RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000620182.4

CPEB1-218, Transcript of cytoplasmic polyadenylation element binding protein 1, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene CPEB1, Length 2,422 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CPEB1-218ENST00000620182 KCNAB2Q13303 367 aa20.35■□□□□ 0.85
CPEB1-218ENST00000620182 ZC3H12BQ5HYM0 836 aaKnown RBP20.35■□□□□ 0.85
CPEB1-218ENST00000620182 OR2T5Q6IEZ7 315 aa20.35■□□□□ 0.85
CPEB1-218ENST00000620182 ZNF773Q6PK81 442 aa20.35■□□□□ 0.85
CPEB1-218ENST00000620182 ADAMTSL4Q6UY14 1074 aa20.35■□□□□ 0.85
CPEB1-218ENST00000620182 KCTD8Q6ZWB6 473 aa20.35■□□□□ 0.85
CPEB1-218ENST00000620182 CBLL1Q75N03 491 aa20.35■□□□□ 0.85
CPEB1-218ENST00000620182 TMEM179BQ7Z7N9 219 aa20.35■□□□□ 0.85
CPEB1-218ENST00000620182 SYNPOQ8N3V7 929 aa20.35■□□□□ 0.85
CPEB1-218ENST00000620182 OR2T29Q8NH02 315 aa20.35■□□□□ 0.85
CPEB1-218ENST00000620182 HDAC2Q92769 488 aaKnown RBP20.35■□□□□ 0.85
CPEB1-218ENST00000620182 POLR1BQ9H9Y6 1135 aa20.35■□□□□ 0.85
CPEB1-218ENST00000620182 ERVK-11Q9UQG0 969 aa20.35■□□□□ 0.85
CPEB1-218ENST00000620182 ASF1AQ9Y294 204 aa20.35■□□□□ 0.85
CPEB1-218ENST00000620182 C1orf226A1L170 272 aa20.34■□□□□ 0.85
CPEB1-218ENST00000620182 EPHX1P07099 455 aa20.34■□□□□ 0.85
CPEB1-218ENST00000620182 KELP23276 732 aa20.34■□□□□ 0.85
CPEB1-218ENST00000620182 IL12RB1P42701 662 aa20.34■□□□□ 0.85
CPEB1-218ENST00000620182 GET4Q7L5D6 327 aaPredicted RBP20.34■□□□□ 0.85
CPEB1-218ENST00000620182 OR10Q1Q8NGQ4 319 aa20.34■□□□□ 0.85
CPEB1-218ENST00000620182 TUBA1CQ9BQE3 449 aa20.34■□□□□ 0.85
CPEB1-218ENST00000620182 AMBRA1Q9C0C7 1298 aa20.34■□□□□ 0.85
CPEB1-218ENST00000620182 GABARAPL1Q9H0R8 117 aa20.34■□□□□ 0.85
CPEB1-218ENST00000620182 TRPV4Q9HBA0 871 aa20.34■□□□□ 0.85
CPEB1-218ENST00000620182 U3KQV3 271 aa20.34■□□□□ 0.85
CPEB1-218ENST00000620182 MUC22E2RYF6 1773 aaPredicted RBP20.34■□□□□ 0.85
CPEB1-218ENST00000620182 EPOPA6NHQ4 379 aa20.34■□□□□ 0.85
CPEB1-218ENST00000620182 ABCB1P08183 1280 aaPredicted RBP20.34■□□□□ 0.85
CPEB1-218ENST00000620182 PCSK6P29122 969 aa20.34■□□□□ 0.85
CPEB1-218ENST00000620182 PIK3CBP42338 1070 aa20.34■□□□□ 0.85
CPEB1-218ENST00000620182 IL18R1Q13478 541 aa20.34■□□□□ 0.85
