RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000620099.1

SNORD39.4-201, humanhuman

BASIC

Gene SNORD39, Length 78 nt, Biotype snoRNA.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNORD39.4-201ENST00000620099 PRR11Q96HE9 360 aaPredicted RBP3.35□□□□□ -1.87
SNORD39.4-201ENST00000620099 PPP1R16AQ96I34 528 aa3.35□□□□□ -1.87
SNORD39.4-201ENST00000620099 VPS39Q96JC1 886 aa3.35□□□□□ -1.87
SNORD39.4-201ENST00000620099 PPM1MQ96MI6 270 aa3.35□□□□□ -1.87
SNORD39.4-201ENST00000620099 TRIB3Q96RU7 358 aa3.35□□□□□ -1.87
SNORD39.4-201ENST00000620099 SLC22A12Q96S37 553 aa3.35□□□□□ -1.87
SNORD39.4-201ENST00000620099 LYSMD1Q96S90 227 aa3.35□□□□□ -1.87
SNORD39.4-201ENST00000620099 GPR22Q99680 433 aa3.35□□□□□ -1.87
SNORD39.4-201ENST00000620099 SIKE1Q9BRV8 207 aa3.35□□□□□ -1.87
SNORD39.4-201ENST00000620099 FICDQ9BVA6 458 aa3.35□□□□□ -1.87
SNORD39.4-201ENST00000620099 CIPCQ9C0C6 399 aa3.35□□□□□ -1.87
SNORD39.4-201ENST00000620099 CCDC68Q9H2F9 335 aa3.35□□□□□ -1.87
SNORD39.4-201ENST00000620099 KLK15Q9H2R5 256 aa3.35□□□□□ -1.87
SNORD39.4-201ENST00000620099 PRO3102Q9H379 93 aa3.35□□□□□ -1.87
SNORD39.4-201ENST00000620099 MFSD1Q9H3U5 465 aa3.35□□□□□ -1.87
SNORD39.4-201ENST00000620099 CDCP1Q9H5V8 836 aa3.35□□□□□ -1.87
SNORD39.4-201ENST00000620099 PPANQ9NQ55 473 aaKnown RBP3.35□□□□□ -1.87
SNORD39.4-201ENST00000620099 WASH6PQ9NQA3 447 aa3.35□□□□□ -1.87
SNORD39.4-201ENST00000620099 TRPV5Q9NQA5 729 aa3.35□□□□□ -1.87
SNORD39.4-201ENST00000620099 GKN1Q9NS71 199 aa3.35□□□□□ -1.87
SNORD39.4-201ENST00000620099 TREX1Q9NSU2 369 aa3.35□□□□□ -1.87
SNORD39.4-201ENST00000620099 HCFC1R1Q9NWW0 138 aa3.35□□□□□ -1.87
SNORD39.4-201ENST00000620099 DUS2Q9NX74 493 aaKnown RBP3.35□□□□□ -1.87
SNORD39.4-201ENST00000620099 EPS15L1Q9UBC2 864 aa3.35□□□□□ -1.87
SNORD39.4-201ENST00000620099 LHX3Q9UBR4 397 aa3.35□□□□□ -1.87
SNORD39.4-201ENST00000620099 DCDC2Q9UHG0 476 aa3.35□□□□□ -1.87
SNORD39.4-201ENST00000620099 GGA2Q9UJY4 613 aa3.35□□□□□ -1.87
SNORD39.4-201ENST00000620099 KCND3Q9UK17 655 aa3.35□□□□□ -1.87
SNORD39.4-201ENST00000620099 APPL1Q9UKG1 709 aa3.35□□□□□ -1.87
SNORD39.4-201ENST00000620099 GRID1Q9ULK0 1009 aa3.35□□□□□ -1.87
SNORD39.4-201ENST00000620099 TMCO1Q9UM00 188 aa3.35□□□□□ -1.87
SNORD39.4-201ENST00000620099 VPS4AQ9UN37 437 aa3.35□□□□□ -1.87
