RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000299543.8

CTDP1-202, Transcript of CTD phosphatase subunit 1, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 5 BASIC

Gene CTDP1, Length 3,380 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTDP1-202ENST00000299543 PLXNA3P51805 1871 aa13□□□□□ -0.33
CTDP1-202ENST00000299543 A0A0G2JMP0 313 aa13□□□□□ -0.33
CTDP1-202ENST00000299543 GNG14A0A1W2PPG7 69 aa13□□□□□ -0.33
CTDP1-202ENST00000299543 A0A1W2PQ72 361 aa13□□□□□ -0.33
CTDP1-202ENST00000299543 PRAMEF4O60810 478 aa13□□□□□ -0.33
CTDP1-202ENST00000299543 ALX3O95076 343 aa13□□□□□ -0.33
CTDP1-202ENST00000299543 RETP07949 1114 aa13□□□□□ -0.33
CTDP1-202ENST00000299543 POLR2EP19388 210 aaKnown RBP13□□□□□ -0.33
CTDP1-202ENST00000299543 ENPP1P22413 925 aa13□□□□□ -0.33
CTDP1-202ENST00000299543 DAPP51397 102 aa13□□□□□ -0.33
CTDP1-202ENST00000299543 ZNF691Q5VV52 312 aa13□□□□□ -0.33
CTDP1-202ENST00000299543 PRAMEF9Q5VWM5 478 aa13□□□□□ -0.33
CTDP1-202ENST00000299543 TPRG1Q6ZUI0 275 aa13□□□□□ -0.33
CTDP1-202ENST00000299543 ESX1Q8N693 406 aa13□□□□□ -0.33
CTDP1-202ENST00000299543 OVCA2Q8WZ82 227 aa13□□□□□ -0.33
CTDP1-202ENST00000299543 NELL1Q92832 810 aa13□□□□□ -0.33
CTDP1-202ENST00000299543 DACT3Q96B18 629 aaPredicted RBP13□□□□□ -0.33
CTDP1-202ENST00000299543 TXNDC15Q96J42 360 aa13□□□□□ -0.33
CTDP1-202ENST00000299543 BRD9Q9H8M2 597 aa13□□□□□ -0.33
CTDP1-202ENST00000299543 GPN2Q9H9Y4 310 aaPredicted RBP13□□□□□ -0.33
CTDP1-202ENST00000299543 DNAJC11Q9NVH1 559 aa13□□□□□ -0.33
CTDP1-202ENST00000299543 TOR4AQ9NXH8 423 aa13□□□□□ -0.33
CTDP1-202ENST00000299543 RAPGEFL1Q9UHV5 662 aa13□□□□□ -0.33
CTDP1-202ENST00000299543 ZNF221Q9UK13 617 aa13□□□□□ -0.33
CTDP1-202ENST00000299543 SAMD4AQ9UPU9 718 aaKnown RBP13□□□□□ -0.33
CTDP1-202ENST00000299543 C5orf42Q9H799 3197 aa12.99□□□□□ -0.33
CTDP1-202ENST00000299543 URODP06132 367 aa12.99□□□□□ -0.33
CTDP1-202ENST00000299543 LAMP1P11279 417 aa12.99□□□□□ -0.33
CTDP1-202ENST00000299543 PRPS2P11908 318 aa12.99□□□□□ -0.33
CTDP1-202ENST00000299543 PSMA3P25788 255 aa12.99□□□□□ -0.33
CTDP1-202ENST00000299543 PPP3CCP48454 512 aa12.99□□□□□ -0.33
CTDP1-202ENST00000299543 SERPINB10P48595 397 aa12.99□□□□□ -0.33
CTDP1-202ENST00000299543 CLK1P49759 484 aaKnown RBP12.99□□□□□ -0.33
CTDP1-202ENST00000299543 LYSMD2Q8IV50 215 aa12.99□□□□□ -0.33
CTDP1-202ENST00000299543 LILRA3Q8N6C8 439 aaPredicted RBP12.99□□□□□ -0.33
CTDP1-202ENST00000299543 ZNF366Q8N895 744 aa12.99□□□□□ -0.33
CTDP1-202ENST00000299543 CCDC120Q96HB5 630 aa12.99□□□□□ -0.33
CTDP1-202ENST00000299543 HSH2DQ96JZ2 352 aa12.99□□□□□ -0.33
CTDP1-202ENST00000299543 TMEM175Q9BSA9 504 aa12.99□□□□□ -0.33
CTDP1-202ENST00000299543 MTG2Q9H4K7 406 aa12.99□□□□□ -0.33
CTDP1-202ENST00000299543 MAT2BQ9NZL9 334 aa12.99□□□□□ -0.33
CTDP1-202ENST00000299543 CASP8AP2Q9UKL3 1982 aa12.99□□□□□ -0.33
CTDP1-202ENST00000299543 A8MUA0 341 aa12.99□□□□□ -0.33
CTDP1-202ENST00000299543 MAGEB17A8MXT2 336 aa12.99□□□□□ -0.33
CTDP1-202ENST00000299543 FAM220BPB1ANY3 271 aa12.99□□□□□ -0.33
CTDP1-202ENST00000299543 SAP18O00422 153 aaKnown RBP12.99□□□□□ -0.33
CTDP1-202ENST00000299543 MT-ND2P03891 347 aa12.99□□□□□ -0.33
CTDP1-202ENST00000299543 FABP3P05413 133 aa12.99□□□□□ -0.33
CTDP1-202ENST00000299543 DBTP11182 482 aaKnown RBP12.99□□□□□ -0.33
