RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000539498.1

RAN-209, Transcript of RAN, member RAS oncogene family, human

TSL 2

Gene RAN, Length 1,659 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
RAN-209	ENST00000539498	PROP1	O75360	226 aa		4.92	□□□□□ -1.62
RAN-209	ENST00000539498	DEXI	O95424	95 aa		4.92	□□□□□ -1.62
RAN-209	ENST00000539498	WDPCP	O95876	746 aa		4.92	□□□□□ -1.62
RAN-209	ENST00000539498	PGK1	P00558	417 aa		4.92	□□□□□ -1.62
RAN-209	ENST00000539498	PRKCG	P05129	697 aa		4.92	□□□□□ -1.62
RAN-209	ENST00000539498	CYBA	P13498	195 aa		4.92	□□□□□ -1.62
RAN-209	ENST00000539498	EPCAM	P16422	314 aa		4.92	□□□□□ -1.62
RAN-209	ENST00000539498	TNFRSF1B	P20333	461 aa		4.92	□□□□□ -1.62
RAN-209	ENST00000539498	SSTR2	P30874	369 aa		4.92	□□□□□ -1.62
RAN-209	ENST00000539498	PRMT2	P55345	433 aa		4.92	□□□□□ -1.62
RAN-209	ENST00000539498	COL10A1	Q03692	680 aa		4.92	□□□□□ -1.62
RAN-209	ENST00000539498	VEZF1	Q14119	521 aa		4.92	□□□□□ -1.62
RAN-209	ENST00000539498	MFSD14C	Q5VZR4	134 aa		4.92	□□□□□ -1.62
RAN-209	ENST00000539498	TYW3	Q6IPR3	259 aa	Known RBP	4.92	□□□□□ -1.62
RAN-209	ENST00000539498	MFSD7	Q6UXD7	560 aa		4.92	□□□□□ -1.62
RAN-209	ENST00000539498		Q6ZTK2	550 aa		4.92	□□□□□ -1.62
RAN-209	ENST00000539498	ZNF410	Q86VK4	478 aa		4.92	□□□□□ -1.62
RAN-209	ENST00000539498	ELMOD2	Q8IZ81	293 aa		4.92	□□□□□ -1.62
RAN-209	ENST00000539498	SSMEM1	Q8WWF3	244 aa		4.92	□□□□□ -1.62
RAN-209	ENST00000539498	ZFYVE19	Q96K21	471 aa		4.92	□□□□□ -1.62
RAN-209	ENST00000539498	PRRX2	Q99811	253 aa		4.92	□□□□□ -1.62
RAN-209	ENST00000539498	BTBD10	Q9BSF8	475 aa		4.92	□□□□□ -1.62
RAN-209	ENST00000539498	PXMP2	Q9NR77	195 aa		4.92	□□□□□ -1.62
RAN-209	ENST00000539498	COMMD8	Q9NX08	183 aa		4.92	□□□□□ -1.62
RAN-209	ENST00000539498	TMEM161A	Q9NX61	479 aa		4.92	□□□□□ -1.62
RAN-209	ENST00000539498	MIOS	Q9NXC5	875 aa		4.92	□□□□□ -1.62
RAN-209	ENST00000539498	STRAP	Q9Y3F4	350 aa	Known RBP	4.92	□□□□□ -1.62
RAN-209	ENST00000539498	ZNFX1	Q9P2E3	1918 aa	Known RBP	4.92	□□□□□ -1.62
RAN-209	ENST00000539498	ZNF236	Q9UL36	1845 aa		4.91	□□□□□ -1.62
RAN-209	ENST00000539498	PLXNA1	Q9UIW2	1896 aa		4.91	□□□□□ -1.62
RAN-209	ENST00000539498	IGHV4-28	A0A0C4DH34	117 aa		4.91	□□□□□ -1.62
RAN-209	ENST00000539498	C5orf60	A6NFR6	353 aa		4.91	□□□□□ -1.62
