RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000233336.6

TTL-201, Transcript of tubulin tyrosine ligase, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene TTL, Length 14,269 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTL-201ENST00000233336 LARP6Q9BRS8 491 aaKnown RBP11.84□□□□□ -0.51
TTL-201ENST00000233336 ZHX3Q9H4I2 956 aa11.84□□□□□ -0.51
TTL-201ENST00000233336 GJB2P29033 226 aa11.84□□□□□ -0.51
TTL-201ENST00000233336 RRS1Q15050 365 aaKnown RBP11.84□□□□□ -0.51
TTL-201ENST00000233336 SPA17Q15506 151 aa11.84□□□□□ -0.51
TTL-201ENST00000233336 ASXL1Q8IXJ9 1541 aa11.84□□□□□ -0.51
TTL-201ENST00000233336 WASF1Q92558 559 aa11.84□□□□□ -0.51
TTL-201ENST00000233336 UNC13AQ9UPW8 1703 aa11.84□□□□□ -0.51
TTL-201ENST00000233336 VGLL3A8MV65 326 aa11.84□□□□□ -0.51
TTL-201ENST00000233336 C8orf76Q96K31 380 aa11.83□□□□□ -0.51
TTL-201ENST00000233336 CEP131Q9UPN4 1083 aa11.83□□□□□ -0.51
TTL-201ENST00000233336 PRIM1P49642 420 aaKnown RBP11.83□□□□□ -0.52
TTL-201ENST00000233336 NF2P35240 595 aa11.83□□□□□ -0.52
TTL-201ENST00000233336 NUCB1Q02818 461 aa11.83□□□□□ -0.52
TTL-201ENST00000233336 MICALCLQ6ZW33 695 aa11.83□□□□□ -0.52
TTL-201ENST00000233336 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa11.83□□□□□ -0.52
TTL-201ENST00000233336 IKQ13123 557 aaPredicted RBP11.83□□□□□ -0.52
TTL-201ENST00000233336 GBP2P32456 591 aaPredicted RBP11.83□□□□□ -0.52
TTL-201ENST00000233336 CCDC150Q8NCX0 1101 aa11.83□□□□□ -0.52
TTL-201ENST00000233336 MYL6BP14649 208 aa11.83□□□□□ -0.52
TTL-201ENST00000233336 MIS18AQ9NYP9 233 aa11.83□□□□□ -0.52
TTL-201ENST00000233336 BIN1O00499 593 aa11.83□□□□□ -0.52
TTL-201ENST00000233336 NUP88Q99567 741 aaPredicted RBP11.83□□□□□ -0.52
TTL-201ENST00000233336 SEPT11Q9NVA2 429 aaKnown RBP11.82□□□□□ -0.52
TTL-201ENST00000233336 TTC12Q9H892 705 aaPredicted RBP11.82□□□□□ -0.52
TTL-201ENST00000233336 TFIP11Q9UBB9 837 aaKnown RBP11.82□□□□□ -0.52
TTL-201ENST00000233336 DNMBPQ6XZF7 1577 aa11.82□□□□□ -0.52
TTL-201ENST00000233336 EIF2AK4Q9P2K8 1649 aaKnown RBP11.82□□□□□ -0.52
TTL-201ENST00000233336 GOLGA6L9A6NEM1 432 aa11.82□□□□□ -0.52
TTL-201ENST00000233336 ARFGAP3Q9NP61 516 aa11.82□□□□□ -0.52
TTL-201ENST00000233336 GUCY1B3Q02153 619 aa11.82□□□□□ -0.52
TTL-201ENST00000233336 ZSCAN25Q6NSZ9 544 aa11.82□□□□□ -0.52
TTL-201ENST00000233336 AFAP1Q8N556 730 aa11.82□□□□□ -0.52
TTL-201ENST00000233336 CNPY2Q9Y2B0 182 aa11.82□□□□□ -0.52
TTL-201ENST00000233336 ATAD2Q6PL18 1390 aa11.82□□□□□ -0.52
TTL-201ENST00000233336 TDO2P48775 406 aa11.82□□□□□ -0.52
TTL-201ENST00000233336 ANO6Q4KMQ2 910 aa11.82□□□□□ -0.52
TTL-201ENST00000233336 TTC22Q5TAA0 569 aa11.82□□□□□ -0.52
TTL-201ENST00000233336 UBAC1Q9BSL1 405 aa11.81□□□□□ -0.52
TTL-201ENST00000233336 MAP2K1Q02750 393 aaPredicted RBP11.81□□□□□ -0.52
TTL-201ENST00000233336 LUZP1Q86V48 1076 aa11.81□□□□□ -0.52
TTL-201ENST00000233336 RRAGDQ9NQL2 400 aaPredicted RBP11.81□□□□□ -0.52
TTL-201ENST00000233336 HDAC1Q13547 482 aaPredicted RBP11.81□□□□□ -0.52
TTL-201ENST00000233336 CCDC57Q2TAC2 916 aa11.81□□□□□ -0.52
TTL-201ENST00000233336 CCDC113Q9H0I3 377 aa11.81□□□□□ -0.52
TTL-201ENST00000233336 ANKRD18AQ8IVF6 992 aa11.81□□□□□ -0.52
TTL-201ENST00000233336 SPG7Q9UQ90 795 aa11.81□□□□□ -0.52
TTL-201ENST00000233336 IFFO1Q0D2I5 559 aa11.8□□□□□ -0.52
TTL-201ENST00000233336 SNX21Q969T3 373 aa11.8□□□□□ -0.52
