RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000587718.5

CAPNS1-204, Transcript of calpain small subunit 1, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC

Gene CAPNS1, Length 1,558 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPNS1-204ENST00000587718 CKMT2P17540 419 aa24.49■■□□□ 1.51
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CAPNS1-204ENST00000587718 C21orf59P57076 290 aa24.49■■□□□ 1.51
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CAPNS1-204ENST00000587718 DLGAP4Q9Y2H0 992 aa24.46■■□□□ 1.51
CAPNS1-204ENST00000587718 TRIM64CA6NLI5 447 aa24.45■■□□□ 1.5
CAPNS1-204ENST00000587718 TLR4O00206 839 aa24.45■■□□□ 1.5
CAPNS1-204ENST00000587718 TNFSF14O43557 240 aa24.45■■□□□ 1.5
CAPNS1-204ENST00000587718 MTX2O75431 263 aa24.45■■□□□ 1.5
CAPNS1-204ENST00000587718 MYO1DO94832 1006 aa24.45■■□□□ 1.5
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