RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000546248.5

TRDN-205, Transcript of triadin, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene TRDN, Length 1,179 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRDN-205ENST00000546248 PRMT5O14744 637 aaPredicted RBP5.29□□□□□ -1.56
TRDN-205ENST00000546248 MGST3O14880 152 aa5.29□□□□□ -1.56
TRDN-205ENST00000546248 CHUKO15111 745 aa5.29□□□□□ -1.56
TRDN-205ENST00000546248 DCXO43602 365 aa5.29□□□□□ -1.56
TRDN-205ENST00000546248 KERAO60938 352 aa5.29□□□□□ -1.56
TRDN-205ENST00000546248 SMIM24O75264 130 aa5.29□□□□□ -1.56
TRDN-205ENST00000546248 VPS26AO75436 327 aa5.29□□□□□ -1.56
TRDN-205ENST00000546248 KRT34O76011 436 aa5.29□□□□□ -1.56
TRDN-205ENST00000546248 TM7SF2O76062 418 aa5.29□□□□□ -1.56
TRDN-205ENST00000546248 SUPT7LO94864 414 aa5.29□□□□□ -1.56
TRDN-205ENST00000546248 CDK14O94921 469 aa5.29□□□□□ -1.56
TRDN-205ENST00000546248 SIX3O95343 332 aaPredicted RBP5.29□□□□□ -1.56
TRDN-205ENST00000546248 POP4O95707 220 aaKnown RBP5.29□□□□□ -1.56
TRDN-205ENST00000546248 IGLV2-14P01704 120 aa5.29□□□□□ -1.56
TRDN-205ENST00000546248 PYGLP06737 847 aa5.29□□□□□ -1.56
TRDN-205ENST00000546248 CDK4P11802 303 aa5.29□□□□□ -1.56
TRDN-205ENST00000546248 ARSAP15289 507 aa5.29□□□□□ -1.56
TRDN-205ENST00000546248 TSPAN8P19075 237 aa5.29□□□□□ -1.56
TRDN-205ENST00000546248 ITGALP20701 1170 aa5.29□□□□□ -1.56
TRDN-205ENST00000546248 PIK3R1P27986 724 aa5.29□□□□□ -1.56
TRDN-205ENST00000546248 PGM1P36871 562 aa5.29□□□□□ -1.56
TRDN-205ENST00000546248 VIPR2P41587 438 aa5.29□□□□□ -1.56
TRDN-205ENST00000546248 TTPAP49638 278 aa5.29□□□□□ -1.56
TRDN-205ENST00000546248 SNRPD1P62314 119 aaKnown RBP5.29□□□□□ -1.56
TRDN-205ENST00000546248 ECT2LQ008S8 904 aa5.29□□□□□ -1.56
TRDN-205ENST00000546248 SATB1Q01826 763 aa5.29□□□□□ -1.56
TRDN-205ENST00000546248 SEMG2Q02383 582 aa5.29□□□□□ -1.56
TRDN-205ENST00000546248 TAP2Q03519 686 aa5.29□□□□□ -1.56
TRDN-205ENST00000546248 RAD51Q06609 339 aa5.29□□□□□ -1.56
TRDN-205ENST00000546248 BIRC2Q13490 618 aa5.29□□□□□ -1.56
TRDN-205ENST00000546248 GPM6BQ13491 265 aa5.29□□□□□ -1.56
TRDN-205ENST00000546248 DMC1Q14565 340 aa5.29□□□□□ -1.56
TRDN-205ENST00000546248 TSNQ15631 228 aaKnown RBP5.29□□□□□ -1.56
TRDN-205ENST00000546248 PDCD2Q16342 344 aaPredicted RBP5.29□□□□□ -1.56
TRDN-205ENST00000546248 PLA1AQ53H76 456 aa5.29□□□□□ -1.56
TRDN-205ENST00000546248 FAM209BQ5JX69 171 aa5.29□□□□□ -1.56
TRDN-205ENST00000546248 SH2D4BQ5SQS7 431 aa5.29□□□□□ -1.56
TRDN-205ENST00000546248 C9orf50Q5SZB4 431 aa5.29□□□□□ -1.56
TRDN-205ENST00000546248 WLSQ5T9L3 541 aa5.29□□□□□ -1.56
TRDN-205ENST00000546248 SP5Q6BEB4 398 aaPredicted RBP5.29□□□□□ -1.56
TRDN-205ENST00000546248 ARMC6Q6NXE6 501 aa5.29□□□□□ -1.56
TRDN-205ENST00000546248 TMEM108Q6UXF1 575 aa5.29□□□□□ -1.56
TRDN-205ENST00000546248 FAM151BQ6UXP7 276 aa5.29□□□□□ -1.56
TRDN-205ENST00000546248 CERS6Q6ZMG9 384 aa5.29□□□□□ -1.56
TRDN-205ENST00000546248 RFLNAQ6ZTI6 216 aa5.29□□□□□ -1.56
TRDN-205ENST00000546248 TMPRSS9Q7Z410 1059 aa5.29□□□□□ -1.56
TRDN-205ENST00000546248 SNX20Q7Z614 316 aa5.29□□□□□ -1.56
TRDN-205ENST00000546248 RBM23Q86U06 439 aaKnown RBP5.29□□□□□ -1.56
TRDN-205ENST00000546248 SERPINA9Q86WD7 417 aa5.29□□□□□ -1.56
