RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000504440.1

NPHP3-AS1-202, NPHP3 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene NPHP3-AS1, Length 2,507 nt, Biotype antisense RNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NPHP3-AS1-202ENST00000504440 TRBV5-3A0A0A0MS03 114 aa6.37□□□□□ -1.39
NPHP3-AS1-202ENST00000504440 ILVBLA1L0T0 632 aa6.37□□□□□ -1.39
NPHP3-AS1-202ENST00000504440 ZNF840PA6NDX5 716 aa6.37□□□□□ -1.39
NPHP3-AS1-202ENST00000504440 ZNF99A8MXY4 864 aaPredicted RBP6.37□□□□□ -1.39
NPHP3-AS1-202ENST00000504440 MYO1GB0I1T2 1018 aa6.37□□□□□ -1.39
NPHP3-AS1-202ENST00000504440 BCKDKO14874 412 aa6.37□□□□□ -1.39
NPHP3-AS1-202ENST00000504440 RGS14O43566 566 aa6.37□□□□□ -1.39
NPHP3-AS1-202ENST00000504440 SH3BGRLO75368 114 aa6.37□□□□□ -1.39
NPHP3-AS1-202ENST00000504440 SCG5P05408 212 aa6.37□□□□□ -1.39
NPHP3-AS1-202ENST00000504440 CD3EP07766 207 aa6.37□□□□□ -1.39
NPHP3-AS1-202ENST00000504440 POU3F2P20265 443 aaPredicted RBP6.37□□□□□ -1.39
NPHP3-AS1-202ENST00000504440 CDH3P22223 829 aa6.37□□□□□ -1.39
NPHP3-AS1-202ENST00000504440 GSSP48637 474 aa6.37□□□□□ -1.39
NPHP3-AS1-202ENST00000504440 NCS1P62166 190 aa6.37□□□□□ -1.39
NPHP3-AS1-202ENST00000504440 ZXDBP98169 803 aa6.37□□□□□ -1.39
NPHP3-AS1-202ENST00000504440 TUBA3CQ13748 450 aa6.37□□□□□ -1.39
NPHP3-AS1-202ENST00000504440 NPTX1Q15818 432 aa6.37□□□□□ -1.39
NPHP3-AS1-202ENST00000504440 CHRNA6Q15825 494 aa6.37□□□□□ -1.39
NPHP3-AS1-202ENST00000504440 RGS21Q2M5E4 152 aa6.37□□□□□ -1.39
NPHP3-AS1-202ENST00000504440 DOK6Q6PKX4 331 aa6.37□□□□□ -1.39
NPHP3-AS1-202ENST00000504440 Q6ZPB1 254 aaPredicted RBP6.37□□□□□ -1.39
NPHP3-AS1-202ENST00000504440 DSG4Q86SJ6 1040 aa6.37□□□□□ -1.39
NPHP3-AS1-202ENST00000504440 GPR149Q86SP6 731 aa6.37□□□□□ -1.39
NPHP3-AS1-202ENST00000504440 ADAMTSL2Q86TH1 951 aa6.37□□□□□ -1.39
NPHP3-AS1-202ENST00000504440 TSPAN33Q86UF1 283 aa6.37□□□□□ -1.39
NPHP3-AS1-202ENST00000504440 APCDD1Q8J025 514 aa6.37□□□□□ -1.39
NPHP3-AS1-202ENST00000504440 OR5K1Q8NHB7 308 aa6.37□□□□□ -1.39
NPHP3-AS1-202ENST00000504440 PIH1D2Q8WWB5 315 aa6.37□□□□□ -1.39
NPHP3-AS1-202ENST00000504440 PPP1R14BQ96C90 147 aa6.37□□□□□ -1.39
NPHP3-AS1-202ENST00000504440 FAM120BQ96EK7 910 aaKnown RBP6.37□□□□□ -1.39
NPHP3-AS1-202ENST00000504440 SLC22A12Q96S37 553 aa6.37□□□□□ -1.39