CPEB1-218ENST00000620182 DUSP6Q16828 381 aa20.34■□□□□ 0.85
CPEB1-218ENST00000620182 BROXQ5VW32 411 aa20.34■□□□□ 0.85
CPEB1-218ENST00000620182 COMMD6Q7Z4G1 85 aa20.34■□□□□ 0.85
CPEB1-218ENST00000620182 C11orf96Q7Z7L8 435 aa20.34■□□□□ 0.85
CPEB1-218ENST00000620182 PDZD3Q86UT5 571 aa20.34■□□□□ 0.85
CPEB1-218ENST00000620182 OR4A15Q8NGL6 344 aa20.34■□□□□ 0.85
CPEB1-218ENST00000620182 ZFP90Q8TF47 636 aa20.34■□□□□ 0.85
CPEB1-218ENST00000620182 COX14Q96I36 57 aa20.34■□□□□ 0.85
CPEB1-218ENST00000620182 OR52A5Q9H2C5 316 aa20.34■□□□□ 0.85
CPEB1-218ENST00000620182 CXorf21Q9HAI6 301 aa20.34■□□□□ 0.85
CPEB1-218ENST00000620182 TIMMDC1Q9NPL8 285 aa20.34■□□□□ 0.85
CPEB1-218ENST00000620182 PRSS16Q9NQE7 514 aa20.34■□□□□ 0.85
CPEB1-218ENST00000620182 THAP10Q9P2Z0 257 aaPredicted RBP20.34■□□□□ 0.85
CPEB1-218ENST00000620182 BLOC1S6Q9UL45 172 aa20.34■□□□□ 0.85
CPEB1-218ENST00000620182 SH2B3Q9UQQ2 575 aa20.34■□□□□ 0.85
CPEB1-218ENST00000620182 TSC22D4Q9Y3Q8 395 aa20.34■□□□□ 0.85
CPEB1-218ENST00000620182 MYO7AQ13402 2215 aa20.34■□□□□ 0.85
CPEB1-218ENST00000620182 YAP1P46937 504 aaKnown RBP20.33■□□□□ 0.85
CPEB1-218ENST00000620182 PPP1R8Q12972 351 aaKnown RBP20.33■□□□□ 0.85
CPEB1-218ENST00000620182 PRAMEF14Q5SWL7 426 aa20.33■□□□□ 0.85
CPEB1-218ENST00000620182 PRAMEF13Q5VWM6 474 aa20.33■□□□□ 0.85
CPEB1-218ENST00000620182 LCTLQ6UWM7 567 aa20.33■□□□□ 0.85
CPEB1-218ENST00000620182 AMZ2Q86W34 360 aa20.33■□□□□ 0.85
CPEB1-218ENST00000620182 DCP2Q8IU60 420 aaKnown RBP20.33■□□□□ 0.85
CPEB1-218ENST00000620182 SFTPA1Q8IWL2 248 aa20.33■□□□□ 0.85
CPEB1-218ENST00000620182 ZNF420Q8TAQ5 688 aaPredicted RBP20.33■□□□□ 0.85
CPEB1-218ENST00000620182 ADNPQ9H2P0 1102 aa20.33■□□□□ 0.85
CPEB1-218ENST00000620182 LOC100130705A0A1B0GUX0 176 aa20.33■□□□□ 0.84
CPEB1-218ENST00000620182 FKBP9O95302 570 aa20.33■□□□□ 0.84
CPEB1-218ENST00000620182 C1QCP02747 245 aa20.33■□□□□ 0.84
CPEB1-218ENST00000620182 SEMG1P04279 462 aa20.33■□□□□ 0.84
CPEB1-218ENST00000620182 EFNA1P20827 205 aaPredicted RBP20.33■□□□□ 0.84
CPEB1-218ENST00000620182 PRKACGP22612 351 aa20.33■□□□□ 0.84
CPEB1-218ENST00000620182 CNTN1Q12860 1018 aa20.33■□□□□ 0.84
CPEB1-218ENST00000620182 TOP3AQ13472 1001 aaPredicted RBP20.33■□□□□ 0.84
