RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000320580.8

PACS1-201, Transcript of phosphofurin acidic cluster sorting protein 1, humanhuman

APPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC

Gene PACS1, Length 4,392 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PACS1-201ENST00000320580 SDR16C5Q8N3Y7 309 aa16.08■□□□□ 0.16
PACS1-201ENST00000320580 SLC5A8Q8N695 610 aa16.08■□□□□ 0.16
PACS1-201ENST00000320580 B3GNT7Q8NFL0 401 aa16.08■□□□□ 0.16
PACS1-201ENST00000320580 HCAR2Q8TDS4 363 aa16.08■□□□□ 0.16
PACS1-201ENST00000320580 TNFAIP8L1Q8WVP5 186 aa16.08■□□□□ 0.16
PACS1-201ENST00000320580 SLC5A11Q8WWX8 675 aa16.08■□□□□ 0.16
PACS1-201ENST00000320580 MINDY3Q9H8M7 445 aa16.08■□□□□ 0.16
PACS1-201ENST00000320580 NUDT15Q9NV35 164 aa16.08■□□□□ 0.16
PACS1-201ENST00000320580 TCRBV5S2A0A599 114 aa16.08■□□□□ 0.16
PACS1-201ENST00000320580 ANKDD1BA6NHY2 528 aa16.08■□□□□ 0.16
PACS1-201ENST00000320580 POM121CA8CG34 1229 aa16.08■□□□□ 0.16
PACS1-201ENST00000320580 C19orf81C9J6K1 198 aa16.08■□□□□ 0.16
PACS1-201ENST00000320580 DAOAP59103 153 aa16.08■□□□□ 0.16
PACS1-201ENST00000320580 VMACQ2NL98 169 aa16.08■□□□□ 0.16
PACS1-201ENST00000320580 ATP13A5Q4VNC0 1218 aa16.08■□□□□ 0.16
PACS1-201ENST00000320580 RFTN2Q52LD8 501 aaPredicted RBP16.08■□□□□ 0.16
PACS1-201ENST00000320580 ATAT1Q5SQI0 421 aa16.08■□□□□ 0.16
PACS1-201ENST00000320580 CPZQ66K79 652 aa16.08■□□□□ 0.16
PACS1-201ENST00000320580 C3orf58Q8NDZ4 430 aa16.08■□□□□ 0.16
PACS1-201ENST00000320580 BRSK1Q8TDC3 778 aa16.08■□□□□ 0.16
PACS1-201ENST00000320580 HTATIP2Q9BUP3 242 aa16.08■□□□□ 0.16
PACS1-201ENST00000320580 NANSQ9NR45 359 aa16.08■□□□□ 0.16
PACS1-201ENST00000320580 SLC39A1Q9NY26 324 aa16.08■□□□□ 0.16
PACS1-201ENST00000320580 COMMD9Q9P000 198 aa16.08■□□□□ 0.16
PACS1-201ENST00000320580 UTS2RQ9UKP6 389 aa16.08■□□□□ 0.16
PACS1-201ENST00000320580 LCHNA4D1U4 455 aa16.08■□□□□ 0.16
PACS1-201ENST00000320580 SBK3P0C264 359 aa16.08■□□□□ 0.16
PACS1-201ENST00000320580 ARSBP15848 533 aa16.08■□□□□ 0.16
PACS1-201ENST00000320580 ARSDP51689 593 aa16.08■□□□□ 0.16
PACS1-201ENST00000320580 NKX3-2P78367 333 aa16.08■□□□□ 0.16
PACS1-201ENST00000320580 RGS1Q08116 209 aa16.08■□□□□ 0.16
PACS1-201ENST00000320580 PCDH1Q08174 1060 aa16.08■□□□□ 0.16
PACS1-201ENST00000320580 GOLGA7Q7Z5G4 137 aa16.08■□□□□ 0.16
PACS1-201ENST00000320580 C11orf96Q7Z7L8 435 aa16.08■□□□□ 0.16
PACS1-201ENST00000320580 HJURPQ8NCD3 748 aaPredicted RBP16.08■□□□□ 0.16
PACS1-201ENST00000320580 TEX47Q8TBZ9 253 aa16.08■□□□□ 0.16
PACS1-201ENST00000320580 RBPMSQ93062 196 aaKnown RBP16.08■□□□□ 0.16
PACS1-201ENST00000320580 MAPKAP1Q9BPZ7 522 aa16.08■□□□□ 0.16
PACS1-201ENST00000320580 FZD8Q9H461 694 aa16.08■□□□□ 0.16
PACS1-201ENST00000320580 ASB8Q9H765 288 aa16.08■□□□□ 0.16
PACS1-201ENST00000320580 TMEM39AQ9NV64 488 aa16.08■□□□□ 0.16
PACS1-201ENST00000320580 F5H5T6 163 aa16.07■□□□□ 0.16
PACS1-201ENST00000320580 TPST2O60704 377 aa16.07■□□□□ 0.16
PACS1-201ENST00000320580 CYP17A1P05093 508 aa16.07■□□□□ 0.16
PACS1-201ENST00000320580 OGNP20774 298 aaKnown RBP16.07■□□□□ 0.16
PACS1-201ENST00000320580 PIK3CBP42338 1070 aa16.07■□□□□ 0.16
PACS1-201ENST00000320580 AVPR1BP47901 424 aa16.07■□□□□ 0.16
PACS1-201ENST00000320580 XKP51811 444 aa16.07■□□□□ 0.16
