RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000326181.10

TRAF7-201, Transcript of TNF receptor associated factor 7, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene TRAF7, Length 3,700 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAF7-201ENST00000326181 MMP27Q9H306 513 aa14.63□□□□□ -0.07
TRAF7-201ENST00000326181 BRD9Q9H8M2 597 aa14.63□□□□□ -0.07
TRAF7-201ENST00000326181 RDH14Q9HBH5 336 aa14.63□□□□□ -0.07
TRAF7-201ENST00000326181 MS4A12Q9NXJ0 267 aa14.63□□□□□ -0.07
TRAF7-201ENST00000326181 SPASTQ9UBP0 616 aa14.63□□□□□ -0.07
TRAF7-201ENST00000326181 GABRR3A8MPY1 467 aa14.63□□□□□ -0.07
TRAF7-201ENST00000326181 CHRM5P08912 532 aaPredicted RBP14.63□□□□□ -0.07
TRAF7-201ENST00000326181 AZGP1P25311 298 aaKnown RBP14.63□□□□□ -0.07
TRAF7-201ENST00000326181 ACVR2AP27037 513 aa14.63□□□□□ -0.07
TRAF7-201ENST00000326181 CCL23P55773 120 aa14.63□□□□□ -0.07
TRAF7-201ENST00000326181 WNT3P56703 355 aa14.63□□□□□ -0.07
TRAF7-201ENST00000326181 PPIGQ13427 754 aaKnown RBP eCLIP14.63□□□□□ -0.074e-7■■■□□ 15.9
TRAF7-201ENST00000326181 ERICH5Q6P6B1 374 aa14.63□□□□□ -0.07
TRAF7-201ENST00000326181 USP43Q70EL4 1123 aa14.63□□□□□ -0.07
TRAF7-201ENST00000326181 LRRC70Q7Z2Q7 622 aa14.63□□□□□ -0.07
TRAF7-201ENST00000326181 LGI4Q8N135 537 aa14.63□□□□□ -0.07
TRAF7-201ENST00000326181 ELMOD1Q8N336 334 aa14.63□□□□□ -0.07
TRAF7-201ENST00000326181 VPS37AQ8NEZ2 397 aa14.63□□□□□ -0.07
TRAF7-201ENST00000326181 NUAK2Q9H093 628 aa14.63□□□□□ -0.07
TRAF7-201ENST00000326181 QPCTLQ9NXS2 382 aa14.63□□□□□ -0.07
TRAF7-201ENST00000326181 PCDHGB3Q9Y5G1 929 aa14.63□□□□□ -0.07
TRAF7-201ENST00000326181 METTL15A6NJ78 407 aa14.62□□□□□ -0.07
TRAF7-201ENST00000326181 CLDN24A6NM45 220 aa14.62□□□□□ -0.07
TRAF7-201ENST00000326181 MED26O95402 600 aa14.62□□□□□ -0.07
TRAF7-201ENST00000326181 GJA1P17302 382 aa14.62□□□□□ -0.07
TRAF7-201ENST00000326181 CD70P32970 193 aa14.62□□□□□ -0.07
TRAF7-201ENST00000326181 LRRC74AQ0VAA2 488 aa14.62□□□□□ -0.07
TRAF7-201ENST00000326181 VEPH1Q14D04 833 aa14.62□□□□□ -0.07
TRAF7-201ENST00000326181 EXOC3L2Q2M3D2 409 aa14.62□□□□□ -0.07
TRAF7-201ENST00000326181 GPR33Q49SQ1 333 aa14.62□□□□□ -0.07
TRAF7-201ENST00000326181 COX20Q5RI15 118 aa14.62□□□□□ -0.07
TRAF7-201ENST00000326181 IER5LQ5T953 404 aa14.62□□□□□ -0.07
TRAF7-201ENST00000326181 CCBE1Q6UXH8 406 aaPredicted RBP14.62□□□□□ -0.07
TRAF7-201ENST00000326181 GATAD2AQ86YP4 633 aa14.62□□□□□ -0.07
TRAF7-201ENST00000326181 BCL7BQ9BQE9 202 aa14.62□□□□□ -0.07
TRAF7-201ENST00000326181 TPK1Q9H3S4 243 aa14.62□□□□□ -0.07
TRAF7-201ENST00000326181 ZNF556Q9HAH1 456 aa14.62□□□□□ -0.07
TRAF7-201ENST00000326181 EHD3Q9NZN3 535 aa14.62□□□□□ -0.07
TRAF7-201ENST00000326181 PCDHB11Q9Y5F2 797 aa14.62□□□□□ -0.07
TRAF7-201ENST00000326181 MKI67P46013 3256 aaKnown RBP14.62□□□□□ -0.07
TRAF7-201ENST00000326181 ETHE1O95571 254 aa14.62□□□□□ -0.07
TRAF7-201ENST00000326181 GPX2P18283 190 aa14.62□□□□□ -0.07
TRAF7-201ENST00000326181 CD22P20273 847 aa14.62□□□□□ -0.07
TRAF7-201ENST00000326181 KCNJ10P78508 379 aa14.62□□□□□ -0.07
TRAF7-201ENST00000326181 SPANXN2Q5MJ10 180 aa14.62□□□□□ -0.07
TRAF7-201ENST00000326181 LYPLAL1Q5VWZ2 237 aa14.62□□□□□ -0.07
TRAF7-201ENST00000326181 FAM217AQ8IXS0 508 aa14.62□□□□□ -0.07
TRAF7-201ENST00000326181 ZIC5Q96T25 663 aa14.62□□□□□ -0.07
