RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000589318.5

DDX39A-209, Transcript of DExD-box helicase 39A, human

TSL 1 (best)

Gene DDX39A, Length 1,903 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
DDX39A-209	ENST00000589318	HMG20A	Q9NP66	347 aa		14.81	□□□□□ -0.04
DDX39A-209	ENST00000589318	ARMC1	Q9NVT9	282 aa		14.81	□□□□□ -0.04
DDX39A-209	ENST00000589318	PACSIN3	Q9UKS6	424 aa		14.81	□□□□□ -0.04
DDX39A-209	ENST00000589318	DNAH14	Q0VDD8	3507 aa		14.81	□□□□□ -0.04
DDX39A-209	ENST00000589318	FANCM	Q8IYD8	2048 aa		14.8	□□□□□ -0.04
DDX39A-209	ENST00000589318	SEC22B	O75396	215 aa		14.8	□□□□□ -0.04
DDX39A-209	ENST00000589318	APBB3	O95704	486 aa		14.8	□□□□□ -0.04
DDX39A-209	ENST00000589318	AKT2	P31751	481 aa		14.8	□□□□□ -0.04
DDX39A-209	ENST00000589318	CCR5	P51681	352 aa		14.8	□□□□□ -0.04
DDX39A-209	ENST00000589318	CTBS	Q01459	385 aa		14.8	□□□□□ -0.04
DDX39A-209	ENST00000589318	ITGAD	Q13349	1161 aa		14.8	□□□□□ -0.04
DDX39A-209	ENST00000589318	CYP2A13	Q16696	494 aa		14.8	□□□□□ -0.04
DDX39A-209	ENST00000589318	GPR107	Q5VW38	600 aa		14.8	□□□□□ -0.04
DDX39A-209	ENST00000589318	KIAA0895L	Q68EN5	471 aa		14.8	□□□□□ -0.04
DDX39A-209	ENST00000589318	ABRAXAS1	Q6UWZ7	409 aa		14.8	□□□□□ -0.04
DDX39A-209	ENST00000589318	ZNF786	Q8N393	782 aa		14.8	□□□□□ -0.04
DDX39A-209	ENST00000589318	SLC15A4	Q8N697	577 aa		14.8	□□□□□ -0.04
DDX39A-209	ENST00000589318	NUDT8	Q8WV74	236 aa		14.8	□□□□□ -0.04
DDX39A-209	ENST00000589318	SPATA6	Q9NWH7	488 aa	Predicted RBP	14.8	□□□□□ -0.04
DDX39A-209	ENST00000589318	DAPK2	Q9UIK4	370 aa		14.8	□□□□□ -0.04
DDX39A-209	ENST00000589318	MRPS17	Q9Y2R5	130 aa	Known RBP	14.8	□□□□□ -0.04
DDX39A-209	ENST00000589318	PLXND1	Q9Y4D7	1925 aa		14.8	□□□□□ -0.04
DDX39A-209	ENST00000589318	FAM170B	A6NMN3	283 aa		14.8	□□□□□ -0.04
DDX39A-209	ENST00000589318	FXYD1	O00168	92 aa		14.8	□□□□□ -0.04
DDX39A-209	ENST00000589318	PI15	O43692	258 aa		14.8	□□□□□ -0.04
DDX39A-209	ENST00000589318	CPNE6	O95741	557 aa		14.8	□□□□□ -0.04
DDX39A-209	ENST00000589318	IDS	P22304	550 aa		14.8	□□□□□ -0.04
DDX39A-209	ENST00000589318	POLR2J	P52435	117 aa	Known RBP	14.8	□□□□□ -0.04
DDX39A-209	ENST00000589318	CDH15	P55291	814 aa		14.8	□□□□□ -0.04
DDX39A-209	ENST00000589318	OCA2	Q04671	838 aa		14.8	□□□□□ -0.04
DDX39A-209	ENST00000589318	MAD2L1	Q13257	205 aa	Predicted RBP	14.8	□□□□□ -0.04
DDX39A-209	ENST00000589318	TSTA3	Q13630	321 aa	Predicted RBP	14.8	□□□□□ -0.04
