RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000371209.5

TCTN3-202, Transcript of tectonic family member 3, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC

Gene TCTN3, Length 1,464 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TCTN3-202ENST00000371209 AGRPO00253 132 aa10□□□□□ -0.81
TCTN3-202ENST00000371209 HGSO14964 777 aaPredicted RBP10□□□□□ -0.81
TCTN3-202ENST00000371209 PIP5K1BO14986 540 aa10□□□□□ -0.81
TCTN3-202ENST00000371209 P2RX6O15547 441 aa10□□□□□ -0.81
TCTN3-202ENST00000371209 SNX3O60493 162 aa10□□□□□ -0.81
TCTN3-202ENST00000371209 SKAP2O75563 359 aaPredicted RBP10□□□□□ -0.81
TCTN3-202ENST00000371209 KRT6AP02538 564 aa10□□□□□ -0.81
TCTN3-202ENST00000371209 KRT6BP04259 564 aa10□□□□□ -0.81
TCTN3-202ENST00000371209 CEACAM1P13688 526 aa10□□□□□ -0.81
TCTN3-202ENST00000371209 FOLR1P15328 257 aa10□□□□□ -0.81
TCTN3-202ENST00000371209 GRK3P35626 688 aa10□□□□□ -0.81
TCTN3-202ENST00000371209 KRT6CP48668 564 aa10□□□□□ -0.81
TCTN3-202ENST00000371209 NOVA1P51513 510 aaKnown RBP10□□□□□ -0.81
TCTN3-202ENST00000371209 ARF3P61204 181 aaPredicted RBP10□□□□□ -0.81
TCTN3-202ENST00000371209 BTKQ06187 659 aa10□□□□□ -0.81
TCTN3-202ENST00000371209 C16orf72Q14CZ0 275 aa10□□□□□ -0.81
TCTN3-202ENST00000371209 PDCD2Q16342 344 aaPredicted RBP10□□□□□ -0.81
TCTN3-202ENST00000371209 VWA5B1Q5TIE3 1220 aa10□□□□□ -0.81
TCTN3-202ENST00000371209 DGLUCYQ7Z3D6 616 aa10□□□□□ -0.81
TCTN3-202ENST00000371209 KMT5CQ86Y97 462 aa10□□□□□ -0.81
TCTN3-202ENST00000371209 MCATQ8IVS2 390 aaKnown RBP10□□□□□ -0.81
TCTN3-202ENST00000371209 RFWD2Q8NHY2 731 aa10□□□□□ -0.81
TCTN3-202ENST00000371209 CREB3L4Q8TEY5 395 aa10□□□□□ -0.81
TCTN3-202ENST00000371209 SELENOMQ8WWX9 145 aa10□□□□□ -0.81
TCTN3-202ENST00000371209 UBE2E3Q969T4 207 aa10□□□□□ -0.81
TCTN3-202ENST00000371209 REPS1Q96D71 796 aa10□□□□□ -0.81
TCTN3-202ENST00000371209 FAR2Q96K12 515 aa10□□□□□ -0.81
TCTN3-202ENST00000371209 PPP1R36Q96LQ0 422 aa10□□□□□ -0.81
TCTN3-202ENST00000371209 C3orf30Q96M34 536 aa10□□□□□ -0.81
TCTN3-202ENST00000371209 NUF2Q9BZD4 464 aa10□□□□□ -0.81
TCTN3-202ENST00000371209 AICDAQ9GZX7 198 aa10□□□□□ -0.81
TCTN3-202ENST00000371209 PDE7BQ9NP56 450 aa10□□□□□ -0.81
TCTN3-202ENST00000371209 DMRT3Q9NQL9 472 aa10□□□□□ -0.81
TCTN3-202ENST00000371209 ZFP69BQ9UJL9 534 aa10□□□□□ -0.81
TCTN3-202ENST00000371209 CDV3Q9UKY7 258 aaKnown RBP10□□□□□ -0.81
TCTN3-202ENST00000371209 ARL2BPQ9Y2Y0 163 aa10□□□□□ -0.81
TCTN3-202ENST00000371209 TSC22D4Q9Y3Q8 395 aa10□□□□□ -0.81
TCTN3-202ENST00000371209 AP1M2Q9Y6Q5 423 aa10□□□□□ -0.81
TCTN3-202ENST00000371209 CEP250Q9BV73 2442 aa10□□□□□ -0.81
TCTN3-202ENST00000371209 MAGEB17A8MXT2 336 aa9.99□□□□□ -0.81
TCTN3-202ENST00000371209 HDAC3O15379 428 aa9.99□□□□□ -0.81
TCTN3-202ENST00000371209 HYAL3O43820 417 aaPredicted RBP9.99□□□□□ -0.81
TCTN3-202ENST00000371209 SH3BGRLO75368 114 aa9.99□□□□□ -0.81
TCTN3-202ENST00000371209 ULK1O75385 1050 aa9.99□□□□□ -0.81
TCTN3-202ENST00000371209 ATP5HO75947 161 aa9.99□□□□□ -0.81
TCTN3-202ENST00000371209 ETHE1O95571 254 aa9.99□□□□□ -0.81
TCTN3-202ENST00000371209 LINC00032P0C843 101 aa9.99□□□□□ -0.81
TCTN3-202ENST00000371209 ALOX15P16050 662 aaPredicted RBP9.99□□□□□ -0.81
TCTN3-202ENST00000371209 CCKBRP32239 447 aa9.99□□□□□ -0.81