CTDP1-202ENST00000299543 CYP2A7P20853 494 aa12.99□□□□□ -0.33
CTDP1-202ENST00000299543 PREPP48147 710 aa12.99□□□□□ -0.33
CTDP1-202ENST00000299543 TM4SF4P48230 202 aa12.99□□□□□ -0.33
CTDP1-202ENST00000299543 DGKEP52429 567 aa12.99□□□□□ -0.33
CTDP1-202ENST00000299543 GNG2P59768 71 aa12.99□□□□□ -0.33
CTDP1-202ENST00000299543 NKX3-2P78367 333 aa12.99□□□□□ -0.33
CTDP1-202ENST00000299543 TUBA3CQ13748 450 aa12.99□□□□□ -0.33
CTDP1-202ENST00000299543 HKDC1Q2TB90 917 aa12.99□□□□□ -0.33
CTDP1-202ENST00000299543 LYPLAL1Q5VWZ2 237 aa12.99□□□□□ -0.33
CTDP1-202ENST00000299543 Q6ZVL8 140 aa12.99□□□□□ -0.33
CTDP1-202ENST00000299543 B3GNT8Q7Z7M8 397 aa12.99□□□□□ -0.33
CTDP1-202ENST00000299543 REEP1Q9H902 201 aa12.99□□□□□ -0.33
CTDP1-202ENST00000299543 INSL5Q9Y5Q6 135 aa12.99□□□□□ -0.33
CTDP1-202ENST00000299543 MAU2Q9Y6X3 613 aa12.99□□□□□ -0.33
CTDP1-202ENST00000299543 DOCK6Q96HP0 2047 aa12.99□□□□□ -0.33
CTDP1-202ENST00000299543 CCNDBP1O95273 360 aa12.98□□□□□ -0.33
CTDP1-202ENST00000299543 SRCP12931 536 aa12.98□□□□□ -0.33
CTDP1-202ENST00000299543 JUNBP17275 347 aaPredicted RBP12.98□□□□□ -0.33
CTDP1-202ENST00000299543 AOAHP28039 575 aa12.98□□□□□ -0.33
CTDP1-202ENST00000299543 MAPK1P28482 360 aa12.98□□□□□ -0.33
CTDP1-202ENST00000299543 KDELR2P33947 212 aa12.98□□□□□ -0.33
CTDP1-202ENST00000299543 POU6F2P78424 691 aaPredicted RBP12.98□□□□□ -0.33
CTDP1-202ENST00000299543 CHRNEQ04844 493 aa12.98□□□□□ -0.33
CTDP1-202ENST00000299543 DGUOKQ16854 277 aa12.98□□□□□ -0.33
CTDP1-202ENST00000299543 LHX8Q68G74 356 aa12.98□□□□□ -0.33
CTDP1-202ENST00000299543 GALNT12Q8IXK2 581 aa12.98□□□□□ -0.33
CTDP1-202ENST00000299543 SORCS1Q8WY21 1168 aa12.98□□□□□ -0.33
CTDP1-202ENST00000299543 RDH12Q96NR8 316 aa12.98□□□□□ -0.33
CTDP1-202ENST00000299543 SLC29A3Q9BZD2 475 aa12.98□□□□□ -0.33
CTDP1-202ENST00000299543 NARFLQ9H6Q4 476 aa12.98□□□□□ -0.33
CTDP1-202ENST00000299543 TMEM45AQ9NWC5 275 aa12.98□□□□□ -0.33
CTDP1-202ENST00000299543 TPRKBQ9Y3C4 175 aa12.98□□□□□ -0.33
CTDP1-202ENST00000299543 TESMINQ9Y4I5 508 aa12.98□□□□□ -0.33
CTDP1-202ENST00000299543 TMEM202A6NGA9 273 aa12.98□□□□□ -0.33
CTDP1-202ENST00000299543 VIPP01282 170 aa12.98□□□□□ -0.33
CTDP1-202ENST00000299543 EIF2S1P05198 315 aaKnown RBP12.98□□□□□ -0.33
CTDP1-202ENST00000299543 ATF4P18848 351 aaPredicted RBP12.98□□□□□ -0.33
CTDP1-202ENST00000299543 IDH2P48735 452 aaKnown RBP12.98□□□□□ -0.33
CTDP1-202ENST00000299543 CYP4F2P78329 520 aa12.98□□□□□ -0.33
CTDP1-202ENST00000299543 TOP3AQ13472 1001 aaPredicted RBP12.98□□□□□ -0.33
CTDP1-202ENST00000299543 FAM180BQ6P0A1 224 aa12.98□□□□□ -0.33
CTDP1-202ENST00000299543 P3H2Q8IVL5 708 aa12.98□□□□□ -0.33
CTDP1-202ENST00000299543 UBE2J2Q8N2K1 259 aa12.98□□□□□ -0.33
CTDP1-202ENST00000299543 OR5H6Q8NGV6 325 aa12.98□□□□□ -0.33
CTDP1-202ENST00000299543 SCRN2Q96FV2 425 aa12.98□□□□□ -0.33
CTDP1-202ENST00000299543 KCNC2Q96PR1 638 aa12.98□□□□□ -0.33
CTDP1-202ENST00000299543 RETREG1Q9H6L5 497 aa12.98□□□□□ -0.33
CTDP1-202ENST00000299543 BTBD3Q9Y2F9 522 aa12.98□□□□□ -0.33
CTDP1-202ENST00000299543 C12orf71A8MTZ7 269 aa12.98□□□□□ -0.33
CTDP1-202ENST00000299543 NEDD8-MDP1E9PL57 170 aa12.98□□□□□ -0.33
CTDP1-202ENST00000299543 CYP7B1O75881 506 aa12.98□□□□□ -0.33
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 31.3 ms