DDX39A-209	ENST00000589318	PTGR1	Q14914	329 aa		14.8	□□□□□ -0.04
DDX39A-209	ENST00000589318	KCNJ8	Q15842	424 aa		14.8	□□□□□ -0.04
DDX39A-209	ENST00000589318	USP39	Q53GS9	565 aa	Known RBP	14.8	□□□□□ -0.04
DDX39A-209	ENST00000589318	COQ5	Q5HYK3	327 aa		14.8	□□□□□ -0.04
DDX39A-209	ENST00000589318	FGD3	Q5JSP0	725 aa		14.8	□□□□□ -0.04
DDX39A-209	ENST00000589318	PRAMEF14	Q5SWL7	426 aa		14.8	□□□□□ -0.04
DDX39A-209	ENST00000589318	PRAMEF13	Q5VWM6	474 aa		14.8	□□□□□ -0.04
DDX39A-209	ENST00000589318	ATG9B	Q674R7	924 aa		14.8	□□□□□ -0.04
DDX39A-209	ENST00000589318	LCTL	Q6UWM7	567 aa		14.8	□□□□□ -0.04
DDX39A-209	ENST00000589318	ABI3BP	Q7Z7G0	1075 aa		14.8	□□□□□ -0.04
DDX39A-209	ENST00000589318	C2orf73	Q8N5S3	287 aa	Predicted RBP	14.8	□□□□□ -0.04
DDX39A-209	ENST00000589318	TSTD1	Q8NFU3	115 aa		14.8	□□□□□ -0.04
DDX39A-209	ENST00000589318	OR7G3	Q8NG95	312 aa		14.8	□□□□□ -0.04
DDX39A-209	ENST00000589318	SETD7	Q8WTS6	366 aa	Known RBP	14.8	□□□□□ -0.04
DDX39A-209	ENST00000589318	TSACC	Q96A04	125 aa	Predicted RBP	14.8	□□□□□ -0.04
DDX39A-209	ENST00000589318	VPS33A	Q96AX1	596 aa		14.8	□□□□□ -0.04
DDX39A-209	ENST00000589318	BIRC7	Q96CA5	298 aa		14.8	□□□□□ -0.04
DDX39A-209	ENST00000589318	CMTM7	Q96FZ5	175 aa		14.8	□□□□□ -0.04
DDX39A-209	ENST00000589318	APIP	Q96GX9	242 aa		14.8	□□□□□ -0.04
DDX39A-209	ENST00000589318	MAGED4	Q96JG8	741 aa		14.8	□□□□□ -0.04
DDX39A-209	ENST00000589318	EHD1	Q9H4M9	534 aa		14.8	□□□□□ -0.04
DDX39A-209	ENST00000589318	PRDM8	Q9NQV8	689 aa		14.8	□□□□□ -0.04
DDX39A-209	ENST00000589318	ANKMY1	Q9P2S6	941 aa		14.8	□□□□□ -0.04
DDX39A-209	ENST00000589318	DLGAP4	Q9Y2H0	992 aa		14.8	□□□□□ -0.04
DDX39A-209	ENST00000589318	NDUFAF1	Q9Y375	327 aa		14.8	□□□□□ -0.04
DDX39A-209	ENST00000589318	HS3ST3A1	Q9Y663	406 aa		14.8	□□□□□ -0.04
DDX39A-209	ENST00000589318		A0A1W2PP18	115 aa		14.79	□□□□□ -0.04
DDX39A-209	ENST00000589318		A0A1W2PPV9	198 aa		14.79	□□□□□ -0.04
DDX39A-209	ENST00000589318	FAM234B	A2RU67	622 aa		14.79	□□□□□ -0.04
DDX39A-209	ENST00000589318	OR52A4P	A6NMU1	304 aa		14.79	□□□□□ -0.04
DDX39A-209	ENST00000589318	CLDN25	C9JDP6	229 aa		14.79	□□□□□ -0.04
DDX39A-209	ENST00000589318	TNFRSF10C	O14798	259 aa		14.79	□□□□□ -0.04
DDX39A-209	ENST00000589318	SLC22A1	O15245	554 aa		14.79	□□□□□ -0.04
DDX39A-209	ENST00000589318	CFLAR	O15519	480 aa		14.79	□□□□□ -0.04
