RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000546621.5

CS-204, Transcript of citrate synthase, humanhuman

TSL 2

Gene CS, Length 1,513 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CS-204ENST00000546621 SYNCRIPO60506 623 aaKnown RBP7.51□□□□□ -1.21
CS-204ENST00000546621 PSIP1O75475 530 aaKnown RBP7.51□□□□□ -1.21
CS-204ENST00000546621 TRAPPC2P0DI81 140 aa7.51□□□□□ -1.21
CS-204ENST00000546621 TRAPPC2BP0DI82 140 aa7.51□□□□□ -1.21
CS-204ENST00000546621 MAP4P27816 1152 aaKnown RBP7.51□□□□□ -1.21
CS-204ENST00000546621 TSPAN7P41732 249 aa7.51□□□□□ -1.21
CS-204ENST00000546621 DPP6P42658 865 aa7.51□□□□□ -1.21
CS-204ENST00000546621 TNFRSF4P43489 277 aa7.51□□□□□ -1.21
CS-204ENST00000546621 MAPK9P45984 424 aa7.51□□□□□ -1.21
CS-204ENST00000546621 SLC6A12P48065 614 aa7.51□□□□□ -1.21
CS-204ENST00000546621 DIO3P55073 304 aa7.51□□□□□ -1.21
CS-204ENST00000546621 PSME3P61289 254 aa7.51□□□□□ -1.21
CS-204ENST00000546621 ABRAXAS2Q15018 415 aa7.51□□□□□ -1.21
CS-204ENST00000546621 NR6A1Q15406 480 aa7.51□□□□□ -1.21
CS-204ENST00000546621 TBRG1Q3YBR2 411 aa7.51□□□□□ -1.21
CS-204ENST00000546621 C6orf136Q5SQH8 315 aa7.51□□□□□ -1.21
CS-204ENST00000546621 IRAK1BP1Q5VVH5 260 aa7.51□□□□□ -1.21
CS-204ENST00000546621 C8orf82Q6P1X6 216 aaPredicted RBP7.51□□□□□ -1.21
CS-204ENST00000546621 HACD2Q6Y1H2 254 aa7.51□□□□□ -1.21
CS-204ENST00000546621 Q6ZSR9 355 aa7.51□□□□□ -1.21
CS-204ENST00000546621 CHPFQ8IZ52 775 aa7.51□□□□□ -1.21
CS-204ENST00000546621 PARP8Q8N3A8 854 aa7.51□□□□□ -1.21
CS-204ENST00000546621 Q8N9G6 341 aaPredicted RBP7.51□□□□□ -1.21
CS-204ENST00000546621 FNDC5Q8NAU1 212 aa7.51□□□□□ -1.21
CS-204ENST00000546621 KCT2Q8NC54 265 aa7.51□□□□□ -1.21
CS-204ENST00000546621 ERLEC1Q96DZ1 483 aa7.51□□□□□ -1.21
CS-204ENST00000546621 P2RY13Q9BPV8 354 aa7.51□□□□□ -1.21
CS-204ENST00000546621 YTHDF1Q9BYJ9 559 aaKnown RBP7.51□□□□□ -1.21
CS-204ENST00000546621 SLC29A3Q9BZD2 475 aa7.51□□□□□ -1.21
CS-204ENST00000546621 BRINP2Q9C0B6 783 aa7.51□□□□□ -1.21
CS-204ENST00000546621 C8orf33Q9H7E9 229 aaPredicted RBP7.51□□□□□ -1.21
CS-204ENST00000546621 NANOGQ9H9S0 305 aa7.51□□□□□ -1.21
CS-204ENST00000546621 FANCFQ9NPI8 374 aa7.51□□□□□ -1.21
CS-204ENST00000546621 NPDC1Q9NQX5 325 aaPredicted RBP7.51□□□□□ -1.21
CS-204ENST00000546621 HEBP1Q9NRV9 189 aa7.51□□□□□ -1.21
CS-204ENST00000546621 OLAHQ9NV23 265 aa7.51□□□□□ -1.21
CS-204ENST00000546621 PAQR5Q9NXK6 330 aaPredicted RBP7.51□□□□□ -1.21
CS-204ENST00000546621 FAM8A1Q9UBU6 413 aa7.51□□□□□ -1.21
CS-204ENST00000546621 PACSIN3Q9UKS6 424 aa7.51□□□□□ -1.21
CS-204ENST00000546621 NDUFAF1Q9Y375 327 aa7.51□□□□□ -1.21
CS-204ENST00000546621 UGT2A1Q9Y4X1 527 aa7.51□□□□□ -1.21
CS-204ENST00000546621 PCDHGA7Q9Y5G6 932 aa7.51□□□□□ -1.21
CS-204ENST00000546621 COL6A3P12111 3177 aa7.51□□□□□ -1.21
CS-204ENST00000546621 A0A1W2PQ72 361 aa7.5□□□□□ -1.21
CS-204ENST00000546621 A8MU76 341 aa7.5□□□□□ -1.21
CS-204ENST00000546621 ARHGEF33A8MVX0 844 aa7.5□□□□□ -1.21
CS-204ENST00000546621 LOC730098B7Z3J9 87 aa7.5□□□□□ -1.21
CS-204ENST00000546621 C3orf80F5H4A9 247 aa7.5□□□□□ -1.21