TCTN3-202ENST00000371209 AHRP35869 848 aa9.99□□□□□ -0.81
TCTN3-202ENST00000371209 PIK3CBP42338 1070 aa9.99□□□□□ -0.81
TCTN3-202ENST00000371209 ARL4DP49703 201 aa9.99□□□□□ -0.81
TCTN3-202ENST00000371209 INHBCP55103 352 aa9.99□□□□□ -0.81
TCTN3-202ENST00000371209 VSX2P58304 361 aaPredicted RBP9.99□□□□□ -0.81
TCTN3-202ENST00000371209 NCALDP61601 193 aa9.99□□□□□ -0.81
TCTN3-202ENST00000371209 RPS13P62277 151 aaKnown RBP9.99□□□□□ -0.81
TCTN3-202ENST00000371209 SNRPNP63162 240 aaKnown RBP9.99□□□□□ -0.81
TCTN3-202ENST00000371209 SF3A3Q12874 501 aaKnown RBP eCLIP9.99□□□□□ -0.81
TCTN3-202ENST00000371209 HYAL2Q12891 473 aa9.99□□□□□ -0.81
TCTN3-202ENST00000371209 TRA2AQ13595 282 aaKnown RBP eCLIP9.99□□□□□ -0.81
TCTN3-202ENST00000371209 COL9A2Q14055 689 aaPredicted RBP9.99□□□□□ -0.81
TCTN3-202ENST00000371209 GPR19Q15760 415 aa9.99□□□□□ -0.81
TCTN3-202ENST00000371209 RSPO4Q2I0M5 234 aaPredicted RBP9.99□□□□□ -0.81
TCTN3-202ENST00000371209 XKR7Q5GH72 579 aa9.99□□□□□ -0.81
TCTN3-202ENST00000371209 HES3Q5TGS1 186 aa9.99□□□□□ -0.81
TCTN3-202ENST00000371209 RNF165Q6ZSG1 346 aa9.99□□□□□ -0.81
TCTN3-202ENST00000371209 DDIASQ8IXT1 998 aa9.99□□□□□ -0.81
TCTN3-202ENST00000371209 CHCHD4Q8N4Q1 142 aa9.99□□□□□ -0.81
TCTN3-202ENST00000371209 TBC1D19Q8N5T2 526 aa9.99□□□□□ -0.81
TCTN3-202ENST00000371209 OR2T11Q8NH01 316 aa9.99□□□□□ -0.81
TCTN3-202ENST00000371209 TM4SF19Q96DZ7 209 aa9.99□□□□□ -0.81
TCTN3-202ENST00000371209 THAP11Q96EK4 314 aa9.99□□□□□ -0.81
TCTN3-202ENST00000371209 C19orf60Q96EN9 201 aa9.99□□□□□ -0.81
TCTN3-202ENST00000371209 ZNF285Q96NJ3 590 aa9.99□□□□□ -0.81
TCTN3-202ENST00000371209 ELAC2Q9BQ52 826 aaKnown RBP9.99□□□□□ -0.81
TCTN3-202ENST00000371209 MS4A8Q9BY19 250 aa9.99□□□□□ -0.81
TCTN3-202ENST00000371209 ACPTQ9BZG2 426 aa9.99□□□□□ -0.81
TCTN3-202ENST00000371209 NPHS2Q9NP85 383 aa9.99□□□□□ -0.81
TCTN3-202ENST00000371209 STARD5Q9NSY2 213 aa9.99□□□□□ -0.81
TCTN3-202ENST00000371209 TXLNGQ9NUQ3 528 aa9.99□□□□□ -0.81
TCTN3-202ENST00000371209 SIDT1Q9NXL6 827 aaKnown RBP9.99□□□□□ -0.81
TCTN3-202ENST00000371209 VTI1BQ9UEU0 232 aa9.99□□□□□ -0.81
TCTN3-202ENST00000371209 CCL27Q9Y4X3 112 aa9.99□□□□□ -0.81
TCTN3-202ENST00000371209 USH1CQ9Y6N9 552 aa9.99□□□□□ -0.81
TCTN3-202ENST00000371209 PCNX2A6NKB5 2137 aa9.99□□□□□ -0.81
TCTN3-202ENST00000371209 DCHS1Q96JQ0 3298 aa9.98□□□□□ -0.81
TCTN3-202ENST00000371209 SERTM1A2A2V5 107 aa9.98□□□□□ -0.81
TCTN3-202ENST00000371209 ANKDD1BA6NHY2 528 aa9.98□□□□□ -0.81
TCTN3-202ENST00000371209 C4orf51C9J302 202 aa9.98□□□□□ -0.81
TCTN3-202ENST00000371209 RNF223E7ERA6 249 aa9.98□□□□□ -0.81
TCTN3-202ENST00000371209 SLCO1B7G3V0H7 640 aa9.98□□□□□ -0.81
TCTN3-202ENST00000371209 H3BMH7 237 aa9.98□□□□□ -0.81
TCTN3-202ENST00000371209 FOXE1O00358 373 aaPredicted RBP9.98□□□□□ -0.81
TCTN3-202ENST00000371209 SDHDO14521 159 aa9.98□□□□□ -0.81
TCTN3-202ENST00000371209 NDUFS4O43181 175 aa9.98□□□□□ -0.81
TCTN3-202ENST00000371209 CSO75390 466 aaKnown RBP9.98□□□□□ -0.81
TCTN3-202ENST00000371209 CLEC3AO75596 197 aa9.98□□□□□ -0.81
TCTN3-202ENST00000371209 KCNK5O95279 499 aa9.98□□□□□ -0.81
TCTN3-202ENST00000371209 TGDSO95455 350 aa9.98□□□□□ -0.81
TCTN3-202ENST00000371209 ANP32DO95626 131 aa9.98□□□□□ -0.81
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 25 ms