RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000025354.3

Pggt1b-201, Transcript of Geranylgeranyl transferase type-1 subunit beta, mousemouse

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene Pggt1b, Length 2,736 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 FaddQ61160 205 aa12.23□□□□□ -0.45
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Ppp2r2bQ6ZWR4 443 aa12.23□□□□□ -0.45
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Dsg4Q7TMD7 1041 aa12.23□□□□□ -0.45
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Wfikkn2Q7TQN3 571 aa12.23□□□□□ -0.45
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 TiprlQ8BH58 271 aa12.23□□□□□ -0.45
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Gpr61Q8C010 449 aa12.23□□□□□ -0.45
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 SntnQ8C9X1 147 aa12.23□□□□□ -0.45
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Slc8a2Q8K596 921 aa12.23□□□□□ -0.45
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Ptgr1Q91YR9 329 aa12.23□□□□□ -0.45
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Msh4Q99MT2 958 aa12.23□□□□□ -0.45
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Creb3l4Q9D2A5 370 aa12.23□□□□□ -0.45
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Snx5Q9D8U8 404 aa12.23□□□□□ -0.45
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Aldh7a1Q9DBF1 539 aa12.23□□□□□ -0.45
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Sae1Q9R1T2 350 aa12.23□□□□□ -0.45
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Clic1Q9Z1Q5 241 aaKnown RBP12.23□□□□□ -0.45
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Pi4kaE9Q3L2 2105 aa12.23□□□□□ -0.45
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Lzts3A2AHG0 700 aa12.23□□□□□ -0.45
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Ajm1A2AJA9 974 aa12.23□□□□□ -0.45
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Gm8882E9Q7E4 283 aa12.23□□□□□ -0.45
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Cbx4O55187 551 aa12.23□□□□□ -0.45
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 PnpP23492 289 aa12.23□□□□□ -0.45
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 G6pdxQ00612 515 aa12.23□□□□□ -0.45
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Dok6Q2MHE5 331 aa12.23□□□□□ -0.45
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Lpcat1Q3TFD2 534 aa12.23□□□□□ -0.45
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Clca4bQ3UW98 925 aa12.23□□□□□ -0.45
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Trpc1Q61056 793 aa12.23□□□□□ -0.45
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Hesx1Q61658 185 aa12.23□□□□□ -0.45
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Apex2Q68G58 516 aa12.23□□□□□ -0.45
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Olfr1085Q7TR64 313 aa12.23□□□□□ -0.45
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Map4k5Q8BPM2 847 aaKnown RBP12.23□□□□□ -0.45
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Lpcat2Q8BYI6 544 aa12.23□□□□□ -0.45
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Scamp1Q8K021 338 aa12.23□□□□□ -0.45
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 CcsapQ8QZT2 252 aa12.23□□□□□ -0.45
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Slc29a4Q8R139 528 aa12.23□□□□□ -0.45
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Vmn1r185Q8R299 319 aa12.23□□□□□ -0.45
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 SelenomQ8VHC3 145 aa12.23□□□□□ -0.45
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Recql5Q8VID5 982 aa12.23□□□□□ -0.45
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Golga7Q91W53 137 aa12.23□□□□□ -0.45
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Mcm8Q9CWV1 833 aa12.23□□□□□ -0.45
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Ccdc77Q9CZH8 489 aa12.23□□□□□ -0.45
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Gm13090A2A899 111 aa12.22□□□□□ -0.45
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Olfr1006A2ALD2 312 aa12.22□□□□□ -0.45
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Rpl3lE9PWZ3 407 aa12.22□□□□□ -0.45
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Vmn2r8L7N472 848 aa12.22□□□□□ -0.45
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Bnc1O35914 961 aa12.22□□□□□ -0.45
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Gtf2h4O70422 463 aaKnown RBP12.22□□□□□ -0.45
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Tuba3aP05214 450 aaKnown RBP12.22□□□□□ -0.45
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 GzmcP08882 248 aa12.22□□□□□ -0.45
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Grik2P39087 908 aa12.22□□□□□ -0.45
