RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000369864.4

AMIGO1-202, Transcript of adhesion molecule with Ig like domain 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene AMIGO1, Length 5,088 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AMIGO1-202ENST00000369864 OR2L2Q8NH16 312 aa18.05■□□□□ 0.48
AMIGO1-202ENST00000369864 CLCC1Q96S66 551 aa18.05■□□□□ 0.48
AMIGO1-202ENST00000369864 PEBP4Q96S96 227 aa18.05■□□□□ 0.48
AMIGO1-202ENST00000369864 MYOCQ99972 504 aa18.05■□□□□ 0.48
AMIGO1-202ENST00000369864 TSSK6Q9BXA6 273 aa18.05■□□□□ 0.48
AMIGO1-202ENST00000369864 SAV1Q9H4B6 383 aaPredicted RBP18.05■□□□□ 0.48
AMIGO1-202ENST00000369864 RPLP0P6Q8NHW5 317 aa18.05■□□□□ 0.48
AMIGO1-202ENST00000369864 OXCT2Q9BYC2 517 aaPredicted RBP18.05■□□□□ 0.48
AMIGO1-202ENST00000369864 PRSS51A0A1B0GVH4 220 aa18.05■□□□□ 0.48
AMIGO1-202ENST00000369864 TTC24A2A3L6 582 aaPredicted RBP18.05■□□□□ 0.48
AMIGO1-202ENST00000369864 TGFB1P01137 390 aa18.05■□□□□ 0.48
AMIGO1-202ENST00000369864 DGKGP49619 791 aa18.05■□□□□ 0.48
AMIGO1-202ENST00000369864 ZNF630Q2M218 657 aaPredicted RBP18.05■□□□□ 0.48
AMIGO1-202ENST00000369864 DUS1LQ6P1R4 473 aaKnown RBP18.05■□□□□ 0.48
AMIGO1-202ENST00000369864 TMEM220Q6QAJ8 160 aa18.05■□□□□ 0.48
AMIGO1-202ENST00000369864 COX18Q8N8Q8 333 aa18.05■□□□□ 0.48
AMIGO1-202ENST00000369864 C2CD4AQ8NCU7 369 aaPredicted RBP18.05■□□□□ 0.48
AMIGO1-202ENST00000369864 CLEC4DQ8WXI8 215 aa18.05■□□□□ 0.48
AMIGO1-202ENST00000369864 MAFIPQ8WZ33 124 aa18.05■□□□□ 0.48
AMIGO1-202ENST00000369864 ZNF558Q96NG5 402 aa18.05■□□□□ 0.48
AMIGO1-202ENST00000369864 PTPRJQ12913 1337 aa18.05■□□□□ 0.48
AMIGO1-202ENST00000369864 ZNF541Q9H0D2 1346 aa18.05■□□□□ 0.48
AMIGO1-202ENST00000369864 NEDD8-MDP1E9PL57 170 aa18.05■□□□□ 0.48
AMIGO1-202ENST00000369864 SNNO75324 88 aaPredicted RBP18.05■□□□□ 0.48
AMIGO1-202ENST00000369864 RB1P06400 928 aa18.05■□□□□ 0.48
AMIGO1-202ENST00000369864 CELP19835 753 aa18.05■□□□□ 0.48
AMIGO1-202ENST00000369864 IVDP26440 423 aa18.05■□□□□ 0.48
AMIGO1-202ENST00000369864 GABRR2P28476 465 aa18.05■□□□□ 0.48
AMIGO1-202ENST00000369864 NCBP2P52298 156 aaKnown RBP eCLIP18.05■□□□□ 0.48
AMIGO1-202ENST00000369864 GRB7Q14451 532 aa18.05■□□□□ 0.48