RAN-209	ENST00000539498	KBTBD13	C9JR72	458 aa		4.91	□□□□□ -1.62
RAN-209	ENST00000539498	FLRT2	O43155	660 aa		4.91	□□□□□ -1.62
RAN-209	ENST00000539498	EDIL3	O43854	480 aa		4.91	□□□□□ -1.62
RAN-209	ENST00000539498	ATP6AP2	O75787	350 aa		4.91	□□□□□ -1.62
RAN-209	ENST00000539498	SAG	P10523	405 aa	Predicted RBP	4.91	□□□□□ -1.62
RAN-209	ENST00000539498	ACP2	P11117	423 aa		4.91	□□□□□ -1.62
RAN-209	ENST00000539498	ETS1	P14921	441 aa		4.91	□□□□□ -1.62
RAN-209	ENST00000539498	GJB2	P29033	226 aa		4.91	□□□□□ -1.62
RAN-209	ENST00000539498	CLCNKA	P51800	687 aa		4.91	□□□□□ -1.62
RAN-209	ENST00000539498	SMS	P52788	366 aa		4.91	□□□□□ -1.62
RAN-209	ENST00000539498	PTGIS	Q16647	500 aa		4.91	□□□□□ -1.62
RAN-209	ENST00000539498	SPATS1	Q496A3	300 aa		4.91	□□□□□ -1.62
RAN-209	ENST00000539498		Q4G0T1	1027 aa		4.91	□□□□□ -1.62
RAN-209	ENST00000539498	MAP7D3	Q8IWC1	876 aa		4.91	□□□□□ -1.62
RAN-209	ENST00000539498	ANKRD20A12P	Q8NF67	263 aa		4.91	□□□□□ -1.62
RAN-209	ENST00000539498	PSMA8	Q8TAA3	256 aa		4.91	□□□□□ -1.62
RAN-209	ENST00000539498	THAP6	Q8TBB0	222 aa		4.91	□□□□□ -1.62
RAN-209	ENST00000539498	U2AF1L4	Q8WU68	220 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
RAN-209	ENST00000539498	FAM46B	Q96A09	425 aa		4.91	□□□□□ -1.62
RAN-209	ENST00000539498	DTD2	Q96FN9	168 aa		4.91	□□□□□ -1.62
RAN-209	ENST00000539498	RBM18	Q96H35	190 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
RAN-209	ENST00000539498	ZNF560	Q96MR9	790 aa		4.91	□□□□□ -1.62
RAN-209	ENST00000539498	ZMYND12	Q9H0C1	365 aa		4.91	□□□□□ -1.62
RAN-209	ENST00000539498	CATSPERB	Q9H7T0	1116 aa		4.91	□□□□□ -1.62
RAN-209	ENST00000539498	PLAC1	Q9HBJ0	212 aa		4.91	□□□□□ -1.62
RAN-209	ENST00000539498	C6orf50	Q9HD87	102 aa		4.91	□□□□□ -1.62
RAN-209	ENST00000539498	KRCC1	Q9NPI7	259 aa	Predicted RBP	4.91	□□□□□ -1.62
RAN-209	ENST00000539498	B3GAT1	Q9P2W7	334 aa		4.91	□□□□□ -1.62
RAN-209	ENST00000539498	TRMT6	Q9UJA5	497 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
RAN-209	ENST00000539498	PAM16	Q9Y3D7	125 aa		4.91	□□□□□ -1.62
RAN-209	ENST00000539498	SPIN1	Q9Y657	262 aa	Predicted RBP	4.91	□□□□□ -1.62
RAN-209	ENST00000539498	ATP8B3	O60423	1300 aa		4.91	□□□□□ -1.62
RAN-209	ENST00000539498	MCM3AP	O60318	1980 aa		4.9	□□□□□ -1.62
RAN-209	ENST00000539498	TEX13D	A0A0J9YY54	714 aa	Predicted RBP	4.9	□□□□□ -1.62
