RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000488403.5

NOP58-208, Transcript of NOP58 ribonucleoprotein, human

TSL 2

Gene NOP58, Length 871 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
NOP58-208	ENST00000488403	METTL27	Q8N6F8	245 aa	Predicted RBP	13.98	□□□□□ -0.17
NOP58-208	ENST00000488403	UBTD2	Q8WUN7	234 aa		13.98	□□□□□ -0.17
NOP58-208	ENST00000488403	CAVIN3	Q969G5	261 aa		13.98	□□□□□ -0.17
NOP58-208	ENST00000488403	FKBP10	Q96AY3	582 aa		13.98	□□□□□ -0.17
NOP58-208	ENST00000488403	C10orf90	Q96M02	699 aa		13.98	□□□□□ -0.17
NOP58-208	ENST00000488403	MRPL57	Q9BQC6	102 aa	Known RBP	13.98	□□□□□ -0.17
NOP58-208	ENST00000488403	DRC3	Q9H069	523 aa		13.98	□□□□□ -0.17
NOP58-208	ENST00000488403	SYNPO2L	Q9H987	977 aa		13.98	□□□□□ -0.17
NOP58-208	ENST00000488403	PRM3	Q9NNZ6	103 aa		13.98	□□□□□ -0.17
NOP58-208	ENST00000488403	ZNF358	Q9NW07	568 aa		13.98	□□□□□ -0.17
NOP58-208	ENST00000488403	TNPO3	Q9Y5L0	923 aa	Known RBP	13.98	□□□□□ -0.17
NOP58-208	ENST00000488403	MAU2	Q9Y6X3	613 aa		13.98	□□□□□ -0.17
NOP58-208	ENST00000488403	PRRC2C	Q9Y520	2896 aa	Known RBP	13.98	□□□□□ -0.17
NOP58-208	ENST00000488403	RP1L1	Q8IWN7	2480 aa	Predicted RBP	13.98	□□□□□ -0.17
NOP58-208	ENST00000488403	SNRNP200	O75643	2136 aa	Known RBP	13.97	□□□□□ -0.17
NOP58-208	ENST00000488403	CDH16	O75309	829 aa		13.97	□□□□□ -0.17
NOP58-208	ENST00000488403	ALB	P02768	609 aa		13.97	□□□□□ -0.17
NOP58-208	ENST00000488403	KRT15	P19012	456 aa		13.97	□□□□□ -0.17
NOP58-208	ENST00000488403	FBL	P22087	321 aa	Known RBP	13.97	□□□□□ -0.17
NOP58-208	ENST00000488403	VARS	P26640	1264 aa	Known RBP	13.97	□□□□□ -0.17
NOP58-208	ENST00000488403	AHR	P35869	848 aa		13.97	□□□□□ -0.17
NOP58-208	ENST00000488403	FOLR3	P41439	243 aa		13.97	□□□□□ -0.17
NOP58-208	ENST00000488403	SCTR	P47872	440 aa		13.97	□□□□□ -0.17
NOP58-208	ENST00000488403	AVPR1B	P47901	424 aa		13.97	□□□□□ -0.17
NOP58-208	ENST00000488403	IRF8	Q02556	426 aa		13.97	□□□□□ -0.17
NOP58-208	ENST00000488403	RGS1	Q08116	209 aa		13.97	□□□□□ -0.17
NOP58-208	ENST00000488403	FAM53B	Q14153	422 aa		13.97	□□□□□ -0.17
NOP58-208	ENST00000488403	SLBP	Q14493	270 aa	Known RBP eCLIP	13.97	□□□□□ -0.17	6e-7	■■□□□ 13.2
NOP58-208	ENST00000488403	SETDB1	Q15047	1291 aa		13.97	□□□□□ -0.17
NOP58-208	ENST00000488403	RASA2	Q15283	850 aa		13.97	□□□□□ -0.17
NOP58-208	ENST00000488403	XKR6	Q5GH73	641 aa		13.97	□□□□□ -0.17