SNORD39.4-201ENST00000620099 PPIL1Q9Y3C6 166 aa3.35□□□□□ -1.87
SNORD39.4-201ENST00000620099 PKP3Q9Y446 797 aa3.35□□□□□ -1.87
SNORD39.4-201ENST00000620099 OR51B4Q9Y5P0 310 aa3.35□□□□□ -1.87
SNORD39.4-201ENST00000620099 SNX10Q9Y5X0 201 aa3.35□□□□□ -1.87
SNORD39.4-201ENST00000620099 WNT6Q9Y6F9 365 aa3.35□□□□□ -1.87
SNORD39.4-201ENST00000620099 ATXN2Q99700 1313 aaKnown RBP3.35□□□□□ -1.87
SNORD39.4-201ENST00000620099 BPTFQ12830 3046 aa3.35□□□□□ -1.87
SNORD39.4-201ENST00000620099 LAMA2P24043 3122 aaKnown RBP3.35□□□□□ -1.87
SNORD39.4-201ENST00000620099 KMT2EQ8IZD2 1858 aa3.35□□□□□ -1.87
SNORD39.4-201ENST00000620099 SCN2AQ99250 2005 aa3.34□□□□□ -1.87
SNORD39.4-201ENST00000620099 CACNA1IQ9P0X4 2223 aa3.34□□□□□ -1.87
SNORD39.4-201ENST00000620099 A0A0D9SEW6 157 aa3.34□□□□□ -1.87
SNORD39.4-201ENST00000620099 A0A0J9YYE9 177 aa3.34□□□□□ -1.87
SNORD39.4-201ENST00000620099 EDDM13A0A1B0GTR0 161 aa3.34□□□□□ -1.87
SNORD39.4-201ENST00000620099 ZCWPW2A0A1B0GU75 182 aa3.34□□□□□ -1.87
SNORD39.4-201ENST00000620099 GOLGA6L7A0A1B0GV03 622 aa3.34□□□□□ -1.87
SNORD39.4-201ENST00000620099 TMEM120BA0PK00 339 aa3.34□□□□□ -1.87
SNORD39.4-201ENST00000620099 SMIM23A6NLE4 172 aa3.34□□□□□ -1.87
SNORD39.4-201ENST00000620099 TRIM49D1C9J1S8 452 aa3.34□□□□□ -1.87
SNORD39.4-201ENST00000620099 H3BMM5 538 aa3.34□□□□□ -1.87
SNORD39.4-201ENST00000620099 COPEO14579 308 aa3.34□□□□□ -1.87
SNORD39.4-201ENST00000620099 KLF11O14901 512 aa3.34□□□□□ -1.87
SNORD39.4-201ENST00000620099 BIRC5O15392 142 aa3.34□□□□□ -1.87
SNORD39.4-201ENST00000620099 PRAMEF2O60811 474 aa3.34□□□□□ -1.87
SNORD39.4-201ENST00000620099 PGLSO95336 258 aa3.34□□□□□ -1.87
SNORD39.4-201ENST00000620099 PRAMEF12O95522 483 aa3.34□□□□□ -1.87
SNORD39.4-201ENST00000620099 FAM107AO95990 144 aa3.34□□□□□ -1.87
SNORD39.4-201ENST00000620099 MT-CYBP00156 380 aaPredicted RBP3.34□□□□□ -1.87
SNORD39.4-201ENST00000620099 TRBC1P01850 177 aa3.34□□□□□ -1.87
SNORD39.4-201ENST00000620099 MBPP02686 304 aaPredicted RBP3.34□□□□□ -1.87
SNORD39.4-201ENST00000620099 C1QAP02745 245 aa3.34□□□□□ -1.87
SNORD39.4-201ENST00000620099 ALDOAP04075 364 aaKnown RBP3.34□□□□□ -1.87
SNORD39.4-201ENST00000620099 APODP05090 189 aa3.34□□□□□ -1.87
SNORD39.4-201ENST00000620099 HNRNPCP07910 306 aaKnown RBP eCLIP3.34□□□□□ -1.87
SNORD39.4-201ENST00000620099 SRCP12931 536 aa3.34□□□□□ -1.87