TTL-201ENST00000233336 TTC31Q49AM3 519 aaPredicted RBP11.8□□□□□ -0.52
TTL-201ENST00000233336 ZNF530Q6P9A1 599 aaPredicted RBP11.8□□□□□ -0.52
TTL-201ENST00000233336 ZSWIM4Q9H7M6 989 aa11.8□□□□□ -0.52
TTL-201ENST00000233336 MCM10Q7L590 875 aa11.8□□□□□ -0.52
TTL-201ENST00000233336 USP48Q86UV5 1035 aa11.8□□□□□ -0.52
TTL-201ENST00000233336 RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 1400 aa11.8□□□□□ -0.52
TTL-201ENST00000233336 RAB3GAP1Q15042 981 aa11.8□□□□□ -0.52
TTL-201ENST00000233336 EZRP15311 586 aaKnown RBP11.8□□□□□ -0.52
TTL-201ENST00000233336 PCDHB15Q9Y5E8 787 aa11.8□□□□□ -0.52
TTL-201ENST00000233336 TMX3Q96JJ7 454 aa11.8□□□□□ -0.52
TTL-201ENST00000233336 GNL3LQ9NVN8 582 aaKnown RBP11.8□□□□□ -0.52
TTL-201ENST00000233336 BCCIPQ9P287 314 aaKnown RBP eCLIP11.8□□□□□ -0.52
TTL-201ENST00000233336 SSBP05455 408 aaKnown RBP eCLIP11.8□□□□□ -0.522e-7■■■□□ 14.7
TTL-201ENST00000233336 ZSCAN22P10073 491 aaPredicted RBP11.8□□□□□ -0.52
TTL-201ENST00000233336 DISP3Q9P2K9 1392 aa11.8□□□□□ -0.52
TTL-201ENST00000233336 BTBD11A6QL63 1104 aa11.79□□□□□ -0.52
TTL-201ENST00000233336 GNG11P61952 73 aa11.79□□□□□ -0.52
TTL-201ENST00000233336 IVLP07476 585 aa11.79□□□□□ -0.52
TTL-201ENST00000233336 SKILP12757 684 aa11.79□□□□□ -0.52
TTL-201ENST00000233336 BOLA2Q9H3K6 86 aa11.79□□□□□ -0.52
TTL-201ENST00000233336 RALGAPBQ86X10 1494 aa11.79□□□□□ -0.52
TTL-201ENST00000233336 TSHZ3Q63HK5 1081 aa11.79□□□□□ -0.52
TTL-201ENST00000233336 CCDC178Q5BJE1 867 aa11.79□□□□□ -0.52
TTL-201ENST00000233336 TOPBP1Q92547 1522 aa11.79□□□□□ -0.52
TTL-201ENST00000233336 CPLX3Q8WVH0 158 aa11.79□□□□□ -0.52
TTL-201ENST00000233336 NOL12Q9UGY1 213 aaKnown RBP eCLIP11.79□□□□□ -0.52
TTL-201ENST00000233336 V9GYY5 206 aaPredicted RBP11.79□□□□□ -0.52
TTL-201ENST00000233336 CNNM3Q8NE01 707 aa11.79□□□□□ -0.52
TTL-201ENST00000233336 CCDC12Q8WUD4 166 aaPredicted RBP11.79□□□□□ -0.52
TTL-201ENST00000233336 DNA2P51530 1060 aa11.79□□□□□ -0.52
TTL-201ENST00000233336 LIG1P18858 919 aa11.79□□□□□ -0.52
TTL-201ENST00000233336 FKBP15Q5T1M5 1219 aa11.79□□□□□ -0.52
TTL-201ENST00000233336 SMAP1Q8IYB5 467 aaPredicted RBP11.79□□□□□ -0.52
TTL-201ENST00000233336 PIBF1Q8WXW3 757 aa11.79□□□□□ -0.52
TTL-201ENST00000233336 CCT2P78371 535 aaKnown RBP11.78□□□□□ -0.52
TTL-201ENST00000233336 ARHGEF11O15085 1522 aa11.78□□□□□ -0.52
TTL-201ENST00000233336 FAM177BA6PVY3 158 aa11.78□□□□□ -0.52
TTL-201ENST00000233336 GOPCQ9HD26 462 aa11.78□□□□□ -0.52
TTL-201ENST00000233336 MCM6Q14566 821 aa11.78□□□□□ -0.52
TTL-201ENST00000233336 IGF2BP2Q9Y6M1 599 aaKnown RBP eCLIP11.78□□□□□ -0.52
TTL-201ENST00000233336 SPINK5Q9NQ38 1064 aaPredicted RBP11.78□□□□□ -0.52
TTL-201ENST00000233336 FAM200AQ8TCP9 573 aa11.78□□□□□ -0.52
TTL-201ENST00000233336 HMGB1P09429 215 aaKnown RBP11.78□□□□□ -0.52
TTL-201ENST00000233336 PAFAH1B1P43034 410 aa11.78□□□□□ -0.52
TTL-201ENST00000233336 GOLGA8BA8MQT2 603 aa11.78□□□□□ -0.52
TTL-201ENST00000233336 F6X3S4 739 aa11.77□□□□□ -0.52
TTL-201ENST00000233336 SRRTQ9BXP5 876 aaKnown RBP11.77□□□□□ -0.52
TTL-201ENST00000233336 IGSF3O75054 1194 aa11.77□□□□□ -0.52
TTL-201ENST00000233336 ISM2Q6H9L7 571 aa11.77□□□□□ -0.52
TTL-201ENST00000233336 ATP2B2Q01814 1243 aa11.77□□□□□ -0.52
TTL-201ENST00000233336 PTPRCP08575 1304 aa11.77□□□□□ -0.53
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 42.5 ms