TRAF7-201ENST00000326181 CWH43Q9H720 699 aa14.62□□□□□ -0.07
TRAF7-201ENST00000326181 ERVW-1Q9UQF0 538 aa14.62□□□□□ -0.07
TRAF7-201ENST00000326181 MFN2O95140 757 aa14.62□□□□□ -0.07
TRAF7-201ENST00000326181 PREPP48147 710 aa14.62□□□□□ -0.07
TRAF7-201ENST00000326181 CYP4F8P98187 520 aa14.62□□□□□ -0.07
TRAF7-201ENST00000326181 CSTF3Q12996 717 aaKnown RBP14.62□□□□□ -0.07
TRAF7-201ENST00000326181 DOC2AQ14183 400 aa14.62□□□□□ -0.07
TRAF7-201ENST00000326181 UAP1L1Q3KQV9 507 aa14.62□□□□□ -0.07
TRAF7-201ENST00000326181 CCSMST1Q4G0I0 132 aa14.62□□□□□ -0.07
TRAF7-201ENST00000326181 DCAF4L2Q8NA75 395 aa14.62□□□□□ -0.07
TRAF7-201ENST00000326181 IL4I1Q96RQ9 567 aa14.62□□□□□ -0.07
TRAF7-201ENST00000326181 CCM2Q9BSQ5 444 aa14.62□□□□□ -0.07
TRAF7-201ENST00000326181 SLC12A9Q9BXP2 914 aa14.62□□□□□ -0.07
TRAF7-201ENST00000326181 CEP44Q9C0F1 390 aa14.62□□□□□ -0.07
TRAF7-201ENST00000326181 SMG9Q9H0W8 520 aaKnown RBP14.62□□□□□ -0.07
TRAF7-201ENST00000326181 TRIM39Q9HCM9 518 aa14.62□□□□□ -0.07
TRAF7-201ENST00000326181 PLXNA4Q9HCM2 1894 aa14.61□□□□□ -0.07
TRAF7-201ENST00000326181 CTDSP2O14595 271 aa14.61□□□□□ -0.07
TRAF7-201ENST00000326181 INPPL1O15357 1258 aa14.61□□□□□ -0.07
TRAF7-201ENST00000326181 CCNKO75909 580 aa14.61□□□□□ -0.07
TRAF7-201ENST00000326181 HLA-EP13747 358 aa14.61□□□□□ -0.07
TRAF7-201ENST00000326181 IL1RNP18510 177 aa14.61□□□□□ -0.07
TRAF7-201ENST00000326181 LHCGRP22888 699 aa14.61□□□□□ -0.07
TRAF7-201ENST00000326181 SMARCB1Q12824 385 aa14.61□□□□□ -0.07
TRAF7-201ENST00000326181 TSTQ16762 297 aaKnown RBP14.61□□□□□ -0.07
TRAF7-201ENST00000326181 METTL4Q8N3J2 472 aa14.61□□□□□ -0.07
TRAF7-201ENST00000326181 TCAIMQ8N3R3 496 aa14.61□□□□□ -0.07
TRAF7-201ENST00000326181 LILRA3Q8N6C8 439 aaPredicted RBP14.61□□□□□ -0.07
TRAF7-201ENST00000326181 NFKBIDQ8NI38 313 aa14.61□□□□□ -0.07
TRAF7-201ENST00000326181 HRASLS5Q96KN8 279 aa14.61□□□□□ -0.07
TRAF7-201ENST00000326181 PSORS1C1Q9UIG5 152 aa14.61□□□□□ -0.07
TRAF7-201ENST00000326181 TMED5Q9Y3A6 229 aa14.61□□□□□ -0.07
TRAF7-201ENST00000326181 KCNE1BA0A087WTH5 132 aa14.61□□□□□ -0.07
TRAF7-201ENST00000326181 LOC107983988A0A1B0GUW6 1196 aaPredicted RBP14.61□□□□□ -0.07
TRAF7-201ENST00000326181 CLCA1A8K7I4 914 aa14.61□□□□□ -0.07
TRAF7-201ENST00000326181 FAM227AF5H4B4 570 aa14.61□□□□□ -0.07
TRAF7-201ENST00000326181 DSCR3O14972 297 aa14.61□□□□□ -0.07
TRAF7-201ENST00000326181 SH3BP5O60239 455 aa14.61□□□□□ -0.07
TRAF7-201ENST00000326181 LMAN2Q12907 356 aa14.61□□□□□ -0.07
TRAF7-201ENST00000326181 ELAVL2Q12926 359 aaKnown RBP14.61□□□□□ -0.07
TRAF7-201ENST00000326181 RGNQ15493 299 aa14.61□□□□□ -0.07
TRAF7-201ENST00000326181 DNAJB7Q7Z6W7 309 aaPredicted RBP14.61□□□□□ -0.07
TRAF7-201ENST00000326181 DNAJC22Q8N4W6 341 aa14.61□□□□□ -0.07
TRAF7-201ENST00000326181 ASB11Q8WXH4 323 aa14.61□□□□□ -0.07
TRAF7-201ENST00000326181 OR5M11Q96RB7 305 aa14.61□□□□□ -0.07
TRAF7-201ENST00000326181 DOHHQ9BU89 302 aa14.61□□□□□ -0.07
TRAF7-201ENST00000326181 YIPF1Q9Y548 306 aa14.61□□□□□ -0.07
TRAF7-201ENST00000326181 TMEM202A6NGA9 273 aa14.61□□□□□ -0.07
TRAF7-201ENST00000326181 APOA1P02647 267 aa14.61□□□□□ -0.07
TRAF7-201ENST00000326181 ADORA3P0DMS8 318 aa14.61□□□□□ -0.07
TRAF7-201ENST00000326181 PTSQ03393 145 aa14.61□□□□□ -0.07
TRAF7-201ENST00000326181 SYTL3Q4VX76 610 aa14.61□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 52.9 ms