NOP58-208	ENST00000488403	PAGE2B	Q5JRK9	111 aa		13.97	□□□□□ -0.17
NOP58-208	ENST00000488403	ATCAY	Q86WG3	371 aa		13.97	□□□□□ -0.17
NOP58-208	ENST00000488403	TEX9	Q8N6V9	391 aa		13.97	□□□□□ -0.17
NOP58-208	ENST00000488403	ZNF740	Q8NDX6	193 aa		13.97	□□□□□ -0.17
NOP58-208	ENST00000488403	TRPV3	Q8NET8	790 aa		13.97	□□□□□ -0.17
NOP58-208	ENST00000488403	TTL	Q8NG68	377 aa		13.97	□□□□□ -0.17
NOP58-208	ENST00000488403	ZDHHC19	Q8WVZ1	309 aa	Predicted RBP	13.97	□□□□□ -0.17
NOP58-208	ENST00000488403	TM4SF19	Q96DZ7	209 aa		13.97	□□□□□ -0.17
NOP58-208	ENST00000488403	YIPF2	Q9BWQ6	316 aa		13.97	□□□□□ -0.17
NOP58-208	ENST00000488403	PITHD1	Q9GZP4	211 aa	Predicted RBP	13.97	□□□□□ -0.17
NOP58-208	ENST00000488403	MRPL46	Q9H2W6	279 aa	Known RBP	13.97	□□□□□ -0.17
NOP58-208	ENST00000488403	EHD1	Q9H4M9	534 aa		13.97	□□□□□ -0.17
NOP58-208	ENST00000488403	MLXIPL	Q9NP71	852 aa		13.97	□□□□□ -0.17
NOP58-208	ENST00000488403	XPR1	Q9UBH6	696 aa		13.97	□□□□□ -0.17
NOP58-208	ENST00000488403	ZFP69B	Q9UJL9	534 aa		13.97	□□□□□ -0.17
NOP58-208	ENST00000488403	PTRH2	Q9Y3E5	179 aa	Known RBP	13.97	□□□□□ -0.17
NOP58-208	ENST00000488403	PCDHGA9	Q9Y5G4	932 aa	Known RBP	13.97	□□□□□ -0.17
NOP58-208	ENST00000488403	UTP20	O75691	2785 aa	Known RBP	13.96	□□□□□ -0.17
NOP58-208	ENST00000488403	TLDC2	A0PJX2	215 aa		13.96	□□□□□ -0.17
NOP58-208	ENST00000488403	URAD	A6NGE7	173 aa		13.96	□□□□□ -0.17
NOP58-208	ENST00000488403	GOLGA8R	I6L899	631 aa		13.96	□□□□□ -0.17
NOP58-208	ENST00000488403	NDUFS4	O43181	175 aa		13.96	□□□□□ -0.17
NOP58-208	ENST00000488403	MED26	O95402	600 aa		13.96	□□□□□ -0.17
NOP58-208	ENST00000488403	ONECUT2	O95948	504 aa		13.96	□□□□□ -0.17
NOP58-208	ENST00000488403	PYGB	P11216	843 aa		13.96	□□□□□ -0.17
NOP58-208	ENST00000488403	EPB42	P16452	691 aa		13.96	□□□□□ -0.17
NOP58-208	ENST00000488403	PIK3CG	P48736	1102 aa		13.96	□□□□□ -0.17
NOP58-208	ENST00000488403	CD97	P48960	835 aa		13.96	□□□□□ -0.17
NOP58-208	ENST00000488403	OCA2	Q04671	838 aa		13.96	□□□□□ -0.17
NOP58-208	ENST00000488403	LAPTM5	Q13571	262 aa		13.96	□□□□□ -0.17
NOP58-208	ENST00000488403	PWP1	Q13610	501 aa		13.96	□□□□□ -0.17
NOP58-208	ENST00000488403	HIST2H2AC	Q16777	129 aa	Predicted RBP	13.96	□□□□□ -0.17
NOP58-208	ENST00000488403	HIST2H2AA3	Q6FI13	130 aa		13.96	□□□□□ -0.17
NOP58-208	ENST00000488403	METTL2B	Q6P1Q9	378 aa	Known RBP	13.96	□□□□□ -0.17
NOP58-208	ENST00000488403	TMIGD1	Q6UXZ0	262 aa		13.96	□□□□□ -0.17