DDX39A-209	ENST00000589318	NTRK1	P04629	796 aa		14.79	□□□□□ -0.04
DDX39A-209	ENST00000589318	C1GALT1C1L	P0DN25	315 aa		14.79	□□□□□ -0.04
DDX39A-209	ENST00000589318	PSME3	P61289	254 aa		14.79	□□□□□ -0.04
DDX39A-209	ENST00000589318	YPEL5	P62699	121 aa		14.79	□□□□□ -0.04
DDX39A-209	ENST00000589318	YBX1	P67809	324 aa	Known RBP	14.79	□□□□□ -0.04
DDX39A-209	ENST00000589318	BNIP3	Q12983	259 aa		14.79	□□□□□ -0.04
DDX39A-209	ENST00000589318	CSTF3	Q12996	717 aa	Known RBP	14.79	□□□□□ -0.04
DDX39A-209	ENST00000589318	UAP1L1	Q3KQV9	507 aa		14.79	□□□□□ -0.04
DDX39A-209	ENST00000589318	PRPF38B	Q5VTL8	546 aa	Known RBP	14.79	□□□□□ -0.04
DDX39A-209	ENST00000589318	SLC22A18AS	Q8N1D0	253 aa		14.79	□□□□□ -0.04
DDX39A-209	ENST00000589318	LIX1	Q8N485	282 aa		14.79	□□□□□ -0.04
DDX39A-209	ENST00000589318	LINC01555	Q8NAE3	123 aa		14.79	□□□□□ -0.04
DDX39A-209	ENST00000589318	OR13H1	Q8NG92	308 aa		14.79	□□□□□ -0.04
DDX39A-209	ENST00000589318	SLC5A11	Q8WWX8	675 aa		14.79	□□□□□ -0.04
DDX39A-209	ENST00000589318	LRTOMT	Q8WZ04	291 aa		14.79	□□□□□ -0.04
DDX39A-209	ENST00000589318	FCRL1	Q96LA6	429 aa		14.79	□□□□□ -0.04
DDX39A-209	ENST00000589318	ALPK1	Q96QP1	1244 aa		14.79	□□□□□ -0.04
DDX39A-209	ENST00000589318	MTERF1	Q99551	399 aa	Known RBP	14.79	□□□□□ -0.04
DDX39A-209	ENST00000589318	ORAI3	Q9BRQ5	295 aa		14.79	□□□□□ -0.04
DDX39A-209	ENST00000589318	GPR174	Q9BXC1	333 aa		14.79	□□□□□ -0.04
DDX39A-209	ENST00000589318	SPNS1	Q9H2V7	528 aa		14.79	□□□□□ -0.04
DDX39A-209	ENST00000589318	RMND5A	Q9H871	391 aa		14.79	□□□□□ -0.04
DDX39A-209	ENST00000589318	IMP3	Q9NV31	184 aa	Known RBP	14.79	□□□□□ -0.04
DDX39A-209	ENST00000589318	PSME2	Q9UL46	239 aa		14.79	□□□□□ -0.04
DDX39A-209	ENST00000589318	EIF3L	Q9Y262	564 aa	Known RBP	14.79	□□□□□ -0.04
DDX39A-209	ENST00000589318	DYRK1B	Q9Y463	629 aa		14.79	□□□□□ -0.04
DDX39A-209	ENST00000589318	HEATR5B	Q9P2D3	2071 aa		14.79	□□□□□ -0.04
DDX39A-209	ENST00000589318	ETHE1	O95571	254 aa		14.78	□□□□□ -0.04
DDX39A-209	ENST00000589318	EML2	O95834	649 aa		14.78	□□□□□ -0.04
DDX39A-209	ENST00000589318	BCKDHA	P12694	445 aa		14.78	□□□□□ -0.04
DDX39A-209	ENST00000589318	AMD1	P17707	334 aa		14.78	□□□□□ -0.04
DDX39A-209	ENST00000589318	KCNK10	P57789	538 aa		14.78	□□□□□ -0.04
DDX39A-209	ENST00000589318	PMS2P3	Q13401	168 aa		14.78	□□□□□ -0.04
DDX39A-209	ENST00000589318	ALG11	Q2TAA5	492 aa		14.78	□□□□□ -0.04

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