SNORD39.4-201ENST00000620099 MYOGP15173 224 aa3.34□□□□□ -1.87
SNORD39.4-201ENST00000620099 STMN1P16949 149 aa3.34□□□□□ -1.87
SNORD39.4-201ENST00000620099 FBLP22087 321 aaKnown RBP3.34□□□□□ -1.87
SNORD39.4-201ENST00000620099 GCAP28676 217 aa3.34□□□□□ -1.87
SNORD39.4-201ENST00000620099 CRABP2P29373 138 aa3.34□□□□□ -1.87
SNORD39.4-201ENST00000620099 HLA-FP30511 346 aa3.34□□□□□ -1.87
SNORD39.4-201ENST00000620099 HPDP32754 393 aaPredicted RBP3.34□□□□□ -1.87
SNORD39.4-201ENST00000620099 SERPINB5P36952 375 aa3.34□□□□□ -1.87
SNORD39.4-201ENST00000620099 MAGEA12P43365 314 aa3.34□□□□□ -1.87
SNORD39.4-201ENST00000620099 SLCO1A2P46721 670 aa3.34□□□□□ -1.87
SNORD39.4-201ENST00000620099 LEPRP48357 1165 aaKnown RBP3.34□□□□□ -1.87
SNORD39.4-201ENST00000620099 CD151P48509 253 aa3.34□□□□□ -1.87
SNORD39.4-201ENST00000620099 CCR3P51677 355 aa3.34□□□□□ -1.87
SNORD39.4-201ENST00000620099 ZNF140P52738 457 aaPredicted RBP3.34□□□□□ -1.87
SNORD39.4-201ENST00000620099 STC1P52823 247 aa3.34□□□□□ -1.87
SNORD39.4-201ENST00000620099 SLC12A2P55011 1212 aa3.34□□□□□ -1.87
SNORD39.4-201ENST00000620099 SLC18A2Q05940 514 aa3.34□□□□□ -1.87
SNORD39.4-201ENST00000620099 KHDRBS1Q07666 443 aaKnown RBP eCLIP3.34□□□□□ -1.87
SNORD39.4-201ENST00000620099 ELP6Q0PNE2 266 aa3.34□□□□□ -1.87
SNORD39.4-201ENST00000620099 HYAL1Q12794 435 aa3.34□□□□□ -1.87
SNORD39.4-201ENST00000620099 ELAVL3Q14576 367 aaKnown RBP3.34□□□□□ -1.87
SNORD39.4-201ENST00000620099 ITIH4Q14624 930 aa3.34□□□□□ -1.87
SNORD39.4-201ENST00000620099 POU6F1Q14863 301 aa3.34□□□□□ -1.87
SNORD39.4-201ENST00000620099 MFSD13AQ14CX5 517 aa3.34□□□□□ -1.87
SNORD39.4-201ENST00000620099 PDK4Q16654 411 aa3.34□□□□□ -1.87
SNORD39.4-201ENST00000620099 TYSND1Q2T9J0 566 aa3.34□□□□□ -1.87
SNORD39.4-201ENST00000620099 ITPRIPL2Q3MIP1 535 aa3.34□□□□□ -1.87
SNORD39.4-201ENST00000620099 GPR33Q49SQ1 333 aa3.34□□□□□ -1.87
SNORD39.4-201ENST00000620099 CARD16Q5EG05 197 aa3.34□□□□□ -1.87
SNORD39.4-201ENST00000620099 SIRPB2Q5JXA9 342 aa3.34□□□□□ -1.87
SNORD39.4-201ENST00000620099 RARS2Q5T160 578 aaKnown RBP3.34□□□□□ -1.87
SNORD39.4-201ENST00000620099 FAM46CQ5VWP2 391 aa3.34□□□□□ -1.87
SNORD39.4-201ENST00000620099 ATG16L1Q676U5 607 aa3.34□□□□□ -1.87
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 24.6 ms