CS-204ENST00000546621 SLC28A1O00337 649 aa7.5□□□□□ -1.21
CS-204ENST00000546621 FFAR3O14843 346 aa7.5□□□□□ -1.21
CS-204ENST00000546621 ANGPT2O15123 496 aa7.5□□□□□ -1.21
CS-204ENST00000546621 MID1O15344 667 aa7.5□□□□□ -1.21
CS-204ENST00000546621 GPR42O15529 346 aa7.5□□□□□ -1.21
CS-204ENST00000546621 RGS14O43566 566 aa7.5□□□□□ -1.21
CS-204ENST00000546621 VEGFDO43915 354 aa7.5□□□□□ -1.21
CS-204ENST00000546621 LILRB5O75023 590 aa7.5□□□□□ -1.21
CS-204ENST00000546621 SLC22A3O75751 556 aa7.5□□□□□ -1.21
CS-204ENST00000546621 SERPINI2O75830 405 aa7.5□□□□□ -1.21
CS-204ENST00000546621 OR7A10O76100 309 aa7.5□□□□□ -1.21
CS-204ENST00000546621 CLDN9O95484 217 aa7.5□□□□□ -1.21
CS-204ENST00000546621 NADKO95544 446 aaPredicted RBP7.5□□□□□ -1.21
CS-204ENST00000546621 CPNE6O95741 557 aa7.5□□□□□ -1.21
CS-204ENST00000546621 PTTG1O95997 202 aa7.5□□□□□ -1.21
CS-204ENST00000546621 ADH1BP00325 375 aa7.5□□□□□ -1.21
CS-204ENST00000546621 CATP04040 527 aaKnown RBP7.5□□□□□ -1.21
CS-204ENST00000546621 SFTPCP11686 197 aa7.5□□□□□ -1.21
CS-204ENST00000546621 ZNF3P17036 446 aa7.5□□□□□ -1.21
CS-204ENST00000546621 JUNBP17275 347 aaPredicted RBP7.5□□□□□ -1.21
CS-204ENST00000546621 XRCC1P18887 633 aaPredicted RBP7.5□□□□□ -1.21
CS-204ENST00000546621 EPORP19235 508 aa7.5□□□□□ -1.21
CS-204ENST00000546621 CAPN3P20807 821 aa7.5□□□□□ -1.21
CS-204ENST00000546621 ME2P23368 584 aa7.5□□□□□ -1.21
CS-204ENST00000546621 PBLDP30039 288 aaPredicted RBP7.5□□□□□ -1.21
CS-204ENST00000546621 DRD3P35462 400 aa7.5□□□□□ -1.21
CS-204ENST00000546621 WASP42768 502 aa7.5□□□□□ -1.21
CS-204ENST00000546621 PREPP48147 710 aa7.5□□□□□ -1.21
CS-204ENST00000546621 SOX9P48436 509 aa7.5□□□□□ -1.21
CS-204ENST00000546621 ST13P50502 369 aaKnown RBP7.5□□□□□ -1.21
CS-204ENST00000546621 EMX2Q04743 252 aa7.5□□□□□ -1.21
CS-204ENST00000546621 ABRQ12979 859 aa7.5□□□□□ -1.21
CS-204ENST00000546621 IKZF1Q13422 519 aa7.5□□□□□ -1.21
CS-204ENST00000546621 CAMK2GQ13555 558 aaPredicted RBP7.5□□□□□ -1.21
CS-204ENST00000546621 GTF2H3Q13889 308 aa7.5□□□□□ -1.21
CS-204ENST00000546621 CEACAM7Q14002 265 aa7.5□□□□□ -1.21
CS-204ENST00000546621 RCAN2Q14206 197 aa7.5□□□□□ -1.21
CS-204ENST00000546621 LAPTM4AQ15012 233 aa7.5□□□□□ -1.21
CS-204ENST00000546621 CST6Q15828 149 aa7.5□□□□□ -1.21
CS-204ENST00000546621 ZXDCQ2QGD7 858 aaPredicted RBP7.5□□□□□ -1.21
CS-204ENST00000546621 PTCHD3Q3KNS1 767 aa7.5□□□□□ -1.21
CS-204ENST00000546621 Q3ZCU0 254 aa7.5□□□□□ -1.21
CS-204ENST00000546621 GGTA1PQ4G0N0 100 aa7.5□□□□□ -1.21
CS-204ENST00000546621 ZNF658BQ4V348 819 aaPredicted RBP7.5□□□□□ -1.21
CS-204ENST00000546621 YIF1BQ5BJH7 314 aa7.5□□□□□ -1.21
CS-204ENST00000546621 COQ5Q5HYK3 327 aa7.5□□□□□ -1.21
CS-204ENST00000546621 FGD3Q5JSP0 725 aa7.5□□□□□ -1.21
CS-204ENST00000546621 DDX59Q5T1V6 619 aaKnown RBP eCLIP7.5□□□□□ -1.21
CS-204ENST00000546621 PXDC1Q5TGL8 231 aa7.5□□□□□ -1.21
CS-204ENST00000546621 AGBL4Q5VU57 503 aa7.5□□□□□ -1.21
CS-204ENST00000546621 BLOC1S3Q6QNY0 202 aa7.5□□□□□ -1.21
CS-204ENST00000546621 ZNF767PQ75MW2 155 aa7.5□□□□□ -1.21
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