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Slc19a1P41438 512 aa12.22□□□□□ -0.45
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Sat1P48026 171 aa12.22□□□□□ -0.45
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 CartptP56388 129 aa12.22□□□□□ -0.45
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 InhbbQ04999 411 aa12.22□□□□□ -0.45
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Cdkl4Q3TZA2 342 aa12.22□□□□□ -0.45
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Mapkapk3Q3UMW7 384 aa12.22□□□□□ -0.45
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 PtprnQ60673 979 aa12.22□□□□□ -0.45
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 PapolgQ6PCL9 739 aa12.22□□□□□ -0.45
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Olfr845Q7TRG2 312 aa12.22□□□□□ -0.45
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 RragdQ7TT45 449 aa12.22□□□□□ -0.45
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Ncs1Q8BNY6 190 aa12.22□□□□□ -0.45
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Cops8Q8VBV7 209 aa12.22□□□□□ -0.45
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Olfr807Q8VGI9 311 aa12.22□□□□□ -0.45
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Far1Q922J9 515 aa12.22□□□□□ -0.45
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 2610042L04RikQ9D073 150 aa12.22□□□□□ -0.45
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Slco1a4Q9EP96 670 aa12.22□□□□□ -0.45
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 PrepQ9QUR6 710 aa12.22□□□□□ -0.45
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Cst9Q9Z0H6 137 aa12.22□□□□□ -0.45
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Btbd35f28A2CFD5 498 aa12.22□□□□□ -0.45
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Mybpc1D3YU50 1127 aa12.22□□□□□ -0.45
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Apol11bE9PUZ0 337 aa12.22□□□□□ -0.45
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 2210016F16RikG3X8U3 338 aa12.22□□□□□ -0.45
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Btbd35f30J3QML3 498 aa12.22□□□□□ -0.45
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 AlyrefO08583 255 aaKnown RBP12.22□□□□□ -0.45
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Akap3O88987 864 aa12.22□□□□□ -0.45
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 mt-Co3P00416 261 aa12.22□□□□□ -0.45
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Nat1P50294 290 aa12.22□□□□□ -0.45
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Tgm3Q08189 693 aa12.22□□□□□ -0.45
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Scrn3Q3TMH2 418 aa12.22□□□□□ -0.45
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Defb48Q3UW22 87 aa12.22□□□□□ -0.45
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Elavl3Q60900 367 aaKnown RBP12.22□□□□□ -0.45
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Wbp4Q61048 376 aa12.22□□□□□ -0.45
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Nudcd1Q6PIP5 582 aa12.22□□□□□ -0.45
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 MtdhQ80WJ7 579 aaKnown RBP12.22□□□□□ -0.45
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Gykl1Q8C635 549 aa12.22□□□□□ -0.45
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Vps4aQ8VEJ9 437 aa12.22□□□□□ -0.45
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Olfr985Q8VGB4 311 aa12.22□□□□□ -0.45
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 GlyatQ91XE0 296 aa12.22□□□□□ -0.45
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Cts3Q91ZD5 332 aa12.22□□□□□ -0.45
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 PpidQ9CR16 370 aaKnown RBP12.22□□□□□ -0.45
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Ints11Q9CWS4 600 aa12.22□□□□□ -0.45
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Abcb8Q9CXJ4 717 aa12.22□□□□□ -0.45
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Pebp4Q9D9G2 242 aa12.22□□□□□ -0.45
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Fezf2Q9ESP5 455 aa12.22□□□□□ -0.45
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Anapc1P53995 1944 aaKnown RBP12.22□□□□□ -0.45
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Atg2bQ80XK6 2075 aa12.22□□□□□ -0.45
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Pkd2l1A2A259 760 aa12.21□□□□□ -0.45
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Zfp277E9Q6D6 583 aaKnown RBP12.21□□□□□ -0.45
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Vmn2r35E9Q7U8 861 aa12.21□□□□□ -0.45
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Alkal1J3QPP8 127 aa12.21□□□□□ -0.45
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Pdlim1O70400 327 aa12.21□□□□□ -0.45
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 26.5 ms