RAN-209	ENST00000539498	C13orf42	A0A1B0GVH6	325 aa		4.9	□□□□□ -1.62
RAN-209	ENST00000539498	ASB14	A6NK59	587 aa		4.9	□□□□□ -1.62
RAN-209	ENST00000539498	CH25H	O95992	272 aa		4.9	□□□□□ -1.62
RAN-209	ENST00000539498	IFNB1	P01574	187 aa		4.9	□□□□□ -1.62
RAN-209	ENST00000539498	GHR	P10912	638 aa		4.9	□□□□□ -1.62
RAN-209	ENST00000539498	HAPLN1	P10915	354 aa	Predicted RBP	4.9	□□□□□ -1.62
RAN-209	ENST00000539498	OR3A1	P47881	315 aa		4.9	□□□□□ -1.62
RAN-209	ENST00000539498	KRTAP10-2	P60368	255 aa		4.9	□□□□□ -1.62
RAN-209	ENST00000539498	BEX3	Q00994	111 aa		4.9	□□□□□ -1.62
RAN-209	ENST00000539498	SP4	Q02446	784 aa		4.9	□□□□□ -1.62
RAN-209	ENST00000539498	SLC18B1	Q6NT16	456 aa		4.9	□□□□□ -1.62
RAN-209	ENST00000539498	ABRAXAS1	Q6UWZ7	409 aa		4.9	□□□□□ -1.62
RAN-209	ENST00000539498	BLID	Q8IZY5	108 aa		4.9	□□□□□ -1.62
RAN-209	ENST00000539498	FAM184A	Q8NB25	1140 aa		4.9	□□□□□ -1.62
RAN-209	ENST00000539498	SPATA22	Q8NHS9	363 aa		4.9	□□□□□ -1.62
RAN-209	ENST00000539498	CHFR	Q96EP1	664 aa		4.9	□□□□□ -1.62
RAN-209	ENST00000539498	C8orf76	Q96K31	380 aa		4.9	□□□□□ -1.62
RAN-209	ENST00000539498	EBF3	Q9H4W6	596 aa		4.9	□□□□□ -1.62
RAN-209	ENST00000539498	WDR83OS	Q9Y284	106 aa		4.9	□□□□□ -1.62
RAN-209	ENST00000539498	INSL6	Q9Y581	213 aa		4.9	□□□□□ -1.62
RAN-209	ENST00000539498	ATXN2	Q99700	1313 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.62
RAN-209	ENST00000539498	STK36	Q9NRP7	1315 aa		4.9	□□□□□ -1.62
RAN-209	ENST00000539498	RBBP6	Q7Z6E9	1792 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.63
RAN-209	ENST00000539498	LRRC37A2	A6NM11	1700 aa		4.89	□□□□□ -1.63
RAN-209	ENST00000539498	KPNA7	A9QM74	516 aa		4.89	□□□□□ -1.63
RAN-209	ENST00000539498	TLR4	O00206	839 aa		4.89	□□□□□ -1.63
RAN-209	ENST00000539498	RGS14	O43566	566 aa		4.89	□□□□□ -1.63
RAN-209	ENST00000539498	ATP9A	O75110	1047 aa		4.89	□□□□□ -1.63
RAN-209	ENST00000539498	CRCP	O75575	148 aa		4.89	□□□□□ -1.63
RAN-209	ENST00000539498	TDP2	O95551	362 aa		4.89	□□□□□ -1.63
RAN-209	ENST00000539498	PDGFB	P01127	241 aa	Predicted RBP	4.89	□□□□□ -1.63
RAN-209	ENST00000539498	TGFA	P01135	160 aa		4.89	□□□□□ -1.63
RAN-209	ENST00000539498	MMP1	P03956	469 aa		4.89	□□□□□ -1.63
RAN-209	ENST00000539498	CDX1	P47902	265 aa	Predicted RBP	4.89	□□□□□ -1.63

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 29.7 ms