AMIGO1-202ENST00000369864 SPIN4Q56A73 249 aa18.05■□□□□ 0.48
AMIGO1-202ENST00000369864 TREML2Q5T2D2 321 aa18.05■□□□□ 0.48
AMIGO1-202ENST00000369864 UBE2UQ5VVX9 321 aa18.05■□□□□ 0.48
AMIGO1-202ENST00000369864 PYHIN1Q6K0P9 492 aa18.05■□□□□ 0.48
AMIGO1-202ENST00000369864 PNCKQ6P2M8 343 aa18.05■□□□□ 0.48
AMIGO1-202ENST00000369864 LRRC70Q7Z2Q7 622 aa18.05■□□□□ 0.48
AMIGO1-202ENST00000369864 DEDD2Q8WXF8 326 aa18.05■□□□□ 0.48
AMIGO1-202ENST00000369864 UTP4Q969X6 686 aaKnown RBP18.05■□□□□ 0.48
AMIGO1-202ENST00000369864 MOCOSQ96EN8 888 aa18.05■□□□□ 0.48
AMIGO1-202ENST00000369864 S100A16Q96FQ6 103 aaKnown RBP18.05■□□□□ 0.48
AMIGO1-202ENST00000369864 HYLS1Q96M11 299 aa18.05■□□□□ 0.48
AMIGO1-202ENST00000369864 YIPF4Q9BSR8 244 aa18.05■□□□□ 0.48
AMIGO1-202ENST00000369864 PLATP00750 562 aa18.04■□□□□ 0.48
AMIGO1-202ENST00000369864 ASGR1P07306 291 aa18.04■□□□□ 0.48
AMIGO1-202ENST00000369864 DDX6P26196 483 aaKnown RBP eCLIP18.04■□□□□ 0.48
AMIGO1-202ENST00000369864 ATXN7L2Q5T6C5 722 aaPredicted RBP18.04■□□□□ 0.48
AMIGO1-202ENST00000369864 CLEC20AQ6ZU45 233 aa18.04■□□□□ 0.48
AMIGO1-202ENST00000369864 FOXRED2Q8IWF2 684 aa18.04■□□□□ 0.48
AMIGO1-202ENST00000369864 NEIL3Q8TAT5 605 aa18.04■□□□□ 0.48
AMIGO1-202ENST00000369864 LRRC15Q8TF66 581 aa18.04■□□□□ 0.48
AMIGO1-202ENST00000369864 KLRG1Q96E93 195 aa18.04■□□□□ 0.48
AMIGO1-202ENST00000369864 CYP2S1Q96SQ9 504 aa18.04■□□□□ 0.48
AMIGO1-202ENST00000369864 OSBPL2Q9H1P3 480 aa18.04■□□□□ 0.48
AMIGO1-202ENST00000369864 EXOSC1Q9Y3B2 195 aaKnown RBP18.04■□□□□ 0.48
AMIGO1-202ENST00000369864 PLIN4Q96Q06 1357 aa18.04■□□□□ 0.48
AMIGO1-202ENST00000369864 C13orf42A0A1B0GVH6 325 aa18.04■□□□□ 0.48
AMIGO1-202ENST00000369864 CD40LGP29965 261 aa18.04■□□□□ 0.48
AMIGO1-202ENST00000369864 GPR33Q49SQ1 333 aa18.04■□□□□ 0.48
AMIGO1-202ENST00000369864 HACD2Q6Y1H2 254 aa18.04■□□□□ 0.48
AMIGO1-202ENST00000369864 CCDC120Q96HB5 630 aa18.04■□□□□ 0.48
AMIGO1-202ENST00000369864 TTPALQ9BTX7 342 aa18.04■□□□□ 0.48
AMIGO1-202ENST00000369864 ABCG5Q9H222 651 aa18.04■□□□□ 0.48
AMIGO1-202ENST00000369864 RHCGQ9UBD6 479 aa18.04■□□□□ 0.48
AMIGO1-202ENST00000369864 SLC22A14Q9Y267 594 aa18.04■□□□□ 0.48
AMIGO1-202ENST00000369864 CREMQ03060 361 aa18.04■□□□□ 0.48
AMIGO1-202ENST00000369864 EFCAB11Q9BUY7 163 aa18.04■□□□□ 0.48