PACS1-201ENST00000320580 MBTD1Q05BQ5 628 aa16.07■□□□□ 0.16
PACS1-201ENST00000320580 KCTD20Q7Z5Y7 419 aa16.07■□□□□ 0.16
PACS1-201ENST00000320580 GANCQ8TET4 914 aa16.07■□□□□ 0.16
PACS1-201ENST00000320580 SERPINB11Q96P15 392 aa16.07■□□□□ 0.16
PACS1-201ENST00000320580 PKP4Q99569 1192 aa16.07■□□□□ 0.16
PACS1-201ENST00000320580 DERL2Q9GZP9 239 aa16.07■□□□□ 0.16
PACS1-201ENST00000320580 PIGUQ9H490 435 aa16.07■□□□□ 0.16
PACS1-201ENST00000320580 TAS2R3Q9NYW6 316 aa16.07■□□□□ 0.16
PACS1-201ENST00000320580 ACSL5Q9ULC5 683 aa16.07■□□□□ 0.16
PACS1-201ENST00000320580 ERVW-1Q9UQF0 538 aa16.07■□□□□ 0.16
PACS1-201ENST00000320580 CASTOR2A6NHX0 329 aa16.07■□□□□ 0.16
PACS1-201ENST00000320580 TRIM3O75382 744 aaPredicted RBP16.07■□□□□ 0.16
PACS1-201ENST00000320580 CLTBP09497 229 aa16.07■□□□□ 0.16
PACS1-201ENST00000320580 TYMPP19971 482 aa16.07■□□□□ 0.16
PACS1-201ENST00000320580 APEX1P27695 318 aaKnown RBP16.07■□□□□ 0.16
PACS1-201ENST00000320580 SCNN1AP37088 669 aa16.07■□□□□ 0.16
PACS1-201ENST00000320580 RAB8AP61006 207 aa16.07■□□□□ 0.16
PACS1-201ENST00000320580 PPIGQ13427 754 aaKnown RBP eCLIP16.07■□□□□ 0.165e-6■□□□□ 10.2
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PACS1-201ENST00000320580 FAM46DQ8NEK8 389 aa16.07■□□□□ 0.16
PACS1-201ENST00000320580 C12orf10Q9HB07 376 aa16.07■□□□□ 0.16
PACS1-201ENST00000320580 STON1Q9Y6Q2 735 aa16.07■□□□□ 0.16
PACS1-201ENST00000320580 CIB4A0PJX0 185 aa16.07■□□□□ 0.16
PACS1-201ENST00000320580 AXIN1O15169 862 aa16.07■□□□□ 0.16
PACS1-201ENST00000320580 FFAR2O15552 330 aa16.07■□□□□ 0.16
PACS1-201ENST00000320580 PEX10O60683 326 aa16.07■□□□□ 0.16
PACS1-201ENST00000320580 PAPSS2O95340 614 aaPredicted RBP16.07■□□□□ 0.16
PACS1-201ENST00000320580 PAHP00439 452 aa16.07■□□□□ 0.16
PACS1-201ENST00000320580 CREB5Q02930 508 aa16.07■□□□□ 0.16
PACS1-201ENST00000320580 TEAD4Q15561 434 aa16.07■□□□□ 0.16
PACS1-201ENST00000320580 CEP68Q76N32 757 aa16.07■□□□□ 0.16
PACS1-201ENST00000320580 ZFP41Q8N8Y5 198 aa16.07■□□□□ 0.16
PACS1-201ENST00000320580 BTN2A3PQ96KV6 586 aa16.07■□□□□ 0.16
PACS1-201ENST00000320580 FNDC11Q9BVV2 318 aa16.07■□□□□ 0.16
PACS1-201ENST00000320580 ALOXE3Q9BYJ1 711 aa16.07■□□□□ 0.16
PACS1-201ENST00000320580 PRG3Q9Y2Y8 225 aaPredicted RBP16.07■□□□□ 0.16
PACS1-201ENST00000320580 CACNA1SQ13698 1873 aa16.06■□□□□ 0.16
PACS1-201ENST00000320580 TEX13CA0A0J9YWL9 993 aa16.06■□□□□ 0.16
PACS1-201ENST00000320580 DISC1C4P0D8 188 aa16.06■□□□□ 0.16
PACS1-201ENST00000320580 ARHGAP33O14559 1287 aa16.06■□□□□ 0.16
PACS1-201ENST00000320580 CELF2O95319 508 aaKnown RBP16.06■□□□□ 0.16
PACS1-201ENST00000320580 PTPRAP18433 802 aa16.06■□□□□ 0.16
PACS1-201ENST00000320580 ITPKAP23677 461 aa16.06■□□□□ 0.16
PACS1-201ENST00000320580 SCNN1GP51170 649 aa16.06■□□□□ 0.16
PACS1-201ENST00000320580 SMCO1Q147U7 214 aa16.06■□□□□ 0.16
PACS1-201ENST00000320580 ABRAXAS2Q15018 415 aa16.06■□□□□ 0.16
PACS1-201ENST00000320580 PYCR3Q53H96 274 aa16.06■□□□□ 0.16
PACS1-201ENST00000320580 RHEBL1Q8TAI7 183 aa16.06■□□□□ 0.16
PACS1-201ENST00000320580 METTL2AQ96IZ6 378 aaKnown RBP16.06■□□□□ 0.16
PACS1-201ENST00000320580 FCRL4Q96PJ5 515 aa16.06■□□□□ 0.16
PACS1-201ENST00000320580 NELL2Q99435 816 aa16.06■□□□□ 0.16
PACS1-201ENST00000320580 TSNAXQ99598 290 aaKnown RBP16.06■□□□□ 0.16
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