RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000359315.6

TPGS1-201, Transcript of tubulin polyglutamylase complex subunit 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene TPGS1, Length 1,114 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TPGS1-201ENST00000359315 CCNT2O60583 730 aaKnown RBP25.62■■□□□ 1.69
TPGS1-201ENST00000359315 STK16O75716 305 aa25.62■■□□□ 1.69
TPGS1-201ENST00000359315 KLHL2O95198 593 aa25.62■■□□□ 1.69
TPGS1-201ENST00000359315 NR1D1P20393 614 aa25.62■■□□□ 1.69
TPGS1-201ENST00000359315 PDSS2Q86YH6 399 aa25.62■■□□□ 1.69
TPGS1-201ENST00000359315 RAB43Q86YS6 212 aa25.62■■□□□ 1.69
TPGS1-201ENST00000359315 ABHD17AQ96GS6 310 aa25.62■■□□□ 1.69
TPGS1-201ENST00000359315 ING2Q9H160 280 aa25.62■■□□□ 1.69
TPGS1-201ENST00000359315 ADNPQ9H2P0 1102 aa25.62■■□□□ 1.69
TPGS1-201ENST00000359315 TRPC4Q9UBN4 977 aa25.62■■□□□ 1.69
TPGS1-201ENST00000359315 PCM1Q15154 2024 aa25.61■■□□□ 1.69
TPGS1-201ENST00000359315 SEC16AO15027 2179 aa25.61■■□□□ 1.69
TPGS1-201ENST00000359315 ANKRD12Q6UB98 2062 aa25.61■■□□□ 1.69
TPGS1-201ENST00000359315 IGLV3-12A0A075B6K2 115 aa25.61■■□□□ 1.69
TPGS1-201ENST00000359315 ESPNB1AK53 854 aa25.61■■□□□ 1.69
TPGS1-201ENST00000359315 RFPL1O75677 317 aa25.61■■□□□ 1.69
TPGS1-201ENST00000359315 KRT38O76015 456 aa25.61■■□□□ 1.69
TPGS1-201ENST00000359315 B3GALT4O96024 378 aa25.61■■□□□ 1.69
TPGS1-201ENST00000359315 S100BP04271 92 aaPredicted RBP25.61■■□□□ 1.69
TPGS1-201ENST00000359315 SERPIND1P05546 499 aa25.61■■□□□ 1.69
TPGS1-201ENST00000359315 C1GALT1C1LP0DN25 315 aa25.61■■□□□ 1.69
TPGS1-201ENST00000359315 FAM53BQ14153 422 aa25.61■■□□□ 1.69
TPGS1-201ENST00000359315 SLBPQ14493 270 aaKnown RBP eCLIP25.61■■□□□ 1.69
TPGS1-201ENST00000359315 NDUFA9Q16795 377 aa25.61■■□□□ 1.69
TPGS1-201ENST00000359315 FAM83EQ2M2I3 478 aa25.61■■□□□ 1.69
TPGS1-201ENST00000359315 CCDC91Q7Z6B0 441 aa25.61■■□□□ 1.69
TPGS1-201ENST00000359315 EIF1ADQ8N9N8 165 aaKnown RBP25.61■■□□□ 1.69
TPGS1-201ENST00000359315 SNX31Q8N9S9 440 aa25.61■■□□□ 1.69
TPGS1-201ENST00000359315 AIF1LQ9BQI0 150 aa25.61■■□□□ 1.69
TPGS1-201ENST00000359315 ZNF282Q9UDV7 671 aaPredicted RBP25.61■■□□□ 1.69
TPGS1-201ENST00000359315 ZFP69BQ9UJL9 534 aa25.61■■□□□ 1.69
TPGS1-201ENST00000359315 CDC14AQ9UNH5 594 aa25.61■■□□□ 1.69
TPGS1-201ENST00000359315 LRRC14BA6NHZ5 514 aa25.6■■□□□ 1.69
TPGS1-201ENST00000359315 IPO13O94829 963 aaKnown RBP25.6■■□□□ 1.69
TPGS1-201ENST00000359315 CD63P08962 238 aa25.6■■□□□ 1.69
TPGS1-201ENST00000359315 ZGLP1P0C6A0 271 aa25.6■■□□□ 1.69
TPGS1-201ENST00000359315 SLC35G6P0C7Q6 338 aa25.6■■□□□ 1.69
TPGS1-201ENST00000359315 GNAZP19086 355 aa25.6■■□□□ 1.69
TPGS1-201ENST00000359315 CD22P20273 847 aa25.6■■□□□ 1.69
TPGS1-201ENST00000359315 TNFRSF8P28908 595 aa25.6■■□□□ 1.69
TPGS1-201ENST00000359315 EFNA3P52797 238 aa25.6■■□□□ 1.69
TPGS1-201ENST00000359315 KLC1Q07866 573 aa25.6■■□□□ 1.69
TPGS1-201ENST00000359315 NFATC3Q12968 1075 aa25.6■■□□□ 1.69
TPGS1-201ENST00000359315 RBBP5Q15291 538 aaKnown RBP25.6■■□□□ 1.69
TPGS1-201ENST00000359315 PDK4Q16654 411 aa25.6■■□□□ 1.69
TPGS1-201ENST00000359315 TECRLQ5HYJ1 363 aa25.6■■□□□ 1.69
TPGS1-201ENST00000359315 ATG9BQ674R7 924 aa25.6■■□□□ 1.69
TPGS1-201ENST00000359315 ADNP2Q6IQ32 1131 aa25.6■■□□□ 1.69
