□□ 16.2
CTIF-201ENST00000256413 CACNA2D4Q7Z3S7 1137 aa18.51■□□□□ 0.55
CTIF-201ENST00000256413 ZHX3Q9H4I2 956 aa18.51■□□□□ 0.55
CTIF-201ENST00000256413 IGF1RP08069 1367 aa18.51■□□□□ 0.55
CTIF-201ENST00000256413 HDXQ7Z353 690 aa18.51■□□□□ 0.55
CTIF-201ENST00000256413 SYT1P21579 422 aa18.5■□□□□ 0.55
CTIF-201ENST00000256413 PIP4K2BP78356 416 aa18.5■□□□□ 0.55
CTIF-201ENST00000256413 SPATA24Q86W54 205 aa18.5■□□□□ 0.55
CTIF-201ENST00000256413 MAP3K1Q13233 1512 aa18.5■□□□□ 0.55
CTIF-201ENST00000256413 FCHSD2O94868 740 aa18.5■□□□□ 0.55
CTIF-201ENST00000256413 TUBBP07437 444 aa18.5■□□□□ 0.55
CTIF-201ENST00000256413 DACT1Q9NYF0 836 aa18.5■□□□□ 0.55
CTIF-201ENST00000256413 UBE4AQ14139 1066 aa18.5■□□□□ 0.55
CTIF-201ENST00000256413 BMP2KQ9NSY1 1161 aaPredicted RBP18.49■□□□□ 0.55
CTIF-201ENST00000256413 UTP14CQ5TAP6 766 aaKnown RBP18.49■□□□□ 0.55
CTIF-201ENST00000256413 NACAP1Q9BZK3 213 aa18.49■□□□□ 0.55
CTIF-201ENST00000256413 PCDHB15Q9Y5E8 787 aa18.49■□□□□ 0.55
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