RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000602290.1

HCG18-241, Transcript of HLA complex group 18, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene HCG18, Length 821 nt, Biotype antisense RNA, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HCG18-241ENST00000602290 PCBP2Q15366 365 aaKnown RBP eCLIP11.12□□□□□ -0.635e-7■■■■□ 23.9
HCG18-241ENST00000602290 KRTAP24-1Q3LI83 254 aa11.12□□□□□ -0.63
HCG18-241ENST00000602290 C2CD6Q53TS8 623 aa11.12□□□□□ -0.63
HCG18-241ENST00000602290 LRRC8BQ6P9F7 803 aa11.12□□□□□ -0.63
HCG18-241ENST00000602290 SLC2A7Q6PXP3 512 aa11.12□□□□□ -0.63
HCG18-241ENST00000602290 COX15Q7KZN9 410 aa11.12□□□□□ -0.63
HCG18-241ENST00000602290 LRRC6Q86X45 466 aa11.12□□□□□ -0.63
HCG18-241ENST00000602290 GHDCQ8N2G8 530 aa11.12□□□□□ -0.63
HCG18-241ENST00000602290 EME1Q96AY2 570 aa11.12□□□□□ -0.63
HCG18-241ENST00000602290 NMD3Q96D46 503 aaKnown RBP11.12□□□□□ -0.63
HCG18-241ENST00000602290 C18orf8Q96DM3 657 aa11.12□□□□□ -0.63
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HCG18-241ENST00000602290 SLC26A1Q9H2B4 701 aa11.12□□□□□ -0.63
HCG18-241ENST00000602290 GANQ9H2C0 597 aa11.12□□□□□ -0.63
HCG18-241ENST00000602290 CCDC68Q9H2F9 335 aa11.12□□□□□ -0.63
HCG18-241ENST00000602290 PLEKHF2Q9H8W4 249 aa11.12□□□□□ -0.63
HCG18-241ENST00000602290 TRIM39Q9HCM9 518 aa11.12□□□□□ -0.63
HCG18-241ENST00000602290 UBE2TQ9NPD8 197 aaPredicted RBP11.12□□□□□ -0.63
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HCG18-241ENST00000602290 PACSIN2Q9UNF0 486 aaPredicted RBP11.12□□□□□ -0.63
HCG18-241ENST00000602290 FAF1Q9UNN5 650 aaPredicted RBP11.12□□□□□ -0.63
HCG18-241ENST00000602290 SNX24Q9Y343 169 aa11.12□□□□□ -0.63
HCG18-241ENST00000602290 HRH3Q9Y5N1 445 aa11.12□□□□□ -0.63
HCG18-241ENST00000602290 ARHGAP42A6NI28 874 aa11.11□□□□□ -0.63
HCG18-241ENST00000602290 NPIPA5E9PKD4 350 aa11.11□□□□□ -0.63
HCG18-241ENST00000602290 FAM227AF5H4B4 570 aa11.11□□□□□ -0.63
HCG18-241ENST00000602290 GOLGA8SH3BPF8 625 aa11.11□□□□□ -0.63
HCG18-241ENST00000602290 PRRG2O14669 202 aa11.11□□□□□ -0.63
HCG18-241ENST00000602290 ASNA1O43681 348 aa11.11□□□□□ -0.63
HCG18-241ENST00000602290 SPAG7O75391 227 aa11.11□□□□□ -0.63
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HCG18-241ENST00000602290 MLYCDO95822 493 aa11.11□□□□□ -0.63
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HCG18-241ENST00000602290 PEX11BO96011 259 aa11.11□□□□□ -0.63
HCG18-241ENST00000602290 TFAP2AP05549 437 aa11.11□□□□□ -0.63
HCG18-241ENST00000602290 CTSBP07858 339 aa11.11□□□□□ -0.63
HCG18-241ENST00000602290 VCLP18206 1134 aa11.11□□□□□ -0.63
HCG18-241ENST00000602290 RFC1P35251 1148 aaPredicted RBP11.11□□□□□ -0.63
HCG18-241ENST00000602290 PTPN9P43378 593 aa11.11□□□□□ -0.63
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HCG18-241ENST00000602290 SPINT3P49223 89 aa11.11□□□□□ -0.63
HCG18-241ENST00000602290 TMED10P49755 219 aaKnown RBP11.11□□□□□ -0.63
HCG18-241ENST00000602290 ALDH6A1Q02252 535 aaKnown RBP11.11□□□□□ -0.63
HCG18-241ENST00000602290 IL10RBQ08334 325 aa11.11□□□□□ -0.63
HCG18-241ENST00000602290 CALCOCO2Q13137 446 aa11.11□□□□□ -0.63
HCG18-241ENST00000602290 OLIG2Q13516 323 aa11.11□□□□□ -0.63
HCG18-241ENST00000602290 PDK3Q15120 406 aa11.11□□□□□ -0.63
HCG18-241ENST00000602290 NKG7Q16617 165 aa11.11□□□□□ -0.63
HCG18-241ENST00000602290 ARMC12Q5T9G4 340 aa11.11□□□□□ -0.63
HCG18-241ENST00000602290 ATG9BQ674R7 924 aa11.11□□□□□ -0.63
HCG18-241ENST00000602290 NIPAL1Q6NVV3 410 aa11.11□□□□□ -0.63
HCG18-241ENST00000602290 ALKBH5Q6P6C2 394 aaKnown RBP11.11□□□□□ -0.63
HCG18-241ENST00000602290 ENOSF1Q7L5Y1 443 aa11.11□□□□□ -0.63
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HCG18-241ENST00000602290 GPR135Q8IZ08 494 aa11.11□□□□□ -0.63
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HCG18-241ENST00000602290 SP110Q9HB58 689 aa11.11□□□□□ -0.63
HCG18-241ENST00000602290 ZNF160Q9HCG1 818 aa11.11□□□□□ -0.63
HCG18-241ENST00000602290 TBC1D23Q9NUY8 699 aa11.11□□□□□ -0.63
HCG18-241ENST00000602290 CRIM1Q9NZV1 1036 aa11.11□□□□□ -0.63
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HCG18-241ENST00000602290 CARD8Q9Y2G2 431 aa11.11□□□□□ -0.63
HCG18-241ENST00000602290 SBDSQ9Y3A5 250 aaKnown RBP eCLIP11.11□□□□□ -0.63
HCG18-241ENST00000602290 ZNF711Q9Y462 761 aa11.11□□□□□ -0.63
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HCG18-241ENST00000602290 CDK9P50750 372 aaKnown RBP11.1□□□□□ -0.63
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HCG18-241ENST00000602290 TMPRSS15P98073 1019 aa11.1□□□□□ -0.63
HCG18-241ENST00000602290 CETN1Q12798 172 aa11.1□□□□□ -0.63
HCG18-241ENST00000602290 CBLBQ13191 982 aa11.1□□□□□ -0.63
HCG18-241ENST00000602290 APOFQ13790 326 aa11.1□□□□□ -0.63
HCG18-241ENST00000602290 MPP2Q14168 576 aa11.1□□□□□ -0.63
HCG18-241ENST00000602290 RBBP7Q16576 425 aa11.1□□□□□ -0.63
HCG18-241ENST00000602290 ZNF766Q5HY98 468 aa11.1□□□□□ -0.63
HCG18-241ENST00000602290 C11orf63Q6NUN7 778 aa11.1□□□□□ -0.63
HCG18-241ENST00000602290 ZNF449Q6P9G9 518 aa11.1□□□□□ -0.63
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