TRDN-205ENST00000546248 CLYBLQ8N0X4 340 aa5.29□□□□□ -1.56
TRDN-205ENST00000546248 PELI3Q8N2H9 469 aa5.29□□□□□ -1.56
TRDN-205ENST00000546248 PCDH20Q8N6Y1 951 aaKnown RBP5.29□□□□□ -1.56
TRDN-205ENST00000546248 C12orf76Q8N812 135 aaPredicted RBP5.29□□□□□ -1.56
TRDN-205ENST00000546248 PTGR2Q8N8N7 351 aaPredicted RBP5.29□□□□□ -1.56
TRDN-205ENST00000546248 OR2A12Q8NGT7 310 aa5.29□□□□□ -1.56
TRDN-205ENST00000546248 HMGCLL1Q8TB92 370 aa5.29□□□□□ -1.56
TRDN-205ENST00000546248 LKAAEAR1Q8TD35 194 aa5.29□□□□□ -1.56
TRDN-205ENST00000546248 ACTRT2Q8TDY3 377 aa5.29□□□□□ -1.56
TRDN-205ENST00000546248 NAT14Q8WUY8 206 aa5.29□□□□□ -1.56
TRDN-205ENST00000546248 WDR60Q8WVS4 1066 aa5.29□□□□□ -1.56
TRDN-205ENST00000546248 SNX19Q92543 992 aa5.29□□□□□ -1.56
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TRDN-205ENST00000546248 KCNJ9Q92806 393 aa5.29□□□□□ -1.56
TRDN-205ENST00000546248 NELL1Q92832 810 aa5.29□□□□□ -1.56
TRDN-205ENST00000546248 FUBP1Q96AE4 644 aaKnown RBP5.29□□□□□ -1.56
TRDN-205ENST00000546248 OTUB2Q96DC9 234 aa5.29□□□□□ -1.56
TRDN-205ENST00000546248 PDLIM5Q96HC4 596 aaKnown RBP5.29□□□□□ -1.56
TRDN-205ENST00000546248 SNX22Q96L94 193 aa5.29□□□□□ -1.56
TRDN-205ENST00000546248 PPP1R36Q96LQ0 422 aa5.29□□□□□ -1.56
TRDN-205ENST00000546248 ZNF641Q96N77 438 aaPredicted RBP5.29□□□□□ -1.56
TRDN-205ENST00000546248 MCCC1Q96RQ3 725 aaPredicted RBP5.29□□□□□ -1.56
TRDN-205ENST00000546248 BBS2Q9BXC9 721 aa5.29□□□□□ -1.56
TRDN-205ENST00000546248 SLC2A11Q9BYW1 496 aa5.29□□□□□ -1.56
TRDN-205ENST00000546248 CHST8Q9H2A9 424 aa5.29□□□□□ -1.56
TRDN-205ENST00000546248 ASB8Q9H765 288 aa5.29□□□□□ -1.56
TRDN-205ENST00000546248 ATP13A3Q9H7F0 1226 aa5.29□□□□□ -1.56
TRDN-205ENST00000546248 MEAF6Q9HAF1 191 aa5.29□□□□□ -1.56
TRDN-205ENST00000546248 EML4Q9HC35 981 aaKnown RBP5.29□□□□□ -1.56
TRDN-205ENST00000546248 TMEM74BQ9NUR3 256 aa5.29□□□□□ -1.56
TRDN-205ENST00000546248 ZDHHC7Q9NXF8 308 aa5.29□□□□□ -1.56
TRDN-205ENST00000546248 ZNF225Q9UK10 706 aa5.29□□□□□ -1.56
TRDN-205ENST00000546248 ERVW-1Q9UQF0 538 aa5.29□□□□□ -1.56
TRDN-205ENST00000546248 PKP3Q9Y446 797 aa5.29□□□□□ -1.56
TRDN-205ENST00000546248 L3MBTL1Q9Y468 752 aa5.29□□□□□ -1.56
TRDN-205ENST00000546248 COPG1Q9Y678 874 aaKnown RBP5.29□□□□□ -1.56
TRDN-205ENST00000546248 WNT6Q9Y6F9 365 aa5.29□□□□□ -1.56
TRDN-205ENST00000546248 COMMD10Q9Y6G5 202 aa5.29□□□□□ -1.56
TRDN-205ENST00000546248 SEC23IPQ9Y6Y8 1000 aaKnown RBP5.29□□□□□ -1.56
TRDN-205ENST00000546248 NUP205Q92621 2012 aa5.28□□□□□ -1.56
TRDN-205ENST00000546248 LTBP2Q14767 1821 aa5.28□□□□□ -1.56
TRDN-205ENST00000546248 TRGV11A0A075B6L2 103 aa5.28□□□□□ -1.56
TRDN-205ENST00000546248 GLYATL1P3A0A0U1RQE8 302 aa5.28□□□□□ -1.56
TRDN-205ENST00000546248 C1orf232A0A0U1RR37 186 aa5.28□□□□□ -1.56
TRDN-205ENST00000546248 NPIPB15A6NHN6 443 aaPredicted RBP5.28□□□□□ -1.56
TRDN-205ENST00000546248 TRPC5OSA6NMA1 111 aa5.28□□□□□ -1.56
TRDN-205ENST00000546248 MEI4A8MW99 385 aa5.28□□□□□ -1.56
TRDN-205ENST00000546248 TTC34A8MYJ7 566 aa5.28□□□□□ -1.56
TRDN-205ENST00000546248 STX16-NPEPL1H3BU86 382 aa5.28□□□□□ -1.56
TRDN-205ENST00000546248 STX16O14662 325 aa5.28□□□□□ -1.56
TRDN-205ENST00000546248 PFDN6O15212 129 aa5.28□□□□□ -1.56
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