CPEB1-218ENST00000620182 DCUN1D3Q8IWE4 304 aa20.33■□□□□ 0.84
CPEB1-218ENST00000620182 CHPFQ8IZ52 775 aa20.33■□□□□ 0.84
CPEB1-218ENST00000620182 ISOC1Q96CN7 298 aa20.33■□□□□ 0.84
CPEB1-218ENST00000620182 DPH2Q9BQC3 489 aaPredicted RBP20.33■□□□□ 0.84
CPEB1-218ENST00000620182 LMAN2LQ9H0V9 348 aa20.33■□□□□ 0.84
CPEB1-218ENST00000620182 TMEM98Q9Y2Y6 226 aa20.33■□□□□ 0.84
CPEB1-218ENST00000620182 PCDHGA8Q9Y5G5 932 aa20.33■□□□□ 0.84
CPEB1-218ENST00000620182 TGFB1P01137 390 aa20.32■□□□□ 0.84
CPEB1-218ENST00000620182 RPN2P04844 631 aa20.32■□□□□ 0.84
CPEB1-218ENST00000620182 PIGAP37287 484 aa20.32■□□□□ 0.84
CPEB1-218ENST00000620182 PMS2P3Q13401 168 aa20.32■□□□□ 0.84
CPEB1-218ENST00000620182 CAMK2GQ13555 558 aaPredicted RBP20.32■□□□□ 0.84
CPEB1-218ENST00000620182 RGNQ15493 299 aa20.32■□□□□ 0.84
CPEB1-218ENST00000620182 TEAD4Q15561 434 aa20.32■□□□□ 0.84
CPEB1-218ENST00000620182 PNCKQ6P2M8 343 aa20.32■□□□□ 0.84
CPEB1-218ENST00000620182 FAM83HQ6ZRV2 1179 aaPredicted RBP20.32■□□□□ 0.84
CPEB1-218ENST00000620182 ARMCX6Q7L4S7 300 aa20.32■□□□□ 0.84
CPEB1-218ENST00000620182 KRT78Q8N1N4 520 aa20.32■□□□□ 0.84
CPEB1-218ENST00000620182 PUM2Q8TB72 1066 aaKnown RBP eCLIP20.32■□□□□ 0.84
CPEB1-218ENST00000620182 HSH2DQ96JZ2 352 aa20.32■□□□□ 0.84
CPEB1-218ENST00000620182 CHST8Q9H2A9 424 aa20.32■□□□□ 0.84
CPEB1-218ENST00000620182 SLC28A3Q9HAS3 691 aa20.32■□□□□ 0.84
CPEB1-218ENST00000620182 ABCG2Q9UNQ0 655 aa20.32■□□□□ 0.84
CPEB1-218ENST00000620182 SLC16A6O15403 523 aa20.32■□□□□ 0.84
CPEB1-218ENST00000620182 DNAJA1P31689 397 aaKnown RBP20.32■□□□□ 0.84
CPEB1-218ENST00000620182 OPRD1P41143 372 aa20.32■□□□□ 0.84
CPEB1-218ENST00000620182 RPS6KA3P51812 740 aa20.32■□□□□ 0.84
CPEB1-218ENST00000620182 RAB39AQ14964 217 aa20.32■□□□□ 0.84
CPEB1-218ENST00000620182 LRRTM4Q86VH4 590 aa20.32■□□□□ 0.84
CPEB1-218ENST00000620182 HORMAD1Q86X24 394 aa20.32■□□□□ 0.84
CPEB1-218ENST00000620182 METTL4Q8N3J2 472 aa20.32■□□□□ 0.84
CPEB1-218ENST00000620182 PLA2G15Q8NCC3 412 aa20.32■□□□□ 0.84
CPEB1-218ENST00000620182 GOT1L1Q8NHS2 421 aaPredicted RBP20.32■□□□□ 0.84
CPEB1-218ENST00000620182 CNDP2Q96KP4 475 aaKnown RBP20.32■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 29.2 ms