NPHP3-AS1-202ENST00000504440 SMAD5Q99717 465 aaKnown RBP6.37□□□□□ -1.39
NPHP3-AS1-202ENST00000504440 CPPED1Q9BRF8 314 aaPredicted RBP6.37□□□□□ -1.39
NPHP3-AS1-202ENST00000504440 CLPBQ9H078 707 aa6.37□□□□□ -1.39
NPHP3-AS1-202ENST00000504440 EPS8L2Q9H6S3 715 aa6.37□□□□□ -1.39
NPHP3-AS1-202ENST00000504440 PAK6Q9NQU5 681 aaPredicted RBP6.37□□□□□ -1.39
NPHP3-AS1-202ENST00000504440 RASSF1Q9NS23 344 aa6.37□□□□□ -1.39
NPHP3-AS1-202ENST00000504440 DNMT3BQ9UBC3 853 aaKnown RBP6.37□□□□□ -1.39
NPHP3-AS1-202ENST00000504440 MTRRQ9UBK8 725 aa6.37□□□□□ -1.39
NPHP3-AS1-202ENST00000504440 DAPK2Q9UIK4 370 aa6.37□□□□□ -1.39
NPHP3-AS1-202ENST00000504440 SNX5Q9Y5X3 404 aa6.37□□□□□ -1.39
NPHP3-AS1-202ENST00000504440 CPQQ9Y646 472 aa6.37□□□□□ -1.39
NPHP3-AS1-202ENST00000504440 CHD5Q8TDI0 1954 aa6.36□□□□□ -1.39
NPHP3-AS1-202ENST00000504440 C16orf96A6NNT2 1141 aa6.36□□□□□ -1.39
NPHP3-AS1-202ENST00000504440 TMEM189-UBE2V1I3L0A0 370 aa6.36□□□□□ -1.39
NPHP3-AS1-202ENST00000504440 SYN3O14994 580 aa6.36□□□□□ -1.39
NPHP3-AS1-202ENST00000504440 INPPL1O15357 1258 aa6.36□□□□□ -1.39
NPHP3-AS1-202ENST00000504440 PRAMEF4O60810 478 aa6.36□□□□□ -1.39
NPHP3-AS1-202ENST00000504440 TBL1XO60907 577 aa6.36□□□□□ -1.39
NPHP3-AS1-202ENST00000504440 UGT2B11O75310 529 aa6.36□□□□□ -1.39
NPHP3-AS1-202ENST00000504440 CLDN11O75508 207 aa6.36□□□□□ -1.39
NPHP3-AS1-202ENST00000504440 JRKO75564 520 aa6.36□□□□□ -1.39
NPHP3-AS1-202ENST00000504440 SEC24AO95486 1093 aa6.36□□□□□ -1.39
NPHP3-AS1-202ENST00000504440 ANGPTL1O95841 491 aa6.36□□□□□ -1.39
NPHP3-AS1-202ENST00000504440 FADS2O95864 444 aaKnown RBP6.36□□□□□ -1.39
NPHP3-AS1-202ENST00000504440 HPRP00739 348 aa6.36□□□□□ -1.39
NPHP3-AS1-202ENST00000504440 MT-ND2P03891 347 aa6.36□□□□□ -1.39
NPHP3-AS1-202ENST00000504440 THBDP07204 575 aa6.36□□□□□ -1.39
NPHP3-AS1-202ENST00000504440 FAM87AP0C7U9 286 aa6.36□□□□□ -1.39
NPHP3-AS1-202ENST00000504440 BPIP17213 487 aa6.36□□□□□ -1.39
NPHP3-AS1-202ENST00000504440 PTPN6P29350 595 aa6.36□□□□□ -1.39
NPHP3-AS1-202ENST00000504440 HPCAL1P37235 193 aa6.36□□□□□ -1.39
NPHP3-AS1-202ENST00000504440 CASP9P55211 416 aa6.36□□□□□ -1.39
NPHP3-AS1-202ENST00000504440 RHOAP61586 193 aa6.36□□□□□ -1.39
NPHP3-AS1-202ENST00000504440 FOXD4Q12950 439 aaPredicted RBP6.36□□□□□ -1.39
NPHP3-AS1-202ENST00000504440 CARTPTQ16568 116 aa6.36□□□□□ -1.39