TPGS1-201ENST00000359315 TAOK1Q7L7X3 1001 aa25.6■■□□□ 1.69
TPGS1-201ENST00000359315 LAPTM4BQ86VI4 370 aa25.6■■□□□ 1.69
TPGS1-201ENST00000359315 SUPV3L1Q8IYB8 786 aaKnown RBP eCLIP25.6■■□□□ 1.69
TPGS1-201ENST00000359315 RHEBL1Q8TAI7 183 aa25.6■■□□□ 1.69
TPGS1-201ENST00000359315 MIEF2Q96C03 454 aa25.6■■□□□ 1.69
TPGS1-201ENST00000359315 YIPF2Q9BWQ6 316 aa25.6■■□□□ 1.69
TPGS1-201ENST00000359315 CD244Q9BZW8 370 aa25.6■■□□□ 1.69
TPGS1-201ENST00000359315 AICDAQ9GZX7 198 aa25.6■■□□□ 1.69
TPGS1-201ENST00000359315 CNOT10Q9H9A5 744 aaKnown RBP25.6■■□□□ 1.69
TPGS1-201ENST00000359315 ZNF71Q9NQZ8 489 aaPredicted RBP25.6■■□□□ 1.69
TPGS1-201ENST00000359315 HCN3Q9P1Z3 774 aa25.6■■□□□ 1.69
TPGS1-201ENST00000359315 NXT1Q9UKK6 140 aaKnown RBP25.6■■□□□ 1.69
TPGS1-201ENST00000359315 HS3ST3B1Q9Y662 390 aa25.6■■□□□ 1.69
TPGS1-201ENST00000359315 ZNF860A6NHJ4 632 aa25.59■■□□□ 1.69
TPGS1-201ENST00000359315 SGK494L7N484 410 aa25.59■■□□□ 1.69
TPGS1-201ENST00000359315 PDGFAP04085 211 aa25.59■■□□□ 1.69
TPGS1-201ENST00000359315 HYAL2Q12891 473 aa25.59■■□□□ 1.69
TPGS1-201ENST00000359315 ACAP2Q15057 778 aa25.59■■□□□ 1.69
TPGS1-201ENST00000359315 ZC3H7AQ8IWR0 971 aaKnown RBP25.59■■□□□ 1.69
TPGS1-201ENST00000359315 C9orf43Q8TAL5 461 aaPredicted RBP25.59■■□□□ 1.69
TPGS1-201ENST00000359315 UBTD2Q8WUN7 234 aa25.59■■□□□ 1.69
TPGS1-201ENST00000359315 CRB3Q9BUF7 120 aa25.59■■□□□ 1.69
TPGS1-201ENST00000359315 SLC25A18Q9H1K4 315 aa25.59■■□□□ 1.69
TPGS1-201ENST00000359315 P4HTMQ9NXG6 502 aa25.59■■□□□ 1.69
TPGS1-201ENST00000359315 GPRC5BQ9NZH0 403 aa25.59■■□□□ 1.69
TPGS1-201ENST00000359315 TUBD1Q9UJT1 453 aa25.59■■□□□ 1.69
TPGS1-201ENST00000359315 TP53TG5Q9Y2B4 290 aa25.59■■□□□ 1.69
TPGS1-201ENST00000359315 C4orf51C9J302 202 aa25.58■■□□□ 1.69
TPGS1-201ENST00000359315 SOCS6O14544 535 aa25.58■■□□□ 1.69
TPGS1-201ENST00000359315 MAP2K7O14733 419 aa25.58■■□□□ 1.69
TPGS1-201ENST00000359315 DNAJB6O75190 326 aa25.58■■□□□ 1.69
TPGS1-201ENST00000359315 ALOX12BO75342 701 aa25.58■■□□□ 1.69
TPGS1-201ENST00000359315 JRKO75564 520 aa25.58■■□□□ 1.69
TPGS1-201ENST00000359315 NSA2O95478 260 aaKnown RBP25.58■■□□□ 1.69
TPGS1-201ENST00000359315 SHBGP04278 402 aa25.58■■□□□ 1.69
TPGS1-201ENST00000359315 MMP11P24347 488 aa25.58■■□□□ 1.69
TPGS1-201ENST00000359315 CNTFP26441 200 aa25.58■■□□□ 1.69
TPGS1-201ENST00000359315 CCL11P51671 97 aa25.58■■□□□ 1.69
TPGS1-201ENST00000359315 OCA2Q04671 838 aa25.58■■□□□ 1.69
TPGS1-201ENST00000359315 ADGRD1Q6QNK2 874 aa25.58■■□□□ 1.69
TPGS1-201ENST00000359315 LRRC70Q7Z2Q7 622 aa25.58■■□□□ 1.69
TPGS1-201ENST00000359315 NT5CQ8TCD5 201 aa25.58■■□□□ 1.69
TPGS1-201ENST00000359315 CREB3L4Q8TEY5 395 aa25.58■■□□□ 1.69
TPGS1-201ENST00000359315 ACSS2Q9NR19 701 aa25.58■■□□□ 1.69
TPGS1-201ENST00000359315 MAP4K5Q9Y4K4 846 aa25.58■■□□□ 1.69
TPGS1-201ENST00000359315 PRPF4O43172 522 aaKnown RBP eCLIP25.57■■□□□ 1.68
TPGS1-201ENST00000359315 RDH16O75452 317 aa25.57■■□□□ 1.68
TPGS1-201ENST00000359315 KLHL18O94889 574 aa25.57■■□□□ 1.68
TPGS1-201ENST00000359315 SNRPAP09012 282 aaKnown RBP25.57■■□□□ 1.68
TPGS1-201ENST00000359315 AHRP35869 848 aa25.57■■□□□ 1.68
TPGS1-201ENST00000359315 HNF4AP41235 474 aa25.57■■□□□ 1.68
TPGS1-201ENST00000359315 AVPR1BP47901 424 aa25.57■■□□□ 1.68
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 70.2 ms