NOP58-208	ENST00000488403	FDCSP	Q8NFU4	85 aa		13.96	□□□□□ -0.17
NOP58-208	ENST00000488403	EPS8L3	Q8TE67	593 aa	Known RBP	13.96	□□□□□ -0.17
NOP58-208	ENST00000488403	PTCD3	Q96EY7	689 aa	Known RBP	13.96	□□□□□ -0.17
NOP58-208	ENST00000488403	MMAB	Q96EY8	250 aa	Predicted RBP	13.96	□□□□□ -0.17
NOP58-208	ENST00000488403	MACROD1	Q9BQ69	325 aa		13.96	□□□□□ -0.17
NOP58-208	ENST00000488403	EFCAB11	Q9BUY7	163 aa		13.96	□□□□□ -0.17
NOP58-208	ENST00000488403	SPNS1	Q9H2V7	528 aa		13.96	□□□□□ -0.17
NOP58-208	ENST00000488403	ANKH	Q9HCJ1	492 aa		13.96	□□□□□ -0.17
NOP58-208	ENST00000488403	SLC22A11	Q9NSA0	550 aa		13.96	□□□□□ -0.17
NOP58-208	ENST00000488403	NXT1	Q9UKK6	140 aa	Known RBP	13.96	□□□□□ -0.17
NOP58-208	ENST00000488403	RAB21	Q9UL25	225 aa		13.96	□□□□□ -0.17
NOP58-208	ENST00000488403	PCM1	Q15154	2024 aa		13.96	□□□□□ -0.17
NOP58-208	ENST00000488403	CCDC88C	Q9P219	2028 aa		13.95	□□□□□ -0.18
NOP58-208	ENST00000488403		A0A0A6YYC8	382 aa	Predicted RBP	13.95	□□□□□ -0.18
NOP58-208	ENST00000488403	CLEC18A	A5D8T8	446 aa		13.95	□□□□□ -0.18
NOP58-208	ENST00000488403	ANKDD1B	A6NHY2	528 aa		13.95	□□□□□ -0.18
NOP58-208	ENST00000488403		I3L1I5	382 aa	Predicted RBP	13.95	□□□□□ -0.18
NOP58-208	ENST00000488403	KLK8	O60259	260 aa		13.95	□□□□□ -0.18
NOP58-208	ENST00000488403	VPS4B	O75351	444 aa		13.95	□□□□□ -0.18
NOP58-208	ENST00000488403	GSTA1	P08263	222 aa		13.95	□□□□□ -0.18
NOP58-208	ENST00000488403	NUDT17	P0C025	328 aa		13.95	□□□□□ -0.18
NOP58-208	ENST00000488403	TAC1	P20366	129 aa		13.95	□□□□□ -0.18
NOP58-208	ENST00000488403	ITGAX	P20702	1163 aa		13.95	□□□□□ -0.18
NOP58-208	ENST00000488403	GSTM2	P28161	218 aa		13.95	□□□□□ -0.18
NOP58-208	ENST00000488403	OTX2	P32243	289 aa		13.95	□□□□□ -0.18
NOP58-208	ENST00000488403	UQCRFS1	P47985	274 aa		13.95	□□□□□ -0.18
NOP58-208	ENST00000488403	SKP1	P63208	163 aa		13.95	□□□□□ -0.18
NOP58-208	ENST00000488403	CHIT1	Q13231	466 aa		13.95	□□□□□ -0.18
NOP58-208	ENST00000488403	RAPSN	Q13702	412 aa		13.95	□□□□□ -0.18
NOP58-208	ENST00000488403	ATP1A4	Q13733	1029 aa		13.95	□□□□□ -0.18
NOP58-208	ENST00000488403	DSG2	Q14126	1118 aa		13.95	□□□□□ -0.18
NOP58-208	ENST00000488403	DOC2A	Q14183	400 aa		13.95	□□□□□ -0.18
NOP58-208	ENST00000488403	SSPN	Q14714	243 aa		13.95	□□□□□ -0.18
NOP58-208	ENST00000488403	NAA30	Q147X3	362 aa	Predicted RBP	13.95	□□□□□ -0.18

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 40.8 ms