NPHP3-AS1-202ENST00000504440 TCTN1Q2MV58 587 aa6.36□□□□□ -1.39
NPHP3-AS1-202ENST00000504440 LRRC73Q5JTD7 316 aa6.36□□□□□ -1.39
NPHP3-AS1-202ENST00000504440 CACHD1Q5VU97 1274 aa6.36□□□□□ -1.39
NPHP3-AS1-202ENST00000504440 PRAMEF9Q5VWM5 478 aa6.36□□□□□ -1.39
NPHP3-AS1-202ENST00000504440 OR4F3Q6IEY1 312 aa6.36□□□□□ -1.39
NPHP3-AS1-202ENST00000504440 FUT10Q6P4F1 479 aa6.36□□□□□ -1.39
NPHP3-AS1-202ENST00000504440 ABHD17CQ6PCB6 329 aa6.36□□□□□ -1.39
NPHP3-AS1-202ENST00000504440 MAMDC2Q7Z304 686 aaPredicted RBP6.36□□□□□ -1.39
NPHP3-AS1-202ENST00000504440 ZSWIM9Q86XI8 627 aa6.36□□□□□ -1.39
NPHP3-AS1-202ENST00000504440 CALHM3Q86XJ0 350 aa6.36□□□□□ -1.39
NPHP3-AS1-202ENST00000504440 ANKRD13BQ86YJ7 626 aa6.36□□□□□ -1.39
NPHP3-AS1-202ENST00000504440 ZDHHC21Q8IVQ6 265 aa6.36□□□□□ -1.39
NPHP3-AS1-202ENST00000504440 EID3Q8N140 333 aa6.36□□□□□ -1.39
NPHP3-AS1-202ENST00000504440 PAF1Q8N7H5 531 aa6.36□□□□□ -1.39
NPHP3-AS1-202ENST00000504440 KREMEN2Q8NCW0 462 aa6.36□□□□□ -1.39
NPHP3-AS1-202ENST00000504440 TAMM41Q96BW9 452 aa6.36□□□□□ -1.39
NPHP3-AS1-202ENST00000504440 ULK4Q96C45 1275 aa6.36□□□□□ -1.39
NPHP3-AS1-202ENST00000504440 APIPQ96GX9 242 aa6.36□□□□□ -1.39
NPHP3-AS1-202ENST00000504440 PDLIM5Q96HC4 596 aaKnown RBP6.36□□□□□ -1.39
NPHP3-AS1-202ENST00000504440 PYURFQ96I23 114 aa6.36□□□□□ -1.39
NPHP3-AS1-202ENST00000504440 SPATA17Q96L03 361 aa6.36□□□□□ -1.39
NPHP3-AS1-202ENST00000504440 HERC2P3Q9BVR0 1158 aa6.36□□□□□ -1.39
NPHP3-AS1-202ENST00000504440 EBPLQ9BY08 206 aa6.36□□□□□ -1.39
NPHP3-AS1-202ENST00000504440 C1orf109Q9NX04 203 aa6.36□□□□□ -1.39
NPHP3-AS1-202ENST00000504440 USE1Q9NZ43 259 aa6.36□□□□□ -1.39
NPHP3-AS1-202ENST00000504440 CLEC4EQ9ULY5 219 aa6.36□□□□□ -1.39
NPHP3-AS1-202ENST00000504440 OARD1Q9Y530 152 aa6.36□□□□□ -1.39
NPHP3-AS1-202ENST00000504440 DYTNA2CJ06 578 aa6.36□□□□□ -1.39
NPHP3-AS1-202ENST00000504440 TMEM221A6NGB7 291 aa6.36□□□□□ -1.39
NPHP3-AS1-202ENST00000504440 OR6C75A6NL08 312 aa6.36□□□□□ -1.39
NPHP3-AS1-202ENST00000504440 H7C0S8 307 aa6.36□□□□□ -1.39
NPHP3-AS1-202ENST00000504440 PFDN6O15212 129 aa6.36□□□□□ -1.39
NPHP3-AS1-202ENST00000504440 YY2O15391 372 aa6.36□□□□□ -1.39
NPHP3-AS1-202ENST00000504440 SCELO95171 688 aa6.36□□□□□ -1.39
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 46.3 ms