AMIGO1-202ENST00000369864 MEAF6Q9HAF1 191 aa18.04■□□□□ 0.48
AMIGO1-202ENST00000369864 ZDHHC7Q9NXF8 308 aa18.04■□□□□ 0.48
AMIGO1-202ENST00000369864 PEAK1Q9H792 1746 aa18.04■□□□□ 0.48
AMIGO1-202ENST00000369864 C9IYK1 514 aa18.04■□□□□ 0.48
AMIGO1-202ENST00000369864 CACNB4O00305 520 aaPredicted RBP18.04■□□□□ 0.48
AMIGO1-202ENST00000369864 EEF1E1O43324 174 aaKnown RBP18.04■□□□□ 0.48
AMIGO1-202ENST00000369864 VIPP01282 170 aa18.04■□□□□ 0.48
AMIGO1-202ENST00000369864 STSP08842 583 aa18.04■□□□□ 0.48
AMIGO1-202ENST00000369864 MSL3P1P0C860 447 aa18.04■□□□□ 0.48
AMIGO1-202ENST00000369864 GJA9P57773 515 aa18.04■□□□□ 0.48
AMIGO1-202ENST00000369864 ARFRP1Q13795 201 aa18.04■□□□□ 0.48
AMIGO1-202ENST00000369864 SLBPQ14493 270 aaKnown RBP eCLIP18.04■□□□□ 0.48
AMIGO1-202ENST00000369864 CEACAM20Q6UY09 585 aa18.04■□□□□ 0.48
AMIGO1-202ENST00000369864 GATAD2BQ8WXI9 593 aa18.04■□□□□ 0.48
AMIGO1-202ENST00000369864 PMM1Q92871 262 aa18.04■□□□□ 0.48
AMIGO1-202ENST00000369864 NANSQ9NR45 359 aa18.04■□□□□ 0.48
AMIGO1-202ENST00000369864 MOCS1Q9NZB8 636 aa18.04■□□□□ 0.48
AMIGO1-202ENST00000369864 COQ3Q9NZJ6 369 aa18.04■□□□□ 0.48
AMIGO1-202ENST00000369864 MGAT4BQ9UQ53 548 aa18.04■□□□□ 0.48
AMIGO1-202ENST00000369864 CDH10Q9Y6N8 788 aa18.04■□□□□ 0.48
AMIGO1-202ENST00000369864 SH3D21A4FU49 640 aa18.03■□□□□ 0.48
AMIGO1-202ENST00000369864 NUAK1O60285 661 aa18.03■□□□□ 0.48
AMIGO1-202ENST00000369864 BCAS1O75363 584 aaPredicted RBP18.03■□□□□ 0.48
AMIGO1-202ENST00000369864 MATN4O95460 622 aa18.03■□□□□ 0.48
AMIGO1-202ENST00000369864 ZNF823P16415 610 aa18.03■□□□□ 0.48
AMIGO1-202ENST00000369864 IGFALSP35858 605 aa18.03■□□□□ 0.48
AMIGO1-202ENST00000369864 ARF3P61204 181 aaPredicted RBP18.03■□□□□ 0.48
AMIGO1-202ENST00000369864 ARF1P84077 181 aaKnown RBP18.03■□□□□ 0.48
AMIGO1-202ENST00000369864 PRKCDQ05655 676 aa18.03■□□□□ 0.48
AMIGO1-202ENST00000369864 SP140Q13342 867 aa18.03■□□□□ 0.48
AMIGO1-202ENST00000369864 ATG9BQ674R7 924 aa18.03■□□□□ 0.48
AMIGO1-202ENST00000369864 SLC36A4Q6YBV0 504 aa18.03■□□□□ 0.48
AMIGO1-202ENST00000369864 MSCO60682 206 aa18.03■□□□□ 0.48
AMIGO1-202ENST00000369864 KCNA5P22460 613 